MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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140002	NC_018612	TTC	2	6	5198461	5198466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033072
140003	NC_018612	ATC	2	6	5198532	5198537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033072
140004	NC_018612	CGG	3	9	5198597	5198605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033072
140005	NC_018612	CGC	2	6	5198637	5198642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033072
140006	NC_018612	GAA	2	6	5198703	5198708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033072
140007	NC_018612	CCA	2	6	5198717	5198722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033072
140008	NC_018612	GAC	2	6	5198733	5198738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033072
140009	NC_018612	TGGT	2	8	5198740	5198747	0 %	50 %	50 %	0 %	406033072
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140011	NC_018612	GGC	2	6	5198793	5198798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033072
140012	NC_018612	CGG	2	6	5198801	5198806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033072
140013	NC_018612	GGC	4	12	5198820	5198831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033072
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140017	NC_018612	CGGGGC	2	12	5199017	5199028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033072
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140020	NC_018612	CTC	2	6	5199095	5199100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140021	NC_018612	GAG	2	6	5199123	5199128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140022	NC_018612	GGCG	2	8	5199161	5199168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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140115	NC_018612	CG	3	6	5202308	5202313	0 %	0 %	50 %	50 %	406033076
140116	NC_018612	GCA	2	6	5202342	5202347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033076
140117	NC_018612	CG	3	6	5202356	5202361	0 %	0 %	50 %	50 %	406033076
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140119	NC_018612	CCG	2	6	5202431	5202436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033076
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140126	NC_018612	GGC	2	6	5202853	5202858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033076
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140144	NC_018612	GCG	2	6	5203638	5203643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033076
140145	NC_018612	GAC	3	9	5203701	5203709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140147	NC_018612	TG	3	6	5203774	5203779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140148	NC_018612	CGC	2	6	5203830	5203835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140149	NC_018612	GCT	2	6	5203851	5203856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140152	NC_018612	CGGG	2	8	5203970	5203977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140153	NC_018612	CGA	2	6	5203987	5203992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140185	NC_018612	GAATCT	2	12	5205295	5205306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140186	NC_018612	CTG	2	6	5205363	5205368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033079
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140208	NC_018612	CGG	2	6	5206073	5206078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140209	NC_018612	G	6	6	5206105	5206110	0 %	0 %	100 %	0 %	406033080
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140214	NC_018612	GCTG	2	8	5206294	5206301	0 %	25 %	50 %	25 %	406033080
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140217	NC_018612	G	6	6	5206350	5206355	0 %	0 %	100 %	0 %	406033080
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140220	NC_018612	CCG	2	6	5206471	5206476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033080
140221	NC_018612	TGGA	2	8	5206509	5206516	25 %	25 %	50 %	0 %	406033080
140222	NC_018612	CGC	2	6	5206517	5206522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033080
140223	NC_018612	CGT	2	6	5206523	5206528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033080
140224	NC_018612	CGA	2	6	5206529	5206534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033080
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140227	NC_018612	CG	3	6	5206637	5206642	0 %	0 %	50 %	50 %	406033080
140228	NC_018612	AG	3	6	5206671	5206676	50 %	0 %	50 %	0 %	406033080
140229	NC_018612	CG	3	6	5206689	5206694	0 %	0 %	50 %	50 %	406033080
140230	NC_018612	CGG	2	6	5206843	5206848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033080
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140346	NC_018612	CG	3	6	5210854	5210859	0 %	0 %	50 %	50 %	406033083
140347	NC_018612	TCG	2	6	5210910	5210915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140348	NC_018612	CTT	2	6	5210930	5210935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033083
140349	NC_018612	CAC	2	6	5210936	5210941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033083
140350	NC_018612	GC	3	6	5210946	5210951	0 %	0 %	50 %	50 %	406033083
140351	NC_018612	GTC	2	6	5210972	5210977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140352	NC_018612	CGA	2	6	5210998	5211003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140353	NC_018612	TGA	2	6	5211019	5211024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033083
140354	NC_018612	CGC	2	6	5211055	5211060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
140355	NC_018612	ATC	2	6	5211069	5211074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033083
140356	NC_018612	TCG	2	6	5211075	5211080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140357	NC_018612	TCG	2	6	5211111	5211116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140358	NC_018612	CGA	2	6	5211134	5211139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140359	NC_018612	GAT	2	6	5211152	5211157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033083
140360	NC_018612	CTT	2	6	5211161	5211166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033083
140361	NC_018612	CCCG	2	8	5211170	5211177	0 %	0 %	25 %	75 %	406033083
140362	NC_018612	CGA	2	6	5211205	5211210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140363	NC_018612	GTC	2	6	5211251	5211256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140364	NC_018612	GAC	2	6	5211281	5211286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140365	NC_018612	CGA	2	6	5211299	5211304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140366	NC_018612	TGT	2	6	5211367	5211372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033083
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140368	NC_018612	ACACGA	2	12	5211436	5211447	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406033083
140369	NC_018612	TCT	2	6	5211481	5211486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033083
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140371	NC_018612	GAC	3	9	5211521	5211529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140372	NC_018612	GCA	2	6	5211562	5211567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140373	NC_018612	GCG	2	6	5211571	5211576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033083
140374	NC_018612	GCG	2	6	5211587	5211592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033083
140375	NC_018612	CGTGC	2	10	5211626	5211635	0 %	20 %	40 %	40 %	406033083
140376	NC_018612	CCG	2	6	5211714	5211719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
140377	NC_018612	CGG	2	6	5211734	5211739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033083
140378	NC_018612	TGC	2	6	5211742	5211747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140379	NC_018612	GGT	2	6	5211770	5211775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033083
140380	NC_018612	GAT	3	9	5211788	5211796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033083
140381	NC_018612	GCC	2	6	5211810	5211815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
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140383	NC_018612	TGC	3	9	5211832	5211840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140384	NC_018612	TCG	2	6	5211864	5211869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140385	NC_018612	TGC	2	6	5211871	5211876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140386	NC_018612	TCG	3	9	5211963	5211971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140387	NC_018612	GAT	2	6	5211974	5211979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033083
140388	NC_018612	GAT	2	6	5212046	5212051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033083
140389	NC_018612	GC	4	8	5212052	5212059	0 %	0 %	50 %	50 %	406033083
140390	NC_018612	CG	3	6	5212065	5212070	0 %	0 %	50 %	50 %	406033083
140391	NC_018612	CGC	2	6	5212129	5212134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
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140393	NC_018612	TCG	2	6	5212182	5212187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140394	NC_018612	TCG	2	6	5212215	5212220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033083
140395	NC_018612	CGC	2	6	5212226	5212231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
140396	NC_018612	CG	3	6	5212248	5212253	0 %	0 %	50 %	50 %	406033083
140397	NC_018612	GCC	2	6	5212299	5212304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033083
140398	NC_018612	GCG	2	6	5212321	5212326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033083
140399	NC_018612	CGG	2	6	5212378	5212383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033083
140400	NC_018612	GAG	2	6	5212445	5212450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033083
140401	NC_018612	CCA	2	6	5212465	5212470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033083
140402	NC_018612	CGTC	2	8	5212478	5212485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140403	NC_018612	GTCACC	2	12	5212565	5212576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406033084
140404	NC_018612	CG	3	6	5212601	5212606	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140405	NC_018612	GC	3	6	5212677	5212682	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140406	NC_018612	GCG	2	6	5212686	5212691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140407	NC_018612	GC	4	8	5212759	5212766	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140408	NC_018612	CG	3	6	5212810	5212815	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140409	NC_018612	CGG	2	6	5212827	5212832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140410	NC_018612	CGC	2	6	5212849	5212854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033084
140411	NC_018612	CGA	2	6	5212915	5212920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140412	NC_018612	ATC	2	6	5212926	5212931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033084
140413	NC_018612	CGA	2	6	5212933	5212938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140414	NC_018612	GGC	2	6	5212977	5212982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140415	NC_018612	TGG	2	6	5213001	5213006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033084
140416	NC_018612	CG	3	6	5213007	5213012	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140417	NC_018612	CG	3	6	5213061	5213066	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140418	NC_018612	GCG	2	6	5213152	5213157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
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140420	NC_018612	GGT	2	6	5213181	5213186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033084
140421	NC_018612	GGAA	2	8	5213187	5213194	50 %	0 %	50 %	0 %	406033084
140422	NC_018612	TCG	2	6	5213211	5213216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140423	NC_018612	CGAT	2	8	5213343	5213350	25 %	25 %	25 %	25 %	406033084
140424	NC_018612	CG	3	6	5213359	5213364	0 %	0 %	50 %	50 %	406033084
140425	NC_018612	GGGA	2	8	5213388	5213395	25 %	0 %	75 %	0 %	406033084
140426	NC_018612	GAC	2	6	5213399	5213404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033084
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140428	NC_018612	TGCTGG	2	12	5213427	5213438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	406033084
140429	NC_018612	GAG	2	6	5213441	5213446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033084
140430	NC_018612	CGG	2	6	5213500	5213505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140431	NC_018612	ACCAAG	2	12	5213546	5213557	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406033084
140432	NC_018612	GGC	2	6	5213569	5213574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140433	NC_018612	GCC	2	6	5213592	5213597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033084
140434	NC_018612	CGG	3	9	5213601	5213609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033084
140435	NC_018612	TCG	2	6	5213637	5213642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140436	NC_018612	CCGGAT	2	12	5213674	5213685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140437	NC_018612	GCA	2	6	5213692	5213697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033084
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140439	NC_018612	AGG	2	6	5213724	5213729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033084
140440	NC_018612	AGC	3	9	5213772	5213780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033084
140441	NC_018612	CAG	2	6	5213846	5213851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033085
140442	NC_018612	GAA	2	6	5213858	5213863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033085
140443	NC_018612	TGC	2	6	5213893	5213898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033085
140444	NC_018612	GCC	2	6	5213942	5213947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
140445	NC_018612	CCG	2	6	5213959	5213964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
140446	NC_018612	GC	3	6	5213977	5213982	0 %	0 %	50 %	50 %	406033085
140447	NC_018612	CGG	2	6	5213983	5213988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033085
140448	NC_018612	CGC	2	6	5214022	5214027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
140449	NC_018612	ATC	2	6	5214063	5214068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033085
140450	NC_018612	CGA	2	6	5214100	5214105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033085
140451	NC_018612	GAA	2	6	5214125	5214130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033085
140452	NC_018612	CG	3	6	5214146	5214151	0 %	0 %	50 %	50 %	406033085
140453	NC_018612	GCC	3	9	5214168	5214176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
140454	NC_018612	GGC	2	6	5214200	5214205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033085
140455	NC_018612	GC	3	6	5214212	5214217	0 %	0 %	50 %	50 %	406033085
140456	NC_018612	CCG	2	6	5214219	5214224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
140457	NC_018612	GCC	2	6	5214242	5214247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033085
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140459	NC_018612	GGC	2	6	5214344	5214349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033085
140460	NC_018612	AGC	2	6	5214387	5214392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033085
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140489	NC_018612	AG	3	6	5215227	5215232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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140491	NC_018612	GCC	2	6	5215325	5215330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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