MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017527	CCG	2	6	112319	112324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000822
3002	NC_017527	TCA	2	6	112367	112372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000822
3003	NC_017527	CAC	2	6	112386	112391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3004	NC_017527	CAC	2	6	112395	112400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3005	NC_017527	GAG	4	12	112446	112457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3006	NC_017527	GCG	2	6	112477	112482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000822
3007	NC_017527	C	7	7	112500	112506	0 %	0 %	0 %	100 %	386000822
3008	NC_017527	CGG	2	6	112517	112522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000822
3009	NC_017527	CCCCG	2	10	112530	112539	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
3010	NC_017527	TGG	2	6	112571	112576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000822
3011	NC_017527	ATC	2	6	112585	112590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000822
3012	NC_017527	CCCT	2	8	112600	112607	0 %	25 %	0 %	75 %	386000822
3013	NC_017527	GGCC	2	8	112613	112620	0 %	0 %	50 %	50 %	386000822
3014	NC_017527	GAG	2	6	112638	112643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3015	NC_017527	CCAG	2	8	112664	112671	25 %	0 %	25 %	50 %	386000822
3016	NC_017527	G	6	6	112676	112681	0 %	0 %	100 %	0 %	386000822
3017	NC_017527	GAG	2	6	112683	112688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3018	NC_017527	CCCCG	2	10	112689	112698	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
3019	NC_017527	C	6	6	112755	112760	0 %	0 %	0 %	100 %	386000822
3020	NC_017527	CGG	2	6	112784	112789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000822
3021	NC_017527	CCT	2	6	112794	112799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000822
3022	NC_017527	AGG	3	9	112825	112833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3023	NC_017527	CGG	2	6	112862	112867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000822
3024	NC_017527	CCA	2	6	112895	112900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3025	NC_017527	C	7	7	112977	112983	0 %	0 %	0 %	100 %	386000822
3026	NC_017527	CAC	2	6	113004	113009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3027	NC_017527	TCG	2	6	113045	113050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000822
3028	NC_017527	GAG	2	6	113106	113111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3029	NC_017527	AGG	2	6	113116	113121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3030	NC_017527	CGA	2	6	113126	113131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000822
3031	NC_017527	C	6	6	113141	113146	0 %	0 %	0 %	100 %	386000822
3032	NC_017527	CGG	2	6	113152	113157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000822
3033	NC_017527	GCT	2	6	113159	113164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000822
3034	NC_017527	C	6	6	113223	113228	0 %	0 %	0 %	100 %	386000822
3035	NC_017527	GAC	2	6	113289	113294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000822
3036	NC_017527	AGG	2	6	113332	113337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000822
3037	NC_017527	CCA	2	6	113339	113344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3038	NC_017527	CCA	2	6	113354	113359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000822
3039	NC_017527	ATA	2	6	113443	113448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017527	A	6	6	113451	113456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017527	AGC	2	6	113602	113607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017527	TAT	2	6	113643	113648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017527	CCTGGA	2	12	113728	113739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3044	NC_017527	A	6	6	113788	113793	100 %	0 %	0 %	0 %	386000823
3045	NC_017527	GATATC	2	12	113818	113829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386000823
3046	NC_017527	CGCC	2	8	113857	113864	0 %	0 %	25 %	75 %	386000823
3047	NC_017527	GGC	2	6	113875	113880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3048	NC_017527	ACC	2	6	113897	113902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000823
3049	NC_017527	ACC	2	6	113912	113917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000823
3050	NC_017527	GTC	2	6	113933	113938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3051	NC_017527	CCT	2	6	113940	113945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3052	NC_017527	GAG	2	6	113954	113959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3053	NC_017527	CGCCC	2	10	113989	113998	0 %	0 %	20 %	80 %	386000823
3054	NC_017527	GCC	3	9	114008	114016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3055	NC_017527	GACG	2	8	114033	114040	25 %	0 %	50 %	25 %	386000823
3056	NC_017527	GAC	2	6	114047	114052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3057	NC_017527	TCC	2	6	114074	114079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3058	NC_017527	GTC	2	6	114098	114103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3059	NC_017527	C	7	7	114112	114118	0 %	0 %	0 %	100 %	386000823
3060	NC_017527	TCCG	2	8	114119	114126	0 %	25 %	25 %	50 %	386000823
3061	NC_017527	GAG	2	6	114281	114286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3062	NC_017527	TCG	2	6	114300	114305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3063	NC_017527	ACGA	2	8	114314	114321	50 %	0 %	25 %	25 %	386000823
3064	NC_017527	GCC	2	6	114332	114337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3065	NC_017527	CCGC	2	8	114339	114346	0 %	0 %	25 %	75 %	386000823
3066	NC_017527	TCACCG	2	12	114381	114392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386000823
3067	NC_017527	CTC	2	6	114409	114414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3068	NC_017527	CGG	2	6	114415	114420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3069	NC_017527	GGA	2	6	114426	114431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3070	NC_017527	GAA	2	6	114445	114450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000823
3071	NC_017527	TCC	2	6	114513	114518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3072	NC_017527	GAA	2	6	114541	114546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000823
3073	NC_017527	CCG	3	9	114651	114659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3074	NC_017527	CCGACG	2	12	114662	114673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386000823
3075	NC_017527	CTC	2	6	114685	114690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3076	NC_017527	GAG	2	6	114691	114696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3077	NC_017527	GGA	2	6	114714	114719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3078	NC_017527	TC	3	6	114772	114777	0 %	50 %	0 %	50 %	386000823
3079	NC_017527	CGG	2	6	114784	114789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3080	NC_017527	CGG	2	6	114792	114797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3081	NC_017527	G	8	8	114796	114803	0 %	0 %	100 %	0 %	386000823
3082	NC_017527	GGA	2	6	114884	114889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3083	NC_017527	AGG	3	9	114912	114920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3084	NC_017527	GGC	2	6	114925	114930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3085	NC_017527	GCC	2	6	114950	114955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3086	NC_017527	GCC	2	6	115028	115033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3087	NC_017527	GCG	3	9	115077	115085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3088	NC_017527	CCG	2	6	115095	115100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3089	NC_017527	CTC	2	6	115103	115108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3090	NC_017527	GAT	2	6	115141	115146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000823
3091	NC_017527	GCC	5	15	115172	115186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3092	NC_017527	GGA	2	6	115281	115286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3093	NC_017527	G	6	6	115293	115298	0 %	0 %	100 %	0 %	386000823
3094	NC_017527	CGG	2	6	115330	115335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3095	NC_017527	GAC	2	6	115337	115342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3096	NC_017527	GAC	2	6	115367	115372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3097	NC_017527	GTC	2	6	115415	115420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3098	NC_017527	GAG	2	6	115445	115450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3099	NC_017527	GAGG	2	8	115495	115502	25 %	0 %	75 %	0 %	386000823
3100	NC_017527	GGT	2	6	115506	115511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000823
3101	NC_017527	CGC	3	9	115573	115581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3102	NC_017527	GGT	2	6	115603	115608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000823
3103	NC_017527	TGG	2	6	115641	115646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000823
3104	NC_017527	AGC	2	6	115673	115678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3105	NC_017527	CGC	2	6	115696	115701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3106	NC_017527	G	6	6	115703	115708	0 %	0 %	100 %	0 %	386000823
3107	NC_017527	CCA	2	6	115729	115734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000823
3108	NC_017527	CCG	2	6	115737	115742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3109	NC_017527	G	6	6	115749	115754	0 %	0 %	100 %	0 %	386000823
3110	NC_017527	CCG	2	6	115779	115784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3111	NC_017527	GCG	2	6	115785	115790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3112	NC_017527	TCC	2	6	115799	115804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000823
3113	NC_017527	GGC	2	6	115807	115812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3114	NC_017527	GGT	2	6	115825	115830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000823
3115	NC_017527	AGA	2	6	115881	115886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000823
3116	NC_017527	CGA	2	6	115924	115929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000823
3117	NC_017527	GAG	2	6	115957	115962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
3118	NC_017527	CTT	2	6	116026	116031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000823
3119	NC_017527	ACC	2	6	116045	116050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000823
3120	NC_017527	ATCC	2	8	116146	116153	25 %	25 %	0 %	50 %	386000823
3121	NC_017527	CGG	2	6	116163	116168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000823
3122	NC_017527	GCC	2	6	116171	116176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000823
3123	NC_017527	G	6	6	116179	116184	0 %	0 %	100 %	0 %	386000823
3124	NC_017527	TCA	2	6	116244	116249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000823
3125	NC_017527	GGA	2	6	116253	116258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000823
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3134	NC_017527	TGA	2	6	116640	116645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000823
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3139	NC_017527	C	6	6	116751	116756	0 %	0 %	0 %	100 %	386000823
3140	NC_017527	ACC	2	6	116757	116762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000823
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3143	NC_017527	G	7	7	116823	116829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_017527	GCG	2	6	116859	116864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3145	NC_017527	CCT	2	6	116911	116916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3152	NC_017527	GCC	2	6	117217	117222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000824
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3154	NC_017527	CCGC	2	8	117365	117372	0 %	0 %	25 %	75 %	386000824
3155	NC_017527	ATC	2	6	117378	117383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000824
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3187	NC_017527	AG	3	6	118287	118292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3188	NC_017527	AAT	2	6	118334	118339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3189	NC_017527	TCG	2	6	118406	118411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000825
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3241	NC_017527	ATG	2	6	120133	120138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000827
3242	NC_017527	C	8	8	120140	120147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3243	NC_017527	AGC	2	6	120175	120180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_017527	TTC	2	6	120198	120203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_017527	T	6	6	120233	120238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_017527	AATA	2	8	120262	120269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_017527	GCC	2	6	120291	120296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3248	NC_017527	GCC	3	9	120331	120339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3249	NC_017527	GCG	2	6	120340	120345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_017527	GTC	2	6	120419	120424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000828
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3275	NC_017527	GTA	2	6	121508	121513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000828
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3335	NC_017527	GTAGAT	2	12	123416	123427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000828
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3349	NC_017527	CT	3	6	123899	123904	0 %	50 %	0 %	50 %	386000828
3350	NC_017527	GACGC	2	10	123921	123930	20 %	0 %	40 %	40 %	386000828
3351	NC_017527	CGC	2	6	123944	123949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000828
3352	NC_017527	CAA	2	6	123950	123955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000828
3353	NC_017527	ATG	2	6	123960	123965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000828
3354	NC_017527	TGG	2	6	124028	124033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3355	NC_017527	AT	3	6	124043	124048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_017527	CCG	2	6	124063	124068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3357	NC_017527	GCG	2	6	124126	124131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3358	NC_017527	G	7	7	124155	124161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_017527	GAC	2	6	124174	124179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000829
3360	NC_017527	TCG	2	6	124196	124201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000829
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3362	NC_017527	TGA	2	6	124392	124397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000829
3363	NC_017527	CTC	2	6	124429	124434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000829
3364	NC_017527	CT	3	6	124471	124476	0 %	50 %	0 %	50 %	386000829
3365	NC_017527	TCC	2	6	124496	124501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000829
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3367	NC_017527	TTG	2	6	124529	124534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000829
3368	NC_017527	CGA	2	6	124581	124586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000829
3369	NC_017527	TCC	2	6	124604	124609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000829
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3374	NC_017527	G	7	7	124744	124750	0 %	0 %	100 %	0 %	386000829
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3392	NC_017527	GCC	2	6	125472	125477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3393	NC_017527	GCC	2	6	125482	125487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3488	NC_017527	CTC	2	6	129038	129043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000834
3489	NC_017527	CGA	2	6	129052	129057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000834
3490	NC_017527	C	6	6	129083	129088	0 %	0 %	0 %	100 %	386000834
3491	NC_017527	GGA	2	6	129205	129210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000835
3492	NC_017527	ATC	2	6	129217	129222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000835
3493	NC_017527	TCG	3	9	129262	129270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000835
3494	NC_017527	GAC	2	6	129288	129293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000835
3495	NC_017527	TGA	3	9	129311	129319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000835
3496	NC_017527	TGG	2	6	129343	129348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000835
3497	NC_017527	CGC	2	6	129390	129395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000835
3498	NC_017527	GAT	2	6	129399	129404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000835
3499	NC_017527	CGG	2	6	129469	129474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000835
3500	NC_017527	TGG	2	6	129568	129573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000835

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