MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017527	GGA	2	6	639020	639025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001322
17003	NC_017527	GAG	2	6	639138	639143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001322
17004	NC_017527	GGA	2	6	639146	639151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001322
17005	NC_017527	CCT	2	6	639152	639157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001322
17006	NC_017527	TCG	2	6	639190	639195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001322
17007	NC_017527	GCC	2	6	639210	639215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001322
17008	NC_017527	TCGCCC	2	12	639235	639246	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386001322
17009	NC_017527	TCG	2	6	639265	639270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001322
17010	NC_017527	C	8	8	639271	639278	0 %	0 %	0 %	100 %	386001322
17011	NC_017527	TCC	2	6	639292	639297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001322
17012	NC_017527	GGA	2	6	639328	639333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001322
17013	NC_017527	GGCC	2	8	639365	639372	0 %	0 %	50 %	50 %	386001322
17014	NC_017527	GAG	2	6	639414	639419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001322
17015	NC_017527	TATT	2	8	639429	639436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_017527	ATTT	2	8	639447	639454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_017527	AGG	2	6	639511	639516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001323
17018	NC_017527	GAC	3	9	639532	639540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17019	NC_017527	CCA	2	6	639567	639572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001323
17020	NC_017527	CGA	2	6	639582	639587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17021	NC_017527	TTA	2	6	639606	639611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386001323
17022	NC_017527	ATC	2	6	639629	639634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001323
17023	NC_017527	CCT	2	6	639657	639662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001323
17024	NC_017527	CCAG	2	8	639678	639685	25 %	0 %	25 %	50 %	386001323
17025	NC_017527	GAC	2	6	639694	639699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17026	NC_017527	GGC	3	9	639781	639789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001323
17027	NC_017527	GAA	2	6	639799	639804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001323
17028	NC_017527	ATG	2	6	639824	639829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001323
17029	NC_017527	G	7	7	639832	639838	0 %	0 %	100 %	0 %	386001323
17030	NC_017527	CCA	3	9	639861	639869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001323
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17032	NC_017527	CGAC	2	8	639904	639911	25 %	0 %	25 %	50 %	386001323
17033	NC_017527	CGA	2	6	639924	639929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17034	NC_017527	CGC	2	6	639997	640002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001323
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17036	NC_017527	TA	3	6	640057	640062	50 %	50 %	0 %	0 %	386001323
17037	NC_017527	GAT	2	6	640069	640074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001323
17038	NC_017527	AGCTAT	2	12	640099	640110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386001323
17039	NC_017527	GAA	2	6	640126	640131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001323
17040	NC_017527	CGA	3	9	640152	640160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
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17043	NC_017527	GAC	2	6	640249	640254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
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17052	NC_017527	GCC	2	6	640528	640533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001323
17053	NC_017527	GAC	2	6	640537	640542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17054	NC_017527	ATG	2	6	640553	640558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001323
17055	NC_017527	GTC	2	6	640601	640606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17056	NC_017527	GAC	2	6	640633	640638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
17057	NC_017527	CGA	2	6	640659	640664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
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17061	NC_017527	CGA	2	6	640872	640877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001323
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17064	NC_017527	TC	4	8	641273	641280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17065	NC_017527	TAC	2	6	641303	641308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17067	NC_017527	ATG	2	6	641391	641396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_017527	TGCC	2	8	641423	641430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17069	NC_017527	G	7	7	641484	641490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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17071	NC_017527	GCCG	2	8	641506	641513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17072	NC_017527	G	6	6	641520	641525	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_017527	GGTCC	2	10	641566	641575	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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17089	NC_017527	A	6	6	642217	642222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17105	NC_017527	GGC	2	6	643091	643096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001326
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17110	NC_017527	CTCGG	2	10	643217	643226	0 %	20 %	40 %	40 %	386001326
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17242	NC_017527	CCG	2	6	649108	649113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001329
17243	NC_017527	CTC	2	6	649126	649131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001329
17244	NC_017527	GCG	2	6	649145	649150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001329
17245	NC_017527	CCGGA	2	10	649163	649172	20 %	0 %	40 %	40 %	386001329
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17315	NC_017527	TCCC	2	8	651418	651425	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17316	NC_017527	CCGAT	2	10	651437	651446	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17317	NC_017527	CCGAT	2	10	651452	651461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17318	NC_017527	CTT	2	6	651465	651470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17347	NC_017527	AGGG	2	8	652629	652636	25 %	0 %	75 %	0 %	386001331
17348	NC_017527	CGT	2	6	652639	652644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001331
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17358	NC_017527	G	6	6	653050	653055	0 %	0 %	100 %	0 %	386001331
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17477	NC_017527	TCC	2	6	656695	656700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001335
17478	NC_017527	TCC	2	6	656728	656733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001335
17479	NC_017527	CGC	2	6	656823	656828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001335
17480	NC_017527	CCG	2	6	656840	656845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001335
17481	NC_017527	CGTCGG	2	12	656855	656866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386001335
17482	NC_017527	GTG	2	6	656868	656873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001335
17483	NC_017527	CAC	2	6	656877	656882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001335
17484	NC_017527	CCG	2	6	656907	656912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001335
17485	NC_017527	CCTC	2	8	656927	656934	0 %	25 %	0 %	75 %	386001335
17486	NC_017527	CCA	2	6	656969	656974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001335
17487	NC_017527	GAGG	2	8	656978	656985	25 %	0 %	75 %	0 %	386001335
17488	NC_017527	CGG	2	6	656987	656992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001335
17489	NC_017527	GCTCG	2	10	656993	657002	0 %	20 %	40 %	40 %	386001335
17490	NC_017527	TCG	2	6	657004	657009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001335
17491	NC_017527	C	7	7	657049	657055	0 %	0 %	0 %	100 %	386001335
17492	NC_017527	GATCTG	2	12	657081	657092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386001335
17493	NC_017527	ATC	2	6	657130	657135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001335
17494	NC_017527	GGC	2	6	657180	657185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001335
17495	NC_017527	AGA	2	6	657188	657193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001335
17496	NC_017527	GTC	2	6	657204	657209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001335
17497	NC_017527	TGG	2	6	657224	657229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001335
17498	NC_017527	GCC	2	6	657231	657236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001335
17499	NC_017527	CCCGG	2	10	657287	657296	0 %	0 %	40 %	60 %	386001335
17500	NC_017527	GTG	2	6	657345	657350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001335

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