MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138501	NC_018612	GCCA	2	8	5146166	5146173	25 %	0 %	25 %	50 %	406033019
138502	NC_018612	CAG	2	6	5146193	5146198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138503	NC_018612	GCCG	2	8	5146200	5146207	0 %	0 %	50 %	50 %	406033019
138504	NC_018612	CT	3	6	5146221	5146226	0 %	50 %	0 %	50 %	406033019
138505	NC_018612	GAAG	2	8	5146231	5146238	50 %	0 %	50 %	0 %	406033019
138506	NC_018612	TCG	3	9	5146302	5146310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138507	NC_018612	GCG	2	6	5146401	5146406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033019
138508	NC_018612	GAG	2	6	5146410	5146415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033019
138509	NC_018612	GCGCC	2	10	5146444	5146453	0 %	0 %	40 %	60 %	406033019
138510	NC_018612	CTC	2	6	5146475	5146480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033019
138511	NC_018612	CGT	3	9	5146502	5146510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138512	NC_018612	CAC	2	6	5146553	5146558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033019
138513	NC_018612	GCT	2	6	5146615	5146620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138514	NC_018612	CGG	3	9	5146621	5146629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033019
138515	NC_018612	CTG	2	6	5146652	5146657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138516	NC_018612	ACG	2	6	5146695	5146700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138517	NC_018612	CCA	2	6	5146723	5146728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033019
138518	NC_018612	CGG	2	6	5146735	5146740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033019
138519	NC_018612	GCC	2	6	5146760	5146765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033019
138520	NC_018612	GGC	2	6	5146853	5146858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033019
138521	NC_018612	GAC	2	6	5146893	5146898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138522	NC_018612	CGG	2	6	5146915	5146920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033019
138523	NC_018612	CGC	2	6	5146976	5146981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033019
138524	NC_018612	GTC	2	6	5146982	5146987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138525	NC_018612	CGA	2	6	5147066	5147071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033019
138526	NC_018612	AAAC	2	8	5147104	5147111	75 %	0 %	0 %	25 %	406033019
138527	NC_018612	CTAA	2	8	5147164	5147171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138528	NC_018612	CGG	2	6	5147437	5147442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033020
138529	NC_018612	CAG	2	6	5147453	5147458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033020
138530	NC_018612	GGC	2	6	5147464	5147469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033020
138531	NC_018612	CGA	2	6	5147474	5147479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033020
138532	NC_018612	TGA	2	6	5147518	5147523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033020
138533	NC_018612	CGAGC	2	10	5147534	5147543	20 %	0 %	40 %	40 %	406033020
138534	NC_018612	GCA	2	6	5147560	5147565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033020
138535	NC_018612	GGT	2	6	5147597	5147602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033020
138536	NC_018612	CTG	2	6	5147612	5147617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033020
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138541	NC_018612	CTG	2	6	5147796	5147801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138542	NC_018612	TCG	2	6	5147828	5147833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033021
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138553	NC_018612	CGG	2	6	5148351	5148356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033021
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138557	NC_018612	ATA	2	6	5148476	5148481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138561	NC_018612	CCA	2	6	5148700	5148705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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138568	NC_018612	G	6	6	5148967	5148972	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138569	NC_018612	GTC	2	6	5148992	5148997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033022
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138595	NC_018612	GC	3	6	5150149	5150154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138596	NC_018612	GCC	2	6	5150213	5150218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138597	NC_018612	GC	3	6	5150276	5150281	0 %	0 %	50 %	50 %	406033023
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138603	NC_018612	CGA	2	6	5150556	5150561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033023
138604	NC_018612	GTC	2	6	5150596	5150601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033023
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138610	NC_018612	CTTCC	2	10	5150798	5150807	0 %	40 %	0 %	60 %	406033023
138611	NC_018612	GCA	4	12	5150823	5150834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033023
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138615	NC_018612	CGA	2	6	5150934	5150939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033023
138616	NC_018612	CAG	2	6	5150944	5150949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033023
138617	NC_018612	GC	3	6	5150960	5150965	0 %	0 %	50 %	50 %	406033023
138618	NC_018612	CGGTG	2	10	5150969	5150978	0 %	20 %	60 %	20 %	406033023
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138623	NC_018612	ATC	2	6	5151231	5151236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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138645	NC_018612	CCG	2	6	5152273	5152278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033025
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138667	NC_018612	GCA	2	6	5152779	5152784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138720	NC_018612	CGGCG	2	10	5154520	5154529	0 %	0 %	60 %	40 %	406033028
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138726	NC_018612	CGA	2	6	5154782	5154787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033028
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138729	NC_018612	CG	4	8	5155019	5155026	0 %	0 %	50 %	50 %	406033028
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138731	NC_018612	GCT	2	6	5155076	5155081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033028
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138744	NC_018612	CCG	2	6	5155539	5155544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138746	NC_018612	CGGG	2	8	5155566	5155573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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138845	NC_018612	CGA	2	6	5158834	5158839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033030
138846	NC_018612	CAG	2	6	5158842	5158847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033030
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138848	NC_018612	GTC	2	6	5158862	5158867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033030
138849	NC_018612	GC	3	6	5158902	5158907	0 %	0 %	50 %	50 %	406033030
138850	NC_018612	CTGGAC	2	12	5158922	5158933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033030
138851	NC_018612	TGC	2	6	5158938	5158943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033030
138852	NC_018612	GCA	2	6	5158963	5158968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033030
138853	NC_018612	GGC	2	6	5158972	5158977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033030
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138860	NC_018612	GC	3	6	5159185	5159190	0 %	0 %	50 %	50 %	406033031
138861	NC_018612	GTC	2	6	5159197	5159202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033031
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138865	NC_018612	CGA	2	6	5159265	5159270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033031
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138867	NC_018612	CCGG	2	8	5159330	5159337	0 %	0 %	50 %	50 %	406033031
138868	NC_018612	CGG	2	6	5159459	5159464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033031
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138877	NC_018612	GCT	2	6	5159632	5159637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033031
138878	NC_018612	CGGCCG	2	12	5159638	5159649	0 %	0 %	50 %	50 %	406033031
138879	NC_018612	GCA	2	6	5159658	5159663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033031
138880	NC_018612	CCG	2	6	5159670	5159675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033031
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138884	NC_018612	GC	3	6	5159832	5159837	0 %	0 %	50 %	50 %	406033032
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138888	NC_018612	CGA	4	12	5160000	5160011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033032
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138902	NC_018612	GC	3	6	5160382	5160387	0 %	0 %	50 %	50 %	406033032
138903	NC_018612	GCA	2	6	5160399	5160404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033032
138904	NC_018612	GCC	2	6	5160449	5160454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033032
138905	NC_018612	CGA	2	6	5160459	5160464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033032
138906	NC_018612	GCA	2	6	5160501	5160506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138907	NC_018612	ATC	2	6	5160507	5160512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138908	NC_018612	GCGGT	2	10	5160520	5160529	0 %	20 %	60 %	20 %	406033034
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138910	NC_018612	CCA	2	6	5160619	5160624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033034
138911	NC_018612	CAG	2	6	5160647	5160652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033034
138912	NC_018612	CGA	2	6	5160666	5160671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033034
138913	NC_018612	TGCAGC	2	12	5160677	5160688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033034
138914	NC_018612	GGGC	2	8	5160763	5160770	0 %	0 %	75 %	25 %	406033034
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138916	NC_018612	CGAT	2	8	5160813	5160820	25 %	25 %	25 %	25 %	406033034
138917	NC_018612	GATC	2	8	5160836	5160843	25 %	25 %	25 %	25 %	406033033
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138922	NC_018612	GCC	2	6	5161008	5161013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033033
138923	NC_018612	CCT	2	6	5161018	5161023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033033
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138925	NC_018612	CCT	2	6	5161054	5161059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033033
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138927	NC_018612	GGT	2	6	5161141	5161146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033033
138928	NC_018612	CG	4	8	5161177	5161184	0 %	0 %	50 %	50 %	406033033
138929	NC_018612	GGC	2	6	5161196	5161201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
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138932	NC_018612	GTG	3	9	5161221	5161229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033033
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138934	NC_018612	CAC	2	6	5161298	5161303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033033
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138939	NC_018612	CGG	2	6	5161398	5161403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
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138944	NC_018612	GGTG	2	8	5161553	5161560	0 %	25 %	75 %	0 %	406033033
138945	NC_018612	GGCC	2	8	5161586	5161593	0 %	0 %	50 %	50 %	406033033
138946	NC_018612	GTG	2	6	5161647	5161652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033033
138947	NC_018612	C	6	6	5161676	5161681	0 %	0 %	0 %	100 %	406033033
138948	NC_018612	GGC	2	6	5161694	5161699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
138949	NC_018612	GCT	2	6	5161700	5161705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033033
138950	NC_018612	TG	3	6	5161708	5161713	0 %	50 %	50 %	0 %	406033033
138951	NC_018612	TTGTG	2	10	5161720	5161729	0 %	60 %	40 %	0 %	406033033
138952	NC_018612	CG	3	6	5161742	5161747	0 %	0 %	50 %	50 %	406033033
138953	NC_018612	CGG	2	6	5161783	5161788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
138954	NC_018612	TGGC	2	8	5161791	5161798	0 %	25 %	50 %	25 %	406033033
138955	NC_018612	CCG	2	6	5161807	5161812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033033
138956	NC_018612	CGC	2	6	5161852	5161857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033033
138957	NC_018612	GCG	3	9	5161906	5161914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
138958	NC_018612	GCC	2	6	5161920	5161925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033033
138959	NC_018612	GGC	3	9	5161967	5161975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
138960	NC_018612	GCGCA	2	10	5161992	5162001	20 %	0 %	40 %	40 %	406033033
138961	NC_018612	CG	3	6	5162054	5162059	0 %	0 %	50 %	50 %	406033033
138962	NC_018612	CTG	2	6	5162079	5162084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033033
138963	NC_018612	GGC	2	6	5162132	5162137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033033
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138998	NC_018612	GCG	2	6	5163371	5163376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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