MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018612	ACG	2	6	38179	38184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028214
1002	NC_018612	CGG	2	6	38195	38200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028214
1003	NC_018612	CGG	2	6	38242	38247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028214
1004	NC_018612	CGC	2	6	38258	38263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028214
1005	NC_018612	CG	3	6	38298	38303	0 %	0 %	50 %	50 %	406028214
1006	NC_018612	GC	3	6	38307	38312	0 %	0 %	50 %	50 %	406028214
1007	NC_018612	CCA	2	6	38353	38358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028214
1008	NC_018612	GAG	2	6	38388	38393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028214
1009	NC_018612	GCC	2	6	38398	38403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028214
1010	NC_018612	CGT	2	6	38435	38440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028214
1011	NC_018612	CCA	2	6	38465	38470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028214
1012	NC_018612	CTG	2	6	38478	38483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028214
1013	NC_018612	CCG	2	6	38526	38531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028214
1014	NC_018612	GCG	2	6	38559	38564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028214
1015	NC_018612	GCC	2	6	38578	38583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028214
1016	NC_018612	CG	3	6	38648	38653	0 %	0 %	50 %	50 %	406028214
1017	NC_018612	CAC	2	6	38675	38680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028214
1018	NC_018612	CAG	2	6	38685	38690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028214
1019	NC_018612	ACG	2	6	38695	38700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028214
1020	NC_018612	CAA	2	6	38780	38785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028214
1021	NC_018612	CAA	2	6	38840	38845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028214
1022	NC_018612	CCG	2	6	38855	38860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028214
1023	NC_018612	ACG	2	6	38899	38904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018612	AAC	2	6	38926	38931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028215
1025	NC_018612	CAGCG	2	10	39041	39050	20 %	0 %	40 %	40 %	406028215
1026	NC_018612	CG	3	6	39049	39054	0 %	0 %	50 %	50 %	406028215
1027	NC_018612	CGT	2	6	39101	39106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028215
1028	NC_018612	AGCA	2	8	39109	39116	50 %	0 %	25 %	25 %	406028215
1029	NC_018612	CTG	2	6	39165	39170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028215
1030	NC_018612	AGC	2	6	39175	39180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028215
1031	NC_018612	CGC	2	6	39188	39193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028215
1032	NC_018612	GTC	2	6	39195	39200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028215
1033	NC_018612	GC	3	6	39207	39212	0 %	0 %	50 %	50 %	406028215
1034	NC_018612	ACC	2	6	39264	39269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028215
1035	NC_018612	GCA	2	6	39271	39276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028215
1036	NC_018612	TGC	2	6	39302	39307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_018612	CGCC	2	8	39329	39336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1038	NC_018612	ACT	2	6	39337	39342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_018612	ACG	2	6	39422	39427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1040	NC_018612	CTG	2	6	39430	39435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1041	NC_018612	GTCC	2	8	39447	39454	0 %	25 %	25 %	50 %	406028216
1042	NC_018612	CCGA	2	8	39499	39506	25 %	0 %	25 %	50 %	406028216
1043	NC_018612	ACC	2	6	39529	39534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028216
1044	NC_018612	CCG	2	6	39570	39575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1045	NC_018612	CCG	2	6	39616	39621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1046	NC_018612	CCG	2	6	39652	39657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1047	NC_018612	GCG	3	9	39673	39681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1048	NC_018612	CAG	2	6	39715	39720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1049	NC_018612	GCA	2	6	39816	39821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1050	NC_018612	TGA	2	6	39842	39847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028216
1051	NC_018612	CGG	2	6	39866	39871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1052	NC_018612	GC	3	6	39874	39879	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
1053	NC_018612	CG	3	6	39919	39924	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
1054	NC_018612	GAC	2	6	39946	39951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1055	NC_018612	GCC	2	6	39973	39978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1056	NC_018612	ACG	2	6	39992	39997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1057	NC_018612	GCCG	2	8	40016	40023	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
1058	NC_018612	G	6	6	40023	40028	0 %	0 %	100 %	0 %	406028216
1059	NC_018612	CGG	2	6	40037	40042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1060	NC_018612	GCC	2	6	40075	40080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1061	NC_018612	GCT	2	6	40113	40118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1062	NC_018612	GTCG	2	8	40128	40135	0 %	25 %	50 %	25 %	406028216
1063	NC_018612	ATG	2	6	40136	40141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028216
1064	NC_018612	GAC	2	6	40159	40164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1065	NC_018612	CGG	3	9	40178	40186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1066	NC_018612	GGT	2	6	40243	40248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028216
1067	NC_018612	CGG	2	6	40286	40291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1068	NC_018612	CGG	2	6	40305	40310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1069	NC_018612	GCG	2	6	40325	40330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1070	NC_018612	GAA	2	6	40366	40371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028216
1071	NC_018612	GC	3	6	40400	40405	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
1072	NC_018612	CGA	2	6	40425	40430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1073	NC_018612	CCG	2	6	40514	40519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1074	NC_018612	GCG	2	6	40537	40542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1075	NC_018612	GCC	2	6	40549	40554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1076	NC_018612	CAA	2	6	40585	40590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028216
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1078	NC_018612	CCG	2	6	40783	40788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028216
1079	NC_018612	GCG	2	6	40789	40794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028216
1080	NC_018612	ACC	2	6	40827	40832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028216
1081	NC_018612	CGGC	2	8	40843	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
1082	NC_018612	TCG	2	6	40855	40860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028216
1083	NC_018612	ACC	2	6	40861	40866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028216
1084	NC_018612	CGG	2	6	40894	40899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_018612	GCC	2	6	40962	40967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028217
1086	NC_018612	CAT	2	6	40971	40976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028217
1087	NC_018612	CCGTC	2	10	41002	41011	0 %	20 %	20 %	60 %	406028217
1088	NC_018612	CGC	2	6	41018	41023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028217
1089	NC_018612	GCCG	2	8	41076	41083	0 %	0 %	50 %	50 %	406028217
1090	NC_018612	GCT	2	6	41087	41092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028217
1091	NC_018612	AGC	2	6	41116	41121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028217
1092	NC_018612	CGA	2	6	41167	41172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028217
1093	NC_018612	AGG	2	6	41191	41196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028217
1094	NC_018612	CGT	2	6	41216	41221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028217
1095	NC_018612	CGG	2	6	41302	41307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028218
1096	NC_018612	AT	3	6	41308	41313	50 %	50 %	0 %	0 %	406028218
1097	NC_018612	CGA	2	6	41425	41430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028218
1098	NC_018612	CCG	2	6	41457	41462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028218
1099	NC_018612	C	6	6	41472	41477	0 %	0 %	0 %	100 %	406028218
1100	NC_018612	CGC	2	6	41488	41493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028218
1101	NC_018612	GCC	2	6	41523	41528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028218
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1104	NC_018612	AAC	2	6	41652	41657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028219
1105	NC_018612	CG	4	8	41661	41668	0 %	0 %	50 %	50 %	406028219
1106	NC_018612	GC	3	6	41679	41684	0 %	0 %	50 %	50 %	406028219
1107	NC_018612	TCG	2	6	41688	41693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028219
1108	NC_018612	TGC	3	9	41697	41705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028219
1109	NC_018612	TGG	2	6	41803	41808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018612	TCGG	2	8	41815	41822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_018612	CCG	2	6	41950	41955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028220
1112	NC_018612	GCGG	2	8	42038	42045	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
1113	NC_018612	GACC	2	8	42050	42057	25 %	0 %	25 %	50 %	406028220
1114	NC_018612	GC	3	6	42060	42065	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
1115	NC_018612	GGC	2	6	42068	42073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028220
1116	NC_018612	GAG	2	6	42090	42095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
1117	NC_018612	CGA	2	6	42127	42132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028220
1118	NC_018612	C	6	6	42168	42173	0 %	0 %	0 %	100 %	406028220
1119	NC_018612	GCC	3	9	42174	42182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028220
1120	NC_018612	TGC	2	6	42229	42234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028220
1121	NC_018612	CGA	2	6	42251	42256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028220
1122	NC_018612	CGC	2	6	42274	42279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028220
1123	NC_018612	CCCG	2	8	42295	42302	0 %	0 %	25 %	75 %	406028220
1124	NC_018612	GGCG	2	8	42359	42366	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
1125	NC_018612	CCAC	2	8	42376	42383	25 %	0 %	0 %	75 %	406028220
1126	NC_018612	GAG	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
1127	NC_018612	GAG	2	6	42423	42428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
1128	NC_018612	GTC	2	6	42444	42449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028220
1129	NC_018612	GTC	2	6	42465	42470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028220
1130	NC_018612	CGAGCC	2	12	42488	42499	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028220
1131	NC_018612	GAG	2	6	42504	42509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
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1135	NC_018612	CGA	2	6	42560	42565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028220
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1139	NC_018612	GAG	2	6	42636	42641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
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1142	NC_018612	CG	3	6	42699	42704	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
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1148	NC_018612	GCCG	2	8	42827	42834	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
1149	NC_018612	GAG	2	6	42858	42863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028220
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1159	NC_018612	TCG	3	9	43333	43341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028220
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1167	NC_018612	CGA	2	6	43588	43593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1177	NC_018612	C	7	7	43962	43968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1239	NC_018612	CAC	2	6	45849	45854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028223
1240	NC_018612	CG	3	6	45860	45865	0 %	0 %	50 %	50 %	406028223
1241	NC_018612	CAC	2	6	45867	45872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028223
1242	NC_018612	CGA	2	6	45902	45907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028223
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1244	NC_018612	CAG	3	9	45939	45947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028223
1245	NC_018612	CGCC	2	8	45956	45963	0 %	0 %	25 %	75 %	406028223
1246	NC_018612	CGA	2	6	45992	45997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028223
1247	NC_018612	GGC	2	6	46004	46009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028223
1248	NC_018612	CGA	2	6	46022	46027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028223
1249	NC_018612	CGG	2	6	46036	46041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028223
1250	NC_018612	CAG	2	6	46077	46082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028223
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1252	NC_018612	CG	3	6	46137	46142	0 %	0 %	50 %	50 %	406028223
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1377	NC_018612	CGG	2	6	50787	50792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028227
1378	NC_018612	TGC	2	6	50807	50812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028227
1379	NC_018612	CCG	2	6	50883	50888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028227
1380	NC_018612	CCG	2	6	50951	50956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028227
1381	NC_018612	GGT	2	6	50961	50966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028227
1382	NC_018612	G	7	7	51001	51007	0 %	0 %	100 %	0 %	406028227
1383	NC_018612	CGA	2	6	51069	51074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028227
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1414	NC_018612	CAG	3	9	52326	52334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028228
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1416	NC_018612	TGA	2	6	52394	52399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028228
1417	NC_018612	CAG	2	6	52462	52467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_018612	GGCG	3	12	52482	52493	0 %	0 %	75 %	25 %	406028229
1419	NC_018612	GCCG	2	8	52498	52505	0 %	0 %	50 %	50 %	406028229
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1434	NC_018612	ACC	2	6	53144	53149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028230
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1454	NC_018612	CGG	2	6	54215	54220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028231
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1487	NC_018612	TCG	2	6	55396	55401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028231
1488	NC_018612	GGCC	2	8	55402	55409	0 %	0 %	50 %	50 %	406028231
1489	NC_018612	TCC	2	6	55432	55437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028231
1490	NC_018612	CGG	2	6	55463	55468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028231
1491	NC_018612	GC	3	6	55469	55474	0 %	0 %	50 %	50 %	406028231
1492	NC_018612	GCC	2	6	55489	55494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028231
1493	NC_018612	CAC	2	6	55530	55535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028231
1494	NC_018612	GC	3	6	55579	55584	0 %	0 %	50 %	50 %	406028231
1495	NC_018612	TCA	2	6	55601	55606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028231
1496	NC_018612	CGG	3	9	55624	55632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1497	NC_018612	ACG	2	6	55666	55671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028232
1498	NC_018612	TCGCC	2	10	55684	55693	0 %	20 %	20 %	60 %	406028232
1499	NC_018612	GTC	2	6	55736	55741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028232
1500	NC_018612	GCC	2	6	55818	55823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028232

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