MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017527	TCT	2	6	812021	812026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001449
21502	NC_017527	CTT	2	6	812076	812081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001449
21503	NC_017527	CGC	2	6	812129	812134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001449
21504	NC_017527	GTC	2	6	812166	812171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001449
21505	NC_017527	CTT	3	9	812286	812294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001449
21506	NC_017527	TCA	2	6	812303	812308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001449
21507	NC_017527	CGA	2	6	812321	812326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001449
21508	NC_017527	GGC	2	6	812335	812340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001449
21509	NC_017527	CCT	2	6	812407	812412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21510	NC_017527	TC	3	6	812441	812446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21511	NC_017527	TC	3	6	812510	812515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21512	NC_017527	TAA	2	6	812571	812576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21513	NC_017527	GGT	2	6	812723	812728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001450
21514	NC_017527	AGGG	2	8	812762	812769	25 %	0 %	75 %	0 %	386001450
21515	NC_017527	C	6	6	812819	812824	0 %	0 %	0 %	100 %	386001450
21516	NC_017527	GAT	2	6	812849	812854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001450
21517	NC_017527	CTC	2	6	812855	812860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21518	NC_017527	TTC	2	6	812878	812883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001450
21519	NC_017527	TCC	2	6	812914	812919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21520	NC_017527	CTT	2	6	812930	812935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001450
21521	NC_017527	GAG	2	6	812985	812990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001450
21522	NC_017527	CTC	2	6	813035	813040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21523	NC_017527	GGC	2	6	813044	813049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001450
21524	NC_017527	TCC	3	9	813054	813062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21525	NC_017527	AG	3	6	813097	813102	50 %	0 %	50 %	0 %	386001450
21526	NC_017527	GCC	2	6	813117	813122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001450
21527	NC_017527	GCCGC	2	10	813127	813136	0 %	0 %	40 %	60 %	386001450
21528	NC_017527	AG	3	6	813140	813145	50 %	0 %	50 %	0 %	386001450
21529	NC_017527	G	6	6	813154	813159	0 %	0 %	100 %	0 %	386001450
21530	NC_017527	CTC	2	6	813168	813173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21531	NC_017527	ATCG	2	8	813174	813181	25 %	25 %	25 %	25 %	386001450
21532	NC_017527	CCG	2	6	813190	813195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001450
21533	NC_017527	GGA	2	6	813217	813222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001450
21534	NC_017527	GTC	2	6	813239	813244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001450
21535	NC_017527	CTC	2	6	813260	813265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21536	NC_017527	TCA	2	6	813292	813297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001450
21537	NC_017527	GGGA	2	8	813354	813361	25 %	0 %	75 %	0 %	386001450
21538	NC_017527	GCG	2	6	813387	813392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001450
21539	NC_017527	CCT	2	6	813445	813450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21540	NC_017527	CCT	2	6	813457	813462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21541	NC_017527	GAC	2	6	813545	813550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001450
21542	NC_017527	TCCG	2	8	813571	813578	0 %	25 %	25 %	50 %	386001450
21543	NC_017527	G	6	6	813600	813605	0 %	0 %	100 %	0 %	386001450
21544	NC_017527	TCC	2	6	813619	813624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21545	NC_017527	CGA	2	6	813712	813717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001450
21546	NC_017527	CCT	2	6	813746	813751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21547	NC_017527	CCT	3	9	813811	813819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001450
21548	NC_017527	TCG	2	6	813827	813832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001450
21549	NC_017527	CCA	2	6	813844	813849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001450
21550	NC_017527	CGGGGC	2	12	813941	813952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001450
21551	NC_017527	GGC	2	6	813960	813965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001450
21552	NC_017527	CATC	2	8	813970	813977	25 %	25 %	0 %	50 %	386001450
21553	NC_017527	CCT	3	9	814034	814042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001451
21554	NC_017527	GCC	2	6	814093	814098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001451
21555	NC_017527	TCT	2	6	814100	814105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001451
21556	NC_017527	CCT	2	6	814106	814111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001451
21557	NC_017527	CGA	3	9	814130	814138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001451
21558	NC_017527	GAA	2	6	814161	814166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001451
21559	NC_017527	CCA	2	6	814181	814186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001451
21560	NC_017527	CGA	2	6	814196	814201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001451
21561	NC_017527	GAC	2	6	814209	814214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001451
21562	NC_017527	GAG	2	6	814215	814220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001451
21563	NC_017527	GGAT	2	8	814222	814229	25 %	25 %	50 %	0 %	386001451
21564	NC_017527	TGA	3	9	814259	814267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001451
21565	NC_017527	ATC	2	6	814285	814290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001451
21566	NC_017527	GAG	2	6	814294	814299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001451
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21569	NC_017527	ATG	2	6	814363	814368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001451
21570	NC_017527	AGG	2	6	814376	814381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001451
21571	NC_017527	AGA	2	6	814454	814459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001451
21572	NC_017527	CTT	2	6	814548	814553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001451
21573	NC_017527	TGG	2	6	814583	814588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001451
21574	NC_017527	TCCA	2	8	814611	814618	25 %	25 %	0 %	50 %	386001451
21575	NC_017527	AGG	2	6	814621	814626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001451
21576	NC_017527	GTA	2	6	814796	814801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001451
21577	NC_017527	ACC	2	6	814900	814905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001451
21578	NC_017527	CCT	2	6	814912	814917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001451
21579	NC_017527	GGT	2	6	814953	814958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001451
21580	NC_017527	GCCGA	2	10	814966	814975	20 %	0 %	40 %	40 %	386001451
21581	NC_017527	CT	3	6	814996	815001	0 %	50 %	0 %	50 %	386001451
21582	NC_017527	GAC	2	6	815028	815033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001451
21583	NC_017527	GAT	2	6	815040	815045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001451
21584	NC_017527	AGC	2	6	815083	815088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001451
21585	NC_017527	TC	4	8	815143	815150	0 %	50 %	0 %	50 %	386001451
21586	NC_017527	GGAA	2	8	815213	815220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_017527	TCC	2	6	815223	815228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21588	NC_017527	C	7	7	815238	815244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21589	NC_017527	GTCT	2	8	815323	815330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21590	NC_017527	TGG	2	6	815349	815354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21591	NC_017527	CGA	2	6	815407	815412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21592	NC_017527	CTG	2	6	815417	815422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21593	NC_017527	CCG	2	6	815457	815462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001452
21594	NC_017527	CCT	2	6	815473	815478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001452
21595	NC_017527	AGC	2	6	815497	815502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21596	NC_017527	GGC	2	6	815508	815513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
21597	NC_017527	CTC	2	6	815553	815558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001452
21598	NC_017527	CGA	2	6	815578	815583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21599	NC_017527	TGG	3	9	815614	815622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001452
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21601	NC_017527	CGG	2	6	815671	815676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
21602	NC_017527	TCC	2	6	815687	815692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001452
21603	NC_017527	ACC	2	6	815700	815705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001452
21604	NC_017527	C	7	7	815711	815717	0 %	0 %	0 %	100 %	386001452
21605	NC_017527	CGG	2	6	815740	815745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
21606	NC_017527	AGG	2	6	815806	815811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001452
21607	NC_017527	CGC	2	6	815812	815817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001452
21608	NC_017527	GCG	2	6	815829	815834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
21609	NC_017527	CGA	2	6	815836	815841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21610	NC_017527	CTT	2	6	815849	815854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001452
21611	NC_017527	GGT	2	6	815863	815868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001452
21612	NC_017527	GCT	2	6	815876	815881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21613	NC_017527	GTC	2	6	815928	815933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001452
21614	NC_017527	CCG	2	6	815937	815942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001452
21615	NC_017527	CTT	2	6	815987	815992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001452
21616	NC_017527	CGG	2	6	816022	816027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
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21618	NC_017527	CGG	2	6	816094	816099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001452
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21861	NC_017527	GAC	2	6	824839	824844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21980	NC_017527	GGA	2	6	829942	829947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001466
21981	NC_017527	GGA	2	6	829965	829970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001466
21982	NC_017527	G	7	7	830094	830100	0 %	0 %	100 %	0 %	386001466
21983	NC_017527	GAC	2	6	830118	830123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001467
21984	NC_017527	CTA	2	6	830165	830170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001467
21985	NC_017527	CCTGG	2	10	830210	830219	0 %	20 %	40 %	40 %	386001467
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21987	NC_017527	ACG	2	6	830301	830306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001467
21988	NC_017527	GCG	2	6	830307	830312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001467
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21990	NC_017527	GGATC	2	10	830341	830350	20 %	20 %	40 %	20 %	386001467
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21992	NC_017527	TCC	2	6	830392	830397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001467
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