MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 59207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_018876	CTT	2	6	2343052	2343057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671628
45002	NC_018876	TCG	2	6	2343071	2343076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671628
45003	NC_018876	CTT	2	6	2343126	2343131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671628
45004	NC_018876	TCG	2	6	2343132	2343137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671628
45005	NC_018876	CTT	2	6	2343151	2343156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671628
45006	NC_018876	TCA	2	6	2343270	2343275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671629
45007	NC_018876	TTA	2	6	2343276	2343281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410671629
45008	NC_018876	TAA	2	6	2343282	2343287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410671629
45009	NC_018876	TA	4	8	2343297	2343304	50 %	50 %	0 %	0 %	410671629
45010	NC_018876	T	6	6	2343306	2343311	0 %	100 %	0 %	0 %	410671629
45011	NC_018876	CTG	2	6	2343321	2343326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45012	NC_018876	TTTAT	2	10	2343353	2343362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45013	NC_018876	AT	3	6	2343435	2343440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45014	NC_018876	TA	4	8	2343468	2343475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45015	NC_018876	CAAAAT	2	12	2343597	2343608	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410671630
45016	NC_018876	TTATA	2	10	2343617	2343626	40 %	60 %	0 %	0 %	410671630
45017	NC_018876	TAA	2	6	2343683	2343688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410671631
45018	NC_018876	AGA	2	6	2343825	2343830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410671631
45019	NC_018876	TCC	2	6	2343844	2343849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410671631
45020	NC_018876	GCA	2	6	2343903	2343908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671631
45021	NC_018876	ATCC	2	8	2343965	2343972	25 %	25 %	0 %	50 %	410671632
45022	NC_018876	CTG	2	6	2344057	2344062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671632
45023	NC_018876	ACC	2	6	2344136	2344141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410671632
45024	NC_018876	GAT	2	6	2344142	2344147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410671632
45025	NC_018876	CAT	2	6	2344171	2344176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671632
45026	NC_018876	CAA	2	6	2344177	2344182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671632
45027	NC_018876	CCATCG	2	12	2344200	2344211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410671632
45028	NC_018876	ACCTC	2	10	2344236	2344245	20 %	20 %	0 %	60 %	410671632
45029	NC_018876	ACG	2	6	2344275	2344280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671632
45030	NC_018876	GGC	2	6	2344298	2344303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410671632
45031	NC_018876	TCA	2	6	2344350	2344355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671632
45032	NC_018876	AAG	2	6	2344385	2344390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410671632
45033	NC_018876	TCAA	2	8	2344400	2344407	50 %	25 %	0 %	25 %	410671632
45034	NC_018876	CAA	2	6	2344416	2344421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671632
45035	NC_018876	CGA	2	6	2344543	2344548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671632
45036	NC_018876	GCA	2	6	2344596	2344601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671632
45037	NC_018876	GC	3	6	2344645	2344650	0 %	0 %	50 %	50 %	410671632
45038	NC_018876	CT	4	8	2344781	2344788	0 %	50 %	0 %	50 %	410671632
45039	NC_018876	GCCA	2	8	2344798	2344805	25 %	0 %	25 %	50 %	410671632
45040	NC_018876	CGC	2	6	2344819	2344824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410671632
45041	NC_018876	CGCACT	2	12	2344876	2344887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410671632
45042	NC_018876	A	6	6	2344904	2344909	100 %	0 %	0 %	0 %	410671632
45043	NC_018876	TCC	3	9	2344925	2344933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410671632
45044	NC_018876	TG	3	6	2344998	2345003	0 %	50 %	50 %	0 %	410671632
45045	NC_018876	AGATG	2	10	2345116	2345125	40 %	20 %	40 %	0 %	410671632
45046	NC_018876	AAC	2	6	2345149	2345154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671632
45047	NC_018876	CGG	2	6	2345209	2345214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410671632
45048	NC_018876	GGC	2	6	2345279	2345284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410671632
45049	NC_018876	CT	3	6	2345327	2345332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45050	NC_018876	TCAG	2	8	2345351	2345358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45051	NC_018876	ATA	2	6	2345397	2345402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410671633
45052	NC_018876	GAC	2	6	2345487	2345492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671633
45053	NC_018876	ATC	2	6	2345496	2345501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671633
45054	NC_018876	GAG	2	6	2345568	2345573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410671633
45055	NC_018876	ACA	2	6	2345602	2345607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671633
45056	NC_018876	GTC	2	6	2345631	2345636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671633
45057	NC_018876	GCAAT	2	10	2345649	2345658	40 %	20 %	20 %	20 %	410671633
45058	NC_018876	GTT	2	6	2345679	2345684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410671633
45059	NC_018876	CTGC	2	8	2345948	2345955	0 %	25 %	25 %	50 %	410671634
45060	NC_018876	CT	3	6	2345971	2345976	0 %	50 %	0 %	50 %	410671634
45061	NC_018876	A	6	6	2346006	2346011	100 %	0 %	0 %	0 %	410671634
45062	NC_018876	TAT	2	6	2346023	2346028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410671634
45063	NC_018876	A	8	8	2346032	2346039	100 %	0 %	0 %	0 %	410671634
45064	NC_018876	GCA	2	6	2346040	2346045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671634
45065	NC_018876	A	6	6	2346125	2346130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45066	NC_018876	CTT	2	6	2346152	2346157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671635
45067	NC_018876	CT	3	6	2346243	2346248	0 %	50 %	0 %	50 %	410671635
45068	NC_018876	CTT	2	6	2346253	2346258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671635
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45071	NC_018876	TGTT	2	8	2346403	2346410	0 %	75 %	25 %	0 %	410671635
45072	NC_018876	TTC	2	6	2346411	2346416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671635
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45075	NC_018876	TGC	2	6	2346659	2346664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45076	NC_018876	TTG	2	6	2346675	2346680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45077	NC_018876	TAC	2	6	2346734	2346739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671636
45078	NC_018876	TAC	2	6	2346817	2346822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671636
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45082	NC_018876	TCCT	2	8	2346921	2346928	0 %	50 %	0 %	50 %	410671636
45083	NC_018876	ACA	2	6	2346930	2346935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671636
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45085	NC_018876	TCC	2	6	2347058	2347063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410671636
45086	NC_018876	TCA	2	6	2347071	2347076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671636
45087	NC_018876	CTC	2	6	2347094	2347099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410671636
45088	NC_018876	CCA	2	6	2347126	2347131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410671636
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45090	NC_018876	CAG	2	6	2347181	2347186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671636
45091	NC_018876	TTC	3	9	2347392	2347400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671636
45092	NC_018876	TTC	2	6	2347476	2347481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671637
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45099	NC_018876	GGA	2	6	2347968	2347973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410671637
45100	NC_018876	CTG	2	6	2347983	2347988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671637
45101	NC_018876	TGC	2	6	2348098	2348103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671637
45102	NC_018876	TTG	2	6	2348123	2348128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410671637
45103	NC_018876	GCT	2	6	2348152	2348157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671637
45104	NC_018876	TGC	2	6	2348160	2348165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671637
45105	NC_018876	ATG	2	6	2348177	2348182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410671637
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45107	NC_018876	GAGG	2	8	2348322	2348329	25 %	0 %	75 %	0 %	410671637
45108	NC_018876	ACA	2	6	2348390	2348395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671637
45109	NC_018876	GTGG	2	8	2348399	2348406	0 %	25 %	75 %	0 %	410671637
45110	NC_018876	CTT	2	6	2348526	2348531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671637
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45113	NC_018876	TTC	2	6	2348812	2348817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671638
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45115	NC_018876	ATT	2	6	2348911	2348916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410671638
45116	NC_018876	CT	3	6	2348938	2348943	0 %	50 %	0 %	50 %	410671638
45117	NC_018876	CTG	2	6	2348954	2348959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671638
45118	NC_018876	ATGGA	2	10	2349006	2349015	40 %	20 %	40 %	0 %	410671638
45119	NC_018876	TTATC	2	10	2349083	2349092	20 %	60 %	0 %	20 %	410671638
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45121	NC_018876	CTC	2	6	2349159	2349164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410671638
45122	NC_018876	GCGGAA	2	12	2349304	2349315	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410671638
45123	NC_018876	TCT	2	6	2349359	2349364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410671638
45124	NC_018876	GTC	2	6	2349369	2349374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671638
45125	NC_018876	CGA	2	6	2349482	2349487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671638
45126	NC_018876	ACCGGA	2	12	2349528	2349539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671638
45127	NC_018876	TC	3	6	2349648	2349653	0 %	50 %	0 %	50 %	410671638
45128	NC_018876	T	7	7	2349724	2349730	0 %	100 %	0 %	0 %	410671638
45129	NC_018876	AAT	2	6	2349871	2349876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45130	NC_018876	ATA	2	6	2349885	2349890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45131	NC_018876	CTC	2	6	2349925	2349930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45132	NC_018876	GTGC	2	8	2349960	2349967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45133	NC_018876	TA	3	6	2350004	2350009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45134	NC_018876	A	6	6	2350017	2350022	100 %	0 %	0 %	0 %	410671639
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45137	NC_018876	ACA	2	6	2350116	2350121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671639
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45152	NC_018876	TGA	2	6	2350804	2350809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410671640
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45159	NC_018876	GAC	2	6	2351050	2351055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671641
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45163	NC_018876	AT	3	6	2351313	2351318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45164	NC_018876	CAT	2	6	2351405	2351410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671642
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45171	NC_018876	GCG	2	6	2351856	2351861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410671642
45172	NC_018876	TGC	2	6	2351906	2351911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671642
45173	NC_018876	TAT	2	6	2352010	2352015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45174	NC_018876	TAC	2	6	2352020	2352025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45175	NC_018876	GAT	2	6	2352118	2352123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410671643
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45181	NC_018876	CTTTT	2	10	2352439	2352448	0 %	80 %	0 %	20 %	410671643
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45188	NC_018876	A	6	6	2352918	2352923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45189	NC_018876	AGT	2	6	2353047	2353052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45190	NC_018876	AAT	2	6	2353077	2353082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45191	NC_018876	TGTT	2	8	2353092	2353099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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45217	NC_018876	TCG	2	6	2354145	2354150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671645
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45219	NC_018876	CAT	2	6	2354263	2354268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671645
45220	NC_018876	ACT	2	6	2354324	2354329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671645
45221	NC_018876	AAAG	2	8	2354431	2354438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45222	NC_018876	TCA	2	6	2354440	2354445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45223	NC_018876	G	6	6	2354452	2354457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45224	NC_018876	ATA	2	6	2354565	2354570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45225	NC_018876	CT	3	6	2354598	2354603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45226	NC_018876	A	6	6	2354624	2354629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45227	NC_018876	TTA	2	6	2354657	2354662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45228	NC_018876	TTG	2	6	2354665	2354670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45229	NC_018876	AT	3	6	2354702	2354707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45230	NC_018876	AAT	2	6	2354717	2354722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45231	NC_018876	AAAAG	2	10	2354762	2354771	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45232	NC_018876	TA	3	6	2354775	2354780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45233	NC_018876	TTA	2	6	2354781	2354786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45234	NC_018876	CAA	2	6	2354817	2354822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45235	NC_018876	CAA	2	6	2354934	2354939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410671646
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45335	NC_018876	ACAGG	2	10	2359845	2359854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45336	NC_018876	CAAA	2	8	2359943	2359950	75 %	0 %	0 %	25 %	410671651
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45340	NC_018876	TTA	2	6	2360074	2360079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45341	NC_018876	ATTA	2	8	2360083	2360090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45342	NC_018876	ACAGAT	2	12	2360192	2360203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410671652
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45344	NC_018876	CGA	2	6	2360264	2360269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410671652
45345	NC_018876	GTT	2	6	2360342	2360347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410671653
45346	NC_018876	CAT	2	6	2360410	2360415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671653
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45350	NC_018876	C	6	6	2360635	2360640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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45352	NC_018876	GCT	2	6	2360744	2360749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410671654
45353	NC_018876	GCAG	2	8	2360770	2360777	25 %	0 %	50 %	25 %	410671654
45354	NC_018876	TGG	2	6	2360794	2360799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410671654
45355	NC_018876	T	6	6	2360806	2360811	0 %	100 %	0 %	0 %	410671654
45356	NC_018876	ATT	2	6	2360817	2360822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410671654
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45359	NC_018876	TGCCT	2	10	2361069	2361078	0 %	40 %	20 %	40 %	410671654
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45371	NC_018876	AT	3	6	2361820	2361825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45372	NC_018876	CCA	2	6	2361909	2361914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45401	NC_018876	TATT	2	8	2363003	2363010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45402	NC_018876	AT	4	8	2363033	2363040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45403	NC_018876	TATT	2	8	2363061	2363068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45404	NC_018876	TTA	2	6	2363075	2363080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45451	NC_018876	ATG	2	6	2365679	2365684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410671658
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45453	NC_018876	GGA	2	6	2365867	2365872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410671658
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45461	NC_018876	AAGC	2	8	2366219	2366226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45462	NC_018876	CAT	2	6	2366260	2366265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45463	NC_018876	CCAG	2	8	2366288	2366295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45464	NC_018876	C	6	6	2366353	2366358	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45465	NC_018876	ACCT	2	8	2366434	2366441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45466	NC_018876	GACTT	2	10	2366491	2366500	20 %	40 %	20 %	20 %	410671659
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45470	NC_018876	TCA	2	6	2366602	2366607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410671659
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