MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
142001	NC_018612	GAC	2	6	5270609	5270614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033135
142002	NC_018612	CGC	2	6	5270627	5270632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033135
142003	NC_018612	CGG	2	6	5270634	5270639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033135
142004	NC_018612	CGG	2	6	5270704	5270709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142005	NC_018612	GGC	2	6	5270727	5270732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142006	NC_018612	G	6	6	5270733	5270738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142007	NC_018612	AAG	2	6	5270750	5270755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142008	NC_018612	TCA	2	6	5270775	5270780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142009	NC_018612	GCC	2	6	5270800	5270805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142010	NC_018612	GCC	2	6	5270833	5270838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142011	NC_018612	CG	3	6	5270852	5270857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142012	NC_018612	TCA	2	6	5270872	5270877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142013	NC_018612	GGC	2	6	5270883	5270888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033136
142014	NC_018612	CCG	2	6	5270909	5270914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033136
142015	NC_018612	CAT	2	6	5270929	5270934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033136
142016	NC_018612	CGA	2	6	5270989	5270994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142017	NC_018612	AGG	2	6	5271018	5271023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033136
142018	NC_018612	GCC	2	6	5271182	5271187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033136
142019	NC_018612	CGC	2	6	5271201	5271206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033136
142020	NC_018612	C	6	6	5271262	5271267	0 %	0 %	0 %	100 %	406033136
142021	NC_018612	CTT	2	6	5271286	5271291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033136
142022	NC_018612	CGA	2	6	5271304	5271309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142023	NC_018612	CGT	2	6	5271351	5271356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142024	NC_018612	GGC	2	6	5271367	5271372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033136
142025	NC_018612	GGT	2	6	5271373	5271378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033136
142026	NC_018612	GGC	2	6	5271425	5271430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033136
142027	NC_018612	CGGC	2	8	5271433	5271440	0 %	0 %	50 %	50 %	406033136
142028	NC_018612	TCG	2	6	5271446	5271451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142029	NC_018612	CGC	3	9	5271457	5271465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033136
142030	NC_018612	CCGA	2	8	5271546	5271553	25 %	0 %	25 %	50 %	406033136
142031	NC_018612	CGGG	2	8	5271564	5271571	0 %	0 %	75 %	25 %	406033136
142032	NC_018612	TTC	2	6	5271575	5271580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033136
142033	NC_018612	GCCG	2	8	5271589	5271596	0 %	0 %	50 %	50 %	406033136
142034	NC_018612	TGA	2	6	5271609	5271614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033136
142035	NC_018612	GCT	4	12	5271697	5271708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142036	NC_018612	GTC	2	6	5271716	5271721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033136
142037	NC_018612	GGCG	2	8	5271778	5271785	0 %	0 %	75 %	25 %	406033136
142038	NC_018612	GACC	2	8	5271811	5271818	25 %	0 %	25 %	50 %	406033136
142039	NC_018612	GGC	2	6	5271830	5271835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033136
142040	NC_018612	GTG	2	6	5271851	5271856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033136
142041	NC_018612	CAG	2	6	5271924	5271929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142042	NC_018612	GCGGT	2	10	5272030	5272039	0 %	20 %	60 %	20 %	406033137
142043	NC_018612	CGA	2	6	5272068	5272073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142044	NC_018612	AAGTCG	2	12	5272097	5272108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142045	NC_018612	CGA	2	6	5272125	5272130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142046	NC_018612	TCGC	2	8	5272265	5272272	0 %	25 %	25 %	50 %	406033138
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142048	NC_018612	CGG	2	6	5272330	5272335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033138
142049	NC_018612	CGA	2	6	5272405	5272410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033138
142050	NC_018612	GGT	2	6	5272487	5272492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033138
142051	NC_018612	GCG	2	6	5272507	5272512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033138
142052	NC_018612	CCGG	2	8	5272516	5272523	0 %	0 %	50 %	50 %	406033138
142053	NC_018612	GCG	2	6	5272534	5272539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033138
142054	NC_018612	CCA	2	6	5272555	5272560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033138
142055	NC_018612	GC	3	6	5272561	5272566	0 %	0 %	50 %	50 %	406033138
142056	NC_018612	CCGGC	2	10	5272618	5272627	0 %	0 %	40 %	60 %	406033138
142057	NC_018612	GCG	2	6	5272630	5272635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033138
142058	NC_018612	GCC	3	9	5272653	5272661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033138
142059	NC_018612	CGA	2	6	5272663	5272668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033138
142060	NC_018612	CG	3	6	5272689	5272694	0 %	0 %	50 %	50 %	406033138
142061	NC_018612	TGCGG	2	10	5272696	5272705	0 %	20 %	60 %	20 %	406033138
142062	NC_018612	CGC	2	6	5272714	5272719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033138
142063	NC_018612	CAG	2	6	5272736	5272741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033138
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142068	NC_018612	CG	4	8	5272869	5272876	0 %	0 %	50 %	50 %	406033138
142069	NC_018612	CGG	2	6	5272887	5272892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033138
142070	NC_018612	CAG	2	6	5272895	5272900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033138
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142073	NC_018612	GCA	2	6	5273050	5273055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033138
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142083	NC_018612	GC	3	6	5273313	5273318	0 %	0 %	50 %	50 %	406033138
142084	NC_018612	CCG	2	6	5273329	5273334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033138
142085	NC_018612	GTC	2	6	5273366	5273371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033138
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142088	NC_018612	CG	3	6	5273436	5273441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142089	NC_018612	GCC	3	9	5273458	5273466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142090	NC_018612	CTG	2	6	5273474	5273479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142091	NC_018612	GCT	2	6	5273505	5273510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142092	NC_018612	TCGGG	2	10	5273514	5273523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142093	NC_018612	GAG	2	6	5273549	5273554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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142106	NC_018612	GCT	3	9	5273892	5273900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033139
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142111	NC_018612	ACG	2	6	5273999	5274004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033139
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142116	NC_018612	TGG	2	6	5274206	5274211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033139
142117	NC_018612	GCT	2	6	5274231	5274236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033139
142118	NC_018612	GCG	2	6	5274293	5274298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033139
142119	NC_018612	CGAA	2	8	5274302	5274309	50 %	0 %	25 %	25 %	406033139
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142128	NC_018612	GC	3	6	5274623	5274628	0 %	0 %	50 %	50 %	406033139
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142144	NC_018612	C	6	6	5275058	5275063	0 %	0 %	0 %	100 %	406033140
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142231	NC_018612	CG	3	6	5277276	5277281	0 %	0 %	50 %	50 %	406033141
142232	NC_018612	TCGAC	2	10	5277337	5277346	20 %	20 %	20 %	40 %	406033141
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142242	NC_018612	GCGG	2	8	5277629	5277636	0 %	0 %	75 %	25 %	406033141
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142336	NC_018612	CTGG	2	8	5280295	5280302	0 %	25 %	50 %	25 %	406033144
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142341	NC_018612	CG	3	6	5280370	5280375	0 %	0 %	50 %	50 %	406033144
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142344	NC_018612	GTT	2	6	5280415	5280420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033144
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142460	NC_018612	GCG	2	6	5284694	5284699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033149
142461	NC_018612	GTC	2	6	5284708	5284713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033149
142462	NC_018612	CGC	2	6	5284737	5284742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033149
142463	NC_018612	ATC	2	6	5284745	5284750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033149
142464	NC_018612	ACC	3	9	5284769	5284777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033149
142465	NC_018612	CGG	2	6	5284818	5284823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033149
142466	NC_018612	GC	4	8	5284859	5284866	0 %	0 %	50 %	50 %	406033149
142467	NC_018612	GCA	2	6	5284887	5284892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033149
142468	NC_018612	CGC	2	6	5284896	5284901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033149
142469	NC_018612	ACC	2	6	5284943	5284948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033149
142470	NC_018612	CGC	2	6	5284953	5284958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033149
142471	NC_018612	GCT	2	6	5284977	5284982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033149
142472	NC_018612	ACC	2	6	5285009	5285014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033149
142473	NC_018612	AGC	2	6	5285051	5285056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033149
142474	NC_018612	CG	3	6	5285155	5285160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142475	NC_018612	CGG	2	6	5285177	5285182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142476	NC_018612	GCGG	3	12	5285255	5285266	0 %	0 %	75 %	25 %	406033150
142477	NC_018612	TCC	2	6	5285355	5285360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033150
142478	NC_018612	GATGGC	2	12	5285369	5285380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406033150
142479	NC_018612	ATG	2	6	5285430	5285435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033150
142480	NC_018612	GCC	2	6	5285436	5285441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033150
142481	NC_018612	ATC	2	6	5285472	5285477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033150
142482	NC_018612	CAC	2	6	5285507	5285512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033150
142483	NC_018612	ATC	2	6	5285592	5285597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033150
142484	NC_018612	CGG	2	6	5285608	5285613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033150
142485	NC_018612	TCG	2	6	5285647	5285652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033150
142486	NC_018612	GCCG	2	8	5285681	5285688	0 %	0 %	50 %	50 %	406033150
142487	NC_018612	CGA	2	6	5285692	5285697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033150
142488	NC_018612	CAC	2	6	5285708	5285713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033150
142489	NC_018612	TCG	2	6	5285722	5285727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033150
142490	NC_018612	AAC	2	6	5285733	5285738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033150
142491	NC_018612	CCA	2	6	5285759	5285764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142492	NC_018612	CGC	2	6	5285772	5285777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142493	NC_018612	CCT	2	6	5285798	5285803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142494	NC_018612	CAA	2	6	5285828	5285833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142495	NC_018612	CGC	2	6	5285842	5285847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142496	NC_018612	TTG	2	6	5285868	5285873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142497	NC_018612	CAG	2	6	5285894	5285899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142498	NC_018612	GC	3	6	5285904	5285909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142499	NC_018612	ACAG	2	8	5285936	5285943	50 %	0 %	25 %	25 %	406033151
142500	NC_018612	CAT	2	6	5285946	5285951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033151

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