MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018143	GCC	2	6	614385	614390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672321
15002	NC_018143	GCT	2	6	614395	614400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672321
15003	NC_018143	GCC	2	6	614411	614416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672321
15004	NC_018143	GCC	2	6	614430	614435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672321
15005	NC_018143	GCG	2	6	614467	614472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672321
15006	NC_018143	CCG	2	6	614483	614488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672321
15007	NC_018143	TTC	2	6	614501	614506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397672321
15008	NC_018143	CGCC	2	8	614547	614554	0 %	0 %	25 %	75 %	397672321
15009	NC_018143	GTACG	2	10	614591	614600	20 %	20 %	40 %	20 %	397672321
15010	NC_018143	GCG	2	6	614611	614616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672321
15011	NC_018143	AGCC	2	8	614648	614655	25 %	0 %	25 %	50 %	397672321
15012	NC_018143	AGCC	2	8	614701	614708	25 %	0 %	25 %	50 %	397672321
15013	NC_018143	CCA	2	6	614727	614732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15014	NC_018143	TGG	2	6	614771	614776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_018143	GTC	2	6	614832	614837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_018143	GCA	2	6	614842	614847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15017	NC_018143	CG	3	6	614879	614884	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15018	NC_018143	CGG	2	6	614927	614932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15019	NC_018143	CGG	2	6	614959	614964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15020	NC_018143	GGC	2	6	614967	614972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15021	NC_018143	GCT	2	6	615001	615006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15022	NC_018143	TTGA	2	8	615009	615016	25 %	50 %	25 %	0 %	397672322
15023	NC_018143	GAT	2	6	615062	615067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672322
15024	NC_018143	CGT	2	6	615089	615094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15025	NC_018143	CCG	2	6	615148	615153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15026	NC_018143	ATC	2	6	615174	615179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672322
15027	NC_018143	CCGG	2	8	615268	615275	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15028	NC_018143	GCT	2	6	615298	615303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15029	NC_018143	GAC	2	6	615369	615374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15030	NC_018143	CGC	2	6	615391	615396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15031	NC_018143	TCC	2	6	615423	615428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397672322
15032	NC_018143	CAG	2	6	615495	615500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15033	NC_018143	CGC	2	6	615527	615532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15034	NC_018143	GTC	2	6	615567	615572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15035	NC_018143	GCCCGG	2	12	615575	615586	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15036	NC_018143	GC	3	6	615602	615607	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15037	NC_018143	CCG	2	6	615613	615618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15038	NC_018143	CGA	2	6	615641	615646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15039	NC_018143	TGA	2	6	615649	615654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672322
15040	NC_018143	TGGT	2	8	615677	615684	0 %	50 %	50 %	0 %	397672322
15041	NC_018143	TGA	2	6	615730	615735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672322
15042	NC_018143	GCG	2	6	615736	615741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15043	NC_018143	CGC	3	9	615749	615757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15044	NC_018143	CGG	2	6	615761	615766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15045	NC_018143	GC	3	6	615767	615772	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15046	NC_018143	GCC	2	6	615849	615854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15047	NC_018143	GCC	2	6	615873	615878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15048	NC_018143	GAC	2	6	615879	615884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15049	NC_018143	GGCC	2	8	615923	615930	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15050	NC_018143	GGCA	2	8	615980	615987	25 %	0 %	50 %	25 %	397672322
15051	NC_018143	GT	3	6	615997	616002	0 %	50 %	50 %	0 %	397672322
15052	NC_018143	CG	3	6	616037	616042	0 %	0 %	50 %	50 %	397672322
15053	NC_018143	GCCA	2	8	616044	616051	25 %	0 %	25 %	50 %	397672322
15054	NC_018143	CATGC	2	10	616077	616086	20 %	20 %	20 %	40 %	397672322
15055	NC_018143	CCG	2	6	616104	616109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15056	NC_018143	GAC	2	6	616149	616154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672322
15057	NC_018143	GCG	2	6	616155	616160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15058	NC_018143	CGC	2	6	616187	616192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672322
15059	NC_018143	GCG	2	6	616200	616205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672322
15060	NC_018143	GTG	2	6	616250	616255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672323
15061	NC_018143	GGC	2	6	616296	616301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672323
15062	NC_018143	CGGCG	2	10	616327	616336	0 %	0 %	60 %	40 %	397672323
15063	NC_018143	GCC	3	9	616340	616348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672323
15064	NC_018143	TCG	2	6	616377	616382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672323
15065	NC_018143	ATCGC	2	10	616388	616397	20 %	20 %	20 %	40 %	397672323
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15080	NC_018143	GCG	2	6	616874	616879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672324
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15088	NC_018143	GT	3	6	617084	617089	0 %	50 %	50 %	0 %	397672324
15089	NC_018143	GAC	2	6	617095	617100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672324
15090	NC_018143	GTC	4	12	617113	617124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672324
15091	NC_018143	GT	3	6	617207	617212	0 %	50 %	50 %	0 %	397672324
15092	NC_018143	ACA	2	6	617237	617242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397672324
15093	NC_018143	TCA	2	6	617264	617269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672324
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15099	NC_018143	GTCGG	2	10	617469	617478	0 %	20 %	60 %	20 %	397672324
15100	NC_018143	CTG	2	6	617532	617537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672325
15101	NC_018143	CTG	2	6	617556	617561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672325
15102	NC_018143	CTGGT	2	10	617563	617572	0 %	40 %	40 %	20 %	397672325
15103	NC_018143	TG	3	6	617589	617594	0 %	50 %	50 %	0 %	397672325
15104	NC_018143	GGC	2	6	617627	617632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672325
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15107	NC_018143	GCCG	2	8	617657	617664	0 %	0 %	50 %	50 %	397672325
15108	NC_018143	CGT	2	6	617666	617671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672325
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15120	NC_018143	CGGT	2	8	618184	618191	0 %	25 %	50 %	25 %	397672325
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15225	NC_018143	TCG	3	9	622173	622181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15227	NC_018143	GAG	2	6	622268	622273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15228	NC_018143	CCT	2	6	622292	622297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15229	NC_018143	GCT	3	9	622400	622408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672329
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15231	NC_018143	CAGCG	2	10	622421	622430	20 %	0 %	40 %	40 %	397672329
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15237	NC_018143	GGC	2	6	622745	622750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15240	NC_018143	GCG	2	6	622883	622888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672330
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15466	NC_018143	GCCGCG	2	12	628923	628934	0 %	0 %	50 %	50 %	397672335
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15479	NC_018143	CCAGCA	2	12	629479	629490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397672335
15480	NC_018143	AG	3	6	629564	629569	50 %	0 %	50 %	0 %	397672335
15481	NC_018143	CAG	2	6	629582	629587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15482	NC_018143	TGC	2	6	629605	629610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15483	NC_018143	GAC	2	6	629693	629698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15484	NC_018143	CGT	2	6	629703	629708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15485	NC_018143	GTC	2	6	629714	629719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15486	NC_018143	GCT	2	6	629720	629725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672335
15487	NC_018143	C	6	6	629739	629744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15488	NC_018143	TGG	2	6	629780	629785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_018143	GGCCG	2	10	629799	629808	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15490	NC_018143	CGA	2	6	629844	629849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_018143	AGCC	2	8	630021	630028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15492	NC_018143	CG	3	6	630081	630086	0 %	0 %	50 %	50 %	397672336
15493	NC_018143	GTG	2	6	630181	630186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672336
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15500	NC_018143	TGA	2	6	630387	630392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672336

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