MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_018143	GGT	2	6	207734	207739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671962
5004	NC_018143	TGG	2	6	207799	207804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671962
5005	NC_018143	TGT	2	6	207874	207879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671962
5006	NC_018143	CGG	3	9	207940	207948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671962
5007	NC_018143	GGC	3	9	207956	207964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671962
5008	NC_018143	GGT	2	6	208001	208006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671962
5009	NC_018143	AATG	2	8	208014	208021	50 %	25 %	25 %	0 %	397671962
5010	NC_018143	CG	3	6	208038	208043	0 %	0 %	50 %	50 %	397671962
5011	NC_018143	CCGC	2	8	208151	208158	0 %	0 %	25 %	75 %	397671962
5012	NC_018143	TGT	2	6	208267	208272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671962
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5015	NC_018143	CGA	2	6	208367	208372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671962
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5017	NC_018143	CGT	2	6	208424	208429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671963
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5122	NC_018143	GGT	2	6	213062	213067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671968
5123	NC_018143	CCA	2	6	213079	213084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671968
5124	NC_018143	CGG	2	6	213100	213105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671968
5125	NC_018143	CGG	2	6	213169	213174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671968
5126	NC_018143	CGG	2	6	213287	213292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671968
5127	NC_018143	CGG	2	6	213310	213315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671968
5128	NC_018143	CGG	2	6	213418	213423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671968
5129	NC_018143	GCA	2	6	213463	213468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5130	NC_018143	GCA	2	6	213529	213534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5131	NC_018143	GCA	3	9	213541	213549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5132	NC_018143	TGC	2	6	213576	213581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5133	NC_018143	GCC	2	6	213585	213590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671968
5134	NC_018143	CGA	2	6	213622	213627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5135	NC_018143	CAG	2	6	213640	213645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
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5138	NC_018143	CCA	2	6	213697	213702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671968
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5140	NC_018143	GCC	2	6	213727	213732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671968
5141	NC_018143	CGGC	2	8	213749	213756	0 %	0 %	50 %	50 %	397671968
5142	NC_018143	CAGG	2	8	213779	213786	25 %	0 %	50 %	25 %	397671968
5143	NC_018143	TGG	2	6	213790	213795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671968
5144	NC_018143	GCA	2	6	213862	213867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5145	NC_018143	CGT	2	6	213892	213897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671968
5146	NC_018143	TCG	2	6	213981	213986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671968
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5154	NC_018143	ACC	2	6	214276	214281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671969
5155	NC_018143	GA	3	6	214319	214324	50 %	0 %	50 %	0 %	397671969
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5162	NC_018143	GGT	2	6	214613	214618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671969
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5166	NC_018143	CG	3	6	214677	214682	0 %	0 %	50 %	50 %	397671969
5167	NC_018143	CTG	2	6	214683	214688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671969
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5169	NC_018143	TGC	2	6	214744	214749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671969
5170	NC_018143	TG	3	6	214803	214808	0 %	50 %	50 %	0 %	397671969
5171	NC_018143	CGA	2	6	214889	214894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671969
5172	NC_018143	GCCGA	2	10	214926	214935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5173	NC_018143	CTG	2	6	215003	215008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671970
5174	NC_018143	CGG	2	6	215079	215084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671970
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5176	NC_018143	CACCAT	2	12	215155	215166	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	397671970
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5178	NC_018143	CGG	2	6	215223	215228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671970
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5180	NC_018143	TGG	2	6	215328	215333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671970
5181	NC_018143	CCTCG	2	10	215362	215371	0 %	20 %	20 %	60 %	397671970
5182	NC_018143	CGA	2	6	215391	215396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671970
5183	NC_018143	CCA	2	6	215484	215489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671970
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5185	NC_018143	CGT	2	6	215561	215566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671970
5186	NC_018143	GC	3	6	215576	215581	0 %	0 %	50 %	50 %	397671970
5187	NC_018143	AGCC	2	8	215593	215600	25 %	0 %	25 %	50 %	397671970
5188	NC_018143	TCG	2	6	215618	215623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671970
5189	NC_018143	GC	3	6	215632	215637	0 %	0 %	50 %	50 %	397671970
5190	NC_018143	AAC	2	6	215672	215677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671970
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5192	NC_018143	TCGGT	3	15	215862	215876	0 %	40 %	40 %	20 %	397671971
5193	NC_018143	GAC	2	6	215899	215904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671971
5194	NC_018143	CGG	2	6	215918	215923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671971
5195	NC_018143	GC	3	6	215965	215970	0 %	0 %	50 %	50 %	397671971
5196	NC_018143	GGC	2	6	215973	215978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671971
5197	NC_018143	GGC	2	6	216004	216009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671971
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5199	NC_018143	CAT	2	6	216088	216093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671971
5200	NC_018143	CGT	2	6	216192	216197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671971
5201	NC_018143	AGG	2	6	216206	216211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671971
5202	NC_018143	CGA	3	9	216272	216280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5203	NC_018143	TG	3	6	216364	216369	0 %	50 %	50 %	0 %	397671972
5204	NC_018143	TTG	2	6	216411	216416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671972
5205	NC_018143	CCG	2	6	216484	216489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671972
5206	NC_018143	GC	3	6	216558	216563	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5207	NC_018143	CAAT	2	8	216595	216602	50 %	25 %	0 %	25 %	397671972
5208	NC_018143	GC	3	6	216606	216611	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5209	NC_018143	GTT	2	6	216656	216661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671972
5210	NC_018143	ATC	2	6	216687	216692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671972
5211	NC_018143	CAG	3	9	216699	216707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5212	NC_018143	CGA	3	9	216718	216726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5213	NC_018143	CTGG	2	8	216764	216771	0 %	25 %	50 %	25 %	397671972
5214	NC_018143	TTG	2	6	216810	216815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671972
5215	NC_018143	GGC	2	6	216860	216865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
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5218	NC_018143	GC	3	6	216991	216996	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5219	NC_018143	GGCC	2	8	216998	217005	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5220	NC_018143	GTGCG	2	10	217016	217025	0 %	20 %	60 %	20 %	397671972
5221	NC_018143	ACCG	2	8	217062	217069	25 %	0 %	25 %	50 %	397671972
5222	NC_018143	GCC	2	6	217077	217082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671972
5223	NC_018143	CGG	2	6	217128	217133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5224	NC_018143	GCGCCG	2	12	217179	217190	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5225	NC_018143	TGC	3	9	217243	217251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5226	NC_018143	GCT	2	6	217262	217267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5227	NC_018143	CGCT	2	8	217270	217277	0 %	25 %	25 %	50 %	397671972
5228	NC_018143	CGG	2	6	217307	217312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5229	NC_018143	G	6	6	217367	217372	0 %	0 %	100 %	0 %	397671972
5230	NC_018143	CTG	2	6	217434	217439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5231	NC_018143	TGAG	2	8	217453	217460	25 %	25 %	50 %	0 %	397671972
5232	NC_018143	AGTTCG	2	12	217486	217497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397671972
5233	NC_018143	CGG	2	6	217513	217518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5234	NC_018143	GCTG	2	8	217526	217533	0 %	25 %	50 %	25 %	397671972
5235	NC_018143	CGC	2	6	217634	217639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671972
5236	NC_018143	CAT	2	6	217724	217729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671972
5237	NC_018143	TGG	2	6	218011	218016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671972
5238	NC_018143	GGC	2	6	218022	218027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5239	NC_018143	CGGTTG	2	12	218124	218135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397671972
5240	NC_018143	CGG	2	6	218175	218180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5241	NC_018143	ACG	2	6	218218	218223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671972
5242	NC_018143	CGGTGG	2	12	218263	218274	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	397671972
5243	NC_018143	CGG	2	6	218281	218286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671972
5244	NC_018143	GGCC	2	8	218318	218325	0 %	0 %	50 %	50 %	397671972
5245	NC_018143	GGCC	2	8	218345	218352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5246	NC_018143	TCG	2	6	218407	218412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_018143	ACAGCC	2	12	218478	218489	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5248	NC_018143	GGT	2	6	218578	218583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_018143	AT	3	6	218615	218620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_018143	CTG	2	6	218667	218672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_018143	GC	3	6	218673	218678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_018143	CGGT	2	8	218681	218688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_018143	CAACC	2	10	218718	218727	40 %	0 %	0 %	60 %	397671973
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5365	NC_018143	CGT	2	6	223030	223035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671977
5366	NC_018143	CTGGC	2	10	223055	223064	0 %	20 %	40 %	40 %	397671977
5367	NC_018143	CGC	2	6	223069	223074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671977
5368	NC_018143	TGG	2	6	223107	223112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671977
5369	NC_018143	TCG	2	6	223149	223154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671977
5370	NC_018143	CGG	2	6	223170	223175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671977
5371	NC_018143	CTG	2	6	223232	223237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671977
5372	NC_018143	TGC	2	6	223290	223295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671977
5373	NC_018143	CGG	2	6	223299	223304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671977
5374	NC_018143	GCG	3	9	223314	223322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671977
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5485	NC_018143	ATGG	2	8	227661	227668	25 %	25 %	50 %	0 %	397671981
5486	NC_018143	GCA	2	6	227678	227683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5487	NC_018143	TTG	2	6	227699	227704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671981
5488	NC_018143	GCCT	2	8	227713	227720	0 %	25 %	25 %	50 %	397671981
5489	NC_018143	CGGC	2	8	227734	227741	0 %	0 %	50 %	50 %	397671981
5490	NC_018143	CAG	2	6	227773	227778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5491	NC_018143	GC	4	8	227779	227786	0 %	0 %	50 %	50 %	397671981
5492	NC_018143	GCCG	2	8	227819	227826	0 %	0 %	50 %	50 %	397671981
5493	NC_018143	CCGGG	2	10	227946	227955	0 %	0 %	60 %	40 %	397671981
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5498	NC_018143	GCC	2	6	228167	228172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671981
5499	NC_018143	CGG	2	6	228200	228205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981
5500	NC_018143	GCG	2	6	228211	228216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981

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