MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
146001	NC_018612	CAG	3	9	5412804	5412812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033273
146002	NC_018612	TTC	2	6	5412817	5412822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033273
146003	NC_018612	GCA	2	6	5412830	5412835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033273
146004	NC_018612	GCG	2	6	5412892	5412897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033273
146005	NC_018612	GTC	2	6	5412924	5412929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033273
146006	NC_018612	TCA	2	6	5413016	5413021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033273
146007	NC_018612	CTG	2	6	5413032	5413037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033273
146008	NC_018612	ATGG	2	8	5413132	5413139	25 %	25 %	50 %	0 %	406033274
146009	NC_018612	GGCC	2	8	5413147	5413154	0 %	0 %	50 %	50 %	406033274
146010	NC_018612	CGC	2	6	5413173	5413178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033274
146011	NC_018612	GC	3	6	5413185	5413190	0 %	0 %	50 %	50 %	406033274
146012	NC_018612	CCG	2	6	5413281	5413286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033274
146013	NC_018612	CAC	2	6	5413413	5413418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033274
146014	NC_018612	GGC	2	6	5413431	5413436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033274
146015	NC_018612	GCT	2	6	5413488	5413493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033274
146016	NC_018612	CGC	2	6	5413539	5413544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033274
146017	NC_018612	GGC	3	9	5413545	5413553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033274
146018	NC_018612	CCG	2	6	5413580	5413585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033274
146019	NC_018612	GGAA	2	8	5413689	5413696	50 %	0 %	50 %	0 %	406033274
146020	NC_018612	GGC	2	6	5413752	5413757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033275
146021	NC_018612	CCA	2	6	5413834	5413839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033275
146022	NC_018612	GGCGT	2	10	5413845	5413854	0 %	20 %	60 %	20 %	406033275
146023	NC_018612	ACCT	2	8	5413860	5413867	25 %	25 %	0 %	50 %	406033275
146024	NC_018612	TCG	2	6	5413894	5413899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033275
146025	NC_018612	CCG	2	6	5413925	5413930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033275
146026	NC_018612	ACA	2	6	5413942	5413947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033275
146027	NC_018612	TAC	2	6	5413956	5413961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033275
146028	NC_018612	GC	3	6	5413983	5413988	0 %	0 %	50 %	50 %	406033275
146029	NC_018612	GGT	2	6	5414078	5414083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033275
146030	NC_018612	TCGACG	2	12	5414107	5414118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033275
146031	NC_018612	C	6	6	5414144	5414149	0 %	0 %	0 %	100 %	406033275
146032	NC_018612	TGA	2	6	5414170	5414175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033275
146033	NC_018612	CGA	2	6	5414237	5414242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033275
146034	NC_018612	CGG	2	6	5414275	5414280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033275
146035	NC_018612	GC	3	6	5414288	5414293	0 %	0 %	50 %	50 %	406033275
146036	NC_018612	CGC	2	6	5414390	5414395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033275
146037	NC_018612	GC	3	6	5414448	5414453	0 %	0 %	50 %	50 %	406033275
146038	NC_018612	CGA	4	12	5414486	5414497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033275
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146040	NC_018612	TGG	2	6	5414545	5414550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033275
146041	NC_018612	CG	3	6	5414597	5414602	0 %	0 %	50 %	50 %	406033275
146042	NC_018612	CG	3	6	5414713	5414718	0 %	0 %	50 %	50 %	406033275
146043	NC_018612	GGT	2	6	5414734	5414739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033275
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146045	NC_018612	CGA	3	9	5414800	5414808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033275
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146047	NC_018612	CG	3	6	5414846	5414851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146048	NC_018612	CGC	2	6	5414859	5414864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146049	NC_018612	CGG	2	6	5414876	5414881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146050	NC_018612	CG	3	6	5414900	5414905	0 %	0 %	50 %	50 %	406033276
146051	NC_018612	GGCCC	2	10	5414918	5414927	0 %	0 %	40 %	60 %	406033276
146052	NC_018612	GC	3	6	5415011	5415016	0 %	0 %	50 %	50 %	406033276
146053	NC_018612	CCA	2	6	5415019	5415024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033276
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146058	NC_018612	CGA	2	6	5415182	5415187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033276
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146097	NC_018612	TG	3	6	5416864	5416869	0 %	50 %	50 %	0 %	406033278
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146220	NC_018612	GC	3	6	5421828	5421833	0 %	0 %	50 %	50 %	406033284
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146227	NC_018612	TCG	2	6	5421966	5421971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033284
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146229	NC_018612	AAG	2	6	5422001	5422006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033284
146230	NC_018612	CTG	2	6	5422007	5422012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033284
146231	NC_018612	TCG	2	6	5422071	5422076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033284
146232	NC_018612	CGG	2	6	5422077	5422082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033284
146233	NC_018612	GAG	2	6	5422148	5422153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033284
146234	NC_018612	AGA	2	6	5422188	5422193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033284
146235	NC_018612	CGC	2	6	5422221	5422226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033284
146236	NC_018612	GATGGG	2	12	5422249	5422260	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	406033284
146237	NC_018612	TCG	2	6	5422269	5422274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033284
146238	NC_018612	CCG	2	6	5422316	5422321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033284
146239	NC_018612	ACG	2	6	5422347	5422352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146240	NC_018612	CGTG	2	8	5422420	5422427	0 %	25 %	50 %	25 %	406033285
146241	NC_018612	CGGC	2	8	5422447	5422454	0 %	0 %	50 %	50 %	406033285
146242	NC_018612	GCC	2	6	5422499	5422504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033285
146243	NC_018612	CTG	2	6	5422511	5422516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033285
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146248	NC_018612	GTC	2	6	5422763	5422768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033285
146249	NC_018612	GC	3	6	5422803	5422808	0 %	0 %	50 %	50 %	406033285
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146264	NC_018612	TGT	2	6	5423281	5423286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033285
146265	NC_018612	TCGG	2	8	5423386	5423393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146266	NC_018612	CCGG	2	8	5423398	5423405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146267	NC_018612	GAC	2	6	5423548	5423553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033286
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146305	NC_018612	GGAC	2	8	5424806	5424813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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146343	NC_018612	CGA	2	6	5426555	5426560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033291
146344	NC_018612	CGA	2	6	5426570	5426575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033291
146345	NC_018612	CCG	2	6	5426709	5426714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033292
146346	NC_018612	CGA	2	6	5426716	5426721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033292
146347	NC_018612	CCGGC	2	10	5426737	5426746	0 %	0 %	40 %	60 %	406033292
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146349	NC_018612	GCA	2	6	5426824	5426829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033292
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146351	NC_018612	ACC	2	6	5426870	5426875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033292
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146354	NC_018612	CTG	2	6	5427029	5427034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033292
146355	NC_018612	CGG	2	6	5427067	5427072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033292
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146371	NC_018612	GC	3	6	5427538	5427543	0 %	0 %	50 %	50 %	406033293
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146457	NC_018612	TCG	2	6	5430873	5430878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146458	NC_018612	CTC	2	6	5430893	5430898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033296
146459	NC_018612	CGA	2	6	5430923	5430928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146460	NC_018612	CGC	2	6	5431048	5431053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033296
146461	NC_018612	CGCTGG	2	12	5431099	5431110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406033296
146462	NC_018612	GGC	2	6	5431136	5431141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033296
146463	NC_018612	TCG	2	6	5431173	5431178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146464	NC_018612	CAG	2	6	5431205	5431210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146465	NC_018612	CG	3	6	5431232	5431237	0 %	0 %	50 %	50 %	406033296
146466	NC_018612	GCC	2	6	5431274	5431279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033296
146467	NC_018612	CGG	2	6	5431287	5431292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033296
146468	NC_018612	TCGCG	2	10	5431306	5431315	0 %	20 %	40 %	40 %	406033296
146469	NC_018612	CGCGC	2	10	5431424	5431433	0 %	0 %	40 %	60 %	406033296
146470	NC_018612	CGA	2	6	5431439	5431444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146471	NC_018612	GCG	2	6	5431468	5431473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033296
146472	NC_018612	CGT	2	6	5431480	5431485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033296
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146474	NC_018612	CGG	2	6	5431513	5431518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033296
146475	NC_018612	TGG	2	6	5431525	5431530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033296
146476	NC_018612	CGA	2	6	5431546	5431551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146477	NC_018612	AGG	2	6	5431609	5431614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033296
146478	NC_018612	CGA	2	6	5431618	5431623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146479	NC_018612	TCG	2	6	5431638	5431643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146480	NC_018612	ACG	3	9	5431653	5431661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146481	NC_018612	CTCGG	2	10	5431662	5431671	0 %	20 %	40 %	40 %	406033296
146482	NC_018612	GCT	2	6	5431708	5431713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033296
146483	NC_018612	TCA	2	6	5431753	5431758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033296
146484	NC_018612	CTC	2	6	5431765	5431770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146485	NC_018612	TCC	2	6	5431813	5431818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033297
146486	NC_018612	CAG	2	6	5431866	5431871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033297
146487	NC_018612	GCGT	2	8	5431925	5431932	0 %	25 %	50 %	25 %	406033297
146488	NC_018612	TGC	2	6	5431942	5431947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033297
146489	NC_018612	GTT	2	6	5431983	5431988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033297
146490	NC_018612	GTCGCC	2	12	5432004	5432015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406033297
146491	NC_018612	GCC	2	6	5432055	5432060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033297
146492	NC_018612	GGC	2	6	5432096	5432101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033297
146493	NC_018612	AGC	2	6	5432134	5432139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033297
146494	NC_018612	GACGTG	2	12	5432140	5432151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406033297
146495	NC_018612	CTGG	2	8	5432199	5432206	0 %	25 %	50 %	25 %	406033297
146496	NC_018612	GCCG	2	8	5432219	5432226	0 %	0 %	50 %	50 %	406033297
146497	NC_018612	GTA	2	6	5432337	5432342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033297
146498	NC_018612	CAG	3	9	5432367	5432375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033297
146499	NC_018612	CAG	2	6	5432412	5432417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033297
146500	NC_018612	GGC	3	9	5432426	5432434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033297

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