MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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135502	NC_018612	CGG	2	6	5037963	5037968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032913
135503	NC_018612	CGAT	2	8	5038001	5038008	25 %	25 %	25 %	25 %	406032913
135504	NC_018612	TGACT	2	10	5038078	5038087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135505	NC_018612	CGG	2	6	5038193	5038198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135506	NC_018612	AGC	2	6	5038202	5038207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135507	NC_018612	CGA	2	6	5038285	5038290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032914
135508	NC_018612	CGC	2	6	5038370	5038375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032914
135509	NC_018612	GGC	2	6	5038391	5038396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032914
135510	NC_018612	CGA	2	6	5038442	5038447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032914
135511	NC_018612	CGGCG	2	10	5038467	5038476	0 %	0 %	60 %	40 %	406032914
135512	NC_018612	ACG	3	9	5038537	5038545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032914
135513	NC_018612	GTCC	2	8	5038556	5038563	0 %	25 %	25 %	50 %	406032914
135514	NC_018612	CCGG	2	8	5038582	5038589	0 %	0 %	50 %	50 %	406032914
135515	NC_018612	TGC	2	6	5038669	5038674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032914
135516	NC_018612	TCG	2	6	5038720	5038725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032914
135517	NC_018612	GGACC	2	10	5038806	5038815	20 %	0 %	40 %	40 %	406032914
135518	NC_018612	TGA	2	6	5038827	5038832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032914
135519	NC_018612	GGCC	2	8	5038839	5038846	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
135520	NC_018612	CCG	2	6	5038895	5038900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032915
135521	NC_018612	GGT	2	6	5038939	5038944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032915
135522	NC_018612	GTC	2	6	5038970	5038975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032915
135523	NC_018612	CGCC	2	8	5038983	5038990	0 %	0 %	25 %	75 %	406032915
135524	NC_018612	TGC	2	6	5039001	5039006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032915
135525	NC_018612	CG	3	6	5039045	5039050	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
135526	NC_018612	CGG	2	6	5039061	5039066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032915
135527	NC_018612	TGGCC	2	10	5039070	5039079	0 %	20 %	40 %	40 %	406032915
135528	NC_018612	GCTG	2	8	5039106	5039113	0 %	25 %	50 %	25 %	406032915
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135534	NC_018612	GC	3	6	5039375	5039380	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
135535	NC_018612	CGA	2	6	5039383	5039388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032915
135536	NC_018612	GTCGAC	2	12	5039417	5039428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406032915
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135538	NC_018612	CGG	2	6	5039481	5039486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032915
135539	NC_018612	CG	3	6	5039488	5039493	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
135540	NC_018612	GC	4	8	5039520	5039527	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
135541	NC_018612	CGA	2	6	5039554	5039559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032915
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135543	NC_018612	CG	3	6	5039619	5039624	0 %	0 %	50 %	50 %	406032915
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135547	NC_018612	CTGG	2	8	5039783	5039790	0 %	25 %	50 %	25 %	406032916
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135551	NC_018612	CG	3	6	5040018	5040023	0 %	0 %	50 %	50 %	406032916
135552	NC_018612	GCC	2	6	5040027	5040032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032916
135553	NC_018612	GCG	3	9	5040037	5040045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032916
135554	NC_018612	CG	3	6	5040078	5040083	0 %	0 %	50 %	50 %	406032916
135555	NC_018612	CGG	2	6	5040139	5040144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032916
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135615	NC_018612	TCG	2	6	5042462	5042467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135616	NC_018612	CGA	2	6	5042520	5042525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135617	NC_018612	CGGC	2	8	5042530	5042537	0 %	0 %	50 %	50 %	406032918
135618	NC_018612	CGA	2	6	5042541	5042546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135619	NC_018612	CGA	2	6	5042583	5042588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135620	NC_018612	GCC	2	6	5042596	5042601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
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135634	NC_018612	GCTCG	2	10	5043180	5043189	0 %	20 %	40 %	40 %	406032918
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135646	NC_018612	CGA	2	6	5043480	5043485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
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135648	NC_018612	GC	3	6	5043542	5043547	0 %	0 %	50 %	50 %	406032918
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135654	NC_018612	GCC	2	6	5043652	5043657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
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135658	NC_018612	CGG	2	6	5043747	5043752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135659	NC_018612	GC	3	6	5043764	5043769	0 %	0 %	50 %	50 %	406032918
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135662	NC_018612	GCA	2	6	5043795	5043800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
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135666	NC_018612	CGT	2	6	5043878	5043883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032918
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135673	NC_018612	TCG	2	6	5044121	5044126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032918
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135677	NC_018612	CGC	2	6	5044308	5044313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
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135682	NC_018612	CGG	2	6	5044491	5044496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
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135688	NC_018612	ACG	2	6	5044754	5044759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135689	NC_018612	CCG	2	6	5044760	5044765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
135690	NC_018612	TGG	2	6	5044826	5044831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135691	NC_018612	GTG	2	6	5044837	5044842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135692	NC_018612	GGC	2	6	5044901	5044906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135693	NC_018612	CGG	2	6	5044916	5044921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135694	NC_018612	TGC	2	6	5044928	5044933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135695	NC_018612	CGG	2	6	5044935	5044940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135696	NC_018612	ATC	2	6	5044966	5044971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032918
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135699	NC_018612	GCGCG	2	10	5045100	5045109	0 %	0 %	60 %	40 %	406032918
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135702	NC_018612	GAC	2	6	5045166	5045171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032918
135703	NC_018612	GGC	2	6	5045172	5045177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135704	NC_018612	GTCCG	2	10	5045196	5045205	0 %	20 %	40 %	40 %	406032918
135705	NC_018612	AGT	2	6	5045209	5045214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032918
135706	NC_018612	TGG	2	6	5045249	5045254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135707	NC_018612	TGG	2	6	5045276	5045281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135708	NC_018612	TGG	2	6	5045297	5045302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135709	NC_018612	TGG	2	6	5045330	5045335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032918
135710	NC_018612	CAGC	2	8	5045361	5045368	25 %	0 %	25 %	50 %	406032918
135711	NC_018612	GCC	2	6	5045419	5045424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
135712	NC_018612	GCG	3	9	5045425	5045433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032918
135713	NC_018612	GCC	3	9	5045493	5045501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
135714	NC_018612	CCG	2	6	5045507	5045512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032918
135715	NC_018612	ACC	2	6	5045541	5045546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032918
135716	NC_018612	GC	3	6	5045550	5045555	0 %	0 %	50 %	50 %	406032918
135717	NC_018612	CGA	2	6	5045606	5045611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135718	NC_018612	TCG	2	6	5045641	5045646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135719	NC_018612	ATG	2	6	5045711	5045716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032919
135720	NC_018612	AAG	2	6	5045723	5045728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406032919
135721	NC_018612	AGC	2	6	5045835	5045840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032919
135722	NC_018612	G	6	6	5045852	5045857	0 %	0 %	100 %	0 %	406032919
135723	NC_018612	GCC	2	6	5045861	5045866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032919
135724	NC_018612	GGC	2	6	5045869	5045874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032919
135725	NC_018612	CGT	2	6	5045902	5045907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032919
135726	NC_018612	CGC	2	6	5045911	5045916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032919
135727	NC_018612	CTG	2	6	5045924	5045929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032919
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135729	NC_018612	ACA	2	6	5045943	5045948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406032919
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135843	NC_018612	CGG	2	6	5050554	5050559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032924
135844	NC_018612	GC	3	6	5050567	5050572	0 %	0 %	50 %	50 %	406032924
135845	NC_018612	TGGC	2	8	5050601	5050608	0 %	25 %	50 %	25 %	406032924
135846	NC_018612	GCG	2	6	5050642	5050647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032924
135847	NC_018612	TCG	2	6	5050653	5050658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032924
135848	NC_018612	GCC	2	6	5050796	5050801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032925
135849	NC_018612	GCG	2	6	5050809	5050814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032925
135850	NC_018612	GTT	2	6	5050819	5050824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406032925
135851	NC_018612	CTT	2	6	5050840	5050845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406032925
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135853	NC_018612	GCC	2	6	5050913	5050918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032925
135854	NC_018612	CTG	2	6	5050943	5050948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032925
135855	NC_018612	CAC	2	6	5050996	5051001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032925
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135857	NC_018612	GCTGGG	2	12	5051032	5051043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	406032925
135858	NC_018612	CCG	2	6	5051090	5051095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032925
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135860	NC_018612	GAG	2	6	5051120	5051125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032925
135861	NC_018612	GAC	3	9	5051156	5051164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032925
135862	NC_018612	GC	3	6	5051178	5051183	0 %	0 %	50 %	50 %	406032925
135863	NC_018612	TG	3	6	5051207	5051212	0 %	50 %	50 %	0 %	406032925
135864	NC_018612	CGG	2	6	5051245	5051250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032925
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135866	NC_018612	GAG	2	6	5051324	5051329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032925
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135869	NC_018612	CGG	2	6	5051407	5051412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032925
135870	NC_018612	CGA	2	6	5051418	5051423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032925
135871	NC_018612	CGA	2	6	5051443	5051448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032925
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135876	NC_018612	CCA	2	6	5051717	5051722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032926
135877	NC_018612	TCG	2	6	5051752	5051757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135878	NC_018612	CGG	2	6	5051765	5051770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032926
135879	NC_018612	TGC	2	6	5051893	5051898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135880	NC_018612	GTC	2	6	5051940	5051945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135881	NC_018612	TCG	2	6	5051971	5051976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135882	NC_018612	GGTGG	2	10	5052049	5052058	0 %	20 %	80 %	0 %	406032926
135883	NC_018612	CGG	2	6	5052099	5052104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032926
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135888	NC_018612	CGT	3	9	5052338	5052346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
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135890	NC_018612	TGA	2	6	5052383	5052388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032926
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135894	NC_018612	CTG	2	6	5052492	5052497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135895	NC_018612	CTG	2	6	5052543	5052548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032926
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135898	NC_018612	AGT	2	6	5052800	5052805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032926
135899	NC_018612	GCCC	2	8	5052929	5052936	0 %	0 %	25 %	75 %	406032926
135900	NC_018612	GC	4	8	5052965	5052972	0 %	0 %	50 %	50 %	406032926
135901	NC_018612	CGA	2	6	5052977	5052982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032926
135902	NC_018612	CCA	3	9	5052998	5053006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032926
135903	NC_018612	CCG	3	9	5053010	5053018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032926
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135905	NC_018612	CGG	2	6	5053125	5053130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135906	NC_018612	GA	3	6	5053139	5053144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135907	NC_018612	CCG	2	6	5053321	5053326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032927
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135909	NC_018612	CGC	2	6	5053335	5053340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032927
135910	NC_018612	GC	3	6	5053362	5053367	0 %	0 %	50 %	50 %	406032927
135911	NC_018612	CGA	2	6	5053386	5053391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032928
135912	NC_018612	CCA	2	6	5053550	5053555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032928
135913	NC_018612	GAT	2	6	5053578	5053583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032928
135914	NC_018612	CGA	2	6	5053656	5053661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032928
135915	NC_018612	CCGT	2	8	5053682	5053689	0 %	25 %	25 %	50 %	406032928
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135924	NC_018612	ATC	2	6	5053957	5053962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032928
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135928	NC_018612	CGGGCG	2	12	5054180	5054191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032928
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135930	NC_018612	TCG	2	6	5054264	5054269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032928
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135936	NC_018612	CTGA	2	8	5054575	5054582	25 %	25 %	25 %	25 %	406032928
135937	NC_018612	ACC	2	6	5054605	5054610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032928
135938	NC_018612	GCACC	2	10	5054763	5054772	20 %	0 %	20 %	60 %	406032928
135939	NC_018612	CGA	3	9	5054798	5054806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135940	NC_018612	CGA	3	9	5054839	5054847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032929
135941	NC_018612	CGA	2	6	5054883	5054888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032929
135942	NC_018612	GC	3	6	5054902	5054907	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135943	NC_018612	CCA	2	6	5054913	5054918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032929
135944	NC_018612	CG	3	6	5054925	5054930	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135945	NC_018612	GAC	2	6	5055095	5055100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032929
135946	NC_018612	CCGG	2	8	5055117	5055124	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135947	NC_018612	GGT	2	6	5055136	5055141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032929
135948	NC_018612	GGT	2	6	5055199	5055204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032929
135949	NC_018612	ACCA	2	8	5055216	5055223	50 %	0 %	0 %	50 %	406032929
135950	NC_018612	CGA	2	6	5055243	5055248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032929
135951	NC_018612	GGCC	2	8	5055253	5055260	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135952	NC_018612	GAC	2	6	5055277	5055282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032929
135953	NC_018612	GC	3	6	5055286	5055291	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135954	NC_018612	GC	3	6	5055307	5055312	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
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135956	NC_018612	GC	3	6	5055331	5055336	0 %	0 %	50 %	50 %	406032929
135957	NC_018612	CGG	2	6	5055351	5055356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032929
135958	NC_018612	TGGC	2	8	5055368	5055375	0 %	25 %	50 %	25 %	406032929
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