MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 109632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017528	GGC	2	6	166377	166382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003217
4002	NC_017528	TGC	2	6	166394	166399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003217
4003	NC_017528	ACG	2	6	166409	166414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003217
4004	NC_017528	CCG	2	6	166424	166429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003217
4005	NC_017528	TG	4	8	166436	166443	0 %	50 %	50 %	0 %	386003217
4006	NC_017528	CGG	3	9	166455	166463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003217
4007	NC_017528	GGTG	2	8	166554	166561	0 %	25 %	75 %	0 %	386003217
4008	NC_017528	CGA	2	6	166563	166568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003217
4009	NC_017528	TGC	2	6	166569	166574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003217
4010	NC_017528	GGC	2	6	166590	166595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003217
4011	NC_017528	ATG	2	6	166639	166644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003217
4012	NC_017528	AAG	2	6	166652	166657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003217
4013	NC_017528	CGC	2	6	166668	166673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003217
4014	NC_017528	CGC	2	6	166691	166696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003217
4015	NC_017528	CGGTGC	2	12	166712	166723	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386003217
4016	NC_017528	ATG	2	6	166804	166809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003217
4017	NC_017528	GTTGG	2	10	166851	166860	0 %	40 %	60 %	0 %	386003217
4018	NC_017528	GGA	2	6	166875	166880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003217
4019	NC_017528	GCC	2	6	166894	166899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003217
4020	NC_017528	GCG	2	6	166909	166914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003217
4021	NC_017528	GGT	2	6	167103	167108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003218
4022	NC_017528	AT	3	6	167163	167168	50 %	50 %	0 %	0 %	386003218
4023	NC_017528	TCG	2	6	167279	167284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003218
4024	NC_017528	ACG	2	6	167285	167290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003218
4025	NC_017528	CGG	2	6	167318	167323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003218
4026	NC_017528	GCG	2	6	167326	167331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003218
4027	NC_017528	ATC	2	6	167456	167461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003219
4028	NC_017528	TCT	2	6	167634	167639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003219
4029	NC_017528	AGC	2	6	167690	167695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003219
4030	NC_017528	TCG	2	6	167705	167710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003219
4031	NC_017528	GTC	2	6	167767	167772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003219
4032	NC_017528	TCA	2	6	167781	167786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003219
4033	NC_017528	GTC	2	6	167832	167837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003220
4034	NC_017528	GGT	2	6	167843	167848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003220
4035	NC_017528	CGGC	2	8	167863	167870	0 %	0 %	50 %	50 %	386003220
4036	NC_017528	CAG	2	6	167904	167909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003220
4037	NC_017528	TGC	2	6	167959	167964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003220
4038	NC_017528	CG	3	6	167981	167986	0 %	0 %	50 %	50 %	386003220
4039	NC_017528	CGC	2	6	168008	168013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003220
4040	NC_017528	GCGTG	2	10	168019	168028	0 %	20 %	60 %	20 %	386003220
4041	NC_017528	GAG	2	6	168042	168047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003220
4042	NC_017528	GCC	2	6	168078	168083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003220
4043	NC_017528	GCC	2	6	168123	168128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003220
4044	NC_017528	CCG	2	6	168134	168139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003220
4045	NC_017528	CGG	2	6	168193	168198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003220
4046	NC_017528	AGC	2	6	168205	168210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003220
4047	NC_017528	GGC	2	6	168243	168248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003220
4048	NC_017528	GCC	2	6	168307	168312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003221
4049	NC_017528	CG	3	6	168383	168388	0 %	0 %	50 %	50 %	386003221
4050	NC_017528	GTG	2	6	168389	168394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003221
4051	NC_017528	GC	3	6	168399	168404	0 %	0 %	50 %	50 %	386003221
4052	NC_017528	GCGG	2	8	168406	168413	0 %	0 %	75 %	25 %	386003221
4053	NC_017528	GCG	2	6	168452	168457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003221
4054	NC_017528	CA	3	6	168508	168513	50 %	0 %	0 %	50 %	386003221
4055	NC_017528	GACGCC	2	12	168527	168538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386003221
4056	NC_017528	GTCG	2	8	168541	168548	0 %	25 %	50 %	25 %	386003221
4057	NC_017528	GAT	2	6	168568	168573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003221
4058	NC_017528	GCCG	2	8	168591	168598	0 %	0 %	50 %	50 %	386003221
4059	NC_017528	CGA	2	6	168601	168606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003221
4060	NC_017528	GCT	2	6	168622	168627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003221
4061	NC_017528	GGT	2	6	168655	168660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003221
4062	NC_017528	GCCGC	2	10	168694	168703	0 %	0 %	40 %	60 %	386003221
4063	NC_017528	CGG	2	6	168850	168855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003222
4064	NC_017528	ACA	3	9	168904	168912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003222
4065	NC_017528	GAT	2	6	168932	168937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003222
4066	NC_017528	CAC	2	6	168947	168952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003222
4067	NC_017528	GCG	2	6	168997	169002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003222
4068	NC_017528	CG	3	6	169001	169006	0 %	0 %	50 %	50 %	386003222
4069	NC_017528	CAT	2	6	169028	169033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003222
4070	NC_017528	ACG	2	6	169041	169046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4071	NC_017528	GCC	2	6	169096	169101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4072	NC_017528	CGC	2	6	169106	169111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4073	NC_017528	CGA	2	6	169114	169119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4074	NC_017528	CCG	2	6	169161	169166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4075	NC_017528	GACGAT	2	12	169211	169222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386003222
4076	NC_017528	CAG	2	6	169238	169243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4077	NC_017528	CGG	2	6	169255	169260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003222
4078	NC_017528	GCT	2	6	169283	169288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4079	NC_017528	CAG	2	6	169325	169330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4080	NC_017528	CCG	2	6	169332	169337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4081	NC_017528	CGG	2	6	169423	169428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003222
4082	NC_017528	CAC	2	6	169445	169450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003222
4083	NC_017528	AGT	2	6	169458	169463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003222
4084	NC_017528	AAG	2	6	169524	169529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003222
4085	NC_017528	GCA	2	6	169573	169578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4086	NC_017528	GTC	2	6	169595	169600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4087	NC_017528	CGC	2	6	169625	169630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4088	NC_017528	CGGC	2	8	169718	169725	0 %	0 %	50 %	50 %	386003222
4089	NC_017528	CAG	2	6	169730	169735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4090	NC_017528	GCCG	2	8	169745	169752	0 %	0 %	50 %	50 %	386003222
4091	NC_017528	GCC	2	6	169778	169783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4092	NC_017528	CCA	2	6	169816	169821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003222
4093	NC_017528	GC	3	6	169851	169856	0 %	0 %	50 %	50 %	386003222
4094	NC_017528	TCG	2	6	169884	169889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4095	NC_017528	CCGCC	2	10	169945	169954	0 %	0 %	20 %	80 %	386003222
4096	NC_017528	CGT	2	6	169955	169960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4097	NC_017528	CG	3	6	169983	169988	0 %	0 %	50 %	50 %	386003222
4098	NC_017528	GCC	2	6	170009	170014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4099	NC_017528	AGA	2	6	170092	170097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003222
4100	NC_017528	CCG	2	6	170193	170198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003222
4101	NC_017528	AGC	2	6	170246	170251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003222
4102	NC_017528	CGA	2	6	170310	170315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017528	CAG	2	6	170317	170322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017528	CCG	2	6	170358	170363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_017528	GCG	2	6	170368	170373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017528	CGC	3	9	170423	170431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003223
4107	NC_017528	TCG	2	6	170432	170437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003223
4108	NC_017528	GGTA	2	8	170553	170560	25 %	25 %	50 %	0 %	386003223
4109	NC_017528	GTG	2	6	170571	170576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003223
4110	NC_017528	CGG	2	6	170633	170638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003223
4111	NC_017528	CGC	2	6	170673	170678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003223
4112	NC_017528	ACT	2	6	170768	170773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003223
4113	NC_017528	CAA	2	6	170778	170783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003223
4114	NC_017528	GGT	2	6	170802	170807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003223
4115	NC_017528	CGC	2	6	170854	170859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003223
4116	NC_017528	GGC	2	6	170876	170881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003223
4117	NC_017528	GTC	2	6	170887	170892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003223
4118	NC_017528	CCA	2	6	170948	170953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003223
4119	NC_017528	ATG	2	6	171044	171049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003223
4120	NC_017528	GCC	2	6	171070	171075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003223
4121	NC_017528	TG	3	6	171119	171124	0 %	50 %	50 %	0 %	386003223
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4125	NC_017528	CA	3	6	171271	171276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4367	NC_017528	GCG	2	6	181370	181375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4491	NC_017528	CGC	2	6	185781	185786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003238
4492	NC_017528	TGG	2	6	185804	185809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003238
4493	NC_017528	GGT	2	6	185838	185843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003238
4494	NC_017528	CGG	3	9	185882	185890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003238
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