MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
141001	NC_018612	CGC	2	6	5234987	5234992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141002	NC_018612	GCC	2	6	5235067	5235072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141003	NC_018612	CGC	2	6	5235073	5235078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141004	NC_018612	GC	3	6	5235095	5235100	0 %	0 %	50 %	50 %	406033105
141005	NC_018612	GCT	2	6	5235144	5235149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141006	NC_018612	GGC	2	6	5235151	5235156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141007	NC_018612	CCGC	2	8	5235169	5235176	0 %	0 %	25 %	75 %	406033105
141008	NC_018612	GGC	2	6	5235181	5235186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141009	NC_018612	CGG	2	6	5235198	5235203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141010	NC_018612	GAG	2	6	5235209	5235214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033105
141011	NC_018612	CGTTGA	2	12	5235216	5235227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406033105
141012	NC_018612	TCGA	2	8	5235239	5235246	25 %	25 %	25 %	25 %	406033105
141013	NC_018612	GCG	2	6	5235254	5235259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141014	NC_018612	CCAGCC	2	12	5235261	5235272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	406033105
141015	NC_018612	CTC	2	6	5235286	5235291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033105
141016	NC_018612	AGC	2	6	5235389	5235394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141017	NC_018612	CCG	3	9	5235453	5235461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141018	NC_018612	CCA	2	6	5235471	5235476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033105
141019	NC_018612	TCG	2	6	5235515	5235520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141020	NC_018612	CAG	2	6	5235526	5235531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141021	NC_018612	GCCG	2	8	5235568	5235575	0 %	0 %	50 %	50 %	406033105
141022	NC_018612	TCG	2	6	5235579	5235584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141023	NC_018612	CGA	2	6	5235637	5235642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141024	NC_018612	GTC	2	6	5235658	5235663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141025	NC_018612	GTC	2	6	5235694	5235699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141026	NC_018612	GAA	2	6	5235700	5235705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033105
141027	NC_018612	GGC	3	9	5235718	5235726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141028	NC_018612	TGGC	2	8	5235737	5235744	0 %	25 %	50 %	25 %	406033105
141029	NC_018612	GGC	3	9	5235742	5235750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141030	NC_018612	CG	3	6	5235768	5235773	0 %	0 %	50 %	50 %	406033105
141031	NC_018612	CCA	2	6	5235882	5235887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033105
141032	NC_018612	GGCGC	2	10	5235913	5235922	0 %	0 %	60 %	40 %	406033105
141033	NC_018612	CAG	2	6	5235928	5235933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141034	NC_018612	GCG	2	6	5235937	5235942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141035	NC_018612	GGT	2	6	5235976	5235981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033105
141036	NC_018612	CGG	3	9	5235993	5236001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141037	NC_018612	CGGC	2	8	5236013	5236020	0 %	0 %	50 %	50 %	406033105
141038	NC_018612	CGG	3	9	5236032	5236040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141039	NC_018612	GCC	2	6	5236046	5236051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141040	NC_018612	CTG	2	6	5236072	5236077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141041	NC_018612	ACG	2	6	5236098	5236103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141042	NC_018612	CG	3	6	5236128	5236133	0 %	0 %	50 %	50 %	406033105
141043	NC_018612	GCC	2	6	5236168	5236173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141044	NC_018612	ACC	2	6	5236175	5236180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033105
141045	NC_018612	CCA	2	6	5236215	5236220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033105
141046	NC_018612	GCCC	2	8	5236221	5236228	0 %	0 %	25 %	75 %	406033105
141047	NC_018612	GCG	2	6	5236232	5236237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033105
141048	NC_018612	GCC	2	6	5236303	5236308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141049	NC_018612	CGC	3	9	5236322	5236330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033105
141050	NC_018612	AGC	2	6	5236345	5236350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033105
141051	NC_018612	TAC	2	6	5236439	5236444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141052	NC_018612	TC	3	6	5236563	5236568	0 %	50 %	0 %	50 %	406033106
141053	NC_018612	AGC	2	6	5236605	5236610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141054	NC_018612	GCT	2	6	5236675	5236680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141055	NC_018612	CGG	2	6	5236684	5236689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033106
141056	NC_018612	GTC	2	6	5236700	5236705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141057	NC_018612	GC	3	6	5236714	5236719	0 %	0 %	50 %	50 %	406033106
141058	NC_018612	CAA	2	6	5236750	5236755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033106
141059	NC_018612	GGGC	2	8	5236759	5236766	0 %	0 %	75 %	25 %	406033106
141060	NC_018612	CGG	2	6	5236783	5236788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033106
141061	NC_018612	CAC	2	6	5236813	5236818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033106
141062	NC_018612	TTC	2	6	5236847	5236852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033106
141063	NC_018612	GCT	2	6	5236858	5236863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141064	NC_018612	GGT	2	6	5236894	5236899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033106
141065	NC_018612	CAC	2	6	5236903	5236908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033106
141066	NC_018612	GCC	2	6	5236919	5236924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033106
141067	NC_018612	GC	3	6	5236948	5236953	0 %	0 %	50 %	50 %	406033106
141068	NC_018612	CGCT	2	8	5236970	5236977	0 %	25 %	25 %	50 %	406033106
141069	NC_018612	GCA	2	6	5236998	5237003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141070	NC_018612	CCG	2	6	5237141	5237146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033106
141071	NC_018612	CGA	2	6	5237214	5237219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141072	NC_018612	GC	3	6	5237246	5237251	0 %	0 %	50 %	50 %	406033106
141073	NC_018612	GTC	2	6	5237252	5237257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141074	NC_018612	GCC	2	6	5237276	5237281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033106
141075	NC_018612	G	6	6	5237311	5237316	0 %	0 %	100 %	0 %	406033106
141076	NC_018612	CGG	2	6	5237389	5237394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033106
141077	NC_018612	CAA	2	6	5237413	5237418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033106
141078	NC_018612	GCT	2	6	5237440	5237445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141079	NC_018612	GC	3	6	5237462	5237467	0 %	0 %	50 %	50 %	406033106
141080	NC_018612	GCA	2	6	5237535	5237540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141081	NC_018612	GGC	2	6	5237549	5237554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033106
141082	NC_018612	GTC	2	6	5237569	5237574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141083	NC_018612	CCA	3	9	5237616	5237624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033106
141084	NC_018612	GAT	2	6	5237632	5237637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033106
141085	NC_018612	GCC	2	6	5237729	5237734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033106
141086	NC_018612	GCC	2	6	5237760	5237765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033106
141087	NC_018612	CTG	2	6	5237777	5237782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033106
141088	NC_018612	GGC	2	6	5237786	5237791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033106
141089	NC_018612	GGCCA	2	10	5237876	5237885	20 %	0 %	40 %	40 %	406033106
141090	NC_018612	TGA	2	6	5237907	5237912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033107
141091	NC_018612	GAA	2	6	5237929	5237934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033107
141092	NC_018612	CTG	2	6	5237936	5237941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141093	NC_018612	CG	3	6	5237942	5237947	0 %	0 %	50 %	50 %	406033107
141094	NC_018612	GGT	2	6	5237965	5237970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033107
141095	NC_018612	CGG	3	9	5237977	5237985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033107
141096	NC_018612	CGG	2	6	5238051	5238056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033107
141097	NC_018612	CTTTC	2	10	5238148	5238157	0 %	60 %	0 %	40 %	406033107
141098	NC_018612	CGTGCA	2	12	5238232	5238243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141099	NC_018612	CTG	2	6	5238275	5238280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141100	NC_018612	CGA	2	6	5238370	5238375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141101	NC_018612	GCC	2	6	5238409	5238414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033107
141102	NC_018612	TGC	2	6	5238426	5238431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141103	NC_018612	CGT	2	6	5238463	5238468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141104	NC_018612	AC	3	6	5238490	5238495	50 %	0 %	0 %	50 %	406033107
141105	NC_018612	GCC	2	6	5238584	5238589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033107
141106	NC_018612	TGC	2	6	5238636	5238641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141107	NC_018612	CGA	2	6	5238664	5238669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141108	NC_018612	ACG	3	9	5238672	5238680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033107
141109	NC_018612	GCGT	2	8	5238779	5238786	0 %	25 %	50 %	25 %	406033108
141110	NC_018612	GCG	2	6	5238824	5238829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033108
141111	NC_018612	CAG	2	6	5238838	5238843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033108
141112	NC_018612	AAC	2	6	5238854	5238859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033108
141113	NC_018612	GCG	2	6	5238864	5238869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033108
141114	NC_018612	GGCG	3	12	5238866	5238877	0 %	0 %	75 %	25 %	406033108
141115	NC_018612	CGC	2	6	5238895	5238900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033108
141116	NC_018612	CGG	2	6	5238936	5238941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033108
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141218	NC_018612	TCCA	2	8	5242404	5242411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141219	NC_018612	CCT	2	6	5242482	5242487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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141232	NC_018612	CCGTGC	2	12	5242971	5242982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406033110
141233	NC_018612	GCA	2	6	5243005	5243010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033110
141234	NC_018612	CGT	3	9	5243101	5243109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033110
141235	NC_018612	TCG	2	6	5243112	5243117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033110
141236	NC_018612	CGG	2	6	5243182	5243187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033110
141237	NC_018612	CTG	2	6	5243201	5243206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033110
141238	NC_018612	CGG	2	6	5243237	5243242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033110
141239	NC_018612	TCG	2	6	5243289	5243294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033110
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141251	NC_018612	GTG	2	6	5243579	5243584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033110
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141340	NC_018612	CG	3	6	5246308	5246313	0 %	0 %	50 %	50 %	406033113
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141344	NC_018612	GCC	2	6	5246456	5246461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141345	NC_018612	GCC	2	6	5246510	5246515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141346	NC_018612	ACC	2	6	5246544	5246549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033113
141347	NC_018612	CCG	2	6	5246589	5246594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141348	NC_018612	CCG	2	6	5246608	5246613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141349	NC_018612	GCA	2	6	5246637	5246642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141350	NC_018612	CGA	2	6	5246656	5246661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141351	NC_018612	CGC	2	6	5246677	5246682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141352	NC_018612	CCG	2	6	5246721	5246726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141353	NC_018612	CCG	2	6	5246745	5246750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141354	NC_018612	ACG	2	6	5246790	5246795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141355	NC_018612	CCA	2	6	5246809	5246814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033113
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141358	NC_018612	TGCGC	2	10	5246934	5246943	0 %	20 %	40 %	40 %	406033113
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141362	NC_018612	GACGCT	2	12	5247211	5247222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141363	NC_018612	GCG	2	6	5247275	5247280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033113
141364	NC_018612	CGA	2	6	5247294	5247299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033113
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141366	NC_018612	GGC	2	6	5247334	5247339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033113
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141371	NC_018612	CGC	2	6	5247532	5247537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
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141374	NC_018612	CGATC	2	10	5247682	5247691	20 %	20 %	20 %	40 %	406033113
141375	NC_018612	CCG	2	6	5247699	5247704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
141376	NC_018612	GCT	2	6	5247715	5247720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141377	NC_018612	TCG	3	9	5247741	5247749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141378	NC_018612	GC	3	6	5247786	5247791	0 %	0 %	50 %	50 %	406033113
141379	NC_018612	CCGGC	2	10	5247827	5247836	0 %	0 %	40 %	60 %	406033113
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141381	NC_018612	GC	3	6	5247911	5247916	0 %	0 %	50 %	50 %	406033113
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141384	NC_018612	CG	3	6	5248034	5248039	0 %	0 %	50 %	50 %	406033113
141385	NC_018612	TGG	3	9	5248044	5248052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033113
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141393	NC_018612	CGT	3	9	5248201	5248209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141394	NC_018612	GCC	2	6	5248217	5248222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033113
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141397	NC_018612	CGG	2	6	5248285	5248290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033113
141398	NC_018612	GCG	2	6	5248307	5248312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033113
141399	NC_018612	CGG	2	6	5248335	5248340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033113
141400	NC_018612	CTG	2	6	5248373	5248378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141401	NC_018612	TCGC	2	8	5248388	5248395	0 %	25 %	25 %	50 %	406033113
141402	NC_018612	CGA	2	6	5248447	5248452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033113
141403	NC_018612	CGGT	2	8	5248517	5248524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141404	NC_018612	GCC	2	6	5248531	5248536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141405	NC_018612	TGGG	2	8	5248582	5248589	0 %	25 %	75 %	0 %	406033114
141406	NC_018612	GCG	2	6	5248607	5248612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033114
141407	NC_018612	ATCT	2	8	5248621	5248628	25 %	50 %	0 %	25 %	406033114
141408	NC_018612	TCG	2	6	5248637	5248642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033114
141409	NC_018612	CGG	2	6	5248643	5248648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033114
141410	NC_018612	TGC	2	6	5248685	5248690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033114
141411	NC_018612	GGC	2	6	5248707	5248712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033114
141412	NC_018612	CGG	2	6	5248772	5248777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033114
141413	NC_018612	CGG	2	6	5248802	5248807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033114
141414	NC_018612	CGC	2	6	5248812	5248817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033114
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141416	NC_018612	TGA	2	6	5248958	5248963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033114
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141427	NC_018612	GCT	2	6	5249376	5249381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033114
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141432	NC_018612	TGT	2	6	5249498	5249503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033114
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141434	NC_018612	GGT	2	6	5249595	5249600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033114
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141442	NC_018612	TGG	2	6	5249948	5249953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033114
141443	NC_018612	GCC	2	6	5249964	5249969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033114
141444	NC_018612	ACC	3	9	5249989	5249997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033114
141445	NC_018612	GACGC	2	10	5250038	5250047	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141446	NC_018612	CAGC	2	8	5250209	5250216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141447	NC_018612	GAG	2	6	5250232	5250237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141448	NC_018612	ACG	2	6	5250250	5250255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033115
141449	NC_018612	CTG	2	6	5250269	5250274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033115
141450	NC_018612	CTG	3	9	5250287	5250295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033115
141451	NC_018612	GCGT	2	8	5250299	5250306	0 %	25 %	50 %	25 %	406033115
141452	NC_018612	GCC	2	6	5250320	5250325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033115
141453	NC_018612	GCC	2	6	5250428	5250433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033115
141454	NC_018612	ACC	2	6	5250487	5250492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033115
141455	NC_018612	GCC	4	12	5250503	5250514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033115
141456	NC_018612	GGT	2	6	5250586	5250591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033115
141457	NC_018612	CGA	2	6	5250754	5250759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033115
141458	NC_018612	CAAGTA	2	12	5250895	5250906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406033115
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141460	NC_018612	GC	3	6	5251004	5251009	0 %	0 %	50 %	50 %	406033115
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