MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017527	CGA	2	6	129596	129601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000835
3502	NC_017527	TCG	2	6	129625	129630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000835
3503	NC_017527	AGGG	2	8	129631	129638	25 %	0 %	75 %	0 %	386000835
3504	NC_017527	GATCC	2	10	129660	129669	20 %	20 %	20 %	40 %	386000835
3505	NC_017527	TC	3	6	129674	129679	0 %	50 %	0 %	50 %	386000835
3506	NC_017527	CTT	2	6	129700	129705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000835
3507	NC_017527	GCC	2	6	129738	129743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000835
3508	NC_017527	TCGA	2	8	129828	129835	25 %	25 %	25 %	25 %	386000835
3509	NC_017527	GGC	2	6	129869	129874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000836
3510	NC_017527	CCG	2	6	129967	129972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000836
3511	NC_017527	GCG	2	6	130003	130008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000836
3512	NC_017527	GAG	2	6	130083	130088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3513	NC_017527	TCC	3	9	130156	130164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3514	NC_017527	CTT	2	6	130166	130171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000836
3515	NC_017527	CCT	2	6	130265	130270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3516	NC_017527	AGG	2	6	130300	130305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3517	NC_017527	AGGG	2	8	130310	130317	25 %	0 %	75 %	0 %	386000836
3518	NC_017527	CCG	2	6	130324	130329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000836
3519	NC_017527	C	6	6	130336	130341	0 %	0 %	0 %	100 %	386000836
3520	NC_017527	CGGGG	2	10	130461	130470	0 %	0 %	80 %	20 %	386000836
3521	NC_017527	G	6	6	130467	130472	0 %	0 %	100 %	0 %	386000836
3522	NC_017527	GCCC	2	8	130496	130503	0 %	0 %	25 %	75 %	386000836
3523	NC_017527	GGT	2	6	130504	130509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000836
3524	NC_017527	CCG	2	6	130555	130560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000836
3525	NC_017527	GAG	2	6	130593	130598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3526	NC_017527	CGT	2	6	130625	130630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000836
3527	NC_017527	GAAGGG	2	12	130649	130660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3528	NC_017527	CTC	2	6	130670	130675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3529	NC_017527	TCG	2	6	130684	130689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000836
3530	NC_017527	CGT	2	6	130712	130717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000836
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3532	NC_017527	TCC	2	6	130729	130734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3533	NC_017527	ATC	2	6	130743	130748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000836
3534	NC_017527	CTC	2	6	130794	130799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3535	NC_017527	GAG	2	6	130809	130814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3536	NC_017527	GAG	2	6	130833	130838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3537	NC_017527	CGG	2	6	130906	130911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000836
3538	NC_017527	TGG	2	6	130945	130950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000836
3539	NC_017527	GAG	2	6	130958	130963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3540	NC_017527	GCC	2	6	131004	131009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000836
3541	NC_017527	C	6	6	131040	131045	0 %	0 %	0 %	100 %	386000836
3542	NC_017527	AGG	2	6	131065	131070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3543	NC_017527	GGA	2	6	131134	131139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3544	NC_017527	GAG	2	6	131157	131162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3545	NC_017527	GAG	2	6	131190	131195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000836
3546	NC_017527	GGT	2	6	131272	131277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000836
3547	NC_017527	CTC	2	6	131316	131321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000836
3548	NC_017527	GCC	3	9	131325	131333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000836
3549	NC_017527	GGA	2	6	131352	131357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017527	GGC	2	6	131415	131420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000837
3551	NC_017527	AGG	2	6	131426	131431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000837
3552	NC_017527	CAT	2	6	131435	131440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000837
3553	NC_017527	GAA	2	6	131444	131449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000837
3554	NC_017527	GGA	2	6	131453	131458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000837
3555	NC_017527	GGCC	2	8	131477	131484	0 %	0 %	50 %	50 %	386000837
3556	NC_017527	TC	3	6	131520	131525	0 %	50 %	0 %	50 %	386000837
3557	NC_017527	GGC	2	6	131540	131545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000837
3558	NC_017527	GGC	2	6	131624	131629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000837
3559	NC_017527	TCA	2	6	131632	131637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000837
3560	NC_017527	TGG	2	6	131650	131655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000837
3561	NC_017527	CGA	2	6	131678	131683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000837
3562	NC_017527	CGGC	2	8	131723	131730	0 %	0 %	50 %	50 %	386000837
3563	NC_017527	TGA	2	6	131794	131799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000837
3564	NC_017527	GAG	2	6	131802	131807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000837
3565	NC_017527	GGT	2	6	131819	131824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000837
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3570	NC_017527	CTC	2	6	131960	131965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000838
3571	NC_017527	TGG	2	6	131967	131972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000838
3572	NC_017527	GAG	2	6	131977	131982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000838
3573	NC_017527	TGG	2	6	131991	131996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000838
3574	NC_017527	CGG	2	6	132037	132042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000838
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3578	NC_017527	AGGAG	2	10	132168	132177	40 %	0 %	60 %	0 %	386000838
3579	NC_017527	TCCT	2	8	132188	132195	0 %	50 %	0 %	50 %	386000838
3580	NC_017527	TCG	2	6	132228	132233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000838
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3582	NC_017527	GTCC	2	8	132280	132287	0 %	25 %	25 %	50 %	386000838
3583	NC_017527	C	6	6	132290	132295	0 %	0 %	0 %	100 %	386000838
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3588	NC_017527	GAGG	2	8	132478	132485	25 %	0 %	75 %	0 %	386000838
3589	NC_017527	CGC	2	6	132565	132570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000838
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3592	NC_017527	GGACG	2	10	132637	132646	20 %	0 %	60 %	20 %	386000838
3593	NC_017527	AG	6	12	132746	132757	50 %	0 %	50 %	0 %	386000839
3594	NC_017527	GGA	2	6	132796	132801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000839
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3601	NC_017527	ACGGG	2	10	133039	133048	20 %	0 %	60 %	20 %	386000839
3602	NC_017527	GTC	2	6	133095	133100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000839
3603	NC_017527	GAC	2	6	133101	133106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000839
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3605	NC_017527	GTC	2	6	133121	133126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000839
3606	NC_017527	TCGA	2	8	133137	133144	25 %	25 %	25 %	25 %	386000839
3607	NC_017527	CCGG	2	8	133166	133173	0 %	0 %	50 %	50 %	386000839
3608	NC_017527	GAG	2	6	133200	133205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000839
3609	NC_017527	CCT	2	6	133268	133273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000839
3610	NC_017527	CGC	2	6	133321	133326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000840
3611	NC_017527	C	6	6	133402	133407	0 %	0 %	0 %	100 %	386000840
3612	NC_017527	CGA	2	6	133454	133459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000840
3613	NC_017527	G	7	7	133487	133493	0 %	0 %	100 %	0 %	386000840
3614	NC_017527	CCG	2	6	133495	133500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000840
3615	NC_017527	GAC	2	6	133502	133507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000840
3616	NC_017527	TCC	2	6	133563	133568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_017527	TGC	2	6	133596	133601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_017527	CAC	2	6	133616	133621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_017527	CAG	2	6	133631	133636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017527	GCTGGA	2	12	133840	133851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386000841
3621	NC_017527	TCCT	2	8	133865	133872	0 %	50 %	0 %	50 %	386000841
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3623	NC_017527	AGG	2	6	133962	133967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000841
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