MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17740	NC_018612	CG	3	6	684441	684446	0 %	0 %	50 %	50 %	406028849
17741	NC_018612	GAT	2	6	684469	684474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028849
17742	NC_018612	GCC	2	6	684511	684516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028849
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17744	NC_018612	CGA	2	6	684634	684639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028849
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17747	NC_018612	CCG	2	6	684789	684794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028849
17748	NC_018612	CGGGC	2	10	684806	684815	0 %	0 %	60 %	40 %	406028849
17749	NC_018612	CGTT	2	8	684833	684840	0 %	50 %	25 %	25 %	406028849
17750	NC_018612	CGC	2	6	684856	684861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028849
17751	NC_018612	TCG	2	6	684896	684901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028849
17752	NC_018612	CGT	2	6	684912	684917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028849
17753	NC_018612	CGC	2	6	684945	684950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028849
17754	NC_018612	TCT	2	6	685095	685100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028849
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17758	NC_018612	CGC	2	6	685206	685211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028849
17759	NC_018612	GCT	2	6	685239	685244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028849
17760	NC_018612	CCGG	2	8	685303	685310	0 %	0 %	50 %	50 %	406028849
17761	NC_018612	CTC	2	6	685330	685335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028849
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17764	NC_018612	GCG	2	6	685359	685364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028849
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17767	NC_018612	TCG	2	6	685476	685481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028849
17768	NC_018612	GTC	3	9	685540	685548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028849
17769	NC_018612	AGATCC	2	12	685550	685561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406028849
17770	NC_018612	GCC	2	6	685599	685604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17771	NC_018612	CGA	2	6	685625	685630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17772	NC_018612	TCG	2	6	685696	685701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17773	NC_018612	CGGG	2	8	685713	685720	0 %	0 %	75 %	25 %	406028850
17774	NC_018612	TCG	2	6	685756	685761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17775	NC_018612	CCG	2	6	685775	685780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
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17778	NC_018612	GCCG	2	8	685890	685897	0 %	0 %	50 %	50 %	406028850
17779	NC_018612	GGC	3	9	685947	685955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028850
17780	NC_018612	GCC	2	6	685960	685965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17781	NC_018612	GTC	2	6	685968	685973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17782	NC_018612	GCA	2	6	686003	686008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17783	NC_018612	GGT	2	6	686079	686084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028850
17784	NC_018612	CGT	3	9	686099	686107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17785	NC_018612	CGATGT	2	12	686165	686176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406028850
17786	NC_018612	GCC	2	6	686221	686226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17787	NC_018612	GAT	2	6	686276	686281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028850
17788	NC_018612	GC	4	8	686351	686358	0 %	0 %	50 %	50 %	406028850
17789	NC_018612	AGGTG	2	10	686369	686378	20 %	20 %	60 %	0 %	406028850
17790	NC_018612	GTC	2	6	686469	686474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
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17793	NC_018612	GC	3	6	686531	686536	0 %	0 %	50 %	50 %	406028850
17794	NC_018612	TGC	2	6	686549	686554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17795	NC_018612	GGT	2	6	686559	686564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028850
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17798	NC_018612	GGC	2	6	686619	686624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028850
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17800	NC_018612	ATCG	2	8	686682	686689	25 %	25 %	25 %	25 %	406028850
17801	NC_018612	GCC	2	6	686722	686727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17802	NC_018612	CGG	2	6	686822	686827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028850
17803	NC_018612	GTG	2	6	686865	686870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028850
17804	NC_018612	CAGG	2	8	686877	686884	25 %	0 %	50 %	25 %	406028850
17805	NC_018612	CCA	2	6	686885	686890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028850
17806	NC_018612	GCC	3	9	686959	686967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17807	NC_018612	TCG	2	6	686980	686985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17808	NC_018612	CGC	2	6	686991	686996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028850
17809	NC_018612	CGT	2	6	687029	687034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028850
17810	NC_018612	GC	3	6	687048	687053	0 %	0 %	50 %	50 %	406028850
17811	NC_018612	GGT	2	6	687090	687095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028850
17812	NC_018612	CGG	2	6	687113	687118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17813	NC_018612	GAG	2	6	687170	687175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028851
17814	NC_018612	CCTG	2	8	687321	687328	0 %	25 %	25 %	50 %	406028851
17815	NC_018612	CGG	2	6	687346	687351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028851
17816	NC_018612	GAG	2	6	687389	687394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028851
17817	NC_018612	GAG	2	6	687437	687442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028851
17818	NC_018612	CTG	2	6	687443	687448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17819	NC_018612	AGC	4	12	687480	687491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17820	NC_018612	ACC	2	6	687581	687586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028851
17821	NC_018612	GTG	2	6	687658	687663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028851
17822	NC_018612	CG	3	6	687673	687678	0 %	0 %	50 %	50 %	406028851
17823	NC_018612	CTG	2	6	687719	687724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17824	NC_018612	ATC	2	6	687761	687766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028851
17825	NC_018612	TTC	2	6	687800	687805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028851
17826	NC_018612	GAC	2	6	687806	687811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17827	NC_018612	TGG	2	6	687831	687836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028851
17828	NC_018612	GCG	2	6	687891	687896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028851
17829	NC_018612	CAA	2	6	687911	687916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028851
17830	NC_018612	GAC	2	6	687977	687982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17831	NC_018612	AGC	2	6	688065	688070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17832	NC_018612	TGT	2	6	688095	688100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028851
17833	NC_018612	CGT	2	6	688141	688146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17834	NC_018612	CGA	2	6	688183	688188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028851
17835	NC_018612	CTGTTC	2	12	688199	688210	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	406028851
17836	NC_018612	CGG	2	6	688231	688236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028851
17837	NC_018612	CAT	2	6	688258	688263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028851
17838	NC_018612	GGT	3	9	688359	688367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028852
17839	NC_018612	GCC	3	9	688375	688383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028852
17840	NC_018612	CGGCG	2	10	688395	688404	0 %	0 %	60 %	40 %	406028852
17841	NC_018612	CG	3	6	688407	688412	0 %	0 %	50 %	50 %	406028852
17842	NC_018612	GTG	2	6	688438	688443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028852
17843	NC_018612	ACC	2	6	688451	688456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028852
17844	NC_018612	AGC	2	6	688484	688489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028852
17845	NC_018612	CGC	2	6	688491	688496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028852
17846	NC_018612	ACC	2	6	688573	688578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028852
17847	NC_018612	CAA	2	6	688608	688613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028852
17848	NC_018612	CGG	2	6	688623	688628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028852
17849	NC_018612	GTC	2	6	688639	688644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028852
17850	NC_018612	CGA	2	6	688653	688658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028852
17851	NC_018612	TGACGT	2	12	688682	688693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406028852
17852	NC_018612	TGC	2	6	688697	688702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028852
17853	NC_018612	CG	4	8	688709	688716	0 %	0 %	50 %	50 %	406028852
17854	NC_018612	GCGCT	2	10	688717	688726	0 %	20 %	40 %	40 %	406028852
17855	NC_018612	CAC	2	6	688739	688744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028852
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17977	NC_018612	GTG	2	6	692987	692992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028857
17978	NC_018612	CGC	2	6	693021	693026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028857
17979	NC_018612	ATC	2	6	693035	693040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028857
17980	NC_018612	CACCC	2	10	693048	693057	20 %	0 %	0 %	80 %	406028857
17981	NC_018612	CAC	2	6	693100	693105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028857
17982	NC_018612	ATC	2	6	693185	693190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028857
17983	NC_018612	GGC	2	6	693256	693261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028857
17984	NC_018612	TGG	2	6	693303	693308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028857
17985	NC_018612	GCCC	2	8	693327	693334	0 %	0 %	25 %	75 %	406028857
17986	NC_018612	GC	3	6	693358	693363	0 %	0 %	50 %	50 %	406028857
17987	NC_018612	ACCCA	2	10	693371	693380	40 %	0 %	0 %	60 %	406028857
17988	NC_018612	CAC	2	6	693391	693396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028857
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17990	NC_018612	TCA	2	6	693444	693449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028857
17991	NC_018612	TC	3	6	693455	693460	0 %	50 %	0 %	50 %	406028858
17992	NC_018612	GATC	2	8	693479	693486	25 %	25 %	25 %	25 %	406028858
17993	NC_018612	CCG	2	6	693637	693642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028858
17994	NC_018612	CCCA	2	8	693781	693788	25 %	0 %	0 %	75 %	406028858
17995	NC_018612	TGC	2	6	693856	693861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028858
17996	NC_018612	CAC	2	6	693921	693926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028858
17997	NC_018612	GGC	2	6	693929	693934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028858
17998	NC_018612	CAG	2	6	694020	694025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028858
17999	NC_018612	TGC	2	6	694181	694186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028858
18000	NC_018612	CCT	2	6	694198	694203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028859

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