MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_018027	GATC	2	8	518153	518160	25 %	25 %	25 %	25 %	392414396
14502	NC_018027	CGC	2	6	518161	518166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414396
14503	NC_018027	GCA	3	9	518212	518220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414396
14504	NC_018027	GACGGG	2	12	518354	518365	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	392414396
14505	NC_018027	GCA	2	6	518374	518379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414396
14506	NC_018027	GAG	2	6	518484	518489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414396
14507	NC_018027	CCG	2	6	518494	518499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414396
14508	NC_018027	GAT	2	6	518543	518548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414396
14509	NC_018027	GTGGTT	2	12	518567	518578	0 %	50 %	50 %	0 %	392414396
14510	NC_018027	CGGCC	2	10	518590	518599	0 %	0 %	40 %	60 %	392414396
14511	NC_018027	TCG	2	6	518610	518615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414396
14512	NC_018027	GCG	2	6	518646	518651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414396
14513	NC_018027	CGG	2	6	518665	518670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414396
14514	NC_018027	GCG	2	6	518731	518736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414396
14515	NC_018027	GGT	2	6	518897	518902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414396
14516	NC_018027	CGA	2	6	518914	518919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414396
14517	NC_018027	GAC	2	6	519027	519032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_018027	CGA	2	6	519156	519161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_018027	GAC	2	6	519168	519173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14520	NC_018027	ACCG	2	8	519180	519187	25 %	0 %	25 %	50 %	392414397
14521	NC_018027	GAC	2	6	519192	519197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14522	NC_018027	GCC	2	6	519216	519221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14523	NC_018027	GCT	2	6	519330	519335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14524	NC_018027	GCC	2	6	519409	519414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14525	NC_018027	CTG	2	6	519430	519435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14526	NC_018027	TGG	2	6	519473	519478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414397
14527	NC_018027	CGGC	2	8	519486	519493	0 %	0 %	50 %	50 %	392414397
14528	NC_018027	CGC	2	6	519552	519557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14529	NC_018027	CGG	3	9	519588	519596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14530	NC_018027	GGT	2	6	519621	519626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414397
14531	NC_018027	CGG	2	6	519636	519641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14532	NC_018027	TCG	3	9	519658	519666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14533	NC_018027	CGC	2	6	519729	519734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14534	NC_018027	CGG	2	6	519765	519770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14535	NC_018027	TCT	2	6	519800	519805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414397
14536	NC_018027	GGC	2	6	519884	519889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14537	NC_018027	TGC	2	6	519932	519937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14538	NC_018027	TCG	2	6	519973	519978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14539	NC_018027	ACC	2	6	519979	519984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414397
14540	NC_018027	CGG	2	6	519998	520003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14541	NC_018027	GTG	2	6	520018	520023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414397
14542	NC_018027	CGT	2	6	520106	520111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14543	NC_018027	GTC	2	6	520140	520145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14544	NC_018027	ATC	2	6	520177	520182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414397
14545	NC_018027	GGGC	2	8	520241	520248	0 %	0 %	75 %	25 %	392414397
14546	NC_018027	CGG	2	6	520268	520273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14547	NC_018027	CGG	2	6	520341	520346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14548	NC_018027	TGC	2	6	520349	520354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14549	NC_018027	TCG	2	6	520370	520375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14550	NC_018027	ACT	2	6	520403	520408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414397
14551	NC_018027	CGG	3	9	520443	520451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14552	NC_018027	CCG	2	6	520472	520477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14553	NC_018027	CGTCC	2	10	520491	520500	0 %	20 %	20 %	60 %	392414397
14554	NC_018027	GCG	2	6	520508	520513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414397
14555	NC_018027	GC	3	6	520527	520532	0 %	0 %	50 %	50 %	392414397
14556	NC_018027	TTC	2	6	520537	520542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414397
14557	NC_018027	TCG	2	6	520552	520557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14558	NC_018027	TCT	3	9	520571	520579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414397
14559	NC_018027	TGA	2	6	520583	520588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414397
14560	NC_018027	TCG	2	6	520589	520594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14561	NC_018027	AGC	2	6	520624	520629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14562	NC_018027	ACG	2	6	520667	520672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14563	NC_018027	GCC	2	6	520683	520688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14564	NC_018027	CTG	2	6	520738	520743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14565	NC_018027	GCA	2	6	520761	520766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14566	NC_018027	CTT	2	6	520803	520808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414397
14567	NC_018027	TCA	2	6	520817	520822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414397
14568	NC_018027	GTC	2	6	520846	520851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414397
14569	NC_018027	CGC	3	9	520860	520868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414397
14570	NC_018027	TGA	2	6	520871	520876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414397
14571	NC_018027	GAC	2	6	521010	521015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14572	NC_018027	CGA	2	6	521019	521024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14573	NC_018027	GCG	2	6	521077	521082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414398
14574	NC_018027	GCC	2	6	521086	521091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414398
14575	NC_018027	GGA	2	6	521097	521102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414398
14576	NC_018027	GGC	2	6	521107	521112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414398
14577	NC_018027	CGA	2	6	521174	521179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14578	NC_018027	AC	3	6	521204	521209	50 %	0 %	0 %	50 %	392414398
14579	NC_018027	TCG	2	6	521210	521215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14580	NC_018027	ACT	2	6	521216	521221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414398
14581	NC_018027	TGC	2	6	521270	521275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14582	NC_018027	TGG	2	6	521335	521340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414398
14583	NC_018027	CGG	2	6	521341	521346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414398
14584	NC_018027	ACG	2	6	521381	521386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14585	NC_018027	CG	3	6	521422	521427	0 %	0 %	50 %	50 %	392414398
14586	NC_018027	TGC	2	6	521435	521440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14587	NC_018027	CCG	2	6	521441	521446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414398
14588	NC_018027	GCG	2	6	521627	521632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414398
14589	NC_018027	CGA	4	12	521838	521849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414398
14590	NC_018027	GC	3	6	521919	521924	0 %	0 %	50 %	50 %	392414398
14591	NC_018027	CAC	3	9	521966	521974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414399
14592	NC_018027	TCG	2	6	522024	522029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14593	NC_018027	GCGA	2	8	522060	522067	25 %	0 %	50 %	25 %	392414399
14594	NC_018027	CCG	2	6	522148	522153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414399
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14597	NC_018027	TCG	2	6	522276	522281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14598	NC_018027	GTC	2	6	522329	522334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14599	NC_018027	GGC	2	6	522365	522370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414399
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14601	NC_018027	CGT	2	6	522544	522549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14602	NC_018027	CGCGA	2	10	522561	522570	20 %	0 %	40 %	40 %	392414399
14603	NC_018027	ACG	2	6	522606	522611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14604	NC_018027	GCG	2	6	522624	522629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414399
14605	NC_018027	TCG	2	6	522637	522642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14606	NC_018027	ACGTCG	2	12	522684	522695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392414399
14607	NC_018027	GC	3	6	522696	522701	0 %	0 %	50 %	50 %	392414399
14608	NC_018027	CCAG	2	8	522703	522710	25 %	0 %	25 %	50 %	392414399
14609	NC_018027	GGT	2	6	522810	522815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414400
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14611	NC_018027	CGT	2	6	522855	522860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414400
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14613	NC_018027	GC	3	6	522884	522889	0 %	0 %	50 %	50 %	392414400
14614	NC_018027	GTG	2	6	522898	522903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414400
14615	NC_018027	GCC	2	6	522933	522938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414400
14616	NC_018027	GCGCC	2	10	522952	522961	0 %	0 %	40 %	60 %	392414400
14617	NC_018027	CGA	2	6	523077	523082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414400
14618	NC_018027	GCCA	2	8	523124	523131	25 %	0 %	25 %	50 %	392414400
14619	NC_018027	CGCCAC	2	12	523150	523161	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	392414400
14620	NC_018027	CG	4	8	523278	523285	0 %	0 %	50 %	50 %	392414400
14621	NC_018027	CCG	2	6	523302	523307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414400
14622	NC_018027	CGG	2	6	523355	523360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414400
14623	NC_018027	CCG	2	6	523370	523375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414400
14624	NC_018027	GCA	2	6	523380	523385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414400
14625	NC_018027	CTG	2	6	523402	523407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414400
14626	NC_018027	GCG	3	9	523430	523438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414400
14627	NC_018027	CCCGG	2	10	523459	523468	0 %	0 %	40 %	60 %	392414400
14628	NC_018027	GAC	2	6	523483	523488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414400
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14632	NC_018027	GAC	2	6	523522	523527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414400
14633	NC_018027	CCG	2	6	523554	523559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414400
14634	NC_018027	CCG	2	6	523611	523616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414400
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14642	NC_018027	TCG	4	12	523957	523968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414401
14643	NC_018027	ACG	2	6	524020	524025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414401
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14645	NC_018027	GCG	2	6	524125	524130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414401
14646	NC_018027	TGA	2	6	524153	524158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414401
14647	NC_018027	CGGC	2	8	524171	524178	0 %	0 %	50 %	50 %	392414401
14648	NC_018027	TCGGT	2	10	524204	524213	0 %	40 %	40 %	20 %	392414401
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14650	NC_018027	CG	3	6	524416	524421	0 %	0 %	50 %	50 %	392414402
14651	NC_018027	CGG	2	6	524468	524473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414402
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14657	NC_018027	GCTG	2	8	524611	524618	0 %	25 %	50 %	25 %	392414402
14658	NC_018027	GCAG	2	8	524661	524668	25 %	0 %	50 %	25 %	392414402
14659	NC_018027	CG	3	6	524675	524680	0 %	0 %	50 %	50 %	392414402
14660	NC_018027	GC	3	6	524681	524686	0 %	0 %	50 %	50 %	392414402
14661	NC_018027	CGT	2	6	524741	524746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14682	NC_018027	TCC	2	6	525318	525323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414404
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14690	NC_018027	CGGG	2	8	525481	525488	0 %	0 %	75 %	25 %	392414404
14691	NC_018027	GGC	2	6	525496	525501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414404
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14693	NC_018027	GCA	2	6	525516	525521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414404
14694	NC_018027	GCG	3	9	525530	525538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414404
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14698	NC_018027	G	6	6	525771	525776	0 %	0 %	100 %	0 %	392414404
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14702	NC_018027	ATC	2	6	525904	525909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414404
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14713	NC_018027	CGCGC	2	10	526390	526399	0 %	0 %	40 %	60 %	392414405
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14718	NC_018027	CTG	2	6	526535	526540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414405
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14726	NC_018027	GCC	2	6	526885	526890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414405
14727	NC_018027	GC	3	6	526915	526920	0 %	0 %	50 %	50 %	392414405
14728	NC_018027	ATC	3	9	526943	526951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414405
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14731	NC_018027	CGT	2	6	527085	527090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414405
14732	NC_018027	GAG	2	6	527114	527119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414405
14733	NC_018027	GC	3	6	527134	527139	0 %	0 %	50 %	50 %	392414405
14734	NC_018027	GTG	2	6	527141	527146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414405
14735	NC_018027	CGAC	2	8	527288	527295	25 %	0 %	25 %	50 %	392414406
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14972	NC_018027	GCA	2	6	535186	535191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14973	NC_018027	GAC	2	6	535196	535201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14974	NC_018027	CGG	2	6	535211	535216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414414
14975	NC_018027	GC	3	6	535225	535230	0 %	0 %	50 %	50 %	392414414
14976	NC_018027	GCCG	2	8	535237	535244	0 %	0 %	50 %	50 %	392414414
14977	NC_018027	GA	3	6	535312	535317	50 %	0 %	50 %	0 %	392414414
14978	NC_018027	CCCG	2	8	535318	535325	0 %	0 %	25 %	75 %	392414414
14979	NC_018027	CAC	2	6	535340	535345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414414
14980	NC_018027	CGA	2	6	535378	535383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14981	NC_018027	CAG	2	6	535499	535504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14982	NC_018027	GTC	2	6	535526	535531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14983	NC_018027	CCT	2	6	535573	535578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414414
14984	NC_018027	GAGG	2	8	535580	535587	25 %	0 %	75 %	0 %	392414414
14985	NC_018027	GC	3	6	535646	535651	0 %	0 %	50 %	50 %	392414414
14986	NC_018027	GAG	2	6	535667	535672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414414
14987	NC_018027	GCGATC	2	12	535734	535745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392414414
14988	NC_018027	CGC	2	6	535761	535766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14989	NC_018027	TGA	2	6	535772	535777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14990	NC_018027	GGT	2	6	535884	535889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414415
14991	NC_018027	TGC	2	6	535894	535899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414415
14992	NC_018027	CGC	2	6	535910	535915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414415
14993	NC_018027	TCG	2	6	535978	535983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414415
14994	NC_018027	GGAC	2	8	535988	535995	25 %	0 %	50 %	25 %	392414415
14995	NC_018027	TCG	2	6	536062	536067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414415
14996	NC_018027	GAC	2	6	536078	536083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414415
14997	NC_018027	CCG	2	6	536099	536104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414415
14998	NC_018027	CGTCGG	2	12	536135	536146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414415
14999	NC_018027	CGGC	2	8	536164	536171	0 %	0 %	50 %	50 %	392414415
15000	NC_018027	GCT	2	6	536183	536188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414415

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