MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_018143	CGC	2	6	630428	630433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672336
15503	NC_018143	CGA	2	6	630434	630439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15504	NC_018143	TGG	2	6	630440	630445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672336
15505	NC_018143	GGCG	2	8	630459	630466	0 %	0 %	75 %	25 %	397672336
15506	NC_018143	TGG	2	6	630542	630547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672336
15507	NC_018143	CCG	2	6	630554	630559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672336
15508	NC_018143	CAC	2	6	630564	630569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672336
15509	NC_018143	GC	3	6	630588	630593	0 %	0 %	50 %	50 %	397672336
15510	NC_018143	CGA	2	6	630599	630604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15511	NC_018143	CGA	2	6	630621	630626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15512	NC_018143	GCG	2	6	630652	630657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672336
15513	NC_018143	GGC	2	6	630660	630665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672336
15514	NC_018143	AGC	2	6	630758	630763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15515	NC_018143	GCT	2	6	630792	630797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15516	NC_018143	CGA	2	6	630804	630809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15517	NC_018143	ACG	2	6	630821	630826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15518	NC_018143	GCT	2	6	630873	630878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15519	NC_018143	TGGCGG	3	18	630926	630943	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	397672336
15520	NC_018143	CCGA	2	8	630951	630958	25 %	0 %	25 %	50 %	397672336
15521	NC_018143	CCAG	2	8	630996	631003	25 %	0 %	25 %	50 %	397672336
15522	NC_018143	GTT	2	6	631017	631022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397672336
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15524	NC_018143	CGC	2	6	631049	631054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672336
15525	NC_018143	GAT	2	6	631063	631068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672336
15526	NC_018143	GGC	2	6	631087	631092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672336
15527	NC_018143	GTG	2	6	631114	631119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672336
15528	NC_018143	GTGG	2	8	631144	631151	0 %	25 %	75 %	0 %	397672336
15529	NC_018143	GCCG	2	8	631179	631186	0 %	0 %	50 %	50 %	397672336
15530	NC_018143	TGCC	2	8	631199	631206	0 %	25 %	25 %	50 %	397672336
15531	NC_018143	ATC	2	6	631228	631233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672336
15532	NC_018143	CACCG	2	10	631278	631287	20 %	0 %	20 %	60 %	397672336
15533	NC_018143	CGA	2	6	631289	631294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15534	NC_018143	CGA	2	6	631313	631318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
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15536	NC_018143	CGC	2	6	631331	631336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672336
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15541	NC_018143	ACG	2	6	631399	631404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
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15544	NC_018143	CGA	2	6	631448	631453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
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15550	NC_018143	CCAAC	2	10	631567	631576	40 %	0 %	0 %	60 %	397672336
15551	NC_018143	CAG	3	9	631588	631596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672336
15552	NC_018143	GCC	2	6	631632	631637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672336
15553	NC_018143	GCG	2	6	631658	631663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672336
15554	NC_018143	CGG	2	6	631677	631682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672336
15555	NC_018143	GGA	2	6	631715	631720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_018143	GGT	2	6	631742	631747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672337
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15560	NC_018143	GTG	2	6	631821	631826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672337
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15563	NC_018143	GGT	2	6	631880	631885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672337
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15601	NC_018143	GGC	2	6	633238	633243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672339
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15859	NC_018143	TGC	2	6	643517	643522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672350
15860	NC_018143	GC	3	6	643521	643526	0 %	0 %	50 %	50 %	397672350
15861	NC_018143	GC	3	6	643614	643619	0 %	0 %	50 %	50 %	397672350
15862	NC_018143	GAC	2	6	643696	643701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672350
15863	NC_018143	TGC	2	6	643703	643708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672350
15864	NC_018143	TCG	2	6	643865	643870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672350
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15887	NC_018143	GCC	3	9	644705	644713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672351
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15902	NC_018143	CCG	2	6	645214	645219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672351
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15913	NC_018143	CGG	2	6	645532	645537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672352
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15921	NC_018143	CCAC	2	8	645881	645888	25 %	0 %	0 %	75 %	397672352
15922	NC_018143	ACG	2	6	645891	645896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672352
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15924	NC_018143	CGA	2	6	646096	646101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672352
15925	NC_018143	GTG	2	6	646103	646108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672352
15926	NC_018143	CGC	2	6	646110	646115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672352
15927	NC_018143	TTC	2	6	646193	646198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397672352
15928	NC_018143	TTC	2	6	646235	646240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397672352
15929	NC_018143	CGGCC	2	10	646262	646271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15930	NC_018143	CGA	2	6	646311	646316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15932	NC_018143	GTC	3	9	646328	646336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15935	NC_018143	CCGG	2	8	646431	646438	0 %	0 %	50 %	50 %	397672353
15936	NC_018143	CCG	2	6	646470	646475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672353
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15938	NC_018143	GT	4	8	646517	646524	0 %	50 %	50 %	0 %	397672353
15939	NC_018143	CCG	2	6	646542	646547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672353
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15942	NC_018143	GCT	2	6	646630	646635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15944	NC_018143	GGC	2	6	646783	646788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672353
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15946	NC_018143	CTG	2	6	646902	646907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15948	NC_018143	GTCG	2	8	646966	646973	0 %	25 %	50 %	25 %	397672353
15949	NC_018143	GCT	2	6	647095	647100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
15950	NC_018143	GCCG	2	8	647127	647134	0 %	0 %	50 %	50 %	397672353
15951	NC_018143	TGC	2	6	647157	647162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15954	NC_018143	GCG	2	6	647297	647302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672353
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15957	NC_018143	CGG	3	9	647376	647384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672353
15958	NC_018143	GGC	2	6	647539	647544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672353
15959	NC_018143	CCCCG	2	10	647589	647598	0 %	0 %	20 %	80 %	397672353
15960	NC_018143	CCGA	2	8	647660	647667	25 %	0 %	25 %	50 %	397672353
15961	NC_018143	GTG	2	6	647693	647698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672353
15962	NC_018143	CGG	3	9	647710	647718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672353
15963	NC_018143	ACG	2	6	647790	647795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672353
15964	NC_018143	CGA	2	6	647851	647856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672353
15965	NC_018143	GACC	2	8	647862	647869	25 %	0 %	25 %	50 %	397672353
15966	NC_018143	GTC	2	6	647920	647925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672353
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15970	NC_018143	TGA	2	6	648009	648014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672354
15971	NC_018143	TGC	2	6	648041	648046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672354
15972	NC_018143	TGG	2	6	648107	648112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672354
15973	NC_018143	CGA	2	6	648197	648202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672354
15974	NC_018143	CGGAT	2	10	648218	648227	20 %	20 %	40 %	20 %	397672354
15975	NC_018143	TCCG	2	8	648258	648265	0 %	25 %	25 %	50 %	397672354
15976	NC_018143	ACA	2	6	648299	648304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397672354
15977	NC_018143	GCA	2	6	648330	648335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672354
15978	NC_018143	ATC	2	6	648355	648360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672354
15979	NC_018143	CCGG	2	8	648361	648368	0 %	0 %	50 %	50 %	397672354
15980	NC_018143	GGT	2	6	648378	648383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672354
15981	NC_018143	CGC	4	12	648396	648407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672354
15982	NC_018143	CGT	2	6	648445	648450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672354
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15985	NC_018143	TCG	2	6	648561	648566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672355
15986	NC_018143	TCC	2	6	648576	648581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397672355
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