MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018612	GCT	3	9	517368	517376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028676
13002	NC_018612	CGTC	2	8	517387	517394	0 %	25 %	25 %	50 %	406028676
13003	NC_018612	GCTC	2	8	517402	517409	0 %	25 %	25 %	50 %	406028676
13004	NC_018612	TCG	2	6	517455	517460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028676
13005	NC_018612	CCT	2	6	517462	517467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028676
13006	NC_018612	CTT	2	6	517472	517477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028676
13007	NC_018612	GCG	2	6	517478	517483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028676
13008	NC_018612	C	6	6	517488	517493	0 %	0 %	0 %	100 %	406028676
13009	NC_018612	CTT	2	6	517502	517507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028676
13010	NC_018612	CGG	5	15	517532	517546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028676
13011	NC_018612	GA	3	6	517563	517568	50 %	0 %	50 %	0 %	406028676
13012	NC_018612	CGG	2	6	517600	517605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028676
13013	NC_018612	AAC	2	6	517623	517628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028676
13014	NC_018612	CGA	2	6	517678	517683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028676
13015	NC_018612	GCA	2	6	517774	517779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028676
13016	NC_018612	ACC	2	6	517788	517793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028676
13017	NC_018612	GC	3	6	517816	517821	0 %	0 %	50 %	50 %	406028676
13018	NC_018612	GAA	3	9	517895	517903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028676
13019	NC_018612	CGG	2	6	517915	517920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028676
13020	NC_018612	CCT	2	6	517970	517975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_018612	GGTT	2	8	517983	517990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_018612	GGA	2	6	518060	518065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_018612	AACCC	2	10	518094	518103	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13024	NC_018612	TCC	2	6	518139	518144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_018612	CG	3	6	518219	518224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_018612	GCA	2	6	518259	518264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_018612	CCG	2	6	518336	518341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_018612	GCC	2	6	518478	518483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028677
13029	NC_018612	CCA	2	6	518495	518500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028677
13030	NC_018612	GCCC	2	8	518564	518571	0 %	0 %	25 %	75 %	406028677
13031	NC_018612	GCT	2	6	518591	518596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028677
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13034	NC_018612	GCT	2	6	518696	518701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028677
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13038	NC_018612	GAT	2	6	518897	518902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028677
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13040	NC_018612	TGC	2	6	519040	519045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028677
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13043	NC_018612	GGC	4	12	519158	519169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028677
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13045	NC_018612	GAA	2	6	519290	519295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028677
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13048	NC_018612	TGC	2	6	519373	519378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028677
13049	NC_018612	CAG	2	6	519384	519389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028677
13050	NC_018612	GGC	2	6	519413	519418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028677
13051	NC_018612	GACC	2	8	519464	519471	25 %	0 %	25 %	50 %	406028677
13052	NC_018612	GGC	2	6	519477	519482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028677
13053	NC_018612	TCA	2	6	519487	519492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028677
13054	NC_018612	GGCG	2	8	519566	519573	0 %	0 %	75 %	25 %	406028677
13055	NC_018612	CGT	2	6	519574	519579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028677
13056	NC_018612	GC	3	6	519679	519684	0 %	0 %	50 %	50 %	406028677
13057	NC_018612	GCC	2	6	519690	519695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028677
13058	NC_018612	CGA	2	6	519731	519736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_018612	TCG	3	9	519753	519761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_018612	GAC	2	6	519762	519767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_018612	CTG	2	6	519777	519782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_018612	GTG	2	6	519828	519833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028678
13063	NC_018612	GGCC	2	8	519875	519882	0 %	0 %	50 %	50 %	406028678
13064	NC_018612	CG	3	6	519913	519918	0 %	0 %	50 %	50 %	406028678
13065	NC_018612	CCT	2	6	519931	519936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028678
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13067	NC_018612	GCA	2	6	520039	520044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028678
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13073	NC_018612	TCG	2	6	520153	520158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028678
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13092	NC_018612	CTG	2	6	520665	520670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028678
13093	NC_018612	CGG	2	6	520687	520692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028678
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13099	NC_018612	GCT	2	6	520862	520867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028678
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13101	NC_018612	GCCG	3	12	520969	520980	0 %	0 %	50 %	50 %	406028678
13102	NC_018612	CCGG	2	8	520991	520998	0 %	0 %	50 %	50 %	406028678
13103	NC_018612	CCT	2	6	521118	521123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028678
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13105	NC_018612	CGC	2	6	521186	521191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028678
13106	NC_018612	GCA	2	6	521200	521205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028678
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13109	NC_018612	GTGCG	2	10	521409	521418	0 %	20 %	60 %	20 %	406028678
13110	NC_018612	CGG	2	6	521499	521504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028678
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13119	NC_018612	CGC	2	6	521756	521761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
13120	NC_018612	CGGT	2	8	521785	521792	0 %	25 %	50 %	25 %	406028679
13121	NC_018612	GTG	2	6	521867	521872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028679
13122	NC_018612	GCA	2	6	521890	521895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13123	NC_018612	CCGC	2	8	521982	521989	0 %	0 %	25 %	75 %	406028679
13124	NC_018612	ACG	2	6	521992	521997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13125	NC_018612	AGC	2	6	522033	522038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13126	NC_018612	GCC	2	6	522041	522046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
13127	NC_018612	AAG	2	6	522066	522071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028679
13128	NC_018612	CGC	2	6	522140	522145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
13129	NC_018612	CGC	2	6	522268	522273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
13130	NC_018612	GCC	2	6	522296	522301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
13131	NC_018612	CAGCCG	2	12	522303	522314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028679
13132	NC_018612	AGC	2	6	522321	522326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13133	NC_018612	CGCC	2	8	522331	522338	0 %	0 %	25 %	75 %	406028679
13134	NC_018612	CGT	2	6	522475	522480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13135	NC_018612	GTG	3	9	522482	522490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028679
13136	NC_018612	GCC	2	6	522541	522546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028679
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13139	NC_018612	GCA	2	6	522583	522588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13140	NC_018612	ACG	2	6	522612	522617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13141	NC_018612	TGC	2	6	522835	522840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13142	NC_018612	CGT	2	6	522841	522846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028679
13143	NC_018612	GGC	2	6	522878	522883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028679
13144	NC_018612	GTC	2	6	522948	522953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13145	NC_018612	CGC	2	6	523035	523040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028680
13146	NC_018612	TCG	2	6	523049	523054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13147	NC_018612	ATC	2	6	523127	523132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028680
13148	NC_018612	GGC	2	6	523138	523143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028680
13149	NC_018612	C	6	6	523157	523162	0 %	0 %	0 %	100 %	406028680
13150	NC_018612	CGA	2	6	523168	523173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13151	NC_018612	ACGT	2	8	523190	523197	25 %	25 %	25 %	25 %	406028680
13152	NC_018612	GTCGCG	2	12	523231	523242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028680
13153	NC_018612	CAC	2	6	523342	523347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028680
13154	NC_018612	GCC	2	6	523362	523367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028680
13155	NC_018612	GC	3	6	523372	523377	0 %	0 %	50 %	50 %	406028680
13156	NC_018612	GCT	2	6	523435	523440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13157	NC_018612	CG	4	8	523495	523502	0 %	0 %	50 %	50 %	406028680
13158	NC_018612	AGT	2	6	523536	523541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028680
13159	NC_018612	CGT	2	6	523587	523592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13160	NC_018612	GTA	2	6	523606	523611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028680
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13162	NC_018612	GGT	3	9	523648	523656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028680
13163	NC_018612	CCG	2	6	523657	523662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028680
13164	NC_018612	TCG	2	6	523682	523687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028680
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13167	NC_018612	CGA	2	6	523746	523751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13168	NC_018612	AGCG	2	8	523781	523788	25 %	0 %	50 %	25 %	406028680
13169	NC_018612	CGA	2	6	523809	523814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13170	NC_018612	ACG	2	6	523992	523997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028680
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13175	NC_018612	CAG	2	6	524284	524289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028680
13176	NC_018612	CAC	2	6	524338	524343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028680
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13178	NC_018612	CCG	2	6	524377	524382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13179	NC_018612	GCG	3	9	524386	524394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13180	NC_018612	TCA	2	6	524404	524409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13181	NC_018612	GAG	2	6	524411	524416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13182	NC_018612	GCG	2	6	524473	524478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028681
13183	NC_018612	GCC	2	6	524485	524490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028681
13184	NC_018612	TC	3	6	524523	524528	0 %	50 %	0 %	50 %	406028681
13185	NC_018612	TGC	2	6	524552	524557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028681
13186	NC_018612	GGGC	2	8	524559	524566	0 %	0 %	75 %	25 %	406028681
13187	NC_018612	GGGC	2	8	524570	524577	0 %	0 %	75 %	25 %	406028681
13188	NC_018612	CCA	2	6	524603	524608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028681
13189	NC_018612	ACGTGG	2	12	524636	524647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406028681
13190	NC_018612	GCCGG	2	10	524713	524722	0 %	0 %	60 %	40 %	406028681
13191	NC_018612	ACC	2	6	524743	524748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028681
13192	NC_018612	GCGG	2	8	524758	524765	0 %	0 %	75 %	25 %	406028681
13193	NC_018612	CTT	2	6	524775	524780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028681
13194	NC_018612	GAA	2	6	524841	524846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028681
13195	NC_018612	CGGG	2	8	524866	524873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13196	NC_018612	GC	3	6	524880	524885	0 %	0 %	50 %	50 %	406028682
13197	NC_018612	CGC	2	6	524915	524920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028682
13198	NC_018612	TTC	2	6	524986	524991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028682
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13200	NC_018612	ATG	2	6	525124	525129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028682
13201	NC_018612	GCG	3	9	525170	525178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028682
13202	NC_018612	CGG	2	6	525210	525215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028682
13203	NC_018612	GCC	2	6	525216	525221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028682
13204	NC_018612	TGGA	2	8	525229	525236	25 %	25 %	50 %	0 %	406028682
13205	NC_018612	GC	3	6	525274	525279	0 %	0 %	50 %	50 %	406028682
13206	NC_018612	TCG	2	6	525280	525285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028682
13207	NC_018612	CGG	3	9	525404	525412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028682
13208	NC_018612	CTGGC	2	10	525424	525433	0 %	20 %	40 %	40 %	406028682
13209	NC_018612	GCC	2	6	525444	525449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028682
13210	NC_018612	ACC	2	6	525517	525522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028682
13211	NC_018612	C	7	7	525545	525551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13212	NC_018612	GGT	2	6	525562	525567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13213	NC_018612	GGC	2	6	525577	525582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13214	NC_018612	GC	3	6	525588	525593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13215	NC_018612	GC	3	6	525655	525660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13216	NC_018612	GCT	2	6	525764	525769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13217	NC_018612	GCA	2	6	525779	525784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13218	NC_018612	GCA	2	6	525788	525793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13219	NC_018612	CAG	3	9	525810	525818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13220	NC_018612	CGT	3	9	525866	525874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13221	NC_018612	GCG	2	6	525883	525888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028683
13222	NC_018612	GGT	2	6	525890	525895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028683
13223	NC_018612	GATC	2	8	525905	525912	25 %	25 %	25 %	25 %	406028683
13224	NC_018612	CGT	2	6	525917	525922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13225	NC_018612	TCG	2	6	525958	525963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028683
13226	NC_018612	GCC	3	9	526040	526048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028683
13227	NC_018612	CCGC	2	8	526056	526063	0 %	0 %	25 %	75 %	406028683
13228	NC_018612	CGA	2	6	526125	526130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028684
13229	NC_018612	CTG	2	6	526186	526191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028684
13230	NC_018612	GCC	2	6	526200	526205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028684
13231	NC_018612	CGG	2	6	526318	526323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028684
13232	NC_018612	CGT	2	6	526341	526346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028684
13233	NC_018612	GGGCG	2	10	526413	526422	0 %	0 %	80 %	20 %	406028684
13234	NC_018612	GCT	2	6	526470	526475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028684
13235	NC_018612	CGA	2	6	526497	526502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028684
13236	NC_018612	ATC	2	6	526522	526527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028684
13237	NC_018612	GGCGA	2	10	526549	526558	20 %	0 %	60 %	20 %	406028684
13238	NC_018612	ACCT	2	8	526564	526571	25 %	25 %	0 %	50 %	406028684
13239	NC_018612	TGC	2	6	526580	526585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028684
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13242	NC_018612	GGCC	2	8	526683	526690	0 %	0 %	50 %	50 %	406028684
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13476	NC_018612	GC	4	8	535283	535290	0 %	0 %	50 %	50 %	406028692
13477	NC_018612	GGC	2	6	535337	535342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028692
13478	NC_018612	CGCAGA	2	12	535344	535355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028692
13479	NC_018612	GGGT	2	8	535400	535407	0 %	25 %	75 %	0 %	406028692
13480	NC_018612	ACCG	2	8	535478	535485	25 %	0 %	25 %	50 %	406028692
13481	NC_018612	CGGC	2	8	535506	535513	0 %	0 %	50 %	50 %	406028692
13482	NC_018612	G	6	6	535520	535525	0 %	0 %	100 %	0 %	406028692
13483	NC_018612	GCC	2	6	535534	535539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028692
13484	NC_018612	CGA	2	6	535651	535656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028692
13485	NC_018612	CAC	2	6	535684	535689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028692
13486	NC_018612	GGT	2	6	535690	535695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028692
13487	NC_018612	GCA	2	6	535696	535701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028692
13488	NC_018612	CGA	2	6	535702	535707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028692
13489	NC_018612	GCC	3	9	535732	535740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028692
13490	NC_018612	CGG	2	6	535768	535773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028692
13491	NC_018612	CG	4	8	535835	535842	0 %	0 %	50 %	50 %	406028692
13492	NC_018612	GCG	3	9	535917	535925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_018612	GCC	2	6	535958	535963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13494	NC_018612	ACT	2	6	535964	535969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_018612	TCA	2	6	535980	535985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_018612	GCC	2	6	536048	536053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028693
13497	NC_018612	CGC	2	6	536092	536097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028693
13498	NC_018612	TCG	2	6	536109	536114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028693
13499	NC_018612	TCG	2	6	536130	536135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028693
13500	NC_018612	TCT	2	6	536142	536147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028693

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