MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_018612	CGA	2	6	480093	480098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12002	NC_018612	GTG	2	6	480109	480114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028640
12003	NC_018612	GGA	2	6	480135	480140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028640
12004	NC_018612	CAA	2	6	480186	480191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028640
12005	NC_018612	TTC	2	6	480220	480225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028640
12006	NC_018612	GCC	2	6	480266	480271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028640
12007	NC_018612	TCA	2	6	480275	480280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028640
12008	NC_018612	TCG	2	6	480292	480297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12009	NC_018612	GGCCGC	2	12	480298	480309	0 %	0 %	50 %	50 %	406028640
12010	NC_018612	CGCA	2	8	480366	480373	25 %	0 %	25 %	50 %	406028640
12011	NC_018612	GCC	2	6	480424	480429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028640
12012	NC_018612	GGT	2	6	480456	480461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028640
12013	NC_018612	GCT	2	6	480540	480545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12014	NC_018612	TGA	2	6	480554	480559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028640
12015	NC_018612	CGA	2	6	480585	480590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12016	NC_018612	CGA	2	6	480600	480605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12017	NC_018612	CGG	2	6	480663	480668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028640
12018	NC_018612	CTG	2	6	480712	480717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12019	NC_018612	TCG	2	6	480731	480736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12020	NC_018612	GCG	2	6	480782	480787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028640
12021	NC_018612	CGT	2	6	480840	480845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028640
12022	NC_018612	TGG	2	6	480851	480856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028640
12023	NC_018612	TCC	2	6	480901	480906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028640
12024	NC_018612	CGTC	2	8	480934	480941	0 %	25 %	25 %	50 %	406028640
12025	NC_018612	GCC	2	6	480955	480960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028640
12026	NC_018612	GCC	2	6	481007	481012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12027	NC_018612	TGG	2	6	481020	481025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028641
12028	NC_018612	GAA	2	6	481067	481072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028641
12029	NC_018612	CG	3	6	481144	481149	0 %	0 %	50 %	50 %	406028641
12030	NC_018612	CAA	2	6	481150	481155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028641
12031	NC_018612	GCC	2	6	481206	481211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12032	NC_018612	TGG	2	6	481212	481217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028641
12033	NC_018612	GC	3	6	481291	481296	0 %	0 %	50 %	50 %	406028641
12034	NC_018612	TGC	2	6	481317	481322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12035	NC_018612	AGCG	2	8	481355	481362	25 %	0 %	50 %	25 %	406028641
12036	NC_018612	GGCGA	2	10	481382	481391	20 %	0 %	60 %	20 %	406028641
12037	NC_018612	GC	3	6	481425	481430	0 %	0 %	50 %	50 %	406028641
12038	NC_018612	GCC	2	6	481441	481446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12039	NC_018612	GCGTC	2	10	481464	481473	0 %	20 %	40 %	40 %	406028641
12040	NC_018612	CGC	2	6	481480	481485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12041	NC_018612	TGA	2	6	481494	481499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028641
12042	NC_018612	CGG	2	6	481525	481530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028641
12043	NC_018612	GCT	2	6	481576	481581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12044	NC_018612	GCT	2	6	481591	481596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12045	NC_018612	TGGC	2	8	481691	481698	0 %	25 %	50 %	25 %	406028641
12046	NC_018612	GCC	2	6	481749	481754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12047	NC_018612	CTG	2	6	481760	481765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12048	NC_018612	GAC	2	6	481766	481771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12049	NC_018612	CCA	2	6	481845	481850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028641
12050	NC_018612	GCC	2	6	481895	481900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028641
12051	NC_018612	CGA	2	6	481933	481938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12052	NC_018612	CGA	2	6	481972	481977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12053	NC_018612	ACG	2	6	482112	482117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12054	NC_018612	CGA	2	6	482122	482127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028641
12055	NC_018612	GC	3	6	482131	482136	0 %	0 %	50 %	50 %	406028641
12056	NC_018612	TCT	2	6	482179	482184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028642
12057	NC_018612	CCG	2	6	482185	482190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028642
12058	NC_018612	ACA	2	6	482220	482225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028642
12059	NC_018612	GGC	2	6	482236	482241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028642
12060	NC_018612	GGTGC	2	10	482244	482253	0 %	20 %	60 %	20 %	406028642
12061	NC_018612	CCTCGA	2	12	482266	482277	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406028642
12062	NC_018612	ACGCC	2	10	482280	482289	20 %	0 %	20 %	60 %	406028642
12063	NC_018612	CGC	2	6	482290	482295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028642
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12065	NC_018612	CG	3	6	482310	482315	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12066	NC_018612	GC	3	6	482328	482333	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12067	NC_018612	GCGG	2	8	482362	482369	0 %	0 %	75 %	25 %	406028642
12068	NC_018612	GGT	2	6	482394	482399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028642
12069	NC_018612	ACG	3	9	482403	482411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028642
12070	NC_018612	GGT	2	6	482419	482424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028642
12071	NC_018612	GCCG	2	8	482432	482439	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12072	NC_018612	CAT	3	9	482452	482460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028642
12073	NC_018612	CCGC	2	8	482475	482482	0 %	0 %	25 %	75 %	406028642
12074	NC_018612	GTG	2	6	482488	482493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028642
12075	NC_018612	CGG	2	6	482604	482609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028642
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12077	NC_018612	CG	3	6	482728	482733	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12078	NC_018612	CAA	2	6	482734	482739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028642
12079	NC_018612	TCG	2	6	482745	482750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028642
12080	NC_018612	CG	3	6	482752	482757	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12081	NC_018612	GC	3	6	482833	482838	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12082	NC_018612	GCT	2	6	482842	482847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028642
12083	NC_018612	CCG	2	6	482916	482921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028642
12084	NC_018612	CGC	2	6	482950	482955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028642
12085	NC_018612	GAGGCC	2	12	482963	482974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406028642
12086	NC_018612	CGC	2	6	483016	483021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028642
12087	NC_018612	GC	4	8	483050	483057	0 %	0 %	50 %	50 %	406028642
12088	NC_018612	GGC	2	6	483087	483092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12089	NC_018612	GCG	2	6	483121	483126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_018612	CGC	2	6	483145	483150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12091	NC_018612	CGC	2	6	483160	483165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12092	NC_018612	CGC	2	6	483181	483186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028643
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12096	NC_018612	CG	3	6	483247	483252	0 %	0 %	50 %	50 %	406028643
12097	NC_018612	GTG	2	6	483271	483276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028643
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12100	NC_018612	GGCC	2	8	483320	483327	0 %	0 %	50 %	50 %	406028643
12101	NC_018612	CCT	2	6	483332	483337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028643
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12103	NC_018612	GAC	2	6	483360	483365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028643
12104	NC_018612	GCG	2	6	483379	483384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028643
12105	NC_018612	CGG	2	6	483416	483421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028643
12106	NC_018612	TGC	2	6	483440	483445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028643
12107	NC_018612	CAC	2	6	483453	483458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028643
12108	NC_018612	TCG	2	6	483511	483516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028643
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12110	NC_018612	GCTCCA	2	12	483560	483571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406028643
12111	NC_018612	AGA	2	6	483602	483607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028643
12112	NC_018612	GGT	2	6	483650	483655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028643
12113	NC_018612	GGCC	2	8	483669	483676	0 %	0 %	50 %	50 %	406028643
12114	NC_018612	CAG	2	6	483684	483689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028643
12115	NC_018612	GCC	2	6	483700	483705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028643
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12117	NC_018612	GCT	2	6	483758	483763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028643
12118	NC_018612	GCC	2	6	483819	483824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028643
12119	NC_018612	CGC	2	6	483842	483847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028643
12120	NC_018612	GC	3	6	483882	483887	0 %	0 %	50 %	50 %	406028643
12121	NC_018612	GC	3	6	483908	483913	0 %	0 %	50 %	50 %	406028643
12122	NC_018612	CGCC	2	8	483917	483924	0 %	0 %	25 %	75 %	406028643
12123	NC_018612	CCAGCG	2	12	483929	483940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028643
12124	NC_018612	ACC	2	6	483952	483957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028643
12125	NC_018612	CTG	2	6	484062	484067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028643
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12130	NC_018612	GCTG	2	8	484265	484272	0 %	25 %	50 %	25 %	406028643
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12194	NC_018612	CG	3	6	486847	486852	0 %	0 %	50 %	50 %	406028644
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12220	NC_018612	CGCGG	2	10	487993	488002	0 %	0 %	60 %	40 %	406028645
12221	NC_018612	GC	3	6	488078	488083	0 %	0 %	50 %	50 %	406028645
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12224	NC_018612	GC	3	6	488155	488160	0 %	0 %	50 %	50 %	406028645
12225	NC_018612	CGG	2	6	488166	488171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028645
12226	NC_018612	ATC	2	6	488186	488191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028645
12227	NC_018612	GCCG	2	8	488194	488201	0 %	0 %	50 %	50 %	406028645
12228	NC_018612	CAC	2	6	488203	488208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028645
12229	NC_018612	TCC	2	6	488252	488257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028645
12230	NC_018612	CGCGC	2	10	488303	488312	0 %	0 %	40 %	60 %	406028645
12231	NC_018612	GGT	2	6	488407	488412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028645
12232	NC_018612	GCGCC	2	10	488448	488457	0 %	0 %	40 %	60 %	406028645
12233	NC_018612	CGA	2	6	488490	488495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028645
12234	NC_018612	CCA	2	6	488502	488507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028645
12235	NC_018612	GTG	2	6	488508	488513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028645
12236	NC_018612	GTCG	2	8	488578	488585	0 %	25 %	50 %	25 %	406028645
12237	NC_018612	CCG	2	6	488597	488602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028645
12238	NC_018612	GCCC	2	8	488607	488614	0 %	0 %	25 %	75 %	406028645
12239	NC_018612	GC	3	6	488681	488686	0 %	0 %	50 %	50 %	406028646
12240	NC_018612	GCC	2	6	488722	488727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028646
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12473	NC_018612	CGGG	2	8	497393	497400	0 %	0 %	75 %	25 %	406028654
12474	NC_018612	CAC	2	6	497421	497426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028654
12475	NC_018612	CGG	2	6	497439	497444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028654
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12478	NC_018612	CG	3	6	497541	497546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12479	NC_018612	CGCGGT	2	12	497567	497578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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12481	NC_018612	CGG	2	6	497592	497597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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