MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_017527	AAC	2	6	1831154	1831159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48502	NC_017527	G	6	6	1831161	1831166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48503	NC_017527	GGC	2	6	1831291	1831296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48504	NC_017527	CGC	2	6	1831514	1831519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48505	NC_017527	TCC	2	6	1831597	1831602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48506	NC_017527	ATT	2	6	1831739	1831744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48507	NC_017527	CTC	2	6	1831748	1831753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48508	NC_017527	TC	4	8	1831756	1831763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48509	NC_017527	ATCT	2	8	1831827	1831834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48510	NC_017527	GAT	2	6	1831906	1831911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48511	NC_017527	GCCG	2	8	1831970	1831977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48512	NC_017527	GAT	2	6	1831981	1831986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48513	NC_017527	GAGG	2	8	1832053	1832060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48514	NC_017527	GGGA	2	8	1832067	1832074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48515	NC_017527	AAT	2	6	1832118	1832123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48516	NC_017527	CTT	2	6	1832132	1832137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48517	NC_017527	ATC	2	6	1832261	1832266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48518	NC_017527	CTATC	2	10	1832290	1832299	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48519	NC_017527	TCA	2	6	1832332	1832337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48520	NC_017527	CCT	2	6	1832348	1832353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48521	NC_017527	TTC	2	6	1832362	1832367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48522	NC_017527	AGG	2	6	1832496	1832501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48523	NC_017527	TAG	2	6	1832632	1832637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48524	NC_017527	GC	3	6	1832650	1832655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48525	NC_017527	TGG	2	6	1832666	1832671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48526	NC_017527	TTC	2	6	1832743	1832748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48527	NC_017527	GGC	2	6	1832863	1832868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48528	NC_017527	AAG	2	6	1832950	1832955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48529	NC_017527	GA	3	6	1832965	1832970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48530	NC_017527	CAA	2	6	1833094	1833099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48531	NC_017527	ATC	2	6	1833104	1833109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48532	NC_017527	ATCC	2	8	1833240	1833247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48533	NC_017527	A	6	6	1833344	1833349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48534	NC_017527	T	6	6	1833374	1833379	0 %	100 %	0 %	0 %	386002387
48535	NC_017527	GCT	2	6	1833385	1833390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002387
48536	NC_017527	CGG	2	6	1833409	1833414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002387
48537	NC_017527	TTCT	2	8	1833416	1833423	0 %	75 %	0 %	25 %	386002387
48538	NC_017527	TA	3	6	1833503	1833508	50 %	50 %	0 %	0 %	386002387
48539	NC_017527	GATC	2	8	1833517	1833524	25 %	25 %	25 %	25 %	386002387
48540	NC_017527	AGA	2	6	1833535	1833540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002387
48541	NC_017527	CCAG	2	8	1833625	1833632	25 %	0 %	25 %	50 %	386002387
48542	NC_017527	TGA	2	6	1833652	1833657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002387
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48544	NC_017527	C	6	6	1833768	1833773	0 %	0 %	0 %	100 %	386002387
48545	NC_017527	CTT	2	6	1833801	1833806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48546	NC_017527	CTGC	2	8	1833807	1833814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48547	NC_017527	CCA	3	9	1833997	1834005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002388
48548	NC_017527	CGC	3	9	1834037	1834045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002388
48549	NC_017527	GGA	2	6	1834057	1834062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002388
48550	NC_017527	CGA	4	12	1834105	1834116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002388
48551	NC_017527	CGG	2	6	1834156	1834161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002388
48552	NC_017527	TTG	2	6	1834246	1834251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002389
48553	NC_017527	CAG	2	6	1834269	1834274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002389
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48555	NC_017527	ATT	2	6	1834369	1834374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386002389
48556	NC_017527	CTT	2	6	1834446	1834451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002389
48557	NC_017527	GTT	2	6	1834474	1834479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002389
48558	NC_017527	AGT	3	9	1834644	1834652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002389
48559	NC_017527	AG	3	6	1834676	1834681	50 %	0 %	50 %	0 %	386002389
48560	NC_017527	TG	3	6	1834774	1834779	0 %	50 %	50 %	0 %	386002389
48561	NC_017527	TAG	2	6	1834829	1834834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002389
48562	NC_017527	CT	3	6	1834864	1834869	0 %	50 %	0 %	50 %	386002389
48563	NC_017527	TAA	2	6	1834881	1834886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002389
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48565	NC_017527	CTT	2	6	1835091	1835096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002389
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48567	NC_017527	TCT	2	6	1835257	1835262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002390
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48571	NC_017527	CT	3	6	1835426	1835431	0 %	50 %	0 %	50 %	386002390
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48574	NC_017527	TC	3	6	1835589	1835594	0 %	50 %	0 %	50 %	386002390
48575	NC_017527	TCT	2	6	1835606	1835611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002390
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48577	NC_017527	AACGG	2	10	1835658	1835667	40 %	0 %	40 %	20 %	386002390
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48581	NC_017527	TCC	2	6	1835856	1835861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002390
48582	NC_017527	GAC	2	6	1835882	1835887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002390
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48586	NC_017527	CTT	2	6	1836089	1836094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002390
48587	NC_017527	CTT	2	6	1836282	1836287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002391
48588	NC_017527	GCT	2	6	1836342	1836347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002391
48589	NC_017527	CGC	2	6	1836357	1836362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002391
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48591	NC_017527	CT	3	6	1836440	1836445	0 %	50 %	0 %	50 %	386002391
48592	NC_017527	CAGC	2	8	1836485	1836492	25 %	0 %	25 %	50 %	386002391
48593	NC_017527	CTT	2	6	1836576	1836581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002391
48594	NC_017527	GCG	2	6	1836616	1836621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48595	NC_017527	CAT	2	6	1836648	1836653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48597	NC_017527	CCA	2	6	1836734	1836739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002392
48598	NC_017527	GATC	2	8	1836752	1836759	25 %	25 %	25 %	25 %	386002392
48599	NC_017527	TAGC	2	8	1836889	1836896	25 %	25 %	25 %	25 %	386002392
48600	NC_017527	GTC	3	9	1836909	1836917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002392
48601	NC_017527	AGCC	2	8	1836939	1836946	25 %	0 %	25 %	50 %	386002392
48602	NC_017527	CTG	2	6	1836950	1836955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002392
48603	NC_017527	CT	5	10	1837026	1837035	0 %	50 %	0 %	50 %	386002392
48604	NC_017527	T	6	6	1837113	1837118	0 %	100 %	0 %	0 %	386002392
48605	NC_017527	AGA	2	6	1837216	1837221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002392
48606	NC_017527	CCT	2	6	1837283	1837288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002392
48607	NC_017527	CGGC	2	8	1837444	1837451	0 %	0 %	50 %	50 %	386002392
48608	NC_017527	CTC	2	6	1837495	1837500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002392
48609	NC_017527	TCA	2	6	1837522	1837527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002393
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48611	NC_017527	CT	3	6	1837680	1837685	0 %	50 %	0 %	50 %	386002393
48612	NC_017527	CCCA	2	8	1837697	1837704	25 %	0 %	0 %	75 %	386002393
48613	NC_017527	AGA	2	6	1837845	1837850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002393
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48616	NC_017527	CCCT	2	8	1837914	1837921	0 %	25 %	0 %	75 %	386002393
48617	NC_017527	AAG	2	6	1838028	1838033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002393
48618	NC_017527	CGA	2	6	1838075	1838080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002393
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48621	NC_017527	TCGGAT	2	12	1838302	1838313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386002393
48622	NC_017527	CCTT	2	8	1838362	1838369	0 %	50 %	0 %	50 %	386002393
48623	NC_017527	GCTTT	2	10	1838429	1838438	0 %	60 %	20 %	20 %	386002393
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