MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_018612	GAGC	2	8	640130	640137	25 %	0 %	50 %	25 %	406028802
16502	NC_018612	GC	3	6	640148	640153	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16503	NC_018612	C	6	6	640183	640188	0 %	0 %	0 %	100 %	406028802
16504	NC_018612	CG	3	6	640249	640254	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16505	NC_018612	CGA	2	6	640262	640267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028802
16506	NC_018612	CAT	2	6	640274	640279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028802
16507	NC_018612	GAA	2	6	640290	640295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028802
16508	NC_018612	GCC	2	6	640304	640309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16509	NC_018612	CCG	2	6	640317	640322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16510	NC_018612	CCG	3	9	640407	640415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16511	NC_018612	AACCCG	2	12	640453	640464	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	406028802
16512	NC_018612	CCG	2	6	640476	640481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16513	NC_018612	GCA	2	6	640579	640584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028802
16514	NC_018612	CGG	2	6	640615	640620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16515	NC_018612	GCGG	3	12	640617	640628	0 %	0 %	75 %	25 %	406028802
16516	NC_018612	GC	3	6	640631	640636	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16517	NC_018612	CGA	2	6	640652	640657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028802
16518	NC_018612	GCC	2	6	640762	640767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16519	NC_018612	CGG	2	6	640786	640791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16520	NC_018612	GCC	2	6	640850	640855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16521	NC_018612	CGC	2	6	640858	640863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16522	NC_018612	GCA	2	6	640877	640882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028802
16523	NC_018612	GCCC	2	8	640885	640892	0 %	0 %	25 %	75 %	406028802
16524	NC_018612	GC	3	6	640897	640902	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16525	NC_018612	CGC	3	9	640906	640914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16526	NC_018612	GCC	3	9	640922	640930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16527	NC_018612	CGG	2	6	640955	640960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16528	NC_018612	GCC	2	6	640986	640991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16529	NC_018612	GA	3	6	640993	640998	50 %	0 %	50 %	0 %	406028802
16530	NC_018612	GGC	2	6	641010	641015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16531	NC_018612	CTG	2	6	641031	641036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028802
16532	NC_018612	CGGC	2	8	641066	641073	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16533	NC_018612	CGC	3	9	641076	641084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16534	NC_018612	TGG	2	6	641165	641170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_018612	GAAC	2	8	641176	641183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16536	NC_018612	GTC	2	6	641198	641203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_018612	ATC	2	6	641253	641258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028803
16538	NC_018612	CCG	2	6	641260	641265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028803
16539	NC_018612	GC	3	6	641300	641305	0 %	0 %	50 %	50 %	406028803
16540	NC_018612	CGT	2	6	641312	641317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16541	NC_018612	GCC	2	6	641365	641370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028803
16542	NC_018612	CGC	2	6	641392	641397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028803
16543	NC_018612	CGC	2	6	641405	641410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028803
16544	NC_018612	CGA	2	6	641612	641617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16545	NC_018612	CAG	2	6	641624	641629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16546	NC_018612	CGG	2	6	641656	641661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028803
16547	NC_018612	CGA	2	6	641663	641668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16548	NC_018612	GC	3	6	641819	641824	0 %	0 %	50 %	50 %	406028803
16549	NC_018612	GCT	2	6	641843	641848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16550	NC_018612	CGA	2	6	641864	641869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16551	NC_018612	GGC	2	6	641877	641882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028803
16552	NC_018612	TCG	2	6	641896	641901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16553	NC_018612	GCG	2	6	641916	641921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028803
16554	NC_018612	CG	4	8	641969	641976	0 %	0 %	50 %	50 %	406028803
16555	NC_018612	CGC	3	9	641981	641989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028803
16556	NC_018612	GGC	2	6	642005	642010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028803
16557	NC_018612	GC	4	8	642074	642081	0 %	0 %	50 %	50 %	406028803
16558	NC_018612	C	6	6	642085	642090	0 %	0 %	0 %	100 %	406028803
16559	NC_018612	CGT	2	6	642095	642100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028803
16560	NC_018612	GGCG	2	8	642145	642152	0 %	0 %	75 %	25 %	406028804
16561	NC_018612	GCC	2	6	642216	642221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028804
16562	NC_018612	CCA	2	6	642237	642242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028804
16563	NC_018612	GC	3	6	642246	642251	0 %	0 %	50 %	50 %	406028804
16564	NC_018612	ACG	2	6	642255	642260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028804
16565	NC_018612	GCGG	2	8	642277	642284	0 %	0 %	75 %	25 %	406028804
16566	NC_018612	GGT	2	6	642304	642309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028804
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16569	NC_018612	GC	3	6	642403	642408	0 %	0 %	50 %	50 %	406028804
16570	NC_018612	GCC	2	6	642440	642445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028804
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16572	NC_018612	GCC	2	6	642494	642499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028804
16573	NC_018612	GCC	2	6	642510	642515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028804
16574	NC_018612	CCCA	2	8	642521	642528	25 %	0 %	0 %	75 %	406028804
16575	NC_018612	CGT	2	6	642547	642552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028804
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16579	NC_018612	TGA	2	6	642621	642626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028804
16580	NC_018612	GTC	2	6	642665	642670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028804
16581	NC_018612	GTC	2	6	642709	642714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028804
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16587	NC_018612	GCCC	2	8	642904	642911	0 %	0 %	25 %	75 %	406028804
16588	NC_018612	GCT	2	6	642925	642930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028804
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16606	NC_018612	CGA	2	6	643631	643636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028806
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16609	NC_018612	GCT	2	6	643772	643777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028806
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16611	NC_018612	GGC	2	6	643826	643831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028806
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16617	NC_018612	TGCA	2	8	644040	644047	25 %	25 %	25 %	25 %	406028806
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16739	NC_018612	ACG	2	6	648734	648739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028810
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16741	NC_018612	CGA	2	6	648780	648785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028810
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16842	NC_018612	ATG	2	6	652604	652609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16846	NC_018612	GCC	2	6	652730	652735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16979	NC_018612	TGC	2	6	657793	657798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028820
16980	NC_018612	GC	3	6	657797	657802	0 %	0 %	50 %	50 %	406028820
16981	NC_018612	GAG	2	6	657813	657818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028820
16982	NC_018612	CGA	2	6	657820	657825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028820
16983	NC_018612	CGC	2	6	657834	657839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028820
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