MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017527	CTC	2	6	602351	602356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001286
16002	NC_017527	GGA	2	6	602413	602418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001286
16003	NC_017527	TCGC	2	8	602421	602428	0 %	25 %	25 %	50 %	386001286
16004	NC_017527	CGA	2	6	602479	602484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001286
16005	NC_017527	GCTGG	2	10	602509	602518	0 %	20 %	60 %	20 %	386001286
16006	NC_017527	CTC	3	9	602528	602536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16007	NC_017527	GTA	2	6	602591	602596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001287
16008	NC_017527	CTC	2	6	602663	602668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16009	NC_017527	TGG	2	6	602686	602691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001287
16010	NC_017527	GAT	2	6	602699	602704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001287
16011	NC_017527	CCT	2	6	602777	602782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16012	NC_017527	CGA	2	6	602824	602829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16013	NC_017527	TTC	2	6	602883	602888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001287
16014	NC_017527	CTC	2	6	602891	602896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16015	NC_017527	GAC	2	6	602921	602926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16016	NC_017527	CAC	2	6	602936	602941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001287
16017	NC_017527	GAG	2	6	603002	603007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001287
16018	NC_017527	TGA	2	6	603052	603057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001287
16019	NC_017527	GTC	2	6	603059	603064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16020	NC_017527	CGA	2	6	603073	603078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16021	NC_017527	TCCA	2	8	603099	603106	25 %	25 %	0 %	50 %	386001287
16022	NC_017527	GTA	2	6	603125	603130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001287
16023	NC_017527	GTC	2	6	603131	603136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16024	NC_017527	TCT	2	6	603154	603159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001287
16025	NC_017527	GGT	2	6	603169	603174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001287
16026	NC_017527	CGA	2	6	603178	603183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16027	NC_017527	TGA	2	6	603214	603219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001287
16028	NC_017527	CTC	2	6	603230	603235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16029	NC_017527	CCA	2	6	603265	603270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001287
16030	NC_017527	TCCA	2	8	603321	603328	25 %	25 %	0 %	50 %	386001287
16031	NC_017527	CGA	2	6	603346	603351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16032	NC_017527	CGG	2	6	603439	603444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001287
16033	NC_017527	TCC	2	6	603486	603491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16034	NC_017527	TGG	2	6	603511	603516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001287
16035	NC_017527	G	8	8	603515	603522	0 %	0 %	100 %	0 %	386001287
16036	NC_017527	GGT	2	6	603530	603535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001287
16037	NC_017527	GCC	2	6	603549	603554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001287
16038	NC_017527	CAT	2	6	603560	603565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001287
16039	NC_017527	GTCGTA	2	12	603584	603595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386001287
16040	NC_017527	CCG	2	6	603604	603609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001287
16041	NC_017527	GCC	2	6	603686	603691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001287
16042	NC_017527	GTC	2	6	603777	603782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16043	NC_017527	GAG	2	6	603800	603805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001287
16044	NC_017527	GCC	2	6	603852	603857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001287
16045	NC_017527	CTC	2	6	603863	603868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16046	NC_017527	CAGC	2	8	603878	603885	25 %	0 %	25 %	50 %	386001287
16047	NC_017527	CGA	2	6	603904	603909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16048	NC_017527	TC	3	6	603930	603935	0 %	50 %	0 %	50 %	386001287
16049	NC_017527	CCT	2	6	603958	603963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16050	NC_017527	CTC	2	6	603974	603979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16051	NC_017527	ATC	2	6	603993	603998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001287
16052	NC_017527	CCGC	2	8	604006	604013	0 %	0 %	25 %	75 %	386001287
16053	NC_017527	TCCT	2	8	604032	604039	0 %	50 %	0 %	50 %	386001287
16054	NC_017527	CCTT	2	8	604147	604154	0 %	50 %	0 %	50 %	386001287
16055	NC_017527	GAA	2	6	604169	604174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001287
16056	NC_017527	TCT	2	6	604222	604227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001287
16057	NC_017527	TCC	2	6	604272	604277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001287
16058	NC_017527	CGA	2	6	604291	604296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16059	NC_017527	GAC	2	6	604401	604406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001287
16060	NC_017527	CAC	2	6	604436	604441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001288
16061	NC_017527	GTC	2	6	604463	604468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001288
16062	NC_017527	AGGA	2	8	604488	604495	50 %	0 %	50 %	0 %	386001288
16063	NC_017527	GAA	2	6	604646	604651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001288
16064	NC_017527	C	6	6	604654	604659	0 %	0 %	0 %	100 %	386001288
16065	NC_017527	CCG	2	6	604706	604711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001288
16066	NC_017527	GAG	3	9	604778	604786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001288
16067	NC_017527	CTC	2	6	604853	604858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001288
16068	NC_017527	TCC	2	6	604905	604910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001288
16069	NC_017527	CT	3	6	605030	605035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_017527	ATA	2	6	605052	605057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_017527	TAA	2	6	605128	605133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_017527	C	6	6	605135	605140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16073	NC_017527	CCG	2	6	605188	605193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001289
16074	NC_017527	TCCGGG	2	12	605203	605214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386001289
16075	NC_017527	GGA	2	6	605225	605230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001289
16076	NC_017527	GAG	2	6	605295	605300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001289
16077	NC_017527	CTC	2	6	605340	605345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001289
16078	NC_017527	GGC	2	6	605390	605395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001289
16079	NC_017527	G	7	7	605460	605466	0 %	0 %	100 %	0 %	386001289
16080	NC_017527	AG	3	6	605480	605485	50 %	0 %	50 %	0 %	386001289
16081	NC_017527	CCA	2	6	605522	605527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001289
16082	NC_017527	G	8	8	605552	605559	0 %	0 %	100 %	0 %	386001289
16083	NC_017527	GGT	2	6	605579	605584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001289
16084	NC_017527	GAG	2	6	605596	605601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001289
16085	NC_017527	CCA	2	6	605651	605656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001290
16086	NC_017527	CTC	2	6	605700	605705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001290
16087	NC_017527	ACT	2	6	605770	605775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001290
16088	NC_017527	CGG	2	6	605819	605824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001290
16089	NC_017527	CGC	2	6	605828	605833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001290
16090	NC_017527	G	7	7	605847	605853	0 %	0 %	100 %	0 %	386001290
16091	NC_017527	GCG	2	6	605890	605895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001290
16092	NC_017527	GGAC	2	8	605908	605915	25 %	0 %	50 %	25 %	386001290
16093	NC_017527	GGA	2	6	605924	605929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001290
16094	NC_017527	GAT	2	6	605939	605944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001290
16095	NC_017527	TCG	2	6	605953	605958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16096	NC_017527	ACG	2	6	605971	605976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16097	NC_017527	CGA	2	6	606029	606034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16098	NC_017527	G	6	6	606046	606051	0 %	0 %	100 %	0 %	386001290
16099	NC_017527	GAG	2	6	606105	606110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001290
16100	NC_017527	G	6	6	606110	606115	0 %	0 %	100 %	0 %	386001290
16101	NC_017527	CGA	2	6	606227	606232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16102	NC_017527	GAC	2	6	606243	606248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16103	NC_017527	G	6	6	606310	606315	0 %	0 %	100 %	0 %	386001290
16104	NC_017527	CCA	2	6	606320	606325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001290
16105	NC_017527	ACC	2	6	606337	606342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001290
16106	NC_017527	A	6	6	606365	606370	100 %	0 %	0 %	0 %	386001290
16107	NC_017527	AGC	2	6	606394	606399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16108	NC_017527	GC	3	6	606406	606411	0 %	0 %	50 %	50 %	386001290
16109	NC_017527	ACT	2	6	606436	606441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001290
16110	NC_017527	GGC	4	12	606452	606463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001290
16111	NC_017527	ATC	2	6	606489	606494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001290
16112	NC_017527	GAGG	2	8	606506	606513	25 %	0 %	75 %	0 %	386001290
16113	NC_017527	ACG	2	6	606556	606561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16114	NC_017527	GGA	2	6	606584	606589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001290
16115	NC_017527	CGA	2	6	606640	606645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16116	NC_017527	CCT	2	6	606733	606738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001290
16117	NC_017527	GAA	2	6	606827	606832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001290
16118	NC_017527	GAG	2	6	606915	606920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001290
16119	NC_017527	GTC	2	6	606951	606956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16120	NC_017527	CGT	2	6	606959	606964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16121	NC_017527	CCA	2	6	606965	606970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001290
16122	NC_017527	GTC	2	6	606999	607004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001290
16123	NC_017527	GTC	2	6	607037	607042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001291
16124	NC_017527	TGG	2	6	607044	607049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001291
16125	NC_017527	CT	3	6	607053	607058	0 %	50 %	0 %	50 %	386001291
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16129	NC_017527	GTC	2	6	607199	607204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001291
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16157	NC_017527	A	8	8	607883	607890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16159	NC_017527	C	7	7	607914	607920	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16193	NC_017527	GAAA	2	8	609146	609153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16207	NC_017527	A	6	6	609501	609506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16223	NC_017527	ATG	2	6	610273	610278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001295
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16229	NC_017527	TGT	2	6	610555	610560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16230	NC_017527	TATC	2	8	610567	610574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16231	NC_017527	CGA	2	6	610587	610592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16232	NC_017527	CCA	2	6	610600	610605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16233	NC_017527	CTC	2	6	610607	610612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16234	NC_017527	AAG	2	6	610631	610636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16235	NC_017527	TCG	2	6	610638	610643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16236	NC_017527	CCT	2	6	610651	610656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16237	NC_017527	C	6	6	610681	610686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16238	NC_017527	CGA	2	6	610699	610704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16239	NC_017527	TCC	2	6	610720	610725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16240	NC_017527	GAT	2	6	610784	610789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16241	NC_017527	CGG	2	6	610819	610824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16242	NC_017527	TCA	2	6	610840	610845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16243	NC_017527	CCA	2	6	610848	610853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16244	NC_017527	AT	3	6	610870	610875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16245	NC_017527	GGTGAG	2	12	610902	610913	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16252	NC_017527	TCC	3	9	611131	611139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001296
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16488	NC_017527	CTT	2	6	620251	620256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001304
16489	NC_017527	TCA	2	6	620322	620327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001305
16490	NC_017527	T	6	6	620340	620345	0 %	100 %	0 %	0 %	386001305
16491	NC_017527	CCGC	2	8	620457	620464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16492	NC_017527	CAA	2	6	620518	620523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16493	NC_017527	TCCC	2	8	620621	620628	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16494	NC_017527	GCG	2	6	620638	620643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16495	NC_017527	CAG	2	6	620648	620653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001306
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16500	NC_017527	CTT	2	6	620827	620832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001306

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