MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018612	CGG	2	6	498348	498353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028655
12502	NC_018612	CGC	2	6	498358	498363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028655
12503	NC_018612	GCC	2	6	498412	498417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028655
12504	NC_018612	ACG	2	6	498431	498436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028655
12505	NC_018612	CGC	2	6	498503	498508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028655
12506	NC_018612	CGAC	2	8	498596	498603	25 %	0 %	25 %	50 %	406028655
12507	NC_018612	CGA	2	6	498606	498611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028655
12508	NC_018612	CTG	2	6	498625	498630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028655
12509	NC_018612	GCA	2	6	498650	498655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028655
12510	NC_018612	AAG	2	6	498658	498663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028655
12511	NC_018612	TCT	2	6	498665	498670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028655
12512	NC_018612	GGCGCT	2	12	498690	498701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028655
12513	NC_018612	CCG	2	6	498704	498709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028655
12514	NC_018612	GGC	2	6	498732	498737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028655
12515	NC_018612	CGC	2	6	498764	498769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028655
12516	NC_018612	CAT	3	9	498777	498785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028655
12517	NC_018612	CTA	2	6	498816	498821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028655
12518	NC_018612	TGG	2	6	498926	498931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028655
12519	NC_018612	ATC	2	6	498981	498986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028655
12520	NC_018612	CGT	2	6	499074	499079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028656
12521	NC_018612	GAC	2	6	499126	499131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028656
12522	NC_018612	GGA	2	6	499170	499175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028656
12523	NC_018612	GGC	2	6	499182	499187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028656
12524	NC_018612	TCG	2	6	499202	499207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028656
12525	NC_018612	TGCCGG	2	12	499220	499231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028656
12526	NC_018612	CG	3	6	499238	499243	0 %	0 %	50 %	50 %	406028656
12527	NC_018612	GGT	2	6	499278	499283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028656
12528	NC_018612	CG	3	6	499323	499328	0 %	0 %	50 %	50 %	406028656
12529	NC_018612	GCG	2	6	499420	499425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028656
12530	NC_018612	GCT	2	6	499434	499439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028656
12531	NC_018612	CTG	2	6	499481	499486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028656
12532	NC_018612	CGA	2	6	499534	499539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12533	NC_018612	CGA	2	6	499594	499599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12534	NC_018612	CGG	2	6	499603	499608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028657
12535	NC_018612	TGC	2	6	499665	499670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12536	NC_018612	CGT	2	6	499680	499685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12537	NC_018612	GAT	2	6	499705	499710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028657
12538	NC_018612	TGG	2	6	499719	499724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028657
12539	NC_018612	CGT	2	6	499738	499743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12540	NC_018612	TGG	2	6	499755	499760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028657
12541	NC_018612	CGA	2	6	499792	499797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12542	NC_018612	GC	3	6	499808	499813	0 %	0 %	50 %	50 %	406028657
12543	NC_018612	GC	4	8	499828	499835	0 %	0 %	50 %	50 %	406028657
12544	NC_018612	GGTC	2	8	499873	499880	0 %	25 %	50 %	25 %	406028657
12545	NC_018612	GGGC	2	8	499888	499895	0 %	0 %	75 %	25 %	406028657
12546	NC_018612	CGC	2	6	499912	499917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028657
12547	NC_018612	TCG	3	9	499944	499952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12548	NC_018612	TGG	2	6	499997	500002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028657
12549	NC_018612	CGGCGC	2	12	500025	500036	0 %	0 %	50 %	50 %	406028657
12550	NC_018612	GGC	2	6	500060	500065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028657
12551	NC_018612	GCCG	2	8	500070	500077	0 %	0 %	50 %	50 %	406028657
12552	NC_018612	CG	3	6	500093	500098	0 %	0 %	50 %	50 %	406028657
12553	NC_018612	ACG	2	6	500103	500108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12554	NC_018612	CGC	2	6	500185	500190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028657
12555	NC_018612	GGC	2	6	500191	500196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028657
12556	NC_018612	CAA	2	6	500197	500202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028657
12557	NC_018612	ACG	2	6	500231	500236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028657
12558	NC_018612	GCGCG	2	10	500308	500317	0 %	0 %	60 %	40 %	406028657
12559	NC_018612	ACC	2	6	500328	500333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028657
12560	NC_018612	AGG	2	6	500364	500369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028657
12561	NC_018612	GAA	2	6	500378	500383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028657
12562	NC_018612	CGG	2	6	500432	500437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_018612	GGGC	2	8	500443	500450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_018612	GAC	2	6	500464	500469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12565	NC_018612	TGC	2	6	500505	500510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12566	NC_018612	GCT	2	6	500512	500517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12567	NC_018612	GC	3	6	500553	500558	0 %	0 %	50 %	50 %	406028658
12568	NC_018612	TCT	2	6	500607	500612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028658
12569	NC_018612	CGA	2	6	500629	500634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12570	NC_018612	CGT	2	6	500649	500654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
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12572	NC_018612	AGC	2	6	500688	500693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12573	NC_018612	AGGCCG	2	12	500694	500705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406028658
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12577	NC_018612	CCCG	2	8	500752	500759	0 %	0 %	25 %	75 %	406028658
12578	NC_018612	GTG	2	6	500807	500812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028658
12579	NC_018612	GC	3	6	500814	500819	0 %	0 %	50 %	50 %	406028658
12580	NC_018612	CGCT	2	8	500834	500841	0 %	25 %	25 %	50 %	406028658
12581	NC_018612	GTC	2	6	500888	500893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
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12583	NC_018612	CGA	2	6	501015	501020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028658
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12587	NC_018612	GGA	2	6	501154	501159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028658
12588	NC_018612	CTG	2	6	501206	501211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12589	NC_018612	TGC	2	6	501267	501272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028658
12590	NC_018612	GCCGAC	2	12	501302	501313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028658
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12592	NC_018612	CCCG	2	8	501352	501359	0 %	0 %	25 %	75 %	406028658
12593	NC_018612	GCTG	2	8	501364	501371	0 %	25 %	50 %	25 %	406028658
12594	NC_018612	CGG	2	6	501417	501422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028658
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12600	NC_018612	GGC	2	6	501592	501597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028658
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12602	NC_018612	AGGG	2	8	501725	501732	25 %	0 %	75 %	0 %	406028659
12603	NC_018612	GTA	2	6	501750	501755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028659
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12605	NC_018612	GC	4	8	501813	501820	0 %	0 %	50 %	50 %	406028659
12606	NC_018612	CGG	2	6	501836	501841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028659
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12612	NC_018612	CGGTCG	2	12	502033	502044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028659
12613	NC_018612	TGAC	2	8	502070	502077	25 %	25 %	25 %	25 %	406028659
12614	NC_018612	CGG	2	6	502099	502104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_018612	TTC	2	6	502145	502150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_018612	GGGC	2	8	502182	502189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12617	NC_018612	GTT	2	6	502190	502195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_018612	GGT	3	9	502215	502223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_018612	TGA	2	6	502226	502231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12734	NC_018612	CGT	2	6	506992	506997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12738	NC_018612	CGG	2	6	507348	507353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028665
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12862	NC_018612	GCG	2	6	512386	512391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028669
12863	NC_018612	CGA	2	6	512409	512414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028669
12864	NC_018612	GTG	2	6	512499	512504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028669
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12867	NC_018612	CGC	2	6	512621	512626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028670
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12880	NC_018612	GC	3	6	513103	513108	0 %	0 %	50 %	50 %	406028670
12881	NC_018612	CACC	2	8	513175	513182	25 %	0 %	0 %	75 %	406028670
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12890	NC_018612	CGGCGA	2	12	513424	513435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406028670
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12893	NC_018612	TGA	2	6	513571	513576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028670
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12902	NC_018612	GCG	3	9	513754	513762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028671
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12912	NC_018612	GCC	2	6	514130	514135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028671
12913	NC_018612	GGC	2	6	514143	514148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028671
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12915	NC_018612	GC	3	6	514210	514215	0 %	0 %	50 %	50 %	406028671
12916	NC_018612	GCTGCC	2	12	514239	514250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406028671
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12918	NC_018612	GCCC	2	8	514373	514380	0 %	0 %	25 %	75 %	406028672
12919	NC_018612	GCC	2	6	514435	514440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028672
12920	NC_018612	TTC	2	6	514457	514462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028672
12921	NC_018612	AGC	2	6	514502	514507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12922	NC_018612	TCA	2	6	514530	514535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12923	NC_018612	GTG	2	6	514559	514564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028673
12924	NC_018612	AGT	2	6	514567	514572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028673
12925	NC_018612	TGG	2	6	514602	514607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028673
12926	NC_018612	GCT	2	6	514615	514620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028673
12927	NC_018612	GAGG	2	8	514639	514646	25 %	0 %	75 %	0 %	406028673
12928	NC_018612	CGC	2	6	514647	514652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028673
12929	NC_018612	CTG	2	6	514757	514762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028674
12930	NC_018612	GT	3	6	514788	514793	0 %	50 %	50 %	0 %	406028674
12931	NC_018612	GCC	2	6	514799	514804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028674
12932	NC_018612	CGT	2	6	514822	514827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028674
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12943	NC_018612	ATC	2	6	515220	515225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028674
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12948	NC_018612	CGA	2	6	515388	515393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028674
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12962	NC_018612	GCT	2	6	515860	515865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028674
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12965	NC_018612	GC	4	8	515973	515980	0 %	0 %	50 %	50 %	406028674
12966	NC_018612	CCCG	2	8	515990	515997	0 %	0 %	25 %	75 %	406028674
12967	NC_018612	GCG	2	6	515998	516003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028674
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12969	NC_018612	CGA	2	6	516091	516096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028675
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12971	NC_018612	ATG	2	6	516132	516137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028675
12972	NC_018612	TGG	3	9	516163	516171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028675
12973	NC_018612	GCG	2	6	516184	516189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028675
12974	NC_018612	TGG	2	6	516205	516210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028675
12975	NC_018612	GGT	2	6	516407	516412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028675
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12978	NC_018612	CGC	2	6	516509	516514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028675
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