MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_017527	CG	3	6	871644	871649	0 %	0 %	50 %	50 %	386001506
23003	NC_017527	CCT	2	6	871650	871655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001506
23004	NC_017527	TATC	2	8	871709	871716	25 %	50 %	0 %	25 %	386001506
23005	NC_017527	CGG	2	6	871739	871744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001506
23006	NC_017527	TCGCCC	2	12	872011	872022	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386001506
23007	NC_017527	TCT	2	6	872039	872044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001506
23008	NC_017527	GAC	2	6	872049	872054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001506
23009	NC_017527	CCG	2	6	872111	872116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001506
23010	NC_017527	CCCCG	2	10	872148	872157	0 %	0 %	20 %	80 %	386001506
23011	NC_017527	CGCACT	2	12	872159	872170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386001506
23012	NC_017527	GTC	2	6	872196	872201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001506
23013	NC_017527	GCT	2	6	872237	872242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001506
23014	NC_017527	AGGC	2	8	872311	872318	25 %	0 %	50 %	25 %	386001506
23015	NC_017527	CCT	2	6	872319	872324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001506
23016	NC_017527	GAG	2	6	872358	872363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001506
23017	NC_017527	GGCCC	2	10	872370	872379	0 %	0 %	40 %	60 %	386001506
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23019	NC_017527	CGT	2	6	872453	872458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001507
23020	NC_017527	CGC	2	6	872523	872528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001507
23021	NC_017527	CCG	2	6	872563	872568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001507
23022	NC_017527	CCCTGA	2	12	872573	872584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386001507
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23026	NC_017527	TGA	2	6	872741	872746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001507
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23032	NC_017527	GTA	2	6	872909	872914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001508
23033	NC_017527	GCCT	2	8	872976	872983	0 %	25 %	25 %	50 %	386001508
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23035	NC_017527	CTTC	2	8	873082	873089	0 %	50 %	0 %	50 %	386001508
23036	NC_017527	TCC	2	6	873123	873128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001508
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23039	NC_017527	CT	4	8	873227	873234	0 %	50 %	0 %	50 %	386001508
23040	NC_017527	AGCTCC	2	12	873261	873272	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386001508
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23042	NC_017527	CTT	3	9	873365	873373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001509
23043	NC_017527	CTG	2	6	873375	873380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001509
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23049	NC_017527	TTC	2	6	873570	873575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001509
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23052	NC_017527	TCT	2	6	873807	873812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001509
23053	NC_017527	ATT	2	6	873818	873823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_017527	AGC	2	6	873872	873877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23055	NC_017527	CGC	2	6	873896	873901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23056	NC_017527	CCG	2	6	874011	874016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001510
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23105	NC_017527	C	6	6	875602	875607	0 %	0 %	0 %	100 %	386001511
23106	NC_017527	CCTCGG	2	12	875626	875637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386001511
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23116	NC_017527	C	6	6	876079	876084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23117	NC_017527	GGA	2	6	876099	876104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23118	NC_017527	CTT	2	6	876276	876281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001512
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23241	NC_017527	GAG	2	6	881150	881155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001518
23242	NC_017527	CCT	2	6	881212	881217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001518
23243	NC_017527	CGT	2	6	881251	881256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001518
23244	NC_017527	TGA	2	6	881277	881282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001518
23245	NC_017527	TGG	2	6	881289	881294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001518
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23247	NC_017527	CT	4	8	881315	881322	0 %	50 %	0 %	50 %	386001518
23248	NC_017527	TCC	2	6	881333	881338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001518
23249	NC_017527	TGA	2	6	881382	881387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001518
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23253	NC_017527	CAT	3	9	881461	881469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001518
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23255	NC_017527	AGG	2	6	881540	881545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001518
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23271	NC_017527	GGA	2	6	882376	882381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001518
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23274	NC_017527	CGC	2	6	882433	882438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001518
23275	NC_017527	GTGG	2	8	882473	882480	0 %	25 %	75 %	0 %	386001518
23276	NC_017527	GGA	2	6	882507	882512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001518
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23282	NC_017527	GAC	2	6	882764	882769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001518
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23328	NC_017527	GCCTC	2	10	884582	884591	0 %	20 %	20 %	60 %	386001521
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23332	NC_017527	GAC	2	6	884703	884708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001521
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23334	NC_017527	CGG	2	6	884812	884817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001521
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23342	NC_017527	CCTCTC	2	12	885078	885089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001521
23343	NC_017527	CAC	2	6	885096	885101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001521
23344	NC_017527	CT	3	6	885111	885116	0 %	50 %	0 %	50 %	386001521
23345	NC_017527	GAG	2	6	885138	885143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001521
23346	NC_017527	CTC	2	6	885144	885149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001521
23347	NC_017527	TCT	2	6	885161	885166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001521
23348	NC_017527	TCG	2	6	885172	885177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001521
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23351	NC_017527	TCA	2	6	885245	885250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001521
23352	NC_017527	GGC	2	6	885295	885300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001522
23353	NC_017527	CCT	2	6	885357	885362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001522
23354	NC_017527	GGC	2	6	885388	885393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001522
23355	NC_017527	GCC	2	6	885409	885414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001522
23356	NC_017527	GTC	2	6	885418	885423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23357	NC_017527	TAC	2	6	885445	885450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001522
23358	NC_017527	TGC	2	6	885489	885494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23359	NC_017527	GCCGAT	2	12	885535	885546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23360	NC_017527	GTT	2	6	885553	885558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386001522
23361	NC_017527	CTG	2	6	885583	885588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23362	NC_017527	CGC	2	6	885621	885626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001522
23363	NC_017527	GAA	2	6	885628	885633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001522
23364	NC_017527	CGTCC	2	10	885640	885649	0 %	20 %	20 %	60 %	386001522
23365	NC_017527	GTCGAC	2	12	885661	885672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23366	NC_017527	TC	3	6	885696	885701	0 %	50 %	0 %	50 %	386001522
23367	NC_017527	CAG	2	6	885749	885754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001522
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23370	NC_017527	GGAC	2	8	885843	885850	25 %	0 %	50 %	25 %	386001522
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23372	NC_017527	CGT	2	6	885870	885875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001522
23373	NC_017527	CGA	2	6	885939	885944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001522
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23375	NC_017527	AGG	2	6	886023	886028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001522
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23377	NC_017527	GAG	2	6	886180	886185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001523
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23396	NC_017527	CCT	2	6	886680	886685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001523
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23418	NC_017527	TCC	2	6	887478	887483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001523
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23421	NC_017527	CT	3	6	887693	887698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23422	NC_017527	TAAC	2	8	887746	887753	50 %	25 %	0 %	25 %	386001524
23423	NC_017527	TCCG	2	8	887756	887763	0 %	25 %	25 %	50 %	386001524
23424	NC_017527	G	7	7	887769	887775	0 %	0 %	100 %	0 %	386001524
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23430	NC_017527	CGG	4	12	887925	887936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001524
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23466	NC_017527	GATC	2	8	889065	889072	25 %	25 %	25 %	25 %	386001525
23467	NC_017527	TCT	2	6	889085	889090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001525
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