MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018027	ACG	2	6	571419	571424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16003	NC_018027	CGG	2	6	571439	571444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414447
16004	NC_018027	ACG	2	6	571537	571542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16005	NC_018027	CGG	2	6	571568	571573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414447
16006	NC_018027	TGC	2	6	571597	571602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16007	NC_018027	GGC	2	6	571611	571616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414447
16008	NC_018027	CGA	2	6	571649	571654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16009	NC_018027	GCC	2	6	571749	571754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
16010	NC_018027	GCC	2	6	571803	571808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
16011	NC_018027	GCT	2	6	571865	571870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16012	NC_018027	TGG	2	6	571906	571911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414447
16013	NC_018027	CTT	2	6	571913	571918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414447
16014	NC_018027	ACA	2	6	572009	572014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414447
16015	NC_018027	CGC	2	6	572021	572026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
16016	NC_018027	ACG	2	6	572065	572070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16017	NC_018027	CAG	2	6	572103	572108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16018	NC_018027	ACGGC	2	10	572138	572147	20 %	0 %	40 %	40 %	392414447
16019	NC_018027	CGCC	2	8	572192	572199	0 %	0 %	25 %	75 %	392414447
16020	NC_018027	TCG	2	6	572239	572244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16021	NC_018027	CAG	2	6	572261	572266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16022	NC_018027	CGC	2	6	572315	572320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
16023	NC_018027	ACC	2	6	572349	572354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414447
16024	NC_018027	CGG	2	6	572425	572430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414447
16025	NC_018027	GTC	2	6	572448	572453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414447
16026	NC_018027	CA	3	6	572464	572469	50 %	0 %	0 %	50 %	392414447
16027	NC_018027	CCA	2	6	572530	572535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414447
16028	NC_018027	CCG	2	6	572536	572541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
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16031	NC_018027	CGCT	2	8	572602	572609	0 %	25 %	25 %	50 %	392414447
16032	NC_018027	CGGC	2	8	572689	572696	0 %	0 %	50 %	50 %	392414447
16033	NC_018027	GCA	3	9	572704	572712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414447
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16035	NC_018027	CCG	2	6	572797	572802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414447
16036	NC_018027	TG	3	6	572850	572855	0 %	50 %	50 %	0 %	392414447
16037	NC_018027	CCG	2	6	572864	572869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_018027	CAT	2	6	572892	572897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414448
16039	NC_018027	TGG	2	6	572929	572934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414448
16040	NC_018027	GGTGGA	2	12	572939	572950	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	392414448
16041	NC_018027	TCA	2	6	573051	573056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_018027	TCG	2	6	573070	573075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_018027	AGT	2	6	573099	573104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_018027	CTG	2	6	573140	573145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_018027	GC	4	8	573168	573175	0 %	0 %	50 %	50 %	392414449
16046	NC_018027	CAC	2	6	573184	573189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414449
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16048	NC_018027	CGA	2	6	573240	573245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414449
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16050	NC_018027	AGGG	2	8	573292	573299	25 %	0 %	75 %	0 %	392414449
16051	NC_018027	GC	4	8	573301	573308	0 %	0 %	50 %	50 %	392414449
16052	NC_018027	CCA	2	6	573360	573365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414449
16053	NC_018027	CGA	2	6	573375	573380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414449
16054	NC_018027	TGC	2	6	573470	573475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414449
16055	NC_018027	GA	3	6	573540	573545	50 %	0 %	50 %	0 %	392414449
16056	NC_018027	TCC	2	6	573577	573582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414450
16057	NC_018027	GCG	2	6	573658	573663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414450
16058	NC_018027	GCC	2	6	573684	573689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414450
16059	NC_018027	CAT	2	6	573693	573698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414450
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16061	NC_018027	CTGC	2	8	573740	573747	0 %	25 %	25 %	50 %	392414450
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16064	NC_018027	GCG	3	9	573862	573870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414450
16065	NC_018027	TTC	2	6	573897	573902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414450
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16074	NC_018027	CAG	2	6	574287	574292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16082	NC_018027	CG	3	6	574694	574699	0 %	0 %	50 %	50 %	392414450
16083	NC_018027	C	6	6	574774	574779	0 %	0 %	0 %	100 %	392414450
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16087	NC_018027	CG	4	8	574870	574877	0 %	0 %	50 %	50 %	392414450
16088	NC_018027	CCCG	2	8	574993	575000	0 %	0 %	25 %	75 %	392414450
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16091	NC_018027	GGCGC	2	10	575118	575127	0 %	0 %	60 %	40 %	392414450
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16099	NC_018027	CGA	2	6	575441	575446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16104	NC_018027	GCCT	2	8	575679	575686	0 %	25 %	25 %	50 %	392414450
16105	NC_018027	CAG	2	6	575736	575741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16108	NC_018027	GCA	2	6	575774	575779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414450
16109	NC_018027	GTC	2	6	575793	575798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16111	NC_018027	CGT	2	6	575810	575815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16119	NC_018027	GAC	2	6	576051	576056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414450
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16238	NC_018027	GTCG	2	8	580059	580066	0 %	25 %	50 %	25 %	392414452
16239	NC_018027	TCG	2	6	580193	580198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414453
16240	NC_018027	GCC	2	6	580199	580204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414453
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16244	NC_018027	TGA	2	6	580413	580418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414453
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16321	NC_018027	TCG	2	6	583138	583143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414456
16322	NC_018027	CAG	2	6	583176	583181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414456
16323	NC_018027	TCG	2	6	583202	583207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414456
16324	NC_018027	GAA	2	6	583269	583274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414456
16325	NC_018027	TC	3	6	583321	583326	0 %	50 %	0 %	50 %	392414456
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16330	NC_018027	GTCC	2	8	583455	583462	0 %	25 %	25 %	50 %	392414456
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16332	NC_018027	GTCCTC	2	12	583476	583487	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	392414456
16333	NC_018027	CGA	2	6	583532	583537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414456
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16336	NC_018027	GCC	2	6	583584	583589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414456
16337	NC_018027	GCG	2	6	583636	583641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414456
16338	NC_018027	GC	4	8	583669	583676	0 %	0 %	50 %	50 %	392414456
16339	NC_018027	TCG	2	6	583681	583686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414456
16340	NC_018027	GAT	2	6	583692	583697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414456
16341	NC_018027	CGT	2	6	583737	583742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414456
16342	NC_018027	GCC	2	6	583745	583750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414456
16343	NC_018027	GGC	2	6	583767	583772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414456
16344	NC_018027	CGC	2	6	583799	583804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414456
16345	NC_018027	GCC	2	6	583805	583810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414456
16346	NC_018027	GTGTCG	2	12	583828	583839	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392414456
16347	NC_018027	GC	3	6	583858	583863	0 %	0 %	50 %	50 %	392414456
16348	NC_018027	CGC	2	6	583880	583885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414456
16349	NC_018027	GGGT	2	8	583983	583990	0 %	25 %	75 %	0 %	392414456
16350	NC_018027	CCG	2	6	584015	584020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16351	NC_018027	CG	4	8	584055	584062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16352	NC_018027	G	7	7	584081	584087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16353	NC_018027	CTCAG	2	10	584088	584097	20 %	20 %	20 %	40 %	392414457
16354	NC_018027	GTG	2	6	584098	584103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414457
16355	NC_018027	AGT	2	6	584178	584183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414457
16356	NC_018027	GCC	2	6	584203	584208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414457
16357	NC_018027	CTG	2	6	584227	584232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414457
16358	NC_018027	GCT	2	6	584253	584258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414457
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16391	NC_018027	GGT	2	6	585742	585747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414457
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16393	NC_018027	CGA	2	6	585804	585809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414457
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16397	NC_018027	GGC	2	6	585948	585953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16467	NC_018027	CGA	3	9	588818	588826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414460
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16472	NC_018027	GC	3	6	589034	589039	0 %	0 %	50 %	50 %	392414460
16473	NC_018027	CGA	2	6	589133	589138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414460
16474	NC_018027	TGC	3	9	589147	589155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414460
16475	NC_018027	GCCG	2	8	589169	589176	0 %	0 %	50 %	50 %	392414460
16476	NC_018027	CCGCG	2	10	589178	589187	0 %	0 %	40 %	60 %	392414460
16477	NC_018027	GGA	2	6	589196	589201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414460
16478	NC_018027	ACCGA	2	10	589218	589227	40 %	0 %	20 %	40 %	392414461
16479	NC_018027	CGC	2	6	589245	589250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414461
16480	NC_018027	GCT	2	6	589254	589259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414461
16481	NC_018027	GC	3	6	589283	589288	0 %	0 %	50 %	50 %	392414461
16482	NC_018027	CCA	2	6	589296	589301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414461
16483	NC_018027	GCT	2	6	589310	589315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414461
16484	NC_018027	CCG	2	6	589343	589348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414461
16485	NC_018027	TGC	2	6	589376	589381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414461
16486	NC_018027	CGT	2	6	589470	589475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414461
16487	NC_018027	GCG	3	9	589484	589492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414461
16488	NC_018027	CG	3	6	589532	589537	0 %	0 %	50 %	50 %	392414461
16489	NC_018027	CGA	2	6	589551	589556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414461
16490	NC_018027	GC	3	6	589615	589620	0 %	0 %	50 %	50 %	392414461
16491	NC_018027	CCG	2	6	589621	589626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414461
16492	NC_018027	GTG	2	6	589642	589647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414461
16493	NC_018027	CGC	2	6	589653	589658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414461
16494	NC_018027	CAT	2	6	589724	589729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16495	NC_018027	CGA	2	6	589755	589760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414462
16496	NC_018027	CGC	2	6	589827	589832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414462
16497	NC_018027	CGA	2	6	589836	589841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414462
16498	NC_018027	GGT	2	6	589867	589872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414462
16499	NC_018027	CGA	2	6	589900	589905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414462
16500	NC_018027	GC	3	6	589942	589947	0 %	0 %	50 %	50 %	392414462

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