MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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140503	NC_018612	CG	3	6	5215676	5215681	0 %	0 %	50 %	50 %	406033086
140504	NC_018612	GGT	2	6	5215685	5215690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033086
140505	NC_018612	CTT	2	6	5215838	5215843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033086
140506	NC_018612	GCC	3	9	5215863	5215871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033086
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140509	NC_018612	GC	3	6	5215996	5216001	0 %	0 %	50 %	50 %	406033086
140510	NC_018612	CGT	2	6	5216015	5216020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033086
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140512	NC_018612	GC	3	6	5216108	5216113	0 %	0 %	50 %	50 %	406033086
140513	NC_018612	CG	3	6	5216122	5216127	0 %	0 %	50 %	50 %	406033086
140514	NC_018612	GTG	2	6	5216160	5216165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033086
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140517	NC_018612	CTG	2	6	5216202	5216207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033086
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140615	NC_018612	TCG	2	6	5220293	5220298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140616	NC_018612	GGT	2	6	5220430	5220435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033091
140617	NC_018612	GCCG	2	8	5220466	5220473	0 %	0 %	50 %	50 %	406033091
140618	NC_018612	GCG	2	6	5220474	5220479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033091
140619	NC_018612	CGG	2	6	5220509	5220514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033091
140620	NC_018612	GCG	2	6	5220554	5220559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033091
140621	NC_018612	CTG	2	6	5220560	5220565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140622	NC_018612	CTG	2	6	5220599	5220604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140623	NC_018612	CGT	2	6	5220684	5220689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140624	NC_018612	ACC	2	6	5220758	5220763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033091
140625	NC_018612	GCC	2	6	5220770	5220775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033091
140626	NC_018612	CGC	2	6	5220822	5220827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033091
140627	NC_018612	TCGGGA	2	12	5220836	5220847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406033091
140628	NC_018612	GC	4	8	5220859	5220866	0 %	0 %	50 %	50 %	406033091
140629	NC_018612	CGT	2	6	5220886	5220891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140630	NC_018612	CG	3	6	5220892	5220897	0 %	0 %	50 %	50 %	406033091
140631	NC_018612	TGC	2	6	5220960	5220965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033091
140632	NC_018612	CAT	2	6	5220994	5220999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033091
140633	NC_018612	GGT	2	6	5221006	5221011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033091
140634	NC_018612	TGG	2	6	5221070	5221075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033092
140635	NC_018612	CGG	2	6	5221095	5221100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033092
140636	NC_018612	TCG	2	6	5221169	5221174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033092
140637	NC_018612	GTG	2	6	5221177	5221182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033092
140638	NC_018612	ACCC	2	8	5221185	5221192	25 %	0 %	0 %	75 %	406033092
140639	NC_018612	GCC	2	6	5221219	5221224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033092
140640	NC_018612	GGCC	2	8	5221225	5221232	0 %	0 %	50 %	50 %	406033092
140641	NC_018612	GTG	2	6	5221240	5221245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033092
140642	NC_018612	CG	3	6	5221259	5221264	0 %	0 %	50 %	50 %	406033092
140643	NC_018612	GCCC	2	8	5221287	5221294	0 %	0 %	25 %	75 %	406033092
140644	NC_018612	CG	3	6	5221359	5221364	0 %	0 %	50 %	50 %	406033092
140645	NC_018612	TCG	2	6	5221367	5221372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033092
140646	NC_018612	GCT	2	6	5221380	5221385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033092
140647	NC_018612	GGC	2	6	5221397	5221402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033092
140648	NC_018612	GGC	2	6	5221422	5221427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033092
140649	NC_018612	GAC	2	6	5221441	5221446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033092
140650	NC_018612	CAC	2	6	5221467	5221472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033092
140651	NC_018612	GTT	2	6	5221479	5221484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033092
140652	NC_018612	CGT	2	6	5221584	5221589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033092
140653	NC_018612	CCT	2	6	5221595	5221600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033092
140654	NC_018612	CAA	2	6	5221624	5221629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033092
140655	NC_018612	GCG	2	6	5221643	5221648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033092
140656	NC_018612	GTCA	2	8	5221657	5221664	25 %	25 %	25 %	25 %	406033092
140657	NC_018612	GC	3	6	5221690	5221695	0 %	0 %	50 %	50 %	406033092
140658	NC_018612	CCG	2	6	5221713	5221718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033092
140659	NC_018612	GCC	2	6	5221725	5221730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033092
140660	NC_018612	GCC	2	6	5221738	5221743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033092
140661	NC_018612	GCGTC	2	10	5221756	5221765	0 %	20 %	40 %	40 %	406033092
140662	NC_018612	C	6	6	5221772	5221777	0 %	0 %	0 %	100 %	406033092
140663	NC_018612	CG	4	8	5221793	5221800	0 %	0 %	50 %	50 %	406033092
140664	NC_018612	TCAA	2	8	5221959	5221966	50 %	25 %	0 %	25 %	406033093
140665	NC_018612	GCC	2	6	5221971	5221976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033093
140666	NC_018612	CAC	2	6	5221996	5222001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033093
140667	NC_018612	GCC	2	6	5222009	5222014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033093
140668	NC_018612	CCG	2	6	5222067	5222072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033093
140669	NC_018612	GCT	2	6	5222113	5222118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033093
140670	NC_018612	GGC	2	6	5222140	5222145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033093
140671	NC_018612	CAT	2	6	5222188	5222193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033093
140672	NC_018612	CGA	2	6	5222262	5222267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033093
140673	NC_018612	CG	3	6	5222308	5222313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140674	NC_018612	GCC	2	6	5222319	5222324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033094
140675	NC_018612	CGG	2	6	5222362	5222367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033094
140676	NC_018612	CAGG	2	8	5222411	5222418	25 %	0 %	50 %	25 %	406033094
140677	NC_018612	CGAG	2	8	5222428	5222435	25 %	0 %	50 %	25 %	406033094
140678	NC_018612	CGA	2	6	5222488	5222493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033094
140679	NC_018612	GCC	2	6	5222511	5222516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033094
140680	NC_018612	CGT	2	6	5222557	5222562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033094
140681	NC_018612	AAC	2	6	5222571	5222576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033094
140682	NC_018612	CGT	2	6	5222590	5222595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033094
140683	NC_018612	ACGCCG	2	12	5222604	5222615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406033094
140684	NC_018612	GGT	2	6	5222629	5222634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033094
140685	NC_018612	ACGCGC	2	12	5222638	5222649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406033094
140686	NC_018612	CGGC	2	8	5222753	5222760	0 %	0 %	50 %	50 %	406033095
140687	NC_018612	ACGA	2	8	5222807	5222814	50 %	0 %	25 %	25 %	406033095
140688	NC_018612	GTC	2	6	5222839	5222844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140689	NC_018612	GAC	2	6	5222935	5222940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140690	NC_018612	CCG	2	6	5222960	5222965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140691	NC_018612	GTA	2	6	5223019	5223024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033095
140692	NC_018612	CAG	2	6	5223079	5223084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140693	NC_018612	GCC	2	6	5223115	5223120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140694	NC_018612	CG	3	6	5223191	5223196	0 %	0 %	50 %	50 %	406033095
140695	NC_018612	ATCTTG	2	12	5223212	5223223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406033095
140696	NC_018612	GCG	2	6	5223225	5223230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033095
140697	NC_018612	CTG	2	6	5223283	5223288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140698	NC_018612	CA	3	6	5223313	5223318	50 %	0 %	0 %	50 %	406033095
140699	NC_018612	GCC	2	6	5223367	5223372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140700	NC_018612	CG	3	6	5223413	5223418	0 %	0 %	50 %	50 %	406033095
140701	NC_018612	GATCAG	2	12	5223487	5223498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406033095
140702	NC_018612	CGC	2	6	5223516	5223521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140703	NC_018612	CAC	2	6	5223535	5223540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033095
140704	NC_018612	TTC	2	6	5223554	5223559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033095
140705	NC_018612	CCA	2	6	5223654	5223659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033095
140706	NC_018612	CAG	2	6	5223703	5223708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140707	NC_018612	GAT	2	6	5223739	5223744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033095
140708	NC_018612	GC	3	6	5223758	5223763	0 %	0 %	50 %	50 %	406033095
140709	NC_018612	CAG	2	6	5223817	5223822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140710	NC_018612	AGC	2	6	5223830	5223835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140711	NC_018612	GCAC	2	8	5223837	5223844	25 %	0 %	25 %	50 %	406033095
140712	NC_018612	ACG	2	6	5223852	5223857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140713	NC_018612	GTT	2	6	5223940	5223945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033095
140714	NC_018612	CGC	3	9	5223996	5224004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140715	NC_018612	GCA	2	6	5224068	5224073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140716	NC_018612	AGG	3	9	5224080	5224088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033095
140717	NC_018612	CGT	2	6	5224125	5224130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140718	NC_018612	CGT	2	6	5224167	5224172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140719	NC_018612	CAG	2	6	5224240	5224245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140720	NC_018612	CAG	2	6	5224294	5224299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033095
140721	NC_018612	CCA	2	6	5224308	5224313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033095
140722	NC_018612	CCA	2	6	5224338	5224343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033095
140723	NC_018612	GCC	2	6	5224357	5224362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140724	NC_018612	CCG	2	6	5224433	5224438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033095
140725	NC_018612	GC	3	6	5224445	5224450	0 %	0 %	50 %	50 %	406033095
140726	NC_018612	CGG	2	6	5224458	5224463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033095
140727	NC_018612	TCG	2	6	5224475	5224480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033095
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140729	NC_018612	ACC	2	6	5224523	5224528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033095
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140965	NC_018612	GCT	2	6	5233240	5233245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140966	NC_018612	CGG	2	6	5233300	5233305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033104
140967	NC_018612	ACC	2	6	5233329	5233334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033104
140968	NC_018612	GAG	2	6	5233343	5233348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033104
140969	NC_018612	AGA	2	6	5233350	5233355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033104
140970	NC_018612	GCC	2	6	5233370	5233375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033104
140971	NC_018612	GAC	2	6	5233463	5233468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140972	NC_018612	TCA	2	6	5233500	5233505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033104
140973	NC_018612	GC	3	6	5233556	5233561	0 %	0 %	50 %	50 %	406033104
140974	NC_018612	TTC	2	6	5233601	5233606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033104
140975	NC_018612	TGAGC	2	10	5233714	5233723	20 %	20 %	40 %	20 %	406033104
140976	NC_018612	ACG	2	6	5233734	5233739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140977	NC_018612	GCTG	2	8	5233752	5233759	0 %	25 %	50 %	25 %	406033104
140978	NC_018612	ATG	2	6	5233817	5233822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033104
140979	NC_018612	CAC	2	6	5233952	5233957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033104
140980	NC_018612	TGA	2	6	5233977	5233982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033104
140981	NC_018612	TGC	2	6	5234109	5234114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140982	NC_018612	GGT	2	6	5234116	5234121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033104
140983	NC_018612	CAC	2	6	5234257	5234262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033104
140984	NC_018612	CTT	3	9	5234281	5234289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033104
140985	NC_018612	TCG	2	6	5234352	5234357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033104
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140988	NC_018612	TGA	2	6	5234520	5234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033104
140989	NC_018612	GGCT	2	8	5234546	5234553	0 %	25 %	50 %	25 %	406033104
140990	NC_018612	GGC	2	6	5234581	5234586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033104
140991	NC_018612	GAC	2	6	5234609	5234614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140992	NC_018612	CGT	2	6	5234646	5234651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140993	NC_018612	GAA	2	6	5234659	5234664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033104
140994	NC_018612	CAT	2	6	5234719	5234724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033104
140995	NC_018612	CGA	2	6	5234731	5234736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033104
140996	NC_018612	GCC	2	6	5234738	5234743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033104
140997	NC_018612	GCC	2	6	5234836	5234841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140998	NC_018612	GCG	2	6	5234861	5234866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140999	NC_018612	GTCGGG	2	12	5234933	5234944	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141000	NC_018612	G	6	6	5234942	5234947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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