MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_017527	TTCA	2	8	1811193	1811200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48002	NC_017527	T	6	6	1811202	1811207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48003	NC_017527	GGCGG	2	10	1811368	1811377	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48004	NC_017527	GGCC	2	8	1811387	1811394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48005	NC_017527	CGA	2	6	1811404	1811409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48006	NC_017527	TCC	2	6	1811414	1811419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48007	NC_017527	GAG	2	6	1811575	1811580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002363
48008	NC_017527	CGC	2	6	1811631	1811636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002363
48009	NC_017527	CCTGGC	2	12	1811643	1811654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386002363
48010	NC_017527	CTG	2	6	1811736	1811741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002363
48011	NC_017527	GGC	2	6	1811762	1811767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48012	NC_017527	GGCGG	2	10	1811772	1811781	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48013	NC_017527	AG	3	6	1811790	1811795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48014	NC_017527	CCG	2	6	1811807	1811812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48015	NC_017527	CT	3	6	1811861	1811866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48016	NC_017527	GCC	2	6	1811887	1811892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48017	NC_017527	GCGAC	2	10	1811914	1811923	20 %	0 %	40 %	40 %	386002364
48018	NC_017527	GCC	2	6	1812010	1812015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48019	NC_017527	AGG	2	6	1812028	1812033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48020	NC_017527	TCG	2	6	1812056	1812061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48021	NC_017527	CGG	2	6	1812100	1812105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48022	NC_017527	CCTG	2	8	1812120	1812127	0 %	25 %	25 %	50 %	386002364
48023	NC_017527	CGA	2	6	1812146	1812151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48024	NC_017527	CTT	2	6	1812177	1812182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002364
48025	NC_017527	GAA	2	6	1812216	1812221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002364
48026	NC_017527	CCT	2	6	1812329	1812334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
48027	NC_017527	G	6	6	1812391	1812396	0 %	0 %	100 %	0 %	386002364
48028	NC_017527	GGC	2	6	1812401	1812406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48029	NC_017527	CTA	2	6	1812435	1812440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002364
48030	NC_017527	GGC	2	6	1812453	1812458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48031	NC_017527	CTA	2	6	1812498	1812503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002364
48032	NC_017527	CTT	2	6	1812504	1812509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002364
48033	NC_017527	AGG	2	6	1812515	1812520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48034	NC_017527	G	6	6	1812539	1812544	0 %	0 %	100 %	0 %	386002364
48035	NC_017527	GGA	2	6	1812555	1812560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48036	NC_017527	GA	3	6	1812590	1812595	50 %	0 %	50 %	0 %	386002364
48037	NC_017527	CGGG	2	8	1812625	1812632	0 %	0 %	75 %	25 %	386002364
48038	NC_017527	CCG	2	6	1812683	1812688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48039	NC_017527	TCC	2	6	1812728	1812733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
48040	NC_017527	A	6	6	1812829	1812834	100 %	0 %	0 %	0 %	386002364
48041	NC_017527	CGG	2	6	1812847	1812852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48042	NC_017527	CCT	2	6	1813068	1813073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
48043	NC_017527	CGGGCA	2	12	1813106	1813117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386002364
48044	NC_017527	AAG	2	6	1813153	1813158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002364
48045	NC_017527	G	7	7	1813168	1813174	0 %	0 %	100 %	0 %	386002364
48046	NC_017527	G	6	6	1813176	1813181	0 %	0 %	100 %	0 %	386002364
48047	NC_017527	GCG	2	6	1813190	1813195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48048	NC_017527	TCG	2	6	1813217	1813222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48049	NC_017527	ACT	2	6	1813223	1813228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002364
48050	NC_017527	CGA	2	6	1813296	1813301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48051	NC_017527	GTC	2	6	1813309	1813314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48052	NC_017527	CGG	2	6	1813317	1813322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48053	NC_017527	CGG	2	6	1813330	1813335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48054	NC_017527	AAG	3	9	1813366	1813374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002364
48055	NC_017527	GAC	2	6	1813434	1813439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48056	NC_017527	G	6	6	1813445	1813450	0 %	0 %	100 %	0 %	386002364
48057	NC_017527	TAC	2	6	1813471	1813476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002364
48058	NC_017527	TCG	2	6	1813490	1813495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48059	NC_017527	GTC	2	6	1813525	1813530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48060	NC_017527	GAAG	2	8	1813531	1813538	50 %	0 %	50 %	0 %	386002364
48061	NC_017527	AGG	2	6	1813544	1813549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48062	NC_017527	CTC	2	6	1813552	1813557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
48063	NC_017527	GAG	2	6	1813558	1813563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48064	NC_017527	TCG	2	6	1813631	1813636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48065	NC_017527	CTC	2	6	1813663	1813668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
48066	NC_017527	GCG	2	6	1813672	1813677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48067	NC_017527	GGGT	2	8	1813696	1813703	0 %	25 %	75 %	0 %	386002364
48068	NC_017527	GGT	2	6	1813746	1813751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002364
48069	NC_017527	CCA	2	6	1813823	1813828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002364
48070	NC_017527	TCCT	2	8	1813849	1813856	0 %	50 %	0 %	50 %	386002364
48071	NC_017527	ACC	2	6	1813859	1813864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002364
48072	NC_017527	TCG	2	6	1813886	1813891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48073	NC_017527	TGA	2	6	1813910	1813915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002364
48074	NC_017527	GAC	2	6	1813950	1813955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48075	NC_017527	CCTCC	2	10	1813956	1813965	0 %	20 %	0 %	80 %	386002364
48076	NC_017527	CACC	2	8	1813986	1813993	25 %	0 %	0 %	75 %	386002364
48077	NC_017527	GGA	2	6	1814016	1814021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48078	NC_017527	GAC	2	6	1814029	1814034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48079	NC_017527	AAGGAG	2	12	1814050	1814061	50 %	0 %	50 %	0 %	386002364
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48081	NC_017527	CCG	2	6	1814129	1814134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48082	NC_017527	CGG	3	9	1814142	1814150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48083	NC_017527	CGAGG	2	10	1814154	1814163	20 %	0 %	60 %	20 %	386002364
48084	NC_017527	CGC	2	6	1814168	1814173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48085	NC_017527	CGA	2	6	1814229	1814234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48086	NC_017527	GGC	2	6	1814243	1814248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48087	NC_017527	GGT	2	6	1814264	1814269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002364
48088	NC_017527	GAG	2	6	1814298	1814303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48089	NC_017527	CTT	2	6	1814304	1814309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002364
48090	NC_017527	TCT	2	6	1814336	1814341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002364
48091	NC_017527	GCGG	2	8	1814344	1814351	0 %	0 %	75 %	25 %	386002364
48092	NC_017527	GGT	2	6	1814382	1814387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002364
48093	NC_017527	CCG	2	6	1814395	1814400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48094	NC_017527	AGG	2	6	1814411	1814416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48095	NC_017527	CCT	2	6	1814511	1814516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002364
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48099	NC_017527	CGA	2	6	1814657	1814662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48100	NC_017527	GCG	2	6	1814687	1814692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002364
48101	NC_017527	GAG	2	6	1814764	1814769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002364
48102	NC_017527	GAC	2	6	1814800	1814805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48103	NC_017527	GGT	2	6	1814810	1814815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002364
48104	NC_017527	CGA	2	6	1814823	1814828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48105	NC_017527	CCG	2	6	1814856	1814861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002364
48106	NC_017527	CGCC	2	8	1814958	1814965	0 %	0 %	25 %	75 %	386002364
48107	NC_017527	TCG	2	6	1815097	1815102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002364
48108	NC_017527	A	6	6	1815185	1815190	100 %	0 %	0 %	0 %	386002364
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48110	NC_017527	ATT	2	6	1815233	1815238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386002364
48111	NC_017527	ACA	2	6	1815326	1815331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386002364
48112	NC_017527	ATT	2	6	1815340	1815345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386002364
48113	NC_017527	TCT	2	6	1815363	1815368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002364
48114	NC_017527	TCA	2	6	1815382	1815387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002364
48115	NC_017527	TTCA	2	8	1815400	1815407	25 %	50 %	0 %	25 %	386002364
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48236	NC_017527	AT	3	6	1819992	1819997	50 %	50 %	0 %	0 %	386002370
48237	NC_017527	CCT	2	6	1820047	1820052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002370
48238	NC_017527	TCG	2	6	1820087	1820092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002370
48239	NC_017527	TCG	2	6	1820094	1820099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002370
48240	NC_017527	GGT	2	6	1820137	1820142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002370
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48244	NC_017527	GCT	2	6	1820219	1820224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002370
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48249	NC_017527	CCT	2	6	1820495	1820500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48255	NC_017527	TCC	2	6	1820748	1820753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002371
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48259	NC_017527	TATT	2	8	1821046	1821053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48260	NC_017527	ATT	2	6	1821056	1821061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48263	NC_017527	TA	3	6	1821214	1821219	50 %	50 %	0 %	0 %	386002373
48264	NC_017527	CAGC	2	8	1821257	1821264	25 %	0 %	25 %	50 %	386002373
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48270	NC_017527	CCTC	2	8	1821451	1821458	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48271	NC_017527	T	6	6	1821459	1821464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48272	NC_017527	CCG	2	6	1821468	1821473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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48275	NC_017527	GCC	2	6	1821543	1821548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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48284	NC_017527	TCG	2	6	1821964	1821969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002375
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48307	NC_017527	CGG	2	6	1822665	1822670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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48310	NC_017527	TC	3	6	1822804	1822809	0 %	50 %	0 %	50 %	386002377
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48322	NC_017527	AGCC	2	8	1823255	1823262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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48341	NC_017527	TCC	2	6	1824133	1824138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002380
48342	NC_017527	TCT	2	6	1824166	1824171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002380
48343	NC_017527	TGC	2	6	1824196	1824201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002380
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48345	NC_017527	ATATA	2	10	1824218	1824227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48346	NC_017527	TAA	2	6	1824230	1824235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48347	NC_017527	ATA	2	6	1824238	1824243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48348	NC_017527	TAT	2	6	1824253	1824258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48349	NC_017527	TCG	2	6	1824275	1824280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48350	NC_017527	TC	3	6	1824350	1824355	0 %	50 %	0 %	50 %	386002381
48351	NC_017527	GAT	2	6	1824404	1824409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002381
48352	NC_017527	CGG	2	6	1824433	1824438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002381
48353	NC_017527	CCT	2	6	1824514	1824519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002381
48354	NC_017527	CCTC	2	8	1824562	1824569	0 %	25 %	0 %	75 %	386002381
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48475	NC_017527	ACT	2	6	1829831	1829836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002386
48476	NC_017527	GAT	2	6	1829877	1829882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002386
48477	NC_017527	AGC	2	6	1829883	1829888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002386
48478	NC_017527	TGA	2	6	1829924	1829929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002386
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48480	NC_017527	ATC	2	6	1830016	1830021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002386
48481	NC_017527	ATG	2	6	1830024	1830029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002386
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48487	NC_017527	CGGC	2	8	1830354	1830361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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48494	NC_017527	A	6	6	1830709	1830714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48495	NC_017527	AGAA	2	8	1830721	1830728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48496	NC_017527	CTA	2	6	1830780	1830785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48499	NC_017527	TATC	2	8	1830948	1830955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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