MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018612	CGC	2	6	623492	623497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028783
16003	NC_018612	GCC	2	6	623502	623507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028783
16004	NC_018612	ACG	2	6	623512	623517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16005	NC_018612	TGC	2	6	623524	623529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16006	NC_018612	CGA	2	6	623543	623548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16007	NC_018612	TGC	2	6	623563	623568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16008	NC_018612	CCG	2	6	623625	623630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028783
16009	NC_018612	GCCG	2	8	623635	623642	0 %	0 %	50 %	50 %	406028783
16010	NC_018612	TTG	2	6	623643	623648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028783
16011	NC_018612	ACG	2	6	623671	623676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16012	NC_018612	ACCCGG	2	12	623736	623747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028783
16013	NC_018612	GCT	2	6	623768	623773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16014	NC_018612	CGG	2	6	623786	623791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028783
16015	NC_018612	ACCGCG	2	12	623817	623828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028783
16016	NC_018612	GGA	2	6	623834	623839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028783
16017	NC_018612	CGC	2	6	623861	623866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028783
16018	NC_018612	GGCG	2	8	623888	623895	0 %	0 %	75 %	25 %	406028783
16019	NC_018612	GCG	3	9	623939	623947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028783
16020	NC_018612	GCT	2	6	623963	623968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16021	NC_018612	GGCG	2	8	623969	623976	0 %	0 %	75 %	25 %	406028783
16022	NC_018612	G	6	6	624007	624012	0 %	0 %	100 %	0 %	406028783
16023	NC_018612	GCG	2	6	624046	624051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028783
16024	NC_018612	GTC	2	6	624062	624067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028783
16025	NC_018612	CGA	2	6	624074	624079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028783
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16027	NC_018612	GCC	2	6	624094	624099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028783
16028	NC_018612	GCC	2	6	624154	624159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16029	NC_018612	CCGC	2	8	624169	624176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16030	NC_018612	CTG	2	6	624269	624274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028784
16031	NC_018612	CGG	2	6	624276	624281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028784
16032	NC_018612	CGC	2	6	624340	624345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028784
16033	NC_018612	CTG	2	6	624365	624370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028784
16034	NC_018612	CG	3	6	624419	624424	0 %	0 %	50 %	50 %	406028784
16035	NC_018612	ATC	2	6	624472	624477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028784
16036	NC_018612	TCG	2	6	624485	624490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028784
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16040	NC_018612	GCT	2	6	624589	624594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028784
16041	NC_018612	GCT	2	6	624640	624645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028784
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16046	NC_018612	GCG	2	6	624836	624841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_018612	CGC	2	6	624845	624850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_018612	CCGG	2	8	624854	624861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_018612	CGG	2	6	624880	624885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028785
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16052	NC_018612	G	6	6	624969	624974	0 %	0 %	100 %	0 %	406028785
16053	NC_018612	CGT	2	6	625057	625062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028785
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16057	NC_018612	CGA	3	9	625156	625164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028785
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16072	NC_018612	CGAT	2	8	625561	625568	25 %	25 %	25 %	25 %	406028785
16073	NC_018612	CGG	2	6	625569	625574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028785
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16075	NC_018612	CCGT	2	8	625633	625640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16101	NC_018612	GGTT	2	8	626621	626628	0 %	50 %	50 %	0 %	406028787
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16110	NC_018612	CCGTC	2	10	626853	626862	0 %	20 %	20 %	60 %	406028787
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16113	NC_018612	GTC	2	6	626921	626926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_018612	AGCAA	2	10	626951	626960	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16115	NC_018612	TA	3	6	626981	626986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_018612	AT	3	6	626992	626997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_018612	GCCG	2	8	627100	627107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16118	NC_018612	TCA	2	6	627115	627120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_018612	TCG	2	6	627170	627175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16240	NC_018612	TCG	2	6	631421	631426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16241	NC_018612	CCGGC	2	10	631460	631469	0 %	0 %	40 %	60 %	406028792
16242	NC_018612	GC	3	6	631555	631560	0 %	0 %	50 %	50 %	406028792
16243	NC_018612	AGC	2	6	631572	631577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16244	NC_018612	CAG	2	6	631618	631623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16245	NC_018612	GCC	2	6	631633	631638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028792
16246	NC_018612	GCA	2	6	631693	631698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16247	NC_018612	CGA	2	6	631722	631727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16248	NC_018612	CGG	2	6	631779	631784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028792
16249	NC_018612	TCG	2	6	631826	631831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16250	NC_018612	ATG	2	6	631862	631867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028792
16251	NC_018612	CGTCC	2	10	631899	631908	0 %	20 %	20 %	60 %	406028792
16252	NC_018612	CAC	2	6	631930	631935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028792
16253	NC_018612	GGT	2	6	631942	631947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028792
16254	NC_018612	GCC	2	6	631963	631968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028792
16255	NC_018612	CGACAG	2	12	631981	631992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
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16257	NC_018612	CGGAC	2	10	632023	632032	20 %	0 %	40 %	40 %	406028792
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16259	NC_018612	GGTG	2	8	632143	632150	0 %	25 %	75 %	0 %	406028792
16260	NC_018612	CAT	2	6	632191	632196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028792
16261	NC_018612	CAT	2	6	632224	632229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028792
16262	NC_018612	GC	3	6	632247	632252	0 %	0 %	50 %	50 %	406028792
16263	NC_018612	CAG	2	6	632296	632301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
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16265	NC_018612	GCC	2	6	632387	632392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028792
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16268	NC_018612	GTG	2	6	632440	632445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028792
16269	NC_018612	TCG	2	6	632462	632467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16270	NC_018612	CGA	2	6	632487	632492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028792
16271	NC_018612	GC	3	6	632577	632582	0 %	0 %	50 %	50 %	406028792
16272	NC_018612	TCA	2	6	632583	632588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028792
16273	NC_018612	CTG	2	6	632646	632651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028793
16274	NC_018612	ATC	2	6	632674	632679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028793
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16281	NC_018612	TCGGCG	2	12	633055	633066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028793
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16283	NC_018612	TCG	2	6	633131	633136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028793
16284	NC_018612	CG	3	6	633143	633148	0 %	0 %	50 %	50 %	406028793
16285	NC_018612	GCG	2	6	633152	633157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028793
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16290	NC_018612	CGT	2	6	633275	633280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028793
16291	NC_018612	CCG	2	6	633352	633357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028793
16292	NC_018612	TGG	2	6	633415	633420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028793
16293	NC_018612	CAC	2	6	633462	633467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028793
16294	NC_018612	CTA	2	6	633521	633526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16295	NC_018612	GTTGG	2	10	633530	633539	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16296	NC_018612	GCA	2	6	633599	633604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16297	NC_018612	CG	4	8	633652	633659	0 %	0 %	50 %	50 %	406028794
16298	NC_018612	GGT	2	6	633680	633685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028794
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16300	NC_018612	ATC	2	6	633765	633770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028794
16301	NC_018612	CGGTG	2	10	633797	633806	0 %	20 %	60 %	20 %	406028794
16302	NC_018612	GAAG	2	8	633822	633829	50 %	0 %	50 %	0 %	406028794
16303	NC_018612	ACG	2	6	633880	633885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028794
16304	NC_018612	GC	3	6	633949	633954	0 %	0 %	50 %	50 %	406028794
16305	NC_018612	GC	3	6	634011	634016	0 %	0 %	50 %	50 %	406028794
16306	NC_018612	TAC	2	6	634017	634022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028794
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16308	NC_018612	CGT	2	6	634047	634052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028795
16309	NC_018612	GTG	2	6	634065	634070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028795
16310	NC_018612	CGC	2	6	634109	634114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028795
16311	NC_018612	TGG	2	6	634123	634128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028795
16312	NC_018612	GAT	2	6	634234	634239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16313	NC_018612	TGA	2	6	634240	634245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028796
16314	NC_018612	GTG	2	6	634287	634292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028796
16315	NC_018612	TTC	2	6	634308	634313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028796
16316	NC_018612	CGA	2	6	634322	634327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028796
16317	NC_018612	GC	3	6	634396	634401	0 %	0 %	50 %	50 %	406028796
16318	NC_018612	CGA	2	6	634406	634411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028796
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16322	NC_018612	CGT	2	6	634553	634558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028796
16323	NC_018612	GCA	2	6	634567	634572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028796
16324	NC_018612	GCT	2	6	634583	634588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028796
16325	NC_018612	GCT	4	12	634604	634615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028796
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16328	NC_018612	AGC	2	6	634693	634698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028796
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16332	NC_018612	GCT	2	6	634871	634876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028796
16333	NC_018612	CG	3	6	634881	634886	0 %	0 %	50 %	50 %	406028796
16334	NC_018612	GGCG	2	8	634889	634896	0 %	0 %	75 %	25 %	406028796
16335	NC_018612	TTC	2	6	634911	634916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028796
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16340	NC_018612	TCG	2	6	635020	635025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028796
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16342	NC_018612	GCGCG	2	10	635051	635060	0 %	0 %	60 %	40 %	406028796
16343	NC_018612	GCG	2	6	635068	635073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028796
16344	NC_018612	ACG	2	6	635077	635082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028796
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16347	NC_018612	CGGCC	2	10	635199	635208	0 %	0 %	40 %	60 %	406028796
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16354	NC_018612	CAT	2	6	635477	635482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028796
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16357	NC_018612	GGC	2	6	635534	635539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028796
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16359	NC_018612	GGA	2	6	635624	635629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028796
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16479	NC_018612	TGGG	2	8	639397	639404	0 %	25 %	75 %	0 %	406028801
16480	NC_018612	CTG	2	6	639406	639411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028801
16481	NC_018612	GCC	3	9	639445	639453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028801
16482	NC_018612	ACC	2	6	639460	639465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028801
16483	NC_018612	GGT	2	6	639471	639476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028801
16484	NC_018612	GGC	2	6	639477	639482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028801
16485	NC_018612	GC	3	6	639488	639493	0 %	0 %	50 %	50 %	406028801
16486	NC_018612	TGG	2	6	639500	639505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028801
16487	NC_018612	CGC	2	6	639507	639512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028801
16488	NC_018612	TGC	2	6	639529	639534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028801
16489	NC_018612	CGACC	2	10	639546	639555	20 %	0 %	20 %	60 %	406028801
16490	NC_018612	GCG	2	6	639560	639565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028801
16491	NC_018612	CGAT	2	8	639586	639593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16492	NC_018612	CGG	2	6	639594	639599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16493	NC_018612	GCG	2	6	639698	639703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16494	NC_018612	CGG	2	6	639704	639709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028802
16495	NC_018612	GGGT	2	8	639720	639727	0 %	25 %	75 %	0 %	406028802
16496	NC_018612	CTC	2	6	639798	639803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028802
16497	NC_018612	CGC	2	6	639867	639872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16498	NC_018612	GC	3	6	640010	640015	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802
16499	NC_018612	GCC	2	6	640020	640025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028802
16500	NC_018612	GC	3	6	640043	640048	0 %	0 %	50 %	50 %	406028802

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