MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
149001	NC_018612	CGG	2	6	5522272	5522277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033376
149002	NC_018612	GTG	2	6	5522320	5522325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149003	NC_018612	CGG	2	6	5522327	5522332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149004	NC_018612	TCG	2	6	5522338	5522343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149005	NC_018612	GTC	2	6	5522427	5522432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149006	NC_018612	TCG	2	6	5522476	5522481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149007	NC_018612	CGC	2	6	5522543	5522548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149008	NC_018612	GCCA	2	8	5522551	5522558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149009	NC_018612	TGA	2	6	5522582	5522587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149010	NC_018612	TGC	2	6	5522611	5522616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149011	NC_018612	GCG	2	6	5522622	5522627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149012	NC_018612	GGT	2	6	5522649	5522654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149013	NC_018612	GC	3	6	5522671	5522676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149014	NC_018612	CAG	2	6	5522718	5522723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149015	NC_018612	CGC	2	6	5522737	5522742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149016	NC_018612	GC	3	6	5522791	5522796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149017	NC_018612	CGG	2	6	5522810	5522815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149018	NC_018612	TCG	2	6	5522824	5522829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149019	NC_018612	GCC	2	6	5522833	5522838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149020	NC_018612	TTCC	2	8	5522908	5522915	0 %	50 %	0 %	50 %	406033377
149021	NC_018612	CGT	2	6	5522950	5522955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033377
149022	NC_018612	TCC	2	6	5522991	5522996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033377
149023	NC_018612	GGC	2	6	5522997	5523002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033377
149024	NC_018612	CGA	2	6	5523007	5523012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033377
149025	NC_018612	TCG	2	6	5523036	5523041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033377
149026	NC_018612	CGG	2	6	5523065	5523070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033377
149027	NC_018612	ACC	2	6	5523099	5523104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033377
149028	NC_018612	CGC	2	6	5523121	5523126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033377
149029	NC_018612	CGA	2	6	5523148	5523153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033377
149030	NC_018612	GGC	2	6	5523169	5523174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033377
149031	NC_018612	TCGG	2	8	5523180	5523187	0 %	25 %	50 %	25 %	406033377
149032	NC_018612	GCT	2	6	5523275	5523280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149033	NC_018612	CGT	2	6	5523355	5523360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033378
149034	NC_018612	AAC	2	6	5523362	5523367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033378
149035	NC_018612	CTG	2	6	5523442	5523447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033378
149036	NC_018612	GC	3	6	5523461	5523466	0 %	0 %	50 %	50 %	406033378
149037	NC_018612	CAT	2	6	5523469	5523474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033378
149038	NC_018612	C	6	6	5523511	5523516	0 %	0 %	0 %	100 %	406033378
149039	NC_018612	GGT	2	6	5523520	5523525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033378
149040	NC_018612	CGA	2	6	5523564	5523569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033378
149041	NC_018612	GCCC	2	8	5523573	5523580	0 %	0 %	25 %	75 %	406033378
149042	NC_018612	TCGCCG	2	12	5523581	5523592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406033378
149043	NC_018612	GAT	2	6	5523619	5523624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033378
149044	NC_018612	CG	3	6	5523706	5523711	0 %	0 %	50 %	50 %	406033378
149045	NC_018612	CAC	2	6	5523718	5523723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033378
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149047	NC_018612	GCC	2	6	5523744	5523749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033378
149048	NC_018612	GGTG	2	8	5523767	5523774	0 %	25 %	75 %	0 %	406033378
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149051	NC_018612	ACG	2	6	5523860	5523865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033378
149052	NC_018612	GC	3	6	5523867	5523872	0 %	0 %	50 %	50 %	406033378
149053	NC_018612	TCC	2	6	5523944	5523949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033378
149054	NC_018612	GTA	2	6	5523970	5523975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033378
149055	NC_018612	GTT	2	6	5524000	5524005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033378
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149057	NC_018612	GTT	2	6	5524032	5524037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033378
149058	NC_018612	CG	3	6	5524038	5524043	0 %	0 %	50 %	50 %	406033378
149059	NC_018612	CGG	2	6	5524089	5524094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033378
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149066	NC_018612	CG	3	6	5524401	5524406	0 %	0 %	50 %	50 %	406033378
149067	NC_018612	CGC	2	6	5524459	5524464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033378
149068	NC_018612	TCG	2	6	5524473	5524478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033378
149069	NC_018612	CCG	2	6	5524505	5524510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149070	NC_018612	CGA	2	6	5524526	5524531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033379
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149101	NC_018612	ATG	2	6	5525681	5525686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033380
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149115	NC_018612	GCA	2	6	5526246	5526251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033380
149116	NC_018612	CGA	2	6	5526303	5526308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033380
149117	NC_018612	GTG	2	6	5526317	5526322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033380
149118	NC_018612	TCG	2	6	5526359	5526364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033380
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149120	NC_018612	CGA	2	6	5526408	5526413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033380
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149225	NC_018612	GTC	2	6	5530062	5530067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033383
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149227	NC_018612	TGC	2	6	5530147	5530152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033383
149228	NC_018612	GC	3	6	5530172	5530177	0 %	0 %	50 %	50 %	406033383
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149230	NC_018612	CCG	2	6	5530270	5530275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
149231	NC_018612	GCC	2	6	5530315	5530320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
149232	NC_018612	GTG	2	6	5530359	5530364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033384
149233	NC_018612	GCC	2	6	5530368	5530373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
149234	NC_018612	GCC	2	6	5530404	5530409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
149235	NC_018612	CGC	2	6	5530430	5530435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
149236	NC_018612	CGA	2	6	5530457	5530462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033384
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149239	NC_018612	CGG	4	12	5530595	5530606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033384
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149244	NC_018612	AC	3	6	5530747	5530752	50 %	0 %	0 %	50 %	406033384
149245	NC_018612	CGA	3	9	5530877	5530885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033384
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149247	NC_018612	CGC	2	6	5530920	5530925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033384
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149251	NC_018612	GC	3	6	5531096	5531101	0 %	0 %	50 %	50 %	406033384
149252	NC_018612	GCG	2	6	5531137	5531142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033384
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149254	NC_018612	GCG	3	9	5531317	5531325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033384
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149257	NC_018612	CGA	2	6	5531405	5531410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033384
149258	NC_018612	ATC	2	6	5531466	5531471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033385
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149260	NC_018612	CCG	2	6	5531508	5531513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033385
149261	NC_018612	CGGC	2	8	5531521	5531528	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149262	NC_018612	GTC	2	6	5531564	5531569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149263	NC_018612	GCA	3	9	5531620	5531628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033385
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149270	NC_018612	TCG	2	6	5531910	5531915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149271	NC_018612	CGT	2	6	5531926	5531931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149272	NC_018612	GC	3	6	5532059	5532064	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
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149276	NC_018612	GGT	2	6	5532155	5532160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033385
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149284	NC_018612	CG	3	6	5532580	5532585	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149285	NC_018612	GCC	2	6	5532610	5532615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033385
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149290	NC_018612	CGG	3	9	5532775	5532783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033385
149291	NC_018612	TCG	2	6	5532807	5532812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149292	NC_018612	GC	3	6	5532816	5532821	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149293	NC_018612	GCC	2	6	5532834	5532839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033385
149294	NC_018612	CAC	2	6	5532960	5532965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033385
149295	NC_018612	GCCG	2	8	5532974	5532981	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149296	NC_018612	GCG	2	6	5532987	5532992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033385
149297	NC_018612	CA	3	6	5533007	5533012	50 %	0 %	0 %	50 %	406033385
149298	NC_018612	GC	4	8	5533013	5533020	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149299	NC_018612	TCG	2	6	5533047	5533052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149300	NC_018612	GTC	2	6	5533067	5533072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149301	NC_018612	CGA	2	6	5533096	5533101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033385
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149304	NC_018612	GC	3	6	5533186	5533191	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149305	NC_018612	GAT	2	6	5533199	5533204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033385
149306	NC_018612	CCGCG	2	10	5533205	5533214	0 %	0 %	40 %	60 %	406033385
149307	NC_018612	GA	3	6	5533247	5533252	50 %	0 %	50 %	0 %	406033385
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149309	NC_018612	GCCG	2	8	5533319	5533326	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149310	NC_018612	GC	3	6	5533348	5533353	0 %	0 %	50 %	50 %	406033385
149311	NC_018612	GCA	2	6	5533402	5533407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149312	NC_018612	CGGGC	2	10	5533409	5533418	0 %	0 %	60 %	40 %	406033385
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149315	NC_018612	GCG	2	6	5533452	5533457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033385
149316	NC_018612	GCC	2	6	5533478	5533483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033385
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149318	NC_018612	CCA	2	6	5533535	5533540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033385
149319	NC_018612	GGC	2	6	5533549	5533554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033385
149320	NC_018612	TCG	2	6	5533566	5533571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033385
149321	NC_018612	TGT	2	6	5533641	5533646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033385
149322	NC_018612	GCGG	2	8	5533670	5533677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149323	NC_018612	TGAC	2	8	5533686	5533693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149324	NC_018612	CGTCT	2	10	5533751	5533760	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149325	NC_018612	ACC	2	6	5533819	5533824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149326	NC_018612	GC	3	6	5533852	5533857	0 %	0 %	50 %	50 %	406033386
149327	NC_018612	CG	3	6	5533915	5533920	0 %	0 %	50 %	50 %	406033386
149328	NC_018612	CTC	2	6	5533926	5533931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033386
149329	NC_018612	CGC	2	6	5533967	5533972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033386
149330	NC_018612	GGT	2	6	5534005	5534010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033386
149331	NC_018612	GCT	2	6	5534063	5534068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033386
149332	NC_018612	GCG	2	6	5534086	5534091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033386
149333	NC_018612	TGC	2	6	5534164	5534169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033386
149334	NC_018612	CCG	2	6	5534206	5534211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033386
149335	NC_018612	GCGG	2	8	5534219	5534226	0 %	0 %	75 %	25 %	406033386
149336	NC_018612	CGA	2	6	5534282	5534287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033386
149337	NC_018612	TCG	2	6	5534317	5534322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033386
149338	NC_018612	GCG	2	6	5534323	5534328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033386
149339	NC_018612	GC	3	6	5534350	5534355	0 %	0 %	50 %	50 %	406033386
149340	NC_018612	CGG	2	6	5534370	5534375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033386
149341	NC_018612	ACC	2	6	5534385	5534390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033386
149342	NC_018612	CCG	3	9	5534424	5534432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033387
149343	NC_018612	CG	3	6	5534431	5534436	0 %	0 %	50 %	50 %	406033387
149344	NC_018612	GCC	2	6	5534485	5534490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033387
149345	NC_018612	GTC	2	6	5534503	5534508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033387
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149347	NC_018612	GC	3	6	5534538	5534543	0 %	0 %	50 %	50 %	406033387
149348	NC_018612	CGA	2	6	5534595	5534600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033387
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149352	NC_018612	CGG	2	6	5534886	5534891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033387
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