MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_018612	TCG	2	6	5128988	5128993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138002	NC_018612	CG	3	6	5129022	5129027	0 %	0 %	50 %	50 %	406033006
138003	NC_018612	GCG	2	6	5129062	5129067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033006
138004	NC_018612	CGC	2	6	5129082	5129087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138005	NC_018612	G	6	6	5129124	5129129	0 %	0 %	100 %	0 %	406033006
138006	NC_018612	ACC	2	6	5129137	5129142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138007	NC_018612	GCC	3	9	5129146	5129154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138008	NC_018612	CCGA	2	8	5129164	5129171	25 %	0 %	25 %	50 %	406033006
138009	NC_018612	GCC	2	6	5129215	5129220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138010	NC_018612	CGA	2	6	5129271	5129276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138011	NC_018612	GGGC	2	8	5129352	5129359	0 %	0 %	75 %	25 %	406033006
138012	NC_018612	CGT	2	6	5129394	5129399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138013	NC_018612	TGG	2	6	5129420	5129425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033006
138014	NC_018612	TGA	2	6	5129450	5129455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033006
138015	NC_018612	C	7	7	5129471	5129477	0 %	0 %	0 %	100 %	406033006
138016	NC_018612	CCA	3	9	5129500	5129508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138017	NC_018612	CAC	2	6	5129541	5129546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138018	NC_018612	CGT	2	6	5129553	5129558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138019	NC_018612	CCG	2	6	5129566	5129571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138020	NC_018612	CCA	2	6	5129594	5129599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138021	NC_018612	ACC	2	6	5129602	5129607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138022	NC_018612	CCG	3	9	5129614	5129622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138023	NC_018612	ACG	3	9	5129635	5129643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138024	NC_018612	CAC	2	6	5129658	5129663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138025	NC_018612	GAC	2	6	5129664	5129669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138026	NC_018612	CAC	2	6	5129670	5129675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138027	NC_018612	CGC	2	6	5129678	5129683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138028	NC_018612	CCA	2	6	5129684	5129689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138029	NC_018612	ACC	2	6	5129704	5129709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033006
138030	NC_018612	CGA	3	9	5129723	5129731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033006
138031	NC_018612	GCC	2	6	5129751	5129756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033006
138032	NC_018612	TGG	2	6	5129842	5129847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138033	NC_018612	CGA	2	6	5129911	5129916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138034	NC_018612	TCA	2	6	5130050	5130055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033007
138035	NC_018612	TGGGCA	2	12	5130065	5130076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406033007
138036	NC_018612	CGC	2	6	5130099	5130104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033007
138037	NC_018612	ACG	2	6	5130105	5130110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138038	NC_018612	CGA	2	6	5130165	5130170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138039	NC_018612	CTT	2	6	5130255	5130260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033007
138040	NC_018612	CTT	2	6	5130273	5130278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033007
138041	NC_018612	TCC	2	6	5130281	5130286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406033007
138042	NC_018612	TGT	2	6	5130314	5130319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033007
138043	NC_018612	CTT	2	6	5130381	5130386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033007
138044	NC_018612	CGG	2	6	5130489	5130494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033007
138045	NC_018612	CTGG	2	8	5130498	5130505	0 %	25 %	50 %	25 %	406033007
138046	NC_018612	CGT	2	6	5130525	5130530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138047	NC_018612	CAA	2	6	5130564	5130569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033007
138048	NC_018612	ATC	2	6	5130655	5130660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033007
138049	NC_018612	CTG	3	9	5130673	5130681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138050	NC_018612	ATC	2	6	5130709	5130714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033007
138051	NC_018612	TGC	2	6	5130716	5130721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138052	NC_018612	GCACAT	2	12	5130729	5130740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406033007
138053	NC_018612	GCT	2	6	5130795	5130800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138054	NC_018612	ACG	2	6	5130812	5130817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138055	NC_018612	CCCG	2	8	5130840	5130847	0 %	0 %	25 %	75 %	406033007
138056	NC_018612	ACG	2	6	5130848	5130853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138057	NC_018612	TCA	2	6	5130989	5130994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033007
138058	NC_018612	CGG	2	6	5131070	5131075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033007
138059	NC_018612	G	7	7	5131074	5131080	0 %	0 %	100 %	0 %	406033007
138060	NC_018612	GAG	2	6	5131087	5131092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033007
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138065	NC_018612	GCG	2	6	5131250	5131255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033007
138066	NC_018612	CAT	2	6	5131299	5131304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033007
138067	NC_018612	TGA	2	6	5131325	5131330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033007
138068	NC_018612	CGA	2	6	5131431	5131436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
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138072	NC_018612	GCT	2	6	5131566	5131571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
138073	NC_018612	CG	3	6	5131632	5131637	0 %	0 %	50 %	50 %	406033007
138074	NC_018612	CAG	2	6	5131663	5131668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
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138081	NC_018612	CAA	2	6	5131920	5131925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033007
138082	NC_018612	CTG	2	6	5132007	5132012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033007
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138084	NC_018612	CG	3	6	5132025	5132030	0 %	0 %	50 %	50 %	406033007
138085	NC_018612	TGGA	2	8	5132035	5132042	25 %	25 %	50 %	0 %	406033007
138086	NC_018612	CGA	2	6	5132079	5132084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
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138094	NC_018612	AAGGC	2	10	5132414	5132423	40 %	0 %	40 %	20 %	406033007
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138102	NC_018612	GGGCCT	2	12	5132724	5132735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406033007
138103	NC_018612	AAG	2	6	5132764	5132769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033007
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138106	NC_018612	CGA	2	6	5132871	5132876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033007
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138109	NC_018612	GCA	2	6	5133062	5133067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033008
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138111	NC_018612	CAG	2	6	5133132	5133137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033008
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138113	NC_018612	CGC	2	6	5133297	5133302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033008
138114	NC_018612	GGT	2	6	5133305	5133310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033008
138115	NC_018612	TCGACG	2	12	5133346	5133357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406033008
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138122	NC_018612	GC	3	6	5133657	5133662	0 %	0 %	50 %	50 %	406033008
138123	NC_018612	GCT	4	12	5133671	5133682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033008
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138196	NC_018612	GAT	2	6	5136439	5136444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033010
138197	NC_018612	CCTGTG	2	12	5136462	5136473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138210	NC_018612	GCG	2	6	5136897	5136902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033012
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138226	NC_018612	TCG	2	6	5137619	5137624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033012
138227	NC_018612	GTC	2	6	5137716	5137721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138228	NC_018612	TGCT	2	8	5137749	5137756	0 %	50 %	25 %	25 %	406033013
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138248	NC_018612	TCC	2	6	5138448	5138453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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138312	NC_018612	GC	3	6	5140572	5140577	0 %	0 %	50 %	50 %	406033016
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138329	NC_018612	GGCA	2	8	5141084	5141091	25 %	0 %	50 %	25 %	406033016
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138332	NC_018612	GCCG	2	8	5141182	5141189	0 %	0 %	50 %	50 %	406033016
138333	NC_018612	TGA	2	6	5141214	5141219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406033016
138334	NC_018612	TCG	2	6	5141229	5141234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033016
138335	NC_018612	CAG	2	6	5141311	5141316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033016
138336	NC_018612	GC	3	6	5141348	5141353	0 %	0 %	50 %	50 %	406033016
138337	NC_018612	TGG	2	6	5141363	5141368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033016
138338	NC_018612	CG	3	6	5141463	5141468	0 %	0 %	50 %	50 %	406033016
138339	NC_018612	GCG	3	9	5141477	5141485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033016
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