MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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131002	NC_018612	CTG	2	6	4877780	4877785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032748
131003	NC_018612	AGA	2	6	4877788	4877793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406032748
131004	NC_018612	ATG	2	6	4877805	4877810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032748
131005	NC_018612	CGA	2	6	4877867	4877872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032748
131006	NC_018612	CGGGC	2	10	4877899	4877908	0 %	0 %	60 %	40 %	406032748
131007	NC_018612	CCA	2	6	4877920	4877925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032748
131008	NC_018612	CGG	2	6	4877938	4877943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032748
131009	NC_018612	CGA	2	6	4877947	4877952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032748
131010	NC_018612	GCCAGC	2	12	4877994	4878005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406032748
131011	NC_018612	ACG	2	6	4878222	4878227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032748
131012	NC_018612	GCA	2	6	4878256	4878261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032748
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131014	NC_018612	CAG	2	6	4878362	4878367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032748
131015	NC_018612	CAGC	2	8	4878377	4878384	25 %	0 %	25 %	50 %	406032748
131016	NC_018612	CGG	2	6	4878437	4878442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032748
131017	NC_018612	GGT	2	6	4878443	4878448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032748
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131019	NC_018612	GCC	2	6	4878529	4878534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131020	NC_018612	TCG	2	6	4878640	4878645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032749
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131025	NC_018612	CGA	2	6	4878824	4878829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032749
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131033	NC_018612	GATC	2	8	4879175	4879182	25 %	25 %	25 %	25 %	406032749
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131040	NC_018612	TGA	2	6	4879510	4879515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406032749
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131113	NC_018612	CG	3	6	4882044	4882049	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
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131115	NC_018612	CAG	2	6	4882100	4882105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131116	NC_018612	GCC	2	6	4882188	4882193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032752
131117	NC_018612	CG	3	6	4882196	4882201	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
131118	NC_018612	CGG	2	6	4882249	4882254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032752
131119	NC_018612	CGAC	2	8	4882267	4882274	25 %	0 %	25 %	50 %	406032752
131120	NC_018612	TTC	2	6	4882335	4882340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406032752
131121	NC_018612	CTA	2	6	4882349	4882354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032752
131122	NC_018612	ACG	2	6	4882360	4882365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131123	NC_018612	GAG	2	6	4882395	4882400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032752
131124	NC_018612	GGT	2	6	4882412	4882417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032752
131125	NC_018612	AAG	2	6	4882458	4882463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406032752
131126	NC_018612	GTG	2	6	4882467	4882472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032752
131127	NC_018612	GCG	2	6	4882480	4882485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032752
131128	NC_018612	GCT	2	6	4882499	4882504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131129	NC_018612	CCGCG	2	10	4882520	4882529	0 %	0 %	40 %	60 %	406032752
131130	NC_018612	TGC	2	6	4882540	4882545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131131	NC_018612	ATCTC	2	10	4882561	4882570	20 %	40 %	0 %	40 %	406032752
131132	NC_018612	CGC	2	6	4882592	4882597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032752
131133	NC_018612	CG	3	6	4882601	4882606	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
131134	NC_018612	CTG	2	6	4882611	4882616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131135	NC_018612	GTC	2	6	4882638	4882643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131136	NC_018612	TTC	2	6	4882674	4882679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406032752
131137	NC_018612	GCT	2	6	4882715	4882720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131138	NC_018612	GCG	2	6	4882721	4882726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032752
131139	NC_018612	GCCG	2	8	4882745	4882752	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
131140	NC_018612	ACG	2	6	4882756	4882761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131141	NC_018612	GC	3	6	4882853	4882858	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
131142	NC_018612	CGG	2	6	4882916	4882921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032752
131143	NC_018612	CTGCAG	2	12	4882959	4882970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131144	NC_018612	GT	3	6	4883075	4883080	0 %	50 %	50 %	0 %	406032752
131145	NC_018612	CGT	2	6	4883095	4883100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131146	NC_018612	CG	3	6	4883173	4883178	0 %	0 %	50 %	50 %	406032752
131147	NC_018612	CGT	2	6	4883218	4883223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032752
131148	NC_018612	GAG	2	6	4883349	4883354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032752
131149	NC_018612	CCG	2	6	4883374	4883379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032752
131150	NC_018612	ACCGC	2	10	4883380	4883389	20 %	0 %	20 %	60 %	406032752
131151	NC_018612	CACG	2	8	4883404	4883411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131152	NC_018612	ACT	2	6	4883423	4883428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032753
131153	NC_018612	GGC	2	6	4883506	4883511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032753
131154	NC_018612	CAC	2	6	4883520	4883525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032753
131155	NC_018612	GC	4	8	4883540	4883547	0 %	0 %	50 %	50 %	406032753
131156	NC_018612	GAG	2	6	4883578	4883583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032753
131157	NC_018612	CCGC	2	8	4883585	4883592	0 %	0 %	25 %	75 %	406032753
131158	NC_018612	ACC	2	6	4883606	4883611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032753
131159	NC_018612	ACG	2	6	4883633	4883638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032753
131160	NC_018612	GC	3	6	4883658	4883663	0 %	0 %	50 %	50 %	406032753
131161	NC_018612	CAC	2	6	4883664	4883669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406032753
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131169	NC_018612	CG	4	8	4883892	4883899	0 %	0 %	50 %	50 %	406032753
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131175	NC_018612	GGTG	2	8	4884159	4884166	0 %	25 %	75 %	0 %	406032753
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131179	NC_018612	CGA	2	6	4884282	4884287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032753
131180	NC_018612	ATC	2	6	4884289	4884294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032753
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131182	NC_018612	CGTC	2	8	4884416	4884423	0 %	25 %	25 %	50 %	406032753
131183	NC_018612	GAG	2	6	4884424	4884429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406032753
131184	NC_018612	TCG	2	6	4884621	4884626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131185	NC_018612	AAG	2	6	4884679	4884684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131186	NC_018612	CGGG	2	8	4884749	4884756	0 %	0 %	75 %	25 %	406032754
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131190	NC_018612	CGC	2	6	4884907	4884912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032754
131191	NC_018612	TCG	2	6	4884915	4884920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131192	NC_018612	TCG	3	9	4884927	4884935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131193	NC_018612	G	6	6	4884943	4884948	0 %	0 %	100 %	0 %	406032754
131194	NC_018612	TCG	2	6	4884993	4884998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131195	NC_018612	CGC	2	6	4885048	4885053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032754
131196	NC_018612	GC	4	8	4885091	4885098	0 %	0 %	50 %	50 %	406032754
131197	NC_018612	GTC	2	6	4885118	4885123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131198	NC_018612	CGGCAT	2	12	4885141	4885152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131199	NC_018612	GCA	2	6	4885165	4885170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131200	NC_018612	GTC	2	6	4885241	4885246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131201	NC_018612	CCGG	2	8	4885255	4885262	0 %	0 %	50 %	50 %	406032754
131202	NC_018612	TCA	2	6	4885290	4885295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032754
131203	NC_018612	GGTG	2	8	4885308	4885315	0 %	25 %	75 %	0 %	406032754
131204	NC_018612	GTC	2	6	4885379	4885384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131205	NC_018612	CTG	2	6	4885523	4885528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131206	NC_018612	CGG	2	6	4885530	4885535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032754
131207	NC_018612	GTCG	2	8	4885537	4885544	0 %	25 %	50 %	25 %	406032754
131208	NC_018612	TGG	2	6	4885587	4885592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032754
131209	NC_018612	GCC	2	6	4885601	4885606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032754
131210	NC_018612	CAT	2	6	4885609	4885614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032754
131211	NC_018612	CGG	2	6	4885627	4885632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032754
131212	NC_018612	CTG	2	6	4885727	4885732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131213	NC_018612	CCG	2	6	4885773	4885778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032754
131214	NC_018612	CTG	2	6	4885790	4885795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131215	NC_018612	GCT	2	6	4885813	4885818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131216	NC_018612	GTG	2	6	4885871	4885876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032754
131217	NC_018612	CCG	2	6	4885878	4885883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032754
131218	NC_018612	CTG	2	6	4885904	4885909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131219	NC_018612	CGA	2	6	4885996	4886001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032754
131220	NC_018612	GACGGT	2	12	4886089	4886100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406032754
131221	NC_018612	GGCAGC	2	12	4886154	4886165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406032754
131222	NC_018612	CCGCG	2	10	4886218	4886227	0 %	0 %	40 %	60 %	406032754
131223	NC_018612	GC	3	6	4886275	4886280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131224	NC_018612	GC	3	6	4886293	4886298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131225	NC_018612	CG	3	6	4886299	4886304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131226	NC_018612	GCA	2	6	4886362	4886367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032755
131227	NC_018612	CG	3	6	4886374	4886379	0 %	0 %	50 %	50 %	406032755
131228	NC_018612	GTG	2	6	4886421	4886426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032755
131229	NC_018612	GTGC	2	8	4886431	4886438	0 %	25 %	50 %	25 %	406032755
131230	NC_018612	GTT	2	6	4886443	4886448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406032755
131231	NC_018612	CGGCAC	2	12	4886461	4886472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406032755
131232	NC_018612	ATCG	2	8	4886525	4886532	25 %	25 %	25 %	25 %	406032755
131233	NC_018612	CCG	2	6	4886639	4886644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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131236	NC_018612	ATC	2	6	4886752	4886757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406032756
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131254	NC_018612	GCA	2	6	4887755	4887760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406032757
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131343	NC_018612	TGG	2	6	4890804	4890809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406032760
131344	NC_018612	GC	3	6	4890835	4890840	0 %	0 %	50 %	50 %	406032760
131345	NC_018612	CGC	2	6	4890847	4890852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032760
131346	NC_018612	CGG	2	6	4890873	4890878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032760
131347	NC_018612	CA	3	6	4890880	4890885	50 %	0 %	0 %	50 %	406032760
131348	NC_018612	TTC	2	6	4890899	4890904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406032760
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131351	NC_018612	GGTCA	2	10	4891030	4891039	20 %	20 %	40 %	20 %	406032760
131352	NC_018612	CGACG	2	10	4891066	4891075	20 %	0 %	40 %	40 %	406032760
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131355	NC_018612	CAG	2	6	4891146	4891151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131356	NC_018612	TGAC	2	8	4891167	4891174	25 %	25 %	25 %	25 %	406032761
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131359	NC_018612	CGC	2	6	4891255	4891260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406032761
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131450	NC_018612	CGG	2	6	4894806	4894811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406032764
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