MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018143	CGGG	2	8	43206	43213	0 %	0 %	75 %	25 %	397671820
1002	NC_018143	GGC	2	6	43247	43252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671820
1003	NC_018143	GCA	2	6	43257	43262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671820
1004	NC_018143	CGG	2	6	43284	43289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671820
1005	NC_018143	CAC	2	6	43297	43302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671820
1006	NC_018143	GCC	2	6	43324	43329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671820
1007	NC_018143	GC	3	6	43348	43353	0 %	0 %	50 %	50 %	397671820
1008	NC_018143	CGT	2	6	43403	43408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_018143	GTG	2	6	43480	43485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018143	GGC	2	6	43589	43594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671821
1011	NC_018143	CGA	2	6	43606	43611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1012	NC_018143	CCG	2	6	43644	43649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1013	NC_018143	GAC	2	6	43763	43768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1014	NC_018143	CGAC	2	8	43845	43852	25 %	0 %	25 %	50 %	397671821
1015	NC_018143	TGG	2	6	43875	43880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671821
1016	NC_018143	TGC	2	6	43890	43895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1017	NC_018143	CCG	2	6	43926	43931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1018	NC_018143	CGT	2	6	43984	43989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1019	NC_018143	CGC	2	6	43997	44002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1020	NC_018143	CGA	2	6	44036	44041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1021	NC_018143	ACC	2	6	44051	44056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671821
1022	NC_018143	CAA	2	6	44128	44133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671821
1023	NC_018143	GC	3	6	44135	44140	0 %	0 %	50 %	50 %	397671821
1024	NC_018143	GGC	2	6	44192	44197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671821
1025	NC_018143	GAGC	2	8	44225	44232	25 %	0 %	50 %	25 %	397671821
1026	NC_018143	CGA	2	6	44242	44247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1027	NC_018143	CCG	2	6	44328	44333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1028	NC_018143	GAT	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671821
1029	NC_018143	GCT	2	6	44419	44424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1030	NC_018143	CGA	2	6	44425	44430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1031	NC_018143	CAC	2	6	44566	44571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671821
1032	NC_018143	CGA	2	6	44632	44637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1033	NC_018143	CGC	2	6	44644	44649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1034	NC_018143	CGG	3	9	44686	44694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671821
1035	NC_018143	CGC	2	6	44713	44718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1036	NC_018143	CGC	2	6	44734	44739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1037	NC_018143	TCT	2	6	44784	44789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671821
1038	NC_018143	GGTAC	2	10	44862	44871	20 %	20 %	40 %	20 %	397671821
1039	NC_018143	GGGACT	2	12	44907	44918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397671821
1040	NC_018143	CGG	2	6	44959	44964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671821
1041	NC_018143	CAG	2	6	45039	45044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1042	NC_018143	TCG	2	6	45057	45062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1043	NC_018143	TCGAA	2	10	45094	45103	40 %	20 %	20 %	20 %	397671821
1044	NC_018143	CGA	2	6	45196	45201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1045	NC_018143	ACT	2	6	45237	45242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671821
1046	NC_018143	CGA	2	6	45262	45267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1047	NC_018143	GGGC	2	8	45384	45391	0 %	0 %	75 %	25 %	397671821
1048	NC_018143	CGGC	2	8	45479	45486	0 %	0 %	50 %	50 %	397671821
1049	NC_018143	GAC	2	6	45500	45505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1050	NC_018143	CGG	2	6	45529	45534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671821
1051	NC_018143	CTG	2	6	45557	45562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1052	NC_018143	GCTTAC	2	12	45656	45667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397671821
1053	NC_018143	GC	3	6	45674	45679	0 %	0 %	50 %	50 %	397671821
1054	NC_018143	GAA	2	6	45793	45798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671821
1055	NC_018143	TGT	2	6	45907	45912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671821
1056	NC_018143	GTC	2	6	45950	45955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1057	NC_018143	GCACC	2	10	46024	46033	20 %	0 %	20 %	60 %	397671821
1058	NC_018143	TCG	2	6	46035	46040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1059	NC_018143	AGA	2	6	46048	46053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671821
1060	NC_018143	ACC	2	6	46107	46112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671821
1061	NC_018143	AAG	2	6	46118	46123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671821
1062	NC_018143	GCC	2	6	46145	46150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1063	NC_018143	GAG	2	6	46199	46204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671821
1064	NC_018143	ACC	2	6	46226	46231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671821
1065	NC_018143	GCC	2	6	46265	46270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1066	NC_018143	TCG	2	6	46275	46280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1067	NC_018143	GTG	3	9	46331	46339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671821
1068	NC_018143	GCC	2	6	46340	46345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1069	NC_018143	CGA	2	6	46351	46356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
1070	NC_018143	GCC	2	6	46370	46375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671821
1071	NC_018143	CGA	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671821
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1073	NC_018143	CGG	2	6	46479	46484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_018143	CGC	2	6	46534	46539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_018143	CGG	2	6	46546	46551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_018143	TTGC	2	8	46606	46613	0 %	50 %	25 %	25 %	397671822
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1079	NC_018143	CCGC	2	8	46754	46761	0 %	0 %	25 %	75 %	397671822
1080	NC_018143	GCG	2	6	46766	46771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671822
1081	NC_018143	CCGC	2	8	46787	46794	0 %	0 %	25 %	75 %	397671822
1082	NC_018143	TCT	2	6	46832	46837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671822
1083	NC_018143	GCC	2	6	46841	46846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671822
1084	NC_018143	GGT	3	9	46857	46865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671822
1085	NC_018143	GGTC	2	8	46895	46902	0 %	25 %	50 %	25 %	397671822
1086	NC_018143	GCA	2	6	46997	47002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671822
1087	NC_018143	CGGTG	2	10	47058	47067	0 %	20 %	60 %	20 %	397671822
1088	NC_018143	ACA	2	6	47197	47202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671822
1089	NC_018143	TCATG	2	10	47204	47213	20 %	40 %	20 %	20 %	397671822
1090	NC_018143	CTAC	2	8	47219	47226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_018143	GCT	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018143	ATCGG	2	10	47351	47360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_018143	GAG	2	6	47379	47384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671823
1094	NC_018143	CGGG	2	8	47446	47453	0 %	0 %	75 %	25 %	397671823
1095	NC_018143	CGG	3	9	47463	47471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671823
1096	NC_018143	GCAG	2	8	47519	47526	25 %	0 %	50 %	25 %	397671823
1097	NC_018143	GCG	2	6	47559	47564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671823
1098	NC_018143	CGT	2	6	47590	47595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671823
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1102	NC_018143	TGG	2	6	47866	47871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671823
1103	NC_018143	CGC	2	6	47896	47901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671823
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1105	NC_018143	T	6	6	48090	48095	0 %	100 %	0 %	0 %	397671823
1106	NC_018143	CGC	2	6	48358	48363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671824
1107	NC_018143	CGG	2	6	48373	48378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671824
1108	NC_018143	GTGC	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	397671824
1109	NC_018143	CGG	2	6	48460	48465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671824
1110	NC_018143	CCG	4	12	48522	48533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671824
1111	NC_018143	CGG	3	9	48557	48565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671824
1112	NC_018143	GCAGC	2	10	48598	48607	20 %	0 %	40 %	40 %	397671824
1113	NC_018143	GTC	2	6	48614	48619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671824
1114	NC_018143	GGC	2	6	48622	48627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671824
1115	NC_018143	TCG	2	6	48657	48662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671824
1116	NC_018143	CCCGA	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	397671824
1117	NC_018143	GCCG	2	8	48703	48710	0 %	0 %	50 %	50 %	397671824
1118	NC_018143	AGC	2	6	48747	48752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671824
1119	NC_018143	AAG	2	6	48879	48884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671824
1120	NC_018143	CGG	2	6	48927	48932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671824
1121	NC_018143	G	6	6	48958	48963	0 %	0 %	100 %	0 %	397671824
1122	NC_018143	TGC	2	6	48966	48971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671824
1123	NC_018143	GT	3	6	49048	49053	0 %	50 %	50 %	0 %	397671825
1124	NC_018143	GC	3	6	49083	49088	0 %	0 %	50 %	50 %	397671825
1125	NC_018143	CGA	2	6	49123	49128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671825
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1134	NC_018143	CGA	2	6	49504	49509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671825
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1251	NC_018143	CAT	2	6	54121	54126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671830
1252	NC_018143	CGG	2	6	54156	54161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671830
1253	NC_018143	AGC	2	6	54192	54197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671830
1254	NC_018143	GTT	2	6	54217	54222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671830
1255	NC_018143	CGG	2	6	54236	54241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671830
1256	NC_018143	CGG	2	6	54258	54263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671830
1257	NC_018143	TGG	2	6	54312	54317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671830
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1259	NC_018143	GCG	2	6	54347	54352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671830
1260	NC_018143	GCC	2	6	54373	54378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671830
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1267	NC_018143	TAC	2	6	54635	54640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671830
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1272	NC_018143	GCTCAA	2	12	54883	54894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397671830
1273	NC_018143	CGG	2	6	54895	54900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671830
1274	NC_018143	CAA	2	6	55000	55005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671830
1275	NC_018143	ACC	2	6	55086	55091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671830
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1285	NC_018143	GGT	2	6	55517	55522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671830
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1290	NC_018143	CGC	3	9	55683	55691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671830
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1309	NC_018143	GCG	2	6	56460	56465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671831
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1319	NC_018143	CGGCG	2	10	56686	56695	0 %	0 %	60 %	40 %	397671831
1320	NC_018143	CGT	2	6	56718	56723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671831
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1324	NC_018143	CAA	2	6	56916	56921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671831
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1328	NC_018143	CAC	2	6	57087	57092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671831
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1330	NC_018143	TGG	2	6	57137	57142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671831
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1344	NC_018143	CGA	2	6	57499	57504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671832
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1356	NC_018143	TCG	2	6	58032	58037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1357	NC_018143	GGT	2	6	58060	58065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1361	NC_018143	CGACC	2	10	58218	58227	20 %	0 %	20 %	60 %	397671833
1362	NC_018143	CGA	2	6	58230	58235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671833
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1367	NC_018143	GAA	3	9	58533	58541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_018143	GCC	2	6	58550	58555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1369	NC_018143	AGG	2	6	58572	58577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1370	NC_018143	ACC	2	6	58595	58600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671834
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1372	NC_018143	TCC	2	6	58743	58748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397671834
1373	NC_018143	GGC	2	6	58768	58773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671834
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1375	NC_018143	GCGG	2	8	58821	58828	0 %	0 %	75 %	25 %	397671834
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1500	NC_018143	GTG	2	6	63589	63594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671839

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