MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017527	TCC	2	6	564154	564159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001259
15002	NC_017527	CGA	2	6	564162	564167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15003	NC_017527	CCG	2	6	564171	564176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001259
15004	NC_017527	C	6	6	564183	564188	0 %	0 %	0 %	100 %	386001259
15005	NC_017527	AGA	2	6	564207	564212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001259
15006	NC_017527	GCC	2	6	564214	564219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001259
15007	NC_017527	GAT	2	6	564220	564225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001259
15008	NC_017527	AGG	2	6	564237	564242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15009	NC_017527	GAT	2	6	564262	564267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001259
15010	NC_017527	CGA	2	6	564276	564281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15011	NC_017527	GCG	2	6	564308	564313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15012	NC_017527	ATGACG	2	12	564323	564334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386001259
15013	NC_017527	AGG	2	6	564414	564419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15014	NC_017527	GGC	3	9	564457	564465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15015	NC_017527	CGA	2	6	564486	564491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15016	NC_017527	GCC	2	6	564493	564498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001259
15017	NC_017527	CGG	2	6	564552	564557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15018	NC_017527	CGG	2	6	564585	564590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15019	NC_017527	CGA	2	6	564591	564596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15020	NC_017527	GAC	2	6	564610	564615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15021	NC_017527	GGC	2	6	564652	564657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15022	NC_017527	TCT	2	6	564681	564686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001259
15023	NC_017527	GAG	2	6	564718	564723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15024	NC_017527	GGA	2	6	564732	564737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15025	NC_017527	C	8	8	564753	564760	0 %	0 %	0 %	100 %	386001259
15026	NC_017527	CCA	2	6	564775	564780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001259
15027	NC_017527	GAGG	2	8	564790	564797	25 %	0 %	75 %	0 %	386001259
15028	NC_017527	GGC	3	9	564802	564810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001259
15029	NC_017527	C	7	7	564820	564826	0 %	0 %	0 %	100 %	386001259
15030	NC_017527	TCG	2	6	564840	564845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15031	NC_017527	GAC	2	6	564907	564912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15032	NC_017527	GCC	2	6	564922	564927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001259
15033	NC_017527	CAG	2	6	564961	564966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15034	NC_017527	G	8	8	564978	564985	0 %	0 %	100 %	0 %	386001259
15035	NC_017527	GAA	2	6	564991	564996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001259
15036	NC_017527	CGCCAC	2	12	565063	565074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386001259
15037	NC_017527	GGT	2	6	565092	565097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001259
15038	NC_017527	TCC	2	6	565137	565142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001259
15039	NC_017527	GAT	2	6	565165	565170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001259
15040	NC_017527	AGACCC	2	12	565194	565205	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386001259
15041	NC_017527	AAAG	2	8	565227	565234	75 %	0 %	25 %	0 %	386001259
15042	NC_017527	AGG	3	9	565247	565255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15043	NC_017527	GCCA	2	8	565322	565329	25 %	0 %	25 %	50 %	386001259
15044	NC_017527	GAC	2	6	565358	565363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15045	NC_017527	GCT	2	6	565385	565390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001259
15046	NC_017527	AGG	3	9	565406	565414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001259
15047	NC_017527	GGT	2	6	565419	565424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001259
15048	NC_017527	AT	3	6	565465	565470	50 %	50 %	0 %	0 %	386001259
15049	NC_017527	C	7	7	565507	565513	0 %	0 %	0 %	100 %	386001259
15050	NC_017527	GGA	3	9	565557	565565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_017527	GCG	2	6	565613	565618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_017527	TC	3	6	565625	565630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15053	NC_017527	TTC	2	6	565637	565642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_017527	CTC	2	6	565696	565701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001260
15055	NC_017527	GAG	2	6	565723	565728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15056	NC_017527	TCG	2	6	565742	565747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15057	NC_017527	GTC	2	6	565750	565755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15058	NC_017527	G	8	8	565836	565843	0 %	0 %	100 %	0 %	386001260
15059	NC_017527	CTCC	2	8	565911	565918	0 %	25 %	0 %	75 %	386001260
15060	NC_017527	ATC	2	6	565930	565935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001260
15061	NC_017527	TGG	2	6	565955	565960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001260
15062	NC_017527	CCA	2	6	565965	565970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001260
15063	NC_017527	TCC	2	6	565993	565998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001260
15064	NC_017527	GGC	2	6	566028	566033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15065	NC_017527	CGG	2	6	566067	566072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15066	NC_017527	G	6	6	566142	566147	0 %	0 %	100 %	0 %	386001260
15067	NC_017527	CGC	2	6	566280	566285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001260
15068	NC_017527	AAG	2	6	566293	566298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001260
15069	NC_017527	A	6	6	566311	566316	100 %	0 %	0 %	0 %	386001260
15070	NC_017527	TCG	2	6	566330	566335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15071	NC_017527	AG	3	6	566362	566367	50 %	0 %	50 %	0 %	386001260
15072	NC_017527	TCGA	2	8	566383	566390	25 %	25 %	25 %	25 %	386001260
15073	NC_017527	CGG	2	6	566418	566423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15074	NC_017527	CCA	2	6	566426	566431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001260
15075	NC_017527	CGG	2	6	566450	566455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15076	NC_017527	ATCGAT	2	12	566473	566484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386001260
15077	NC_017527	C	6	6	566516	566521	0 %	0 %	0 %	100 %	386001260
15078	NC_017527	CAC	2	6	566551	566556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001260
15079	NC_017527	ATC	2	6	566557	566562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001260
15080	NC_017527	G	6	6	566578	566583	0 %	0 %	100 %	0 %	386001260
15081	NC_017527	CCG	2	6	566588	566593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001260
15082	NC_017527	TGACGG	2	12	566633	566644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386001260
15083	NC_017527	GGA	2	6	566645	566650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15084	NC_017527	GAG	2	6	566659	566664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15085	NC_017527	GTC	2	6	566707	566712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15086	NC_017527	GGC	2	6	566743	566748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15087	NC_017527	GTCG	2	8	566784	566791	0 %	25 %	50 %	25 %	386001260
15088	NC_017527	CGG	2	6	566801	566806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15089	NC_017527	GAG	2	6	566857	566862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15090	NC_017527	TCG	2	6	566879	566884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15091	NC_017527	GCG	2	6	566885	566890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001260
15092	NC_017527	GGT	2	6	566892	566897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001260
15093	NC_017527	CGT	3	9	566907	566915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001260
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15100	NC_017527	ATCGAC	2	12	567130	567141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386001260
15101	NC_017527	GGA	2	6	567146	567151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15102	NC_017527	GAG	2	6	567186	567191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001260
15103	NC_017527	CAG	2	6	567246	567251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001260
15104	NC_017527	AGGT	2	8	567286	567293	25 %	25 %	50 %	0 %	386001260
15105	NC_017527	GA	3	6	567294	567299	50 %	0 %	50 %	0 %	386001261
15106	NC_017527	AGG	2	6	567324	567329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001261
15107	NC_017527	TCG	2	6	567360	567365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001261
15108	NC_017527	CTC	2	6	567541	567546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001261
15109	NC_017527	CCGG	2	8	567582	567589	0 %	0 %	50 %	50 %	386001261
15110	NC_017527	GTC	2	6	567599	567604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001261
15111	NC_017527	CCG	2	6	567642	567647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001261
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15114	NC_017527	GGCCC	2	10	567729	567738	0 %	0 %	40 %	60 %	386001261
15115	NC_017527	GAC	2	6	567742	567747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001261
15116	NC_017527	CTC	2	6	567752	567757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001261
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15118	NC_017527	AAG	2	6	567824	567829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001261
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15120	NC_017527	CTGA	2	8	567888	567895	25 %	25 %	25 %	25 %	386001261
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15211	NC_017527	TAT	2	6	570448	570453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15217	NC_017527	AAT	2	6	570580	570585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15219	NC_017527	TA	3	6	570672	570677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15220	NC_017527	CCG	2	6	570680	570685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15221	NC_017527	GA	3	6	570731	570736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_017527	AT	3	6	570746	570751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15223	NC_017527	ATC	2	6	570903	570908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15226	NC_017527	TGC	2	6	571007	571012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15230	NC_017527	CGA	2	6	571287	571292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001264
15231	NC_017527	TGA	2	6	571352	571357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001264
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15233	NC_017527	GAC	3	9	571387	571395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001264
15234	NC_017527	GGACC	2	10	571398	571407	20 %	0 %	40 %	40 %	386001264
15235	NC_017527	TGA	2	6	571499	571504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001264
15236	NC_017527	GCG	2	6	571508	571513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001264
15237	NC_017527	GTC	2	6	571516	571521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001264
15238	NC_017527	AAG	2	6	571585	571590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001264
15239	NC_017527	AAG	2	6	571606	571611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001264
15240	NC_017527	TCG	2	6	571613	571618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001264
15241	NC_017527	CCA	2	6	571670	571675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001264
15242	NC_017527	TC	3	6	571715	571720	0 %	50 %	0 %	50 %	386001264
15243	NC_017527	AAC	2	6	571786	571791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386001264
15244	NC_017527	GAC	2	6	571792	571797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001264
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15247	NC_017527	CCA	2	6	571991	571996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001264
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15251	NC_017527	CGC	2	6	572184	572189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001264
15252	NC_017527	TGA	2	6	572237	572242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001264
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15270	NC_017527	GAG	2	6	572902	572907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001264
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15277	NC_017527	TAA	2	6	573079	573084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001264
15278	NC_017527	TA	3	6	573125	573130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15279	NC_017527	CGGT	2	8	573214	573221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15280	NC_017527	GAA	2	6	573237	573242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15281	NC_017527	ATGG	2	8	573295	573302	25 %	25 %	50 %	0 %	386001265
15282	NC_017527	GCG	2	6	573411	573416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001265
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15284	NC_017527	CGGC	2	8	573457	573464	0 %	0 %	50 %	50 %	386001265
15285	NC_017527	AGA	2	6	573492	573497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001265
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15287	NC_017527	GTG	2	6	573650	573655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001265
15288	NC_017527	CCTATA	2	12	573690	573701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001265
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15311	NC_017527	AGGGG	2	10	574579	574588	20 %	0 %	80 %	0 %	386001266
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15320	NC_017527	CGT	3	9	574879	574887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001266
15321	NC_017527	TGG	2	6	574914	574919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001266
15322	NC_017527	GTC	2	6	574949	574954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001266
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15332	NC_017527	GTG	2	6	575441	575446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001266
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15334	NC_017527	ACGG	2	8	575606	575613	25 %	0 %	50 %	25 %	386001266
15335	NC_017527	GCCATC	2	12	575639	575650	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386001266
15336	NC_017527	TA	3	6	575698	575703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15337	NC_017527	C	9	9	575774	575782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15338	NC_017527	ATCCT	2	10	575799	575808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15339	NC_017527	TCCTGC	2	12	575819	575830	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15340	NC_017527	GTA	2	6	575916	575921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001267
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15343	NC_017527	GAC	2	6	575979	575984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001267
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15345	NC_017527	TCC	2	6	576012	576017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001267
15346	NC_017527	CGG	2	6	576068	576073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001267
15347	NC_017527	GCCGAC	2	12	576162	576173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386001267
15348	NC_017527	GGT	2	6	576201	576206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001267
15349	NC_017527	GGC	2	6	576246	576251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001267
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15351	NC_017527	GAT	2	6	576402	576407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001267
15352	NC_017527	C	7	7	576408	576414	0 %	0 %	0 %	100 %	386001267
15353	NC_017527	G	6	6	576422	576427	0 %	0 %	100 %	0 %	386001267
15354	NC_017527	TC	3	6	576448	576453	0 %	50 %	0 %	50 %	386001267
15355	NC_017527	GGA	2	6	576455	576460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001267
15356	NC_017527	TTC	2	6	576493	576498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15357	NC_017527	CT	3	6	576518	576523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15358	NC_017527	CGC	2	6	576584	576589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001268
15359	NC_017527	GAT	2	6	576662	576667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001268
15360	NC_017527	GTG	2	6	576740	576745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001268
15361	NC_017527	GGTC	2	8	576778	576785	0 %	25 %	50 %	25 %	386001268
15362	NC_017527	GAC	2	6	576842	576847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001268
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15364	NC_017527	CGGC	2	8	576875	576882	0 %	0 %	50 %	50 %	386001268
15365	NC_017527	CGATCT	2	12	576895	576906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386001268
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15400	NC_017527	ATA	2	6	578509	578514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15401	NC_017527	G	6	6	578521	578526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15479	NC_017527	GTC	2	6	581416	581421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15480	NC_017527	TGG	2	6	581442	581447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001271
15481	NC_017527	GCC	2	6	581449	581454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001271
15482	NC_017527	TGA	2	6	581481	581486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15483	NC_017527	AGTCGG	2	12	581568	581579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386001271
15484	NC_017527	TCC	2	6	581661	581666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001271
15485	NC_017527	GTCCTG	2	12	581744	581755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15486	NC_017527	AGG	2	6	581813	581818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001271
15487	NC_017527	CGA	2	6	581826	581831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15488	NC_017527	GTA	2	6	581884	581889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001271
15489	NC_017527	CGA	2	6	581919	581924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15490	NC_017527	GGCGG	2	10	581947	581956	0 %	0 %	80 %	20 %	386001271
15491	NC_017527	TCG	2	6	581999	582004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15492	NC_017527	GAC	2	6	582007	582012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
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15494	NC_017527	ATC	2	6	582050	582055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001271
15495	NC_017527	CTG	2	6	582133	582138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271
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15497	NC_017527	CCG	2	6	582213	582218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001271
15498	NC_017527	TCC	2	6	582239	582244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001271
15499	NC_017527	CGA	2	6	582255	582260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001271
15500	NC_017527	TCG	2	6	582267	582272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001271

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