MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018027	CGA	2	6	141449	141454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4002	NC_018027	AGGA	2	8	141514	141521	50 %	0 %	50 %	0 %	392414051
4003	NC_018027	CTG	2	6	141537	141542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4004	NC_018027	GGT	2	6	141633	141638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414051
4005	NC_018027	GGT	2	6	141699	141704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414051
4006	NC_018027	CCG	2	6	141712	141717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414051
4007	NC_018027	ACG	2	6	141718	141723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4008	NC_018027	GTC	2	6	141753	141758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4009	NC_018027	GTG	2	6	141843	141848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414051
4010	NC_018027	GAC	2	6	141888	141893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4011	NC_018027	TCG	2	6	141895	141900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414051
4012	NC_018027	TGTCGA	2	12	141953	141964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392414051
4013	NC_018027	CGG	2	6	142034	142039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414051
4014	NC_018027	GGC	3	9	142090	142098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414052
4015	NC_018027	GGT	2	6	142132	142137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414052
4016	NC_018027	CGG	2	6	142164	142169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414052
4017	NC_018027	CGG	2	6	142203	142208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414052
4018	NC_018027	GCC	2	6	142214	142219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414052
4019	NC_018027	CCAGT	2	10	142276	142285	20 %	20 %	20 %	40 %	392414052
4020	NC_018027	GGC	2	6	142297	142302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414052
4021	NC_018027	TCG	2	6	142319	142324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4022	NC_018027	TCG	2	6	142331	142336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4023	NC_018027	GTC	2	6	142415	142420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4024	NC_018027	CGG	2	6	142443	142448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414052
4025	NC_018027	CGGCGT	2	12	142545	142556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414052
4026	NC_018027	CGC	2	6	142566	142571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414052
4027	NC_018027	GCC	2	6	142603	142608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414052
4028	NC_018027	CAG	2	6	142618	142623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4029	NC_018027	TCG	2	6	142634	142639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4030	NC_018027	TCCAG	2	10	142650	142659	20 %	20 %	20 %	40 %	392414052
4031	NC_018027	CGT	2	6	142691	142696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414052
4032	NC_018027	GGCA	2	8	142744	142751	25 %	0 %	50 %	25 %	392414052
4033	NC_018027	CTT	2	6	142761	142766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_018027	CGA	2	6	142767	142772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_018027	GGC	2	6	142787	142792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_018027	CGAT	2	8	142851	142858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_018027	ACT	2	6	142878	142883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_018027	TAC	2	6	142899	142904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_018027	CA	3	6	142989	142994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_018027	CG	4	8	143029	143036	0 %	0 %	50 %	50 %	392414053
4041	NC_018027	CGCGC	2	10	143063	143072	0 %	0 %	40 %	60 %	392414053
4042	NC_018027	GAC	2	6	143099	143104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414053
4043	NC_018027	ACGC	2	8	143108	143115	25 %	0 %	25 %	50 %	392414053
4044	NC_018027	ACC	2	6	143147	143152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414053
4045	NC_018027	CAC	2	6	143222	143227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414053
4046	NC_018027	TGATC	2	10	143251	143260	20 %	40 %	20 %	20 %	392414053
4047	NC_018027	GAG	2	6	143291	143296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414053
4048	NC_018027	CGA	2	6	143344	143349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414053
4049	NC_018027	CTG	2	6	143405	143410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414053
4050	NC_018027	GC	3	6	143493	143498	0 %	0 %	50 %	50 %	392414053
4051	NC_018027	CGT	2	6	143512	143517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414053
4052	NC_018027	GGC	2	6	143521	143526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414053
4053	NC_018027	GA	3	6	143579	143584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018027	GCA	2	6	143610	143615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_018027	GCG	2	6	143635	143640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_018027	GAG	2	6	143691	143696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414054
4057	NC_018027	CCGG	2	8	143704	143711	0 %	0 %	50 %	50 %	392414054
4058	NC_018027	TCG	2	6	143740	143745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414054
4059	NC_018027	TGG	2	6	143761	143766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414054
4060	NC_018027	CCG	2	6	143794	143799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414054
4061	NC_018027	CGG	2	6	143852	143857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_018027	GCC	2	6	143858	143863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_018027	ACG	2	6	143873	143878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_018027	CCG	2	6	143887	143892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_018027	CGG	2	6	143912	143917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_018027	GTG	2	6	143971	143976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414055
4067	NC_018027	CCT	2	6	143982	143987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414055
4068	NC_018027	CGCAG	2	10	144045	144054	20 %	0 %	40 %	40 %	392414055
4069	NC_018027	TGCC	2	8	144164	144171	0 %	25 %	25 %	50 %	392414055
4070	NC_018027	GCG	2	6	144270	144275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414055
4071	NC_018027	CGG	2	6	144304	144309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_018027	GCC	2	6	144319	144324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_018027	GAG	2	6	144376	144381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018027	ATC	2	6	144400	144405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414056
4075	NC_018027	TCG	2	6	144428	144433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414056
4076	NC_018027	GC	3	6	144434	144439	0 %	0 %	50 %	50 %	392414056
4077	NC_018027	CG	3	6	144441	144446	0 %	0 %	50 %	50 %	392414056
4078	NC_018027	TCA	2	6	144449	144454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414056
4079	NC_018027	ACTCCA	2	12	144548	144559	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392414056
4080	NC_018027	CGG	2	6	144561	144566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414056
4081	NC_018027	TCG	2	6	144587	144592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414056
4082	NC_018027	ATCT	2	8	144622	144629	25 %	50 %	0 %	25 %	392414056
4083	NC_018027	GCC	2	6	144641	144646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414056
4084	NC_018027	GCA	2	6	144647	144652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414056
4085	NC_018027	GGCGAT	2	12	144671	144682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392414057
4086	NC_018027	CGA	2	6	144719	144724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4087	NC_018027	GTC	2	6	144767	144772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4088	NC_018027	CGA	3	9	144803	144811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4089	NC_018027	GTC	2	6	144837	144842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4090	NC_018027	TCG	2	6	144847	144852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4091	NC_018027	CGA	2	6	144860	144865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4092	NC_018027	ACT	2	6	144877	144882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414057
4093	NC_018027	ACG	3	9	144889	144897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414057
4094	NC_018027	CGGT	2	8	144944	144951	0 %	25 %	50 %	25 %	392414057
4095	NC_018027	GTG	2	6	145032	145037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414057
4096	NC_018027	AAG	2	6	145038	145043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414057
4097	NC_018027	CGAC	2	8	145069	145076	25 %	0 %	25 %	50 %	392414057
4098	NC_018027	CGC	2	6	145144	145149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4099	NC_018027	GGT	2	6	145186	145191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414058
4100	NC_018027	TCG	2	6	145244	145249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4101	NC_018027	CCG	2	6	145322	145327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4102	NC_018027	GCC	2	6	145372	145377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4103	NC_018027	TCA	2	6	145395	145400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414058
4104	NC_018027	GCA	2	6	145401	145406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4105	NC_018027	GAC	3	9	145498	145506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4106	NC_018027	GCT	2	6	145547	145552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4107	NC_018027	ACC	2	6	145616	145621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414058
4108	NC_018027	GCC	2	6	145660	145665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4109	NC_018027	GC	3	6	145691	145696	0 %	0 %	50 %	50 %	392414058
4110	NC_018027	G	7	7	145718	145724	0 %	0 %	100 %	0 %	392414058
4111	NC_018027	CGGTGA	2	12	145758	145769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392414058
4112	NC_018027	CAG	2	6	145798	145803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4113	NC_018027	TCA	2	6	145809	145814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414058
4114	NC_018027	CGC	2	6	145824	145829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4115	NC_018027	TCC	2	6	145916	145921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414058
4116	NC_018027	CAG	2	6	145957	145962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4117	NC_018027	GCA	2	6	145965	145970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
4118	NC_018027	TGG	2	6	145977	145982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414058
4119	NC_018027	GCC	2	6	145984	145989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414058
4120	NC_018027	CAC	2	6	145999	146004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414058
4121	NC_018027	CCT	2	6	146025	146030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414058
4122	NC_018027	CG	4	8	146043	146050	0 %	0 %	50 %	50 %	392414058
4123	NC_018027	GCA	2	6	146064	146069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414058
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4243	NC_018027	GCCGG	2	10	150559	150568	0 %	0 %	60 %	40 %	392414064
4244	NC_018027	GGCA	2	8	150622	150629	25 %	0 %	50 %	25 %	392414064
4245	NC_018027	CGA	2	6	150700	150705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414064
4246	NC_018027	AC	4	8	150710	150717	50 %	0 %	0 %	50 %	392414064
4247	NC_018027	GTC	2	6	150725	150730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414064
4248	NC_018027	CTA	2	6	150808	150813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414064
4249	NC_018027	ACA	2	6	150921	150926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414064
4250	NC_018027	GCG	2	6	150927	150932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414064
4251	NC_018027	GC	3	6	150945	150950	0 %	0 %	50 %	50 %	392414064
4252	NC_018027	GCG	2	6	151047	151052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414064
4253	NC_018027	TCA	2	6	151062	151067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414064
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4255	NC_018027	GCG	2	6	151144	151149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_018027	GAG	2	6	151166	151171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_018027	TCT	2	6	151181	151186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_018027	GC	3	6	151208	151213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_018027	CCA	2	6	151229	151234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_018027	GCAC	2	8	151314	151321	25 %	0 %	25 %	50 %	392414065
4261	NC_018027	CTGGTG	2	12	151338	151349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392414065
4262	NC_018027	GCC	2	6	151350	151355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414065
4263	NC_018027	GCC	2	6	151385	151390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414065
4264	NC_018027	CG	3	6	151393	151398	0 %	0 %	50 %	50 %	392414065
4265	NC_018027	CGG	2	6	151418	151423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414065
4266	NC_018027	ATCGCG	2	12	151476	151487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392414065
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4268	NC_018027	CTG	3	9	151581	151589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414065
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4276	NC_018027	ATC	2	6	151968	151973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414065
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4280	NC_018027	TCG	2	6	152107	152112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414065
4281	NC_018027	TGA	2	6	152146	152151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414065
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4335	NC_018027	GCCG	2	8	153845	153852	0 %	0 %	50 %	50 %	392414068
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4351	NC_018027	ACGGA	2	10	154419	154428	40 %	0 %	40 %	20 %	392414068
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4354	NC_018027	GAC	2	6	154508	154513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414068
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4360	NC_018027	CGTGG	2	10	154847	154856	0 %	20 %	60 %	20 %	392414068
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4364	NC_018027	CGGC	2	8	154995	155002	0 %	0 %	50 %	50 %	392414069
4365	NC_018027	GCG	2	6	155024	155029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414069
4366	NC_018027	GGC	2	6	155032	155037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414069
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4484	NC_018027	GC	3	6	159472	159477	0 %	0 %	50 %	50 %	392414074
4485	NC_018027	CGA	3	9	159501	159509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4486	NC_018027	GTG	2	6	159532	159537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414074
4487	NC_018027	CGC	2	6	159561	159566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414074
4488	NC_018027	GTC	2	6	159568	159573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4489	NC_018027	GAC	2	6	159616	159621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4490	NC_018027	CAG	2	6	159625	159630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4491	NC_018027	CAG	2	6	159645	159650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4492	NC_018027	TCGA	2	8	159697	159704	25 %	25 %	25 %	25 %	392414074
4493	NC_018027	ATG	2	6	159718	159723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414074
4494	NC_018027	CGC	2	6	159846	159851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414074
4495	NC_018027	GC	3	6	159870	159875	0 %	0 %	50 %	50 %	392414074
4496	NC_018027	GGC	2	6	159946	159951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414074
4497	NC_018027	CGA	2	6	159963	159968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414074
4498	NC_018027	CCTGC	2	10	160007	160016	0 %	20 %	20 %	60 %	392414075
4499	NC_018027	GC	3	6	160015	160020	0 %	0 %	50 %	50 %	392414075
4500	NC_018027	ATC	2	6	160066	160071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414075

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