MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 15345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018022	GCC	2	6	533455	533460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406198
13502	NC_018022	ACC	2	6	533468	533473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406198
13503	NC_018022	TCG	2	6	533474	533479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406198
13504	NC_018022	CGCC	2	8	533484	533491	0 %	0 %	25 %	75 %	392406198
13505	NC_018022	CGC	2	6	533493	533498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406198
13506	NC_018022	C	6	6	533528	533533	0 %	0 %	0 %	100 %	392406198
13507	NC_018022	CGG	2	6	533558	533563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406198
13508	NC_018022	GCT	2	6	533568	533573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406198
13509	NC_018022	CCCTG	2	10	533582	533591	0 %	20 %	20 %	60 %	392406198
13510	NC_018022	CA	3	6	533593	533598	50 %	0 %	0 %	50 %	392406198
13511	NC_018022	GCT	2	6	533634	533639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406198
13512	NC_018022	ACG	2	6	533723	533728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406198
13513	NC_018022	GCG	2	6	533731	533736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406198
13514	NC_018022	CGCGC	2	10	533737	533746	0 %	0 %	40 %	60 %	392406198
13515	NC_018022	GC	4	8	533743	533750	0 %	0 %	50 %	50 %	392406198
13516	NC_018022	CCG	2	6	533757	533762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406198
13517	NC_018022	CCCGG	2	10	533788	533797	0 %	0 %	40 %	60 %	392406198
13518	NC_018022	CGA	2	6	533835	533840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406198
13519	NC_018022	CCAC	2	8	533969	533976	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13520	NC_018022	TCA	2	6	533989	533994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_018022	ACC	2	6	534007	534012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_018022	CGT	2	6	534113	534118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_018022	CAG	2	6	534135	534140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_018022	CGG	2	6	534156	534161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_018022	CACC	2	8	534213	534220	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13526	NC_018022	GCT	2	6	534289	534294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_018022	GAA	2	6	534324	534329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_018022	CGA	3	9	534362	534370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_018022	TGG	2	6	534508	534513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_018022	AAC	2	6	534587	534592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_018022	GAT	2	6	534638	534643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_018022	C	6	6	534659	534664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13533	NC_018022	GCG	2	6	534679	534684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_018022	CGG	2	6	534730	534735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_018022	GTCGAG	2	12	534770	534781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13536	NC_018022	CTG	2	6	534820	534825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_018022	GGT	2	6	534827	534832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_018022	CTTCA	2	10	534833	534842	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13539	NC_018022	GGCG	2	8	534870	534877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13540	NC_018022	GCG	2	6	534911	534916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_018022	CGC	2	6	534966	534971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_018022	TCAC	2	8	534977	534984	25 %	25 %	0 %	50 %	392406199
13543	NC_018022	CA	3	6	535082	535087	50 %	0 %	0 %	50 %	392406199
13544	NC_018022	GC	3	6	535094	535099	0 %	0 %	50 %	50 %	392406199
13545	NC_018022	GGC	2	6	535180	535185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406199
13546	NC_018022	ACA	2	6	535355	535360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406199
13547	NC_018022	GCG	2	6	535361	535366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406199
13548	NC_018022	CAG	2	6	535551	535556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13549	NC_018022	G	6	6	535704	535709	0 %	0 %	100 %	0 %	392406199
13550	NC_018022	CGT	2	6	535736	535741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13551	NC_018022	GATCTC	2	12	535749	535760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392406199
13552	NC_018022	GCA	2	6	535782	535787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13553	NC_018022	CAG	2	6	535788	535793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13554	NC_018022	CGTT	2	8	535810	535817	0 %	50 %	25 %	25 %	392406199
13555	NC_018022	GTC	2	6	535848	535853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13556	NC_018022	ACG	2	6	535883	535888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406199
13557	NC_018022	GTG	2	6	535929	535934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406199
13558	NC_018022	GCG	2	6	535939	535944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406199
13559	NC_018022	GAA	2	6	535971	535976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406199
13560	NC_018022	CTC	2	6	535977	535982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406199
13561	NC_018022	CGT	2	6	536074	536079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406200
13562	NC_018022	GCCC	2	8	536091	536098	0 %	0 %	25 %	75 %	392406200
13563	NC_018022	GTA	2	6	536099	536104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406200
13564	NC_018022	CAGC	2	8	536167	536174	25 %	0 %	25 %	50 %	392406200
13565	NC_018022	GAA	2	6	536207	536212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406200
13566	NC_018022	TCA	2	6	536290	536295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406200
13567	NC_018022	CCG	2	6	536349	536354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406201
13568	NC_018022	GGCC	2	8	536367	536374	0 %	0 %	50 %	50 %	392406201
13569	NC_018022	CGA	2	6	536400	536405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406201
13570	NC_018022	GCG	2	6	536447	536452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406201
13571	NC_018022	CGG	2	6	536574	536579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406201
13572	NC_018022	CGCGG	2	10	536605	536614	0 %	0 %	60 %	40 %	392406201
13573	NC_018022	GAC	2	6	536685	536690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406201
13574	NC_018022	AGG	2	6	536708	536713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406201
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13576	NC_018022	TCA	2	6	536745	536750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406201
13577	NC_018022	GAG	2	6	536779	536784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406201
13578	NC_018022	TGG	2	6	536909	536914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406201
13579	NC_018022	TGCG	2	8	536986	536993	0 %	25 %	50 %	25 %	392406201
13580	NC_018022	ACG	2	6	537015	537020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406201
13581	NC_018022	GTA	2	6	537031	537036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406201
13582	NC_018022	CTG	2	6	537127	537132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406201
13583	NC_018022	GGT	2	6	537211	537216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406201
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13585	NC_018022	CCA	2	6	537263	537268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406201
13586	NC_018022	ATGT	2	8	537347	537354	25 %	50 %	25 %	0 %	392406201
13587	NC_018022	GCC	2	6	537395	537400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406201
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13589	NC_018022	CGG	2	6	537449	537454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406202
13590	NC_018022	TCG	2	6	537502	537507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406202
13591	NC_018022	GC	3	6	537571	537576	0 %	0 %	50 %	50 %	392406202
13592	NC_018022	CGT	2	6	537617	537622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406202
13593	NC_018022	CAC	2	6	537631	537636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406202
13594	NC_018022	G	6	6	537656	537661	0 %	0 %	100 %	0 %	392406202
13595	NC_018022	GGCC	2	8	537710	537717	0 %	0 %	50 %	50 %	392406202
13596	NC_018022	TCGA	2	8	537721	537728	25 %	25 %	25 %	25 %	392406202
13597	NC_018022	CGG	2	6	537792	537797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406202
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13600	NC_018022	GCCC	2	8	537995	538002	0 %	0 %	25 %	75 %	392406202
13601	NC_018022	CGT	2	6	538022	538027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406202
13602	NC_018022	GTC	2	6	538089	538094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406202
13603	NC_018022	TCC	2	6	538216	538221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406202
13604	NC_018022	CTCA	2	8	538245	538252	25 %	25 %	0 %	50 %	392406202
13605	NC_018022	GGACT	2	10	538302	538311	20 %	20 %	40 %	20 %	392406202
13606	NC_018022	GATCG	2	10	538431	538440	20 %	20 %	40 %	20 %	392406202
13607	NC_018022	CG	4	8	538494	538501	0 %	0 %	50 %	50 %	392406202
13608	NC_018022	TCG	2	6	538591	538596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406202
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13614	NC_018022	TTGG	2	8	538876	538883	0 %	50 %	50 %	0 %	392406202
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13617	NC_018022	GATT	2	8	538980	538987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_018022	ACC	2	6	539001	539006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_018022	ATC	2	6	539018	539023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_018022	CG	3	6	539030	539035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13622	NC_018022	CCG	2	6	539083	539088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13623	NC_018022	ACT	2	6	539103	539108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_018022	GCC	2	6	539162	539167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13625	NC_018022	CTG	2	6	539181	539186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13764	NC_018022	CGAT	2	8	545594	545601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13866	NC_018022	TCG	2	6	549906	549911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13867	NC_018022	GACC	2	8	549942	549949	25 %	0 %	25 %	50 %	392406213
13868	NC_018022	TGC	3	9	549955	549963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13869	NC_018022	CTG	2	6	550059	550064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13870	NC_018022	GCA	2	6	550132	550137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13871	NC_018022	GAT	2	6	550193	550198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406213
13872	NC_018022	CGG	2	6	550206	550211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406213
13873	NC_018022	GTT	2	6	550238	550243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406213
13874	NC_018022	GCT	2	6	550313	550318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13875	NC_018022	GCC	2	6	550334	550339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406213
13876	NC_018022	GAC	2	6	550361	550366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13877	NC_018022	GCCC	2	8	550408	550415	0 %	0 %	25 %	75 %	392406213
13878	NC_018022	CGC	2	6	550423	550428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406213
13879	NC_018022	TTG	2	6	550458	550463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406213
13880	NC_018022	GGT	2	6	550484	550489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406213
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13882	NC_018022	GGGT	2	8	550539	550546	0 %	25 %	75 %	0 %	392406213
13883	NC_018022	CGA	3	9	550550	550558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13884	NC_018022	AGC	3	9	550568	550576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406213
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13886	NC_018022	CAG	2	6	550595	550600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406213
13887	NC_018022	CGA	2	6	550621	550626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406214
13888	NC_018022	GAG	2	6	550647	550652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406214
13889	NC_018022	CGATC	2	10	550663	550672	20 %	20 %	20 %	40 %	392406214
13890	NC_018022	GGC	2	6	550674	550679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406214
13891	NC_018022	GCC	2	6	550693	550698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406214
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13895	NC_018022	CGC	3	9	550951	550959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406214
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13897	NC_018022	CGC	2	6	551065	551070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406214
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13902	NC_018022	CGACC	2	10	551326	551335	20 %	0 %	20 %	60 %	392406214
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13905	NC_018022	CG	3	6	551383	551388	0 %	0 %	50 %	50 %	392406214
13906	NC_018022	CCG	2	6	551394	551399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406214
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13922	NC_018022	CAG	2	6	552087	552092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406214
13923	NC_018022	ACGATG	2	12	552269	552280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392406214
13924	NC_018022	CGC	2	6	552289	552294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406214
13925	NC_018022	CGA	2	6	552298	552303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406214
13926	NC_018022	CGA	2	6	552373	552378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406214
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13930	NC_018022	GCCT	2	8	552473	552480	0 %	25 %	25 %	50 %	392406214
13931	NC_018022	CACC	2	8	552508	552515	25 %	0 %	0 %	75 %	392406214
13932	NC_018022	TGC	2	6	552522	552527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406214
13933	NC_018022	AGC	2	6	552582	552587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406214
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13935	NC_018022	TGAC	2	8	552788	552795	25 %	25 %	25 %	25 %	392406214
13936	NC_018022	AGC	2	6	552828	552833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406215
13937	NC_018022	AAGTC	2	10	552836	552845	40 %	20 %	20 %	20 %	392406215
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13940	NC_018022	GCCC	2	8	553003	553010	0 %	0 %	25 %	75 %	392406215
13941	NC_018022	ACC	2	6	553015	553020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406215
13942	NC_018022	AAC	2	6	553025	553030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406215
13943	NC_018022	CCG	2	6	553031	553036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406215
13944	NC_018022	ACA	2	6	553043	553048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406215
13945	NC_018022	TCA	3	9	553052	553060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406215
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13947	NC_018022	ACG	2	6	553161	553166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406215
13948	NC_018022	CATC	2	8	553185	553192	25 %	25 %	0 %	50 %	392406215
13949	NC_018022	ATCG	2	8	553209	553216	25 %	25 %	25 %	25 %	392406215
13950	NC_018022	CAA	2	6	553217	553222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406215
13951	NC_018022	CGT	2	6	553223	553228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406215
13952	NC_018022	ACG	2	6	553289	553294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13953	NC_018022	GTCGAA	2	12	553366	553377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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13955	NC_018022	CGC	2	6	553428	553433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13956	NC_018022	CTC	2	6	553483	553488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13957	NC_018022	CGG	2	6	553584	553589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13958	NC_018022	TGG	2	6	553617	553622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13959	NC_018022	GCT	2	6	553679	553684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406216
13960	NC_018022	CGACCT	2	12	553685	553696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406216
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13965	NC_018022	CGA	2	6	553853	553858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406216
13966	NC_018022	AGT	2	6	553895	553900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406216
13967	NC_018022	CGG	2	6	553974	553979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406216
13968	NC_018022	CGATC	2	10	554009	554018	20 %	20 %	20 %	40 %	392406216
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13970	NC_018022	ACCCG	2	10	554113	554122	20 %	0 %	20 %	60 %	392406216
13971	NC_018022	CCA	2	6	554159	554164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406216
13972	NC_018022	CGCC	2	8	554262	554269	0 %	0 %	25 %	75 %	392406216
13973	NC_018022	TGC	2	6	554335	554340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406216
13974	NC_018022	CAA	2	6	554382	554387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406216
13975	NC_018022	CA	3	6	554411	554416	50 %	0 %	0 %	50 %	392406216
13976	NC_018022	TCA	2	6	554423	554428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406216
13977	NC_018022	CGT	2	6	554526	554531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406216
13978	NC_018022	CGG	2	6	554547	554552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406216
13979	NC_018022	TCA	2	6	554689	554694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406216
13980	NC_018022	CGAC	2	8	554696	554703	25 %	0 %	25 %	50 %	392406216
13981	NC_018022	CGG	2	6	554727	554732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406216
13982	NC_018022	CGC	2	6	554748	554753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406216
13983	NC_018022	GC	3	6	554766	554771	0 %	0 %	50 %	50 %	392406216
13984	NC_018022	CCG	2	6	554826	554831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406216
13985	NC_018022	TCC	2	6	554845	554850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406216
13986	NC_018022	TCC	2	6	554867	554872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13987	NC_018022	GCC	2	6	554947	554952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13988	NC_018022	CCA	2	6	554992	554997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13989	NC_018022	GCC	2	6	555061	555066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13990	NC_018022	CGA	2	6	555214	555219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13991	NC_018022	CTC	2	6	555223	555228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13992	NC_018022	CTGC	2	8	555425	555432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13993	NC_018022	GCC	2	6	555433	555438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13994	NC_018022	TCGC	2	8	555505	555512	0 %	25 %	25 %	50 %	392406217
13995	NC_018022	CAC	2	6	555524	555529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406217
13996	NC_018022	GTC	2	6	555550	555555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406217
13997	NC_018022	CGC	2	6	555560	555565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406217
13998	NC_018022	CAA	2	6	555580	555585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406217
13999	NC_018022	CGCGA	2	10	555610	555619	20 %	0 %	40 %	40 %	392406217
14000	NC_018022	GCG	2	6	555656	555661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406217

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