MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_019738	GAG	2	6	899757	899762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_019738	CTT	2	6	899788	899793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_019738	TCA	2	6	899821	899826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_019738	AAC	2	6	899900	899905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_019738	AAC	2	6	899911	899916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_019738	TAAAG	2	10	900060	900069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_019738	CAA	2	6	900172	900177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_019738	TAA	2	6	900211	900216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_019738	GGT	2	6	900220	900225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_019738	T	6	6	900225	900230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_019738	CTT	2	6	900255	900260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_019738	A	6	6	900321	900326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_019738	A	6	6	900387	900392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_019738	A	6	6	900412	900417	100 %	0 %	0 %	0 %	428309120
16015	NC_019738	AGTG	2	8	900533	900540	25 %	25 %	50 %	0 %	428309120
16016	NC_019738	CCG	2	6	900547	900552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309120
16017	NC_019738	GAA	2	6	900558	900563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428309120
16018	NC_019738	GAT	2	6	900575	900580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309120
16019	NC_019738	AAAAG	2	10	900629	900638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_019738	ACC	2	6	900645	900650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_019738	TGC	2	6	900734	900739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_019738	T	6	6	900751	900756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_019738	GTG	2	6	900816	900821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_019738	T	7	7	900825	900831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_019738	TAA	2	6	900875	900880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_019738	GAT	2	6	900902	900907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_019738	TATTTG	2	12	900942	900953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_019738	TAT	2	6	900967	900972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_019738	T	8	8	900975	900982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_019738	CT	3	6	900987	900992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_019738	TGG	2	6	901062	901067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309121
16032	NC_019738	CAC	2	6	901087	901092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309121
16033	NC_019738	ATTTTG	2	12	901190	901201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428309121
16034	NC_019738	GTT	2	6	901218	901223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309121
16035	NC_019738	TCA	2	6	901234	901239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309121
16036	NC_019738	TGA	2	6	901309	901314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309121
16037	NC_019738	GAA	2	6	901412	901417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428309121
16038	NC_019738	GAG	2	6	901455	901460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428309121
16039	NC_019738	CAAA	2	8	901484	901491	75 %	0 %	0 %	25 %	428309121
16040	NC_019738	TCG	2	6	901543	901548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309121
16041	NC_019738	AATGG	2	10	901552	901561	40 %	20 %	40 %	0 %	428309121
16042	NC_019738	GAA	2	6	901754	901759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428309121
16043	NC_019738	ACC	2	6	901781	901786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309121
16044	NC_019738	GAT	2	6	901913	901918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309121
16045	NC_019738	CAAGT	2	10	901969	901978	40 %	20 %	20 %	20 %	428309121
16046	NC_019738	T	6	6	901994	901999	0 %	100 %	0 %	0 %	428309121
16047	NC_019738	A	6	6	902043	902048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_019738	AGC	2	6	902056	902061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309122
16049	NC_019738	TGT	2	6	902081	902086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309122
16050	NC_019738	GTT	2	6	902121	902126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309122
16051	NC_019738	CCA	2	6	902136	902141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309122
16052	NC_019738	AAT	2	6	902237	902242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309122
16053	NC_019738	TCT	2	6	902270	902275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428309122
16054	NC_019738	CCTC	2	8	902279	902286	0 %	25 %	0 %	75 %	428309122
16055	NC_019738	CGG	2	6	902310	902315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428309122
16056	NC_019738	C	6	6	902417	902422	0 %	0 %	0 %	100 %	428309122
16057	NC_019738	GCCA	2	8	902561	902568	25 %	0 %	25 %	50 %	428309122
16058	NC_019738	GGC	2	6	902647	902652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428309122
16059	NC_019738	TTA	2	6	902778	902783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_019738	CTT	2	6	902826	902831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_019738	GAG	2	6	902871	902876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_019738	AG	3	6	902875	902880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_019738	T	6	6	902898	902903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_019738	ACA	2	6	902934	902939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_019738	CT	3	6	902967	902972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16066	NC_019738	A	7	7	902979	902985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_019738	GA	3	6	903021	903026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_019738	TA	3	6	903060	903065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_019738	TA	3	6	903070	903075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_019738	GTT	2	6	903100	903105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309123
16071	NC_019738	GTA	2	6	903354	903359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309123
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16073	NC_019738	ATG	2	6	903465	903470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309123
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16077	NC_019738	CTT	2	6	903710	903715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428309123
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16079	NC_019738	TTTCGG	2	12	903749	903760	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428309123
16080	NC_019738	GATGTT	2	12	903787	903798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428309123
16081	NC_019738	TGA	2	6	903836	903841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309123
16082	NC_019738	TGG	2	6	903842	903847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309123
16083	NC_019738	TCG	2	6	903946	903951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309123
16084	NC_019738	ACTGA	2	10	904032	904041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16085	NC_019738	TGCT	2	8	904044	904051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16086	NC_019738	CT	3	6	904075	904080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_019738	GT	3	6	904085	904090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_019738	GT	3	6	904136	904141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_019738	AG	3	6	904147	904152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_019738	CAT	2	6	904155	904160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309124
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16092	NC_019738	CTG	2	6	904228	904233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309124
16093	NC_019738	TTTTG	2	10	904289	904298	0 %	80 %	20 %	0 %	428309124
16094	NC_019738	TAT	2	6	904317	904322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309124
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16096	NC_019738	GTT	2	6	904453	904458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309124
16097	NC_019738	TCG	2	6	904474	904479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309124
16098	NC_019738	TGG	2	6	904562	904567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309124
16099	NC_019738	AGTT	2	8	904730	904737	25 %	50 %	25 %	0 %	428309124
16100	NC_019738	TGGGAT	2	12	904772	904783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428309124
16101	NC_019738	GGT	2	6	904812	904817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309124
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16104	NC_019738	GGTT	2	8	905112	905119	0 %	50 %	50 %	0 %	428309124
16105	NC_019738	GTT	4	12	905151	905162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309124
16106	NC_019738	GAA	2	6	905174	905179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_019738	CT	3	6	905181	905186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16108	NC_019738	ACT	2	6	905205	905210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_019738	TTGA	2	8	905268	905275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_019738	CCCTT	2	10	905317	905326	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16111	NC_019738	G	6	6	905342	905347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_019738	CTT	2	6	905386	905391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428309125
16113	NC_019738	GCG	2	6	905438	905443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428309125
16114	NC_019738	GGTC	2	8	905538	905545	0 %	25 %	50 %	25 %	428309125
16115	NC_019738	T	8	8	905646	905653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_019738	TGC	2	6	905657	905662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_019738	AGA	3	9	905797	905805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_019738	GTCGGA	2	12	905833	905844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16119	NC_019738	ACG	2	6	905882	905887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_019738	CAG	2	6	905894	905899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_019738	GAA	2	6	905975	905980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_019738	TGA	2	6	905986	905991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_019738	CT	3	6	906011	906016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_019738	T	7	7	906034	906040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_019738	TTC	2	6	906092	906097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16127	NC_019738	T	6	6	906189	906194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16494	NC_019738	ATC	2	6	928562	928567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16495	NC_019738	AAG	2	6	928571	928576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16496	NC_019738	GGAG	2	8	928596	928603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16497	NC_019738	T	7	7	928619	928625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16498	NC_019738	AGT	2	6	928688	928693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16500	NC_019738	ATT	2	6	929034	929039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309145

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