MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017527	CCA	2	6	544042	544047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14502	NC_017527	TCC	2	6	544099	544104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14503	NC_017527	CTT	2	6	544243	544248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001243
14504	NC_017527	TCCC	2	8	544314	544321	0 %	25 %	0 %	75 %	386001243
14505	NC_017527	CAC	3	9	544327	544335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001243
14506	NC_017527	GGC	2	6	544351	544356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001243
14507	NC_017527	CCA	2	6	544386	544391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001243
14508	NC_017527	CGA	2	6	544497	544502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001243
14509	NC_017527	TCC	2	6	544517	544522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001243
14510	NC_017527	TCT	2	6	544578	544583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001243
14511	NC_017527	TCC	2	6	544593	544598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_017527	CGA	2	6	544685	544690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_017527	GAT	2	6	544709	544714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001244
14514	NC_017527	A	6	6	544718	544723	100 %	0 %	0 %	0 %	386001244
14515	NC_017527	A	7	7	544728	544734	100 %	0 %	0 %	0 %	386001244
14516	NC_017527	CGG	2	6	544759	544764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001244
14517	NC_017527	GGC	2	6	544777	544782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001244
14518	NC_017527	CGG	2	6	544847	544852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001244
14519	NC_017527	CGA	2	6	544886	544891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001244
14520	NC_017527	CCA	2	6	544937	544942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001244
14521	NC_017527	TCG	2	6	544957	544962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001244
14522	NC_017527	G	7	7	545042	545048	0 %	0 %	100 %	0 %	386001244
14523	NC_017527	AGC	2	6	545056	545061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001244
14524	NC_017527	GAG	2	6	545093	545098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001244
14525	NC_017527	TTC	2	6	545166	545171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001244
14526	NC_017527	AG	3	6	545238	545243	50 %	0 %	50 %	0 %	386001244
14527	NC_017527	GGC	2	6	545252	545257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001244
14528	NC_017527	TCCG	2	8	545265	545272	0 %	25 %	25 %	50 %	386001244
14529	NC_017527	CTC	2	6	545274	545279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001244
14530	NC_017527	GGA	2	6	545294	545299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001244
14531	NC_017527	CGG	2	6	545309	545314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001244
14532	NC_017527	GAAGA	2	10	545325	545334	60 %	0 %	40 %	0 %	386001244
14533	NC_017527	TGG	2	6	545366	545371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001244
14534	NC_017527	TCT	2	6	545425	545430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_017527	GGAGG	2	10	545474	545483	20 %	0 %	80 %	0 %	386001245
14536	NC_017527	CCT	2	6	545502	545507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14537	NC_017527	TTC	2	6	545547	545552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14538	NC_017527	A	6	6	545584	545589	100 %	0 %	0 %	0 %	386001245
14539	NC_017527	AGG	2	6	545626	545631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001245
14540	NC_017527	CG	3	6	545723	545728	0 %	0 %	50 %	50 %	386001245
14541	NC_017527	CAT	2	6	545778	545783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14542	NC_017527	CTT	2	6	545838	545843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14543	NC_017527	GCGATC	2	12	545887	545898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14544	NC_017527	CT	3	6	545899	545904	0 %	50 %	0 %	50 %	386001245
14545	NC_017527	GGT	2	6	545946	545951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001245
14546	NC_017527	GCCG	2	8	545964	545971	0 %	0 %	50 %	50 %	386001245
14547	NC_017527	CCT	2	6	545982	545987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14548	NC_017527	GGGA	2	8	546021	546028	25 %	0 %	75 %	0 %	386001245
14549	NC_017527	CGG	2	6	546032	546037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001245
14550	NC_017527	CGC	2	6	546117	546122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001245
14551	NC_017527	TCC	2	6	546128	546133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14552	NC_017527	CAC	2	6	546138	546143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001245
14553	NC_017527	CTT	2	6	546153	546158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14554	NC_017527	GCC	2	6	546199	546204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001245
14555	NC_017527	GGA	2	6	546209	546214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001245
14556	NC_017527	CTGC	2	8	546249	546256	0 %	25 %	25 %	50 %	386001245
14557	NC_017527	ATC	2	6	546319	546324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14558	NC_017527	GGA	2	6	546368	546373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001245
14559	NC_017527	CTT	2	6	546408	546413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14560	NC_017527	CGGCTT	2	12	546456	546467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14561	NC_017527	TCG	2	6	546503	546508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14562	NC_017527	ATC	2	6	546511	546516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14563	NC_017527	CCAG	2	8	546542	546549	25 %	0 %	25 %	50 %	386001245
14564	NC_017527	GTC	3	9	546607	546615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14565	NC_017527	CGGC	2	8	546662	546669	0 %	0 %	50 %	50 %	386001245
14566	NC_017527	CCA	2	6	546704	546709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001245
14567	NC_017527	TCCA	2	8	546742	546749	25 %	25 %	0 %	50 %	386001245
14568	NC_017527	CTC	3	9	546814	546822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14569	NC_017527	CGG	2	6	546832	546837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001245
14570	NC_017527	GAC	2	6	546838	546843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14571	NC_017527	ATC	2	6	546883	546888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14572	NC_017527	CTA	3	9	546921	546929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14573	NC_017527	TCC	2	6	546971	546976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14574	NC_017527	GTC	2	6	547032	547037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14575	NC_017527	CAT	2	6	547065	547070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001245
14576	NC_017527	GTC	2	6	547081	547086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14577	NC_017527	TGG	2	6	547094	547099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001245
14578	NC_017527	GCC	2	6	547269	547274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001245
14579	NC_017527	TGG	2	6	547324	547329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001245
14580	NC_017527	CAG	2	6	547387	547392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14581	NC_017527	CTT	2	6	547434	547439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14582	NC_017527	CGGAGG	2	12	547457	547468	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386001245
14583	NC_017527	GGC	2	6	547473	547478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001245
14584	NC_017527	GCC	2	6	547567	547572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001245
14585	NC_017527	CTT	2	6	547680	547685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001245
14586	NC_017527	GACGG	2	10	547687	547696	20 %	0 %	60 %	20 %	386001245
14587	NC_017527	AGG	2	6	547709	547714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001245
14588	NC_017527	AGA	2	6	547769	547774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001245
14589	NC_017527	CTC	2	6	547795	547800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001245
14590	NC_017527	GGGGC	2	10	547821	547830	0 %	0 %	80 %	20 %	386001245
14591	NC_017527	GCG	2	6	547834	547839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001245
14592	NC_017527	GGT	2	6	547845	547850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001245
14593	NC_017527	GGGCAG	2	12	548043	548054	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386001245
14594	NC_017527	CCG	3	9	548078	548086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001245
14595	NC_017527	TCG	2	6	548108	548113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001245
14596	NC_017527	AG	3	6	548136	548141	50 %	0 %	50 %	0 %	386001245
14597	NC_017527	CCA	2	6	548147	548152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001245
14598	NC_017527	GAG	2	6	548209	548214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001245
14599	NC_017527	ATG	2	6	548262	548267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001245
14600	NC_017527	CTC	2	6	548268	548273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001246
14601	NC_017527	GAG	2	6	548274	548279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14602	NC_017527	TCC	2	6	548329	548334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001246
14603	NC_017527	GGA	2	6	548348	548353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14604	NC_017527	AGG	2	6	548410	548415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14605	NC_017527	TCG	2	6	548437	548442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001246
14606	NC_017527	CGC	2	6	548443	548448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001246
14607	NC_017527	CCT	2	6	548537	548542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001246
14608	NC_017527	CGG	2	6	548597	548602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001246
14609	NC_017527	AGG	2	6	548623	548628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14610	NC_017527	CGG	2	6	548629	548634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001246
14611	NC_017527	GATC	2	8	548690	548697	25 %	25 %	25 %	25 %	386001246
14612	NC_017527	GAGG	2	8	548699	548706	25 %	0 %	75 %	0 %	386001246
14613	NC_017527	GGA	2	6	548768	548773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14614	NC_017527	C	7	7	548804	548810	0 %	0 %	0 %	100 %	386001246
14615	NC_017527	CCA	2	6	548884	548889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001246
14616	NC_017527	GGA	2	6	548945	548950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001246
14617	NC_017527	TC	3	6	548979	548984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14618	NC_017527	CTC	3	9	548982	548990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14619	NC_017527	TTTTC	2	10	548995	549004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14620	NC_017527	GC	3	6	549024	549029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_017527	CGG	2	6	549060	549065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_017527	AT	3	6	549075	549080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_017527	ATC	2	6	549130	549135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14722	NC_017527	TCCC	2	8	553024	553031	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14723	NC_017527	ATAA	2	8	553051	553058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14724	NC_017527	TCC	2	6	553071	553076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14983	NC_017527	GCCCC	2	10	563461	563470	0 %	0 %	20 %	80 %	386001258
14984	NC_017527	CAC	2	6	563471	563476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001258
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14990	NC_017527	GCC	2	6	563754	563759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001259
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