MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018612	TCGGC	2	10	330303	330312	0 %	20 %	40 %	40 %	406028499
8002	NC_018612	CTG	2	6	330316	330321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028499
8003	NC_018612	CCT	2	6	330360	330365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028499
8004	NC_018612	CGG	3	9	330408	330416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028499
8005	NC_018612	ACG	2	6	330422	330427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028499
8006	NC_018612	CTG	2	6	330498	330503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028499
8007	NC_018612	TTG	2	6	330514	330519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028500
8008	NC_018612	TTC	2	6	330597	330602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028500
8009	NC_018612	GGC	2	6	330620	330625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028500
8010	NC_018612	CCG	2	6	330674	330679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028500
8011	NC_018612	TCG	2	6	330736	330741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028500
8012	NC_018612	TGA	2	6	330767	330772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028500
8013	NC_018612	TCT	2	6	330782	330787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028500
8014	NC_018612	TCG	2	6	330805	330810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028500
8015	NC_018612	GCA	2	6	330818	330823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028500
8016	NC_018612	CGG	2	6	330875	330880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028500
8017	NC_018612	CGT	2	6	330917	330922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028500
8018	NC_018612	GCC	2	6	330934	330939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028500
8019	NC_018612	GC	3	6	331010	331015	0 %	0 %	50 %	50 %	406028500
8020	NC_018612	CGC	2	6	331098	331103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028500
8021	NC_018612	GA	3	6	331149	331154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_018612	ACTC	2	8	331157	331164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_018612	GCG	3	9	331200	331208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_018612	GCG	2	6	331218	331223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_018612	GTC	2	6	331306	331311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_018612	TCG	2	6	331396	331401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8027	NC_018612	TGA	2	6	331414	331419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028501
8028	NC_018612	GTC	2	6	331425	331430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8029	NC_018612	CTG	2	6	331431	331436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8030	NC_018612	TGGGTG	2	12	331443	331454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028501
8031	NC_018612	CAGC	2	8	331475	331482	25 %	0 %	25 %	50 %	406028501
8032	NC_018612	CAG	2	6	331505	331510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8033	NC_018612	CAG	2	6	331523	331528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8034	NC_018612	CGC	2	6	331543	331548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028501
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8036	NC_018612	CGG	2	6	331604	331609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028501
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8039	NC_018612	GTG	2	6	331827	331832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028501
8040	NC_018612	CTG	3	9	331869	331877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8041	NC_018612	CAG	2	6	331881	331886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
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8043	NC_018612	CAG	2	6	332001	332006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8044	NC_018612	GGC	2	6	332015	332020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028501
8045	NC_018612	GC	3	6	332031	332036	0 %	0 %	50 %	50 %	406028501
8046	NC_018612	CGG	2	6	332044	332049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028501
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8051	NC_018612	GCT	2	6	332264	332269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8052	NC_018612	CCGCG	2	10	332273	332282	0 %	0 %	40 %	60 %	406028501
8053	NC_018612	ACG	2	6	332284	332289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
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8055	NC_018612	CAG	2	6	332441	332446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8056	NC_018612	CGA	3	9	332474	332482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8057	NC_018612	CAG	2	6	332589	332594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028501
8058	NC_018612	CGG	2	6	332606	332611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028501
8059	NC_018612	GCC	2	6	332693	332698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028501
8060	NC_018612	CGC	2	6	332728	332733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_018612	GC	3	6	332765	332770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_018612	CCCG	2	8	332776	332783	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8063	NC_018612	CGC	2	6	332815	332820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_018612	TTA	2	6	332914	332919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_018612	CACTA	2	10	333031	333040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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8067	NC_018612	GTT	2	6	333100	333105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028502
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8070	NC_018612	CTG	2	6	333199	333204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028502
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8101	NC_018612	CCGG	2	8	334442	334449	0 %	0 %	50 %	50 %	406028503
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8107	NC_018612	G	6	6	334678	334683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_018612	GATCGG	2	12	334780	334791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406028504
8109	NC_018612	TGA	2	6	334821	334826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028504
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8113	NC_018612	CGG	2	6	335005	335010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028504
8114	NC_018612	CCCA	2	8	335028	335035	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8115	NC_018612	CGA	2	6	335164	335169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028505
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8117	NC_018612	TTC	2	6	335201	335206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028505
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8119	NC_018612	AGGCGC	2	12	335235	335246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406028505
8120	NC_018612	GAC	2	6	335299	335304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028505
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8245	NC_018612	CGC	2	6	339756	339761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028509
8246	NC_018612	CGA	2	6	339778	339783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028509
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8330	NC_018612	GCTC	2	8	342299	342306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8366	NC_018612	TGC	2	6	343455	343460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028511
8367	NC_018612	GGTC	2	8	343462	343469	0 %	25 %	50 %	25 %	406028511
8368	NC_018612	GAC	2	6	343486	343491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028511
8369	NC_018612	CCG	2	6	343494	343499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028511
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8372	NC_018612	GGCC	2	8	343828	343835	0 %	0 %	50 %	50 %	406028511
8373	NC_018612	CGG	2	6	343872	343877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028511
8374	NC_018612	TCG	2	6	343881	343886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028511
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8377	NC_018612	CGA	2	6	343927	343932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028511
8378	NC_018612	CGC	2	6	343933	343938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028511
8379	NC_018612	GC	3	6	343937	343942	0 %	0 %	50 %	50 %	406028511
8380	NC_018612	GTC	2	6	344042	344047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028511
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8382	NC_018612	GCGG	2	8	344092	344099	0 %	0 %	75 %	25 %	406028511
8383	NC_018612	ATC	2	6	344129	344134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028511
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8391	NC_018612	CGG	2	6	344371	344376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028512
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8394	NC_018612	GCC	2	6	344451	344456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028512
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8396	NC_018612	GCC	2	6	344492	344497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028512
8397	NC_018612	TGC	2	6	344524	344529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028512
8398	NC_018612	GGCC	2	8	344570	344577	0 %	0 %	50 %	50 %	406028512
8399	NC_018612	CAT	2	6	344606	344611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028512
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8402	NC_018612	CGT	2	6	344753	344758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028513
8403	NC_018612	CGGC	2	8	344889	344896	0 %	0 %	50 %	50 %	406028513
8404	NC_018612	TCG	2	6	344980	344985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028513
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8413	NC_018612	CCA	2	6	345290	345295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028513
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8416	NC_018612	CCG	2	6	345338	345343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028513
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8418	NC_018612	G	6	6	345390	345395	0 %	0 %	100 %	0 %	406028513
8419	NC_018612	CCGG	2	8	345400	345407	0 %	0 %	50 %	50 %	406028513
8420	NC_018612	CG	3	6	345426	345431	0 %	0 %	50 %	50 %	406028513
8421	NC_018612	CG	4	8	345434	345441	0 %	0 %	50 %	50 %	406028513
8422	NC_018612	CGA	2	6	345461	345466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028513
8423	NC_018612	GAC	2	6	345498	345503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028513
8424	NC_018612	CTG	2	6	345541	345546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8425	NC_018612	GCG	2	6	345602	345607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8426	NC_018612	TCG	2	6	345610	345615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8427	NC_018612	AGG	2	6	345744	345749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028514
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8429	NC_018612	CG	4	8	345850	345857	0 %	0 %	50 %	50 %	406028514
8430	NC_018612	GAG	2	6	345884	345889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028514
8431	NC_018612	CGGC	2	8	345890	345897	0 %	0 %	50 %	50 %	406028514
8432	NC_018612	CGA	3	9	345934	345942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028514
8433	NC_018612	GC	3	6	345951	345956	0 %	0 %	50 %	50 %	406028514
8434	NC_018612	TGC	2	6	346005	346010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028514
8435	NC_018612	ACG	2	6	346011	346016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028514
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8439	NC_018612	CGTGGC	2	12	346135	346146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	406028514
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8443	NC_018612	GCC	2	6	346267	346272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028514
8444	NC_018612	CTG	2	6	346313	346318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028514
8445	NC_018612	CGG	2	6	346348	346353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028514
8446	NC_018612	TCG	2	6	346390	346395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028514
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8454	NC_018612	CAG	2	6	346771	346776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028516
8455	NC_018612	CGT	2	6	346777	346782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028516
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8469	NC_018612	ACG	2	6	347180	347185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028516
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8471	NC_018612	GGC	2	6	347227	347232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028516
8472	NC_018612	CGC	2	6	347250	347255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028516
8473	NC_018612	CCT	2	6	347322	347327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028516
8474	NC_018612	GCG	3	9	347421	347429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028516
8475	NC_018612	TGC	2	6	347441	347446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028516
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8478	NC_018612	GCG	3	9	347480	347488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028515
8479	NC_018612	GCG	2	6	347517	347522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028515
8480	NC_018612	CGGGG	3	15	347534	347548	0 %	0 %	80 %	20 %	406028515
8481	NC_018612	GCCGGG	2	12	347549	347560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028515
8482	NC_018612	GCG	2	6	347576	347581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028515
8483	NC_018612	G	6	6	347597	347602	0 %	0 %	100 %	0 %	406028515
8484	NC_018612	GGCG	2	8	347606	347613	0 %	0 %	75 %	25 %	406028515
8485	NC_018612	GCC	2	6	347615	347620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028515
8486	NC_018612	TCG	2	6	347660	347665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028515
8487	NC_018612	CTC	2	6	347680	347685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028515
8488	NC_018612	CGGT	2	8	347696	347703	0 %	25 %	50 %	25 %	406028515
8489	NC_018612	GCG	2	6	347790	347795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028515
8490	NC_018612	CCCGG	2	10	347810	347819	0 %	0 %	40 %	60 %	406028515
8491	NC_018612	GC	3	6	347835	347840	0 %	0 %	50 %	50 %	406028515
8492	NC_018612	CGC	3	9	347838	347846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028515
8493	NC_018612	ACC	2	6	347890	347895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028515
8494	NC_018612	CAG	2	6	347911	347916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028515
8495	NC_018612	TCGA	2	8	347935	347942	25 %	25 %	25 %	25 %	406028515
8496	NC_018612	GC	3	6	347951	347956	0 %	0 %	50 %	50 %	406028515
8497	NC_018612	GGCC	2	8	347964	347971	0 %	0 %	50 %	50 %	406028515
8498	NC_018612	GTG	2	6	347972	347977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028515
8499	NC_018612	CCG	2	6	348049	348054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028515
8500	NC_018612	ATC	2	6	348169	348174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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