MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018612	GTC	2	6	694232	694237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028859
18003	NC_018612	AGGT	2	8	694251	694258	25 %	25 %	50 %	0 %	406028859
18004	NC_018612	TCG	2	6	694281	694286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028859
18005	NC_018612	CGC	2	6	694292	694297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028859
18006	NC_018612	TCG	2	6	694323	694328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028859
18007	NC_018612	GCG	2	6	694344	694349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028859
18008	NC_018612	GTG	2	6	694350	694355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028859
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18011	NC_018612	CAG	2	6	694409	694414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028859
18012	NC_018612	GCG	2	6	694420	694425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028859
18013	NC_018612	TCG	2	6	694443	694448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028859
18014	NC_018612	CGAC	2	8	694465	694472	25 %	0 %	25 %	50 %	406028859
18015	NC_018612	CGG	2	6	694486	694491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028859
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18053	NC_018612	CG	3	6	695739	695744	0 %	0 %	50 %	50 %	406028860
18054	NC_018612	CGGG	2	8	695760	695767	0 %	0 %	75 %	25 %	406028860
18055	NC_018612	CGA	2	6	695784	695789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028860
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18120	NC_018612	TTC	2	6	697647	697652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028863
18121	NC_018612	CAC	2	6	697686	697691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028863
18122	NC_018612	CGG	2	6	697709	697714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028863
18123	NC_018612	GCG	2	6	697754	697759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028863
18124	NC_018612	GTCG	2	8	697782	697789	0 %	25 %	50 %	25 %	406028863
18125	NC_018612	CG	4	8	697793	697800	0 %	0 %	50 %	50 %	406028863
18126	NC_018612	TCG	2	6	697879	697884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028863
18127	NC_018612	GCC	2	6	697887	697892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028863
18128	NC_018612	ACG	2	6	697895	697900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028863
18129	NC_018612	GGT	2	6	697944	697949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028863
18130	NC_018612	CAG	2	6	697983	697988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028863
18131	NC_018612	CGC	2	6	697989	697994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028863
18132	NC_018612	GCA	2	6	698003	698008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028863
18133	NC_018612	CGG	2	6	698035	698040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028863
18134	NC_018612	GC	3	6	698058	698063	0 %	0 %	50 %	50 %	406028863
18135	NC_018612	AGC	3	9	698074	698082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028863
18136	NC_018612	GAC	2	6	698178	698183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18137	NC_018612	TCG	2	6	698215	698220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18138	NC_018612	TTGAGG	2	12	698341	698352	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406028864
18139	NC_018612	GCC	2	6	698376	698381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028864
18140	NC_018612	ACC	2	6	698398	698403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028864
18141	NC_018612	AGC	2	6	698425	698430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18142	NC_018612	CGT	2	6	698463	698468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18143	NC_018612	AGC	2	6	698473	698478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18144	NC_018612	GCC	2	6	698502	698507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028864
18145	NC_018612	TGC	2	6	698519	698524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028864
18146	NC_018612	TGA	3	9	698561	698569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028864
18147	NC_018612	ATG	2	6	698614	698619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028864
18148	NC_018612	TGG	2	6	698670	698675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028865
18149	NC_018612	CGCC	2	8	698745	698752	0 %	0 %	25 %	75 %	406028865
18150	NC_018612	GCC	2	6	698757	698762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028865
18151	NC_018612	GGC	2	6	698780	698785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028865
18152	NC_018612	CGT	2	6	698791	698796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028865
18153	NC_018612	CGT	3	9	698819	698827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028865
18154	NC_018612	CAG	2	6	698834	698839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028865
18155	NC_018612	GCCG	2	8	698924	698931	0 %	0 %	50 %	50 %	406028865
18156	NC_018612	CGT	2	6	698950	698955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028865
18157	NC_018612	CT	3	6	699000	699005	0 %	50 %	0 %	50 %	406028865
18158	NC_018612	GAT	2	6	699039	699044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028866
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18160	NC_018612	GGT	2	6	699090	699095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028866
18161	NC_018612	GGT	2	6	699126	699131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028866
18162	NC_018612	GCC	2	6	699180	699185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028866
18163	NC_018612	GTTGAC	2	12	699186	699197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406028866
18164	NC_018612	ACA	2	6	699233	699238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028866
18165	NC_018612	CGA	2	6	699266	699271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18166	NC_018612	GGT	2	6	699341	699346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028866
18167	NC_018612	GC	3	6	699388	699393	0 %	0 %	50 %	50 %	406028866
18168	NC_018612	GCCTTG	2	12	699409	699420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18169	NC_018612	TCCA	2	8	699427	699434	25 %	25 %	0 %	50 %	406028866
18170	NC_018612	GCC	2	6	699442	699447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028866
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18173	NC_018612	GC	3	6	699512	699517	0 %	0 %	50 %	50 %	406028866
18174	NC_018612	GTC	2	6	699532	699537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18175	NC_018612	GCT	2	6	699584	699589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
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18177	NC_018612	TCG	2	6	699691	699696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18178	NC_018612	GCCGC	2	10	699714	699723	0 %	0 %	40 %	60 %	406028866
18179	NC_018612	CGG	3	9	699737	699745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028866
18180	NC_018612	ACG	2	6	699773	699778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18181	NC_018612	TGC	2	6	699791	699796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18182	NC_018612	CGG	2	6	699875	699880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028866
18183	NC_018612	CTG	2	6	699909	699914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18184	NC_018612	CCA	2	6	699971	699976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028866
18185	NC_018612	TGT	2	6	699995	700000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028866
18186	NC_018612	GCC	2	6	700029	700034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028866
18187	NC_018612	TGCC	2	8	700064	700071	0 %	25 %	25 %	50 %	406028866
18188	NC_018612	GCACC	2	10	700091	700100	20 %	0 %	20 %	60 %	406028866
18189	NC_018612	CGA	2	6	700169	700174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028866
18190	NC_018612	CGC	2	6	700239	700244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18191	NC_018612	TCT	2	6	700456	700461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028867
18192	NC_018612	GGC	2	6	700476	700481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028867
18193	NC_018612	TCT	2	6	700561	700566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028867
18194	NC_018612	CAG	2	6	700572	700577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18195	NC_018612	CG	3	6	700612	700617	0 %	0 %	50 %	50 %	406028867
18196	NC_018612	CAC	2	6	700665	700670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028867
18197	NC_018612	ATC	2	6	700686	700691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028867
18198	NC_018612	CG	3	6	700693	700698	0 %	0 %	50 %	50 %	406028867
18199	NC_018612	CGA	2	6	700730	700735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18200	NC_018612	CG	3	6	700746	700751	0 %	0 %	50 %	50 %	406028867
18201	NC_018612	GCC	2	6	700770	700775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028867
18202	NC_018612	TCG	2	6	700776	700781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18203	NC_018612	TCG	2	6	700795	700800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18204	NC_018612	CTG	2	6	700842	700847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028867
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18207	NC_018612	CGA	2	6	701006	701011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18208	NC_018612	CGA	3	9	701060	701068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18209	NC_018612	TTC	2	6	701076	701081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028867
18210	NC_018612	ACC	2	6	701112	701117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028867
18211	NC_018612	CACG	2	8	701129	701136	25 %	0 %	25 %	50 %	406028867
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18215	NC_018612	AAG	2	6	701292	701297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028867
18216	NC_018612	CGA	2	6	701336	701341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028867
18217	NC_018612	CAT	2	6	701372	701377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028867
18218	NC_018612	GGC	2	6	701406	701411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028867
18219	NC_018612	ACT	2	6	701422	701427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028867
18220	NC_018612	GGC	2	6	701604	701609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
18221	NC_018612	ACA	2	6	701643	701648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028868
18222	NC_018612	CGT	2	6	701661	701666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028868
18223	NC_018612	CGG	2	6	701712	701717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
18224	NC_018612	CGG	2	6	701748	701753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
18225	NC_018612	CAG	2	6	701881	701886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028868
18226	NC_018612	GGCG	2	8	701898	701905	0 %	0 %	75 %	25 %	406028868
18227	NC_018612	GCG	2	6	701915	701920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
18228	NC_018612	CGGC	2	8	701988	701995	0 %	0 %	50 %	50 %	406028868
18229	NC_018612	GTCGGC	2	12	702010	702021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028868
18230	NC_018612	GAT	2	6	702042	702047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028868
18231	NC_018612	CCG	2	6	702053	702058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028868
18232	NC_018612	GGT	2	6	702066	702071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028868
18233	NC_018612	GTG	2	6	702073	702078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028868
18234	NC_018612	CGG	2	6	702090	702095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
18235	NC_018612	GGT	2	6	702102	702107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028868
18236	NC_018612	CGA	2	6	702132	702137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028868
18237	NC_018612	TGG	2	6	702254	702259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028868
18238	NC_018612	CCG	2	6	702278	702283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028868
18239	NC_018612	GCAA	2	8	702299	702306	50 %	0 %	25 %	25 %	406028868
18240	NC_018612	TGG	2	6	702386	702391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028868
18241	NC_018612	GGC	2	6	702407	702412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028868
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18243	NC_018612	GCC	2	6	702477	702482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028868
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18250	NC_018612	CCG	2	6	702758	702763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028869
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18253	NC_018612	GCA	2	6	702917	702922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028869
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18272	NC_018612	GCT	2	6	703502	703507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028869
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18280	NC_018612	GCG	2	6	703717	703722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028869
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18284	NC_018612	CG	3	6	703839	703844	0 %	0 %	50 %	50 %	406028870
18285	NC_018612	AACC	2	8	703862	703869	50 %	0 %	0 %	50 %	406028870
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18290	NC_018612	CGAC	2	8	704019	704026	25 %	0 %	25 %	50 %	406028870
18291	NC_018612	CGA	2	6	704056	704061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028870
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18294	NC_018612	CGT	2	6	704140	704145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028870
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18297	NC_018612	GACGCC	2	12	704324	704335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028870
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18300	NC_018612	CTT	2	6	704368	704373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028870
18301	NC_018612	GGC	2	6	704386	704391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028870
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18303	NC_018612	CCG	2	6	704438	704443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028870
18304	NC_018612	GCCGA	2	10	704468	704477	20 %	0 %	40 %	40 %	406028870
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18308	NC_018612	CAC	2	6	704769	704774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028871
18309	NC_018612	TCA	2	6	704810	704815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028871
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18313	NC_018612	GGTGA	2	10	705034	705043	20 %	20 %	60 %	0 %	406028871
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18316	NC_018612	TCG	2	6	705179	705184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028872
18317	NC_018612	GCC	2	6	705238	705243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028872
18318	NC_018612	GAC	2	6	705265	705270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028872
18319	NC_018612	ACC	2	6	705304	705309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028872
18320	NC_018612	CAA	2	6	705324	705329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028872
18321	NC_018612	CG	3	6	705346	705351	0 %	0 %	50 %	50 %	406028872
18322	NC_018612	TTC	2	6	705373	705378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028872
18323	NC_018612	CGG	3	9	705393	705401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028872
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18331	NC_018612	GAT	2	6	705621	705626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028872
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18333	NC_018612	CTG	2	6	705801	705806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028872
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18335	NC_018612	AGC	2	6	705869	705874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028872
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18337	NC_018612	GGC	3	9	705891	705899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028872
18338	NC_018612	CTA	2	6	705936	705941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028872
18339	NC_018612	GTC	2	6	705973	705978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028872
18340	NC_018612	CAG	2	6	705982	705987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028872
18341	NC_018612	CCG	2	6	706028	706033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028872
18342	NC_018612	GGA	2	6	706074	706079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028872
18343	NC_018612	CGG	2	6	706140	706145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028872
18344	NC_018612	TGG	2	6	706167	706172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028872
18345	NC_018612	GTC	2	6	706327	706332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18346	NC_018612	CCG	2	6	706347	706352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18347	NC_018612	CGC	2	6	706504	706509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028873
18348	NC_018612	CG	3	6	706517	706522	0 %	0 %	50 %	50 %	406028873
18349	NC_018612	CGT	2	6	706603	706608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028873
18350	NC_018612	GCA	2	6	706646	706651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028873
18351	NC_018612	CCGG	2	8	706668	706675	0 %	0 %	50 %	50 %	406028873
18352	NC_018612	CAT	2	6	706680	706685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028873
18353	NC_018612	C	6	6	706701	706706	0 %	0 %	0 %	100 %	406028873
18354	NC_018612	GAC	2	6	706716	706721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028873
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18476	NC_018612	GTGGC	2	10	710639	710648	0 %	20 %	60 %	20 %	406028876
18477	NC_018612	GTG	2	6	710696	710701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028876
18478	NC_018612	CGA	2	6	710743	710748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028876
18479	NC_018612	TCG	2	6	710751	710756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028876
18480	NC_018612	TCGGT	2	10	710772	710781	0 %	40 %	40 %	20 %	406028876
18481	NC_018612	CAG	2	6	710830	710835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18482	NC_018612	CAT	2	6	710848	710853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18483	NC_018612	GTCGG	2	10	710879	710888	0 %	20 %	60 %	20 %	406028877
18484	NC_018612	GTT	2	6	710917	710922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028877
18485	NC_018612	CTGG	2	8	710932	710939	0 %	25 %	50 %	25 %	406028877
18486	NC_018612	ACC	2	6	711011	711016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028877
18487	NC_018612	CGC	2	6	711100	711105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028877
18488	NC_018612	GCC	2	6	711119	711124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028877
18489	NC_018612	CGCC	2	8	711147	711154	0 %	0 %	25 %	75 %	406028877
18490	NC_018612	CCG	2	6	711176	711181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028877
18491	NC_018612	GCG	2	6	711231	711236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028877
18492	NC_018612	CCA	2	6	711243	711248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028877
18493	NC_018612	CG	3	6	711270	711275	0 %	0 %	50 %	50 %	406028877
18494	NC_018612	TCG	2	6	711312	711317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028877
18495	NC_018612	CGG	2	6	711336	711341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028877
18496	NC_018612	CGA	2	6	711364	711369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028877
18497	NC_018612	ACC	2	6	711380	711385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028877
18498	NC_018612	ATC	3	9	711431	711439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028877
18499	NC_018612	CCG	2	6	711455	711460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028877
18500	NC_018612	CGCGA	2	10	711509	711518	20 %	0 %	40 %	40 %	406028877

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