MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_018143	AGAT	2	8	534221	534228	50 %	25 %	25 %	0 %	397672236
13003	NC_018143	GGT	2	6	534235	534240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672236
13004	NC_018143	TTC	2	6	534241	534246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397672236
13005	NC_018143	GCA	2	6	534264	534269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672236
13006	NC_018143	GCT	2	6	534373	534378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672236
13007	NC_018143	CGGTC	2	10	534388	534397	0 %	20 %	40 %	40 %	397672236
13008	NC_018143	TCA	2	6	534445	534450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672237
13009	NC_018143	TC	3	6	534535	534540	0 %	50 %	0 %	50 %	397672237
13010	NC_018143	CCA	2	6	534564	534569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672237
13011	NC_018143	AGGT	2	8	534572	534579	25 %	25 %	50 %	0 %	397672237
13012	NC_018143	CAG	2	6	534583	534588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672237
13013	NC_018143	GCG	2	6	534609	534614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672237
13014	NC_018143	CCA	2	6	534646	534651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672237
13015	NC_018143	AGT	2	6	534669	534674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672237
13016	NC_018143	ATG	2	6	534710	534715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672237
13017	NC_018143	AAC	2	6	534881	534886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397672237
13018	NC_018143	AGG	2	6	534890	534895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397672237
13019	NC_018143	GCA	2	6	534945	534950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672237
13020	NC_018143	TCC	2	6	534968	534973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397672237
13021	NC_018143	TAG	2	6	535039	535044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672237
13022	NC_018143	CGG	2	6	535083	535088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672237
13023	NC_018143	CGACGG	2	12	535089	535100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397672237
13024	NC_018143	CGA	2	6	535101	535106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672237
13025	NC_018143	CGA	2	6	535128	535133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672237
13026	NC_018143	GCG	2	6	535150	535155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672237
13027	NC_018143	CAC	2	6	535180	535185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672237
13028	NC_018143	ACG	2	6	535217	535222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672237
13029	NC_018143	G	6	6	535231	535236	0 %	0 %	100 %	0 %	397672238
13030	NC_018143	TCG	2	6	535336	535341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672238
13031	NC_018143	CGC	2	6	535366	535371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672238
13032	NC_018143	CGA	2	6	535436	535441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672238
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13034	NC_018143	GAT	2	6	535473	535478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672238
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13036	NC_018143	GCG	2	6	535624	535629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672238
13037	NC_018143	ATC	2	6	535666	535671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672238
13038	NC_018143	ACT	2	6	535681	535686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397672238
13039	NC_018143	GCCG	2	8	535749	535756	0 %	0 %	50 %	50 %	397672238
13040	NC_018143	AGCC	2	8	535773	535780	25 %	0 %	25 %	50 %	397672238
13041	NC_018143	TGC	2	6	535783	535788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672238
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13043	NC_018143	CG	3	6	535833	535838	0 %	0 %	50 %	50 %	397672238
13044	NC_018143	CTG	2	6	535887	535892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672238
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13049	NC_018143	AGCG	2	8	536143	536150	25 %	0 %	50 %	25 %	397672238
13050	NC_018143	CGA	2	6	536208	536213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672238
13051	NC_018143	GATG	2	8	536291	536298	25 %	25 %	50 %	0 %	397672238
13052	NC_018143	GC	3	6	536311	536316	0 %	0 %	50 %	50 %	397672238
13053	NC_018143	CGG	2	6	536321	536326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672238
13054	NC_018143	AGTG	2	8	536369	536376	25 %	25 %	50 %	0 %	397672238
13055	NC_018143	AGC	2	6	536389	536394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672238
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13058	NC_018143	TGC	2	6	536475	536480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672238
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13062	NC_018143	CCA	3	9	536572	536580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672239
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13071	NC_018143	CCG	2	6	536841	536846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672239
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13093	NC_018143	TCG	2	6	537698	537703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672240
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13107	NC_018143	GTC	2	6	538246	538251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672240
13108	NC_018143	GC	3	6	538253	538258	0 %	0 %	50 %	50 %	397672240
13109	NC_018143	CGACAT	2	12	538261	538272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397672240
13110	NC_018143	CGA	2	6	538368	538373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672240
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13112	NC_018143	GCCG	2	8	538434	538441	0 %	0 %	50 %	50 %	397672240
13113	NC_018143	GGC	2	6	538486	538491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672240
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13116	NC_018143	TGC	2	6	538544	538549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672240
13117	NC_018143	CGGC	2	8	538567	538574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13119	NC_018143	GCT	2	6	538606	538611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672241
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13220	NC_018143	TG	3	6	543127	543132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13221	NC_018143	ATGG	2	8	543194	543201	25 %	25 %	50 %	0 %	397672244
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13227	NC_018143	GTC	2	6	543281	543286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672244
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13239	NC_018143	GGC	2	6	543626	543631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672244
13240	NC_018143	CAC	2	6	543632	543637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397672244
13241	NC_018143	CGG	2	6	543667	543672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672244
13242	NC_018143	CCG	2	6	543699	543704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397672244
13243	NC_018143	AAT	2	6	543747	543752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397672244
13244	NC_018143	GAC	2	6	543774	543779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672244
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13247	NC_018143	TGG	2	6	543894	543899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672244
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13249	NC_018143	GCT	2	6	543947	543952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672244
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13252	NC_018143	CTGG	2	8	544037	544044	0 %	25 %	50 %	25 %	397672244
13253	NC_018143	TGG	2	6	544063	544068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672244
13254	NC_018143	C	6	6	544143	544148	0 %	0 %	0 %	100 %	397672244
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13270	NC_018143	GCAA	2	8	544605	544612	50 %	0 %	25 %	25 %	397672244
13271	NC_018143	GCCG	2	8	544628	544635	0 %	0 %	50 %	50 %	397672244
13272	NC_018143	CGA	2	6	544652	544657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672244
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13301	NC_018143	TGA	2	6	545912	545917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672248
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13330	NC_018143	CTG	2	6	547120	547125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672249
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13342	NC_018143	GTA	2	6	547513	547518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672250
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13349	NC_018143	ATG	2	6	547989	547994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397672251
13350	NC_018143	CAG	2	6	548000	548005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397672251
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13352	NC_018143	CG	3	6	548025	548030	0 %	0 %	50 %	50 %	397672251
13353	NC_018143	GCT	2	6	548035	548040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672251
13354	NC_018143	GGT	2	6	548045	548050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397672251
13355	NC_018143	CGG	2	6	548080	548085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397672251
13356	NC_018143	GCCA	2	8	548134	548141	25 %	0 %	25 %	50 %	397672251
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13473	NC_018143	TAGGG	2	10	552604	552613	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13474	NC_018143	CGT	3	9	552631	552639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397672256
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