MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_017527	AG	3	6	1854413	1854418	50 %	0 %	50 %	0 %	386002402
49002	NC_017527	TTTA	2	8	1854426	1854433	25 %	75 %	0 %	0 %	386002402
49003	NC_017527	TCG	2	6	1854472	1854477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002402
49004	NC_017527	AG	3	6	1854515	1854520	50 %	0 %	50 %	0 %	386002402
49005	NC_017527	TCA	2	6	1854595	1854600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002402
49006	NC_017527	AG	3	6	1854617	1854622	50 %	0 %	50 %	0 %	386002402
49007	NC_017527	AG	3	6	1854719	1854724	50 %	0 %	50 %	0 %	386002402
49008	NC_017527	TGT	2	6	1854734	1854739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002402
49009	NC_017527	TGT	2	6	1854836	1854841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002402
49010	NC_017527	CA	3	6	1854850	1854855	50 %	0 %	0 %	50 %	386002402
49011	NC_017527	TCG	2	6	1854901	1854906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002402
49012	NC_017527	AG	3	6	1854923	1854928	50 %	0 %	50 %	0 %	386002402
49013	NC_017527	TCA	2	6	1854949	1854954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002402
49014	NC_017527	GTT	2	6	1855002	1855007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002402
49015	NC_017527	ATC	2	6	1855056	1855061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002402
49016	NC_017527	GCA	2	6	1855066	1855071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002402
49017	NC_017527	GCC	2	6	1855081	1855086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002402
49018	NC_017527	CGAC	2	8	1855103	1855110	25 %	0 %	25 %	50 %	386002402
49019	NC_017527	ATCC	2	8	1855117	1855124	25 %	25 %	0 %	50 %	386002402
49020	NC_017527	TCC	2	6	1855138	1855143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49021	NC_017527	TGA	2	6	1855223	1855228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49022	NC_017527	AGATGG	2	12	1855366	1855377	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49023	NC_017527	GAC	2	6	1855395	1855400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49024	NC_017527	TGA	2	6	1855401	1855406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002403
49025	NC_017527	C	7	7	1855475	1855481	0 %	0 %	0 %	100 %	386002403
49026	NC_017527	CAC	2	6	1855492	1855497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002403
49027	NC_017527	GGT	2	6	1855554	1855559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002403
49028	NC_017527	GA	3	6	1855576	1855581	50 %	0 %	50 %	0 %	386002403
49029	NC_017527	TCC	2	6	1855602	1855607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002403
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49031	NC_017527	CGT	2	6	1855687	1855692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002403
49032	NC_017527	GGA	2	6	1855720	1855725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
49033	NC_017527	GGGC	2	8	1855779	1855786	0 %	0 %	75 %	25 %	386002403
49034	NC_017527	GAG	2	6	1855814	1855819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
49035	NC_017527	CGT	2	6	1855834	1855839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002403
49036	NC_017527	TCGA	2	8	1855884	1855891	25 %	25 %	25 %	25 %	386002403
49037	NC_017527	CGC	2	6	1855921	1855926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002403
49038	NC_017527	CCT	2	6	1856010	1856015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002403
49039	NC_017527	GCCG	2	8	1856022	1856029	0 %	0 %	50 %	50 %	386002403
49040	NC_017527	TAC	2	6	1856069	1856074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002403
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49043	NC_017527	CGA	2	6	1856221	1856226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002403
49044	NC_017527	GGC	3	9	1856241	1856249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002403
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49046	NC_017527	A	6	6	1856269	1856274	100 %	0 %	0 %	0 %	386002403
49047	NC_017527	GCC	2	6	1856297	1856302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002403
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49051	NC_017527	AG	3	6	1856473	1856478	50 %	0 %	50 %	0 %	386002403
49052	NC_017527	CCTC	2	8	1856484	1856491	0 %	25 %	0 %	75 %	386002403
49053	NC_017527	GAG	2	6	1856549	1856554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
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49055	NC_017527	ACC	2	6	1856622	1856627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002403
49056	NC_017527	GGA	2	6	1856641	1856646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
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49058	NC_017527	GAG	2	6	1856674	1856679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
49059	NC_017527	GGA	2	6	1856724	1856729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002403
49060	NC_017527	TGC	2	6	1856766	1856771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002403
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49062	NC_017527	AG	3	6	1856840	1856845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49063	NC_017527	AG	3	6	1856894	1856899	50 %	0 %	50 %	0 %	386002404
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49077	NC_017527	GACGG	2	10	1857363	1857372	20 %	0 %	60 %	20 %	386002404
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49084	NC_017527	GAAG	2	8	1857602	1857609	50 %	0 %	50 %	0 %	386002404
49085	NC_017527	GGA	2	6	1857614	1857619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002404
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49088	NC_017527	CTG	2	6	1857864	1857869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002405
49089	NC_017527	GAA	2	6	1857891	1857896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002405
49090	NC_017527	T	6	6	1857921	1857926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49092	NC_017527	G	7	7	1858056	1858062	0 %	0 %	100 %	0 %	386002406
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49100	NC_017527	GAG	2	6	1858231	1858236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002406
49101	NC_017527	G	6	6	1858270	1858275	0 %	0 %	100 %	0 %	386002406
49102	NC_017527	AGGGG	2	10	1858302	1858311	20 %	0 %	80 %	0 %	386002406
49103	NC_017527	C	6	6	1858358	1858363	0 %	0 %	0 %	100 %	386002406
49104	NC_017527	G	6	6	1858383	1858388	0 %	0 %	100 %	0 %	386002406
49105	NC_017527	CCT	2	6	1858395	1858400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002406
49106	NC_017527	GTC	2	6	1858441	1858446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002406
49107	NC_017527	CGG	2	6	1858461	1858466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002406
49108	NC_017527	CCG	2	6	1858471	1858476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002406
49109	NC_017527	CCT	2	6	1858521	1858526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002406
49110	NC_017527	GATAT	2	10	1858540	1858549	40 %	40 %	20 %	0 %	386002406
49111	NC_017527	TCG	2	6	1858577	1858582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002406
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49113	NC_017527	G	6	6	1858670	1858675	0 %	0 %	100 %	0 %	386002406
49114	NC_017527	CTG	2	6	1858683	1858688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002406
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49217	NC_017527	GAT	2	6	1862461	1862466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002411
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49222	NC_017527	GAG	2	6	1862722	1862727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002411
49223	NC_017527	GGGAG	2	10	1862804	1862813	20 %	0 %	80 %	0 %	386002411
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49228	NC_017527	TCCC	2	8	1862973	1862980	0 %	25 %	0 %	75 %	386002412
49229	NC_017527	TCC	2	6	1862989	1862994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002412
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49231	NC_017527	TCC	2	6	1863079	1863084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002412
49232	NC_017527	CCT	2	6	1863111	1863116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002412
49233	NC_017527	GTC	2	6	1863169	1863174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002412
49234	NC_017527	TGGAGG	2	12	1863295	1863306	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386002412
49235	NC_017527	GCT	2	6	1863330	1863335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002412
49236	NC_017527	GAG	2	6	1863346	1863351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002412
49237	NC_017527	TGA	2	6	1863443	1863448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002412
49238	NC_017527	CCT	5	15	1863485	1863499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002412
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49240	NC_017527	GTT	2	6	1863543	1863548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002412
49241	NC_017527	CCA	2	6	1863551	1863556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002412
49242	NC_017527	CCT	2	6	1863561	1863566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002412
49243	NC_017527	GGA	3	9	1863572	1863580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002412
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49246	NC_017527	GCG	2	6	1863656	1863661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002412
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49248	NC_017527	GCTCC	2	10	1863713	1863722	0 %	20 %	20 %	60 %	386002412
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49250	NC_017527	AGG	3	9	1863757	1863765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002412
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49252	NC_017527	GGC	2	6	1863783	1863788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002412
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49257	NC_017527	GAG	3	9	1863936	1863944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002412
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49265	NC_017527	TGA	2	6	1864163	1864168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002412
49266	NC_017527	GGCGAG	2	12	1864170	1864181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386002412
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49269	NC_017527	GGGCGG	2	12	1864211	1864222	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	386002412
49270	NC_017527	CCCT	2	8	1864228	1864235	0 %	25 %	0 %	75 %	386002412
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49295	NC_017527	GATGG	2	10	1864836	1864845	20 %	20 %	60 %	0 %	386002412
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49299	NC_017527	GGA	3	9	1864994	1865002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002412
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49305	NC_017527	TAT	2	6	1865140	1865145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49308	NC_017527	TAT	2	6	1865191	1865196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49310	NC_017527	CGC	2	6	1865232	1865237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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49313	NC_017527	CAC	2	6	1865324	1865329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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49347	NC_017527	GCC	2	6	1866577	1866582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49348	NC_017527	TCG	2	6	1866596	1866601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49349	NC_017527	GGCCC	2	10	1866621	1866630	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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49351	NC_017527	GTTC	2	8	1866693	1866700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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49467	NC_017527	ATGTCG	2	12	1871294	1871305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386002423
49468	NC_017527	GC	3	6	1871334	1871339	0 %	0 %	50 %	50 %	386002423
49469	NC_017527	C	7	7	1871371	1871377	0 %	0 %	0 %	100 %	386002423
49470	NC_017527	CCTC	2	8	1871382	1871389	0 %	25 %	0 %	75 %	386002423
49471	NC_017527	GA	3	6	1871411	1871416	50 %	0 %	50 %	0 %	386002423
49472	NC_017527	CTC	2	6	1871422	1871427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002423
49473	NC_017527	CCT	2	6	1871469	1871474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002423
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49475	NC_017527	CTC	2	6	1871504	1871509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002423
49476	NC_017527	GTA	2	6	1871512	1871517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002423
49477	NC_017527	AGA	2	6	1871529	1871534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002423
49478	NC_017527	TCG	2	6	1871612	1871617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002423
49479	NC_017527	TGG	2	6	1871627	1871632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002423
49480	NC_017527	AGC	2	6	1871676	1871681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002423
49481	NC_017527	GCCTC	2	10	1871697	1871706	0 %	20 %	20 %	60 %	386002423
49482	NC_017527	CCCTCC	2	12	1871756	1871767	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386002423
49483	NC_017527	GGT	2	6	1871791	1871796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002423
49484	NC_017527	CCG	2	6	1871912	1871917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49485	NC_017527	GGT	2	6	1871962	1871967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002424
49486	NC_017527	GGA	2	6	1872039	1872044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002424
49487	NC_017527	ATC	2	6	1872056	1872061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002424
49488	NC_017527	CCTC	2	8	1872069	1872076	0 %	25 %	0 %	75 %	386002424
49489	NC_017527	AG	3	6	1872127	1872132	50 %	0 %	50 %	0 %	386002424
49490	NC_017527	GCA	2	6	1872201	1872206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002424
49491	NC_017527	GCG	2	6	1872216	1872221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002424
49492	NC_017527	TCC	2	6	1872222	1872227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002424
49493	NC_017527	G	7	7	1872255	1872261	0 %	0 %	100 %	0 %	386002424
49494	NC_017527	CCGGT	2	10	1872290	1872299	0 %	20 %	40 %	40 %	386002424
49495	NC_017527	CGA	3	9	1872324	1872332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002424
49496	NC_017527	CGATC	2	10	1872334	1872343	20 %	20 %	20 %	40 %	386002424
49497	NC_017527	TCA	2	6	1872351	1872356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002424
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49499	NC_017527	GAT	2	6	1872382	1872387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002424
49500	NC_017527	AGG	2	6	1872423	1872428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002424

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