MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017527	AGA	2	6	582309	582314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001271
15502	NC_017527	CGT	2	6	582319	582324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15503	NC_017527	CAC	2	6	582439	582444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001271
15504	NC_017527	CGGT	2	8	582480	582487	0 %	25 %	50 %	25 %	386001271
15505	NC_017527	GCT	2	6	582522	582527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15506	NC_017527	TCAG	2	8	582572	582579	25 %	25 %	25 %	25 %	386001271
15507	NC_017527	ATG	2	6	582587	582592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15508	NC_017527	GCT	2	6	582787	582792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15509	NC_017527	TC	3	6	582858	582863	0 %	50 %	0 %	50 %	386001271
15510	NC_017527	GGC	2	6	582904	582909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001271
15511	NC_017527	GAT	2	6	582943	582948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15512	NC_017527	AGG	2	6	583010	583015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001271
15513	NC_017527	GCA	2	6	583037	583042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15514	NC_017527	GGC	2	6	583180	583185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001271
15515	NC_017527	GAT	2	6	583219	583224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15516	NC_017527	GAG	2	6	583285	583290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001271
15517	NC_017527	T	6	6	583293	583298	0 %	100 %	0 %	0 %	386001271
15518	NC_017527	TC	3	6	583410	583415	0 %	50 %	0 %	50 %	386001271
15519	NC_017527	GAG	2	6	583451	583456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001271
15520	NC_017527	GTC	2	6	583459	583464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15521	NC_017527	TGG	2	6	583473	583478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001271
15522	NC_017527	GCC	2	6	583502	583507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001271
15523	NC_017527	CCT	3	9	583545	583553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001271
15524	NC_017527	GGAG	2	8	583574	583581	25 %	0 %	75 %	0 %	386001271
15525	NC_017527	TCGG	2	8	583622	583629	0 %	25 %	50 %	25 %	386001271
15526	NC_017527	TGA	2	6	583686	583691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15527	NC_017527	TGC	2	6	583698	583703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15528	NC_017527	TGG	2	6	583794	583799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001271
15529	NC_017527	TGG	2	6	583832	583837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001271
15530	NC_017527	CAG	2	6	583877	583882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15531	NC_017527	ATC	2	6	583888	583893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001271
15532	NC_017527	CAG	2	6	583895	583900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15533	NC_017527	GCA	2	6	583912	583917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15534	NC_017527	GGT	2	6	583960	583965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001271
15535	NC_017527	ATA	2	6	583987	583992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001271
15536	NC_017527	AGG	2	6	584027	584032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001271
15537	NC_017527	CT	3	6	584076	584081	0 %	50 %	0 %	50 %	386001271
15538	NC_017527	AAG	2	6	584116	584121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001271
15539	NC_017527	TCCATC	2	12	584132	584143	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386001271
15540	NC_017527	TCC	2	6	584146	584151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15541	NC_017527	ATC	2	6	584219	584224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001272
15542	NC_017527	GGT	2	6	584311	584316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001272
15543	NC_017527	C	6	6	584330	584335	0 %	0 %	0 %	100 %	386001272
15544	NC_017527	GTC	2	6	584364	584369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15545	NC_017527	ACC	2	6	584387	584392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001272
15546	NC_017527	CCG	2	6	584452	584457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001272
15547	NC_017527	CCG	2	6	584461	584466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001272
15548	NC_017527	CCT	2	6	584468	584473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001272
15549	NC_017527	CGT	2	6	584486	584491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15550	NC_017527	CTTCG	2	10	584492	584501	0 %	40 %	20 %	40 %	386001272
15551	NC_017527	CTT	2	6	584512	584517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001272
15552	NC_017527	CGA	2	6	584521	584526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15553	NC_017527	TGG	2	6	584572	584577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001272
15554	NC_017527	GCT	2	6	584588	584593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15555	NC_017527	GCC	2	6	584642	584647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001272
15556	NC_017527	TCG	2	6	584659	584664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15557	NC_017527	CTG	2	6	584707	584712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15558	NC_017527	CTAT	2	8	584829	584836	25 %	50 %	0 %	25 %	386001272
15559	NC_017527	GCC	3	9	584840	584848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001272
15560	NC_017527	TCG	2	6	584875	584880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15561	NC_017527	GAACT	2	10	584921	584930	40 %	20 %	20 %	20 %	386001272
15562	NC_017527	G	7	7	584970	584976	0 %	0 %	100 %	0 %	386001272
15563	NC_017527	GTA	2	6	584984	584989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001272
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15568	NC_017527	CGA	2	6	585140	585145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001272
15569	NC_017527	GGT	2	6	585167	585172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001272
15570	NC_017527	GATC	2	8	585188	585195	25 %	25 %	25 %	25 %	386001272
15571	NC_017527	GAC	2	6	585245	585250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001272
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15574	NC_017527	T	6	6	585345	585350	0 %	100 %	0 %	0 %	386001272
15575	NC_017527	G	7	7	585368	585374	0 %	0 %	100 %	0 %	386001272
15576	NC_017527	G	6	6	585403	585408	0 %	0 %	100 %	0 %	386001272
15577	NC_017527	TCCC	2	8	585412	585419	0 %	25 %	0 %	75 %	386001272
15578	NC_017527	GGT	2	6	585425	585430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001272
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15583	NC_017527	CGC	2	6	585724	585729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001272
15584	NC_017527	TCT	2	6	585755	585760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001272
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15586	NC_017527	CGG	2	6	585856	585861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15587	NC_017527	TGG	2	6	586028	586033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001273
15588	NC_017527	CAT	2	6	586061	586066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001273
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15590	NC_017527	GGCG	2	8	586338	586345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15591	NC_017527	CTA	2	6	586370	586375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_017527	AGG	2	6	586380	586385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_017527	GGT	2	6	586431	586436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_017527	GTTG	2	8	586469	586476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_017527	GCT	2	6	586494	586499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15597	NC_017527	TCT	2	6	586595	586600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_017527	TA	3	6	586741	586746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_017527	GTA	2	6	586768	586773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_017527	TCGTA	2	10	586774	586783	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15601	NC_017527	TGA	2	6	586784	586789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_017527	TGAA	2	8	586825	586832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_017527	CAT	2	6	586876	586881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001274
15604	NC_017527	TCGGC	2	10	586890	586899	0 %	20 %	40 %	40 %	386001274
15605	NC_017527	CGA	2	6	586917	586922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001274
15606	NC_017527	TGA	2	6	586932	586937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001274
15607	NC_017527	CGG	2	6	586965	586970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001274
15608	NC_017527	GAA	2	6	586975	586980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001274
15609	NC_017527	AT	3	6	587016	587021	50 %	50 %	0 %	0 %	386001274
15610	NC_017527	CAG	2	6	587023	587028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001274
15611	NC_017527	TCG	2	6	587034	587039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001274
15612	NC_017527	TCT	2	6	587046	587051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001274
15613	NC_017527	GAGTTC	2	12	587114	587125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386001274
15614	NC_017527	CGT	2	6	587224	587229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001274
15615	NC_017527	TACG	2	8	587293	587300	25 %	25 %	25 %	25 %	386001274
15616	NC_017527	CCT	2	6	587311	587316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001274
15617	NC_017527	CAGG	2	8	587342	587349	25 %	0 %	50 %	25 %	386001274
15618	NC_017527	GTC	2	6	587456	587461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001274
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15981	NC_017527	GCT	2	6	601701	601706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001286
15982	NC_017527	CT	3	6	601712	601717	0 %	50 %	0 %	50 %	386001286
15983	NC_017527	GGC	2	6	601721	601726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001286
15984	NC_017527	CGG	2	6	601732	601737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001286
15985	NC_017527	GCT	2	6	601751	601756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001286
15986	NC_017527	ACC	2	6	601776	601781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001286
15987	NC_017527	CCT	3	9	601816	601824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001286
15988	NC_017527	CTC	2	6	601865	601870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001286
15989	NC_017527	GTC	2	6	601946	601951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001286
15990	NC_017527	GAG	2	6	601985	601990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001286
15991	NC_017527	CCA	2	6	601993	601998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001286
15992	NC_017527	CCG	2	6	602029	602034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001286
15993	NC_017527	C	6	6	602135	602140	0 %	0 %	0 %	100 %	386001286
15994	NC_017527	CGA	2	6	602215	602220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001286
15995	NC_017527	CCT	2	6	602260	602265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001286
15996	NC_017527	GGA	2	6	602288	602293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001286
15997	NC_017527	GGC	2	6	602294	602299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001286
15998	NC_017527	CGG	2	6	602314	602319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001286
15999	NC_017527	CCG	2	6	602320	602325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001286
16000	NC_017527	CGC	2	6	602345	602350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001286

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