MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017527	CCT	2	6	506573	506578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001209
13502	NC_017527	GGC	2	6	506585	506590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001209
13503	NC_017527	AGT	2	6	506662	506667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001209
13504	NC_017527	AGTAGC	2	12	506740	506751	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386001209
13505	NC_017527	CCG	2	6	506784	506789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001209
13506	NC_017527	GGGCGG	2	12	506863	506874	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
13507	NC_017527	GAT	2	6	506876	506881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_017527	GGA	2	6	506905	506910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_017527	CCT	2	6	506930	506935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_017527	CGC	2	6	506947	506952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13511	NC_017527	GAA	2	6	506997	507002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001210
13512	NC_017527	ATC	2	6	507046	507051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001210
13513	NC_017527	TCCA	2	8	507066	507073	25 %	25 %	0 %	50 %	386001210
13514	NC_017527	CTG	2	6	507084	507089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001210
13515	NC_017527	TCC	2	6	507091	507096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001210
13516	NC_017527	AAT	2	6	507111	507116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001210
13517	NC_017527	GAC	2	6	507166	507171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001210
13518	NC_017527	TCACCT	2	12	507176	507187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386001210
13519	NC_017527	CGG	2	6	507192	507197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001210
13520	NC_017527	CTC	2	6	507205	507210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001210
13521	NC_017527	CGG	2	6	507401	507406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001210
13522	NC_017527	CACCTC	2	12	507483	507494	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386001210
13523	NC_017527	AGG	2	6	507506	507511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001210
13524	NC_017527	CTT	3	9	507522	507530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001210
13525	NC_017527	TCCC	2	8	507567	507574	0 %	25 %	0 %	75 %	386001210
13526	NC_017527	CGA	2	6	507582	507587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001210
13527	NC_017527	CCCT	2	8	507602	507609	0 %	25 %	0 %	75 %	386001210
13528	NC_017527	CTC	2	6	507628	507633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001210
13529	NC_017527	CCT	2	6	507639	507644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001210
13530	NC_017527	CCGG	2	8	507716	507723	0 %	0 %	50 %	50 %	386001210
13531	NC_017527	GAC	2	6	507754	507759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001210
13532	NC_017527	TCCC	2	8	507849	507856	0 %	25 %	0 %	75 %	386001210
13533	NC_017527	AGG	2	6	507886	507891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001210
13534	NC_017527	GCC	2	6	507935	507940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001210
13535	NC_017527	CGG	2	6	507990	507995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001210
13536	NC_017527	CGA	2	6	508044	508049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001210
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13538	NC_017527	TC	3	6	508197	508202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13539	NC_017527	TCCCT	2	10	508204	508213	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13540	NC_017527	GCC	2	6	508217	508222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13541	NC_017527	ACC	2	6	508253	508258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_017527	TCTCT	2	10	508264	508273	0 %	60 %	0 %	40 %	386001211
13543	NC_017527	AGG	2	6	508303	508308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
13544	NC_017527	CGA	2	6	508316	508321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001211
13545	NC_017527	GAG	3	9	508371	508379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
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13547	NC_017527	CTCG	2	8	508422	508429	0 %	25 %	25 %	50 %	386001211
13548	NC_017527	CCA	2	6	508442	508447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001211
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13550	NC_017527	GAT	2	6	508464	508469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001211
13551	NC_017527	ATG	2	6	508495	508500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001211
13552	NC_017527	C	6	6	508517	508522	0 %	0 %	0 %	100 %	386001211
13553	NC_017527	GGC	2	6	508533	508538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001211
13554	NC_017527	GAGG	2	8	508563	508570	25 %	0 %	75 %	0 %	386001211
13555	NC_017527	AGG	3	9	508582	508590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
13556	NC_017527	CCA	2	6	508595	508600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001211
13557	NC_017527	GAG	2	6	508624	508629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
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13560	NC_017527	GGA	2	6	508769	508774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
13561	NC_017527	GAG	3	9	508794	508802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001211
13562	NC_017527	GAC	2	6	508836	508841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001211
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13564	NC_017527	AGGA	2	8	508867	508874	50 %	0 %	50 %	0 %	386001211
13565	NC_017527	GCC	2	6	508921	508926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001211
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13569	NC_017527	CAT	2	6	509010	509015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001211
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13572	NC_017527	GTA	2	6	509145	509150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001211
13573	NC_017527	CGA	2	6	509156	509161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001211
13574	NC_017527	GA	4	8	509160	509167	50 %	0 %	50 %	0 %	386001211
13575	NC_017527	CGT	2	6	509213	509218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001211
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13577	NC_017527	GCC	2	6	509253	509258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13579	NC_017527	GGC	2	6	509375	509380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13584	NC_017527	CTC	2	6	509584	509589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001212
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13586	NC_017527	CGA	2	6	509710	509715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001212
13587	NC_017527	CGT	2	6	509719	509724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001212
13588	NC_017527	GAA	2	6	509752	509757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001212
13589	NC_017527	CTA	2	6	509773	509778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001212
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13591	NC_017527	CGGG	2	8	509828	509835	0 %	0 %	75 %	25 %	386001212
13592	NC_017527	GTG	2	6	509858	509863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001212
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13601	NC_017527	TGG	2	6	510024	510029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001212
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13603	NC_017527	GAG	2	6	510098	510103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
13604	NC_017527	TCC	2	6	510123	510128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001212
13605	NC_017527	AGG	2	6	510144	510149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
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13607	NC_017527	CGAT	3	12	510194	510205	25 %	25 %	25 %	25 %	386001212
13608	NC_017527	CTC	2	6	510247	510252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001212
13609	NC_017527	GGA	2	6	510256	510261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
13610	NC_017527	ACG	2	6	510279	510284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001212
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13613	NC_017527	TGG	2	6	510333	510338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001212
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13615	NC_017527	TCGGC	2	10	510442	510451	0 %	20 %	40 %	40 %	386001212
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13618	NC_017527	AG	3	6	510554	510559	50 %	0 %	50 %	0 %	386001212
13619	NC_017527	CGT	2	6	510610	510615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001212
13620	NC_017527	GGA	2	6	510628	510633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
13621	NC_017527	GGC	2	6	510646	510651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001212
13622	NC_017527	TGA	2	6	510657	510662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001212
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13627	NC_017527	CGAGG	2	10	510736	510745	20 %	0 %	60 %	20 %	386001212
13628	NC_017527	CGGC	2	8	510784	510791	0 %	0 %	50 %	50 %	386001212
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13640	NC_017527	TCG	2	6	511269	511274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001212
13641	NC_017527	TCC	2	6	511290	511295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001212
13642	NC_017527	TGG	2	6	511326	511331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001212
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13644	NC_017527	G	6	6	511408	511413	0 %	0 %	100 %	0 %	386001212
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13653	NC_017527	CTGGAG	2	12	511688	511699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386001212
13654	NC_017527	CGC	2	6	511705	511710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001212
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13656	NC_017527	GA	3	6	511752	511757	50 %	0 %	50 %	0 %	386001212
13657	NC_017527	GAG	2	6	511781	511786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
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13669	NC_017527	CGG	3	9	512208	512216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001212
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13672	NC_017527	GCGG	2	8	512257	512264	0 %	0 %	75 %	25 %	386001212
13673	NC_017527	GGA	2	6	512293	512298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
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13676	NC_017527	GAG	2	6	512387	512392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
13677	NC_017527	CGG	2	6	512411	512416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001212
13678	NC_017527	CGG	2	6	512432	512437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001212
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13682	NC_017527	GAG	2	6	512600	512605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
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13685	NC_017527	GCCC	2	8	512737	512744	0 %	0 %	25 %	75 %	386001212
13686	NC_017527	CGA	2	6	512758	512763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001212
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13690	NC_017527	AGG	2	6	512874	512879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001212
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13692	NC_017527	AAC	2	6	512912	512917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386001212
13693	NC_017527	GT	3	6	512936	512941	0 %	50 %	50 %	0 %	386001212
13694	NC_017527	CTG	2	6	513013	513018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001213
13695	NC_017527	G	6	6	513032	513037	0 %	0 %	100 %	0 %	386001213
13696	NC_017527	GGACCT	2	12	513051	513062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001213
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13703	NC_017527	C	7	7	513228	513234	0 %	0 %	0 %	100 %	386001213
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13709	NC_017527	GAG	2	6	513310	513315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001213
13710	NC_017527	GGCG	2	8	513332	513339	0 %	0 %	75 %	25 %	386001213
13711	NC_017527	GGA	2	6	513396	513401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001213
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13713	NC_017527	GGA	2	6	513437	513442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001213
13714	NC_017527	GCG	2	6	513478	513483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001213
13715	NC_017527	CCT	2	6	513540	513545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001213
13716	NC_017527	GAG	2	6	513558	513563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001213
13717	NC_017527	AGG	2	6	513610	513615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001213
13718	NC_017527	CGG	2	6	513621	513626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001213
13719	NC_017527	GGC	2	6	513639	513644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001213
13720	NC_017527	GAC	2	6	513654	513659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13721	NC_017527	GGCG	2	8	513663	513670	0 %	0 %	75 %	25 %	386001214
13722	NC_017527	GGC	2	6	513717	513722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001214
13723	NC_017527	GGT	2	6	513723	513728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001214
13724	NC_017527	CGG	3	9	513764	513772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001214
13725	NC_017527	GGGC	2	8	513851	513858	0 %	0 %	75 %	25 %	386001214
13726	NC_017527	TGAGGG	2	12	514019	514030	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386001214
13727	NC_017527	AGG	2	6	514091	514096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001214
13728	NC_017527	GGA	2	6	514097	514102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001214
13729	NC_017527	ATC	2	6	514108	514113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001214
13730	NC_017527	ACC	3	9	514114	514122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001214
13731	NC_017527	CGA	2	6	514155	514160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001214
13732	NC_017527	AGG	2	6	514174	514179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001214
13733	NC_017527	ACG	2	6	514250	514255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001214
13734	NC_017527	TGG	2	6	514289	514294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001214
13735	NC_017527	ACT	2	6	514355	514360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001214
13736	NC_017527	CGG	2	6	514361	514366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001214
13737	NC_017527	GCT	2	6	514414	514419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001214
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13978	NC_017527	AGG	2	6	523877	523882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001219
13979	NC_017527	TGT	2	6	523956	523961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386001219
13980	NC_017527	GGA	3	9	523971	523979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001219
13981	NC_017527	TGG	2	6	524004	524009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001219
13982	NC_017527	AGA	2	6	524012	524017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001219
13983	NC_017527	TCTCC	2	10	524040	524049	0 %	40 %	0 %	60 %	386001219
13984	NC_017527	CCA	2	6	524097	524102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001219
13985	NC_017527	TCG	2	6	524120	524125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001219
13986	NC_017527	CGAT	2	8	524142	524149	25 %	25 %	25 %	25 %	386001219
13987	NC_017527	CAC	3	9	524170	524178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001219
13988	NC_017527	CGA	2	6	524190	524195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001219
13989	NC_017527	CCT	2	6	524214	524219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001219
13990	NC_017527	ATC	2	6	524231	524236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001219
13991	NC_017527	TTC	2	6	524252	524257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001219
13992	NC_017527	GAGG	2	8	524269	524276	25 %	0 %	75 %	0 %	386001219
13993	NC_017527	GGA	2	6	524524	524529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001219
13994	NC_017527	CTC	3	9	524569	524577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001219
13995	NC_017527	CCA	2	6	524598	524603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001219
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13999	NC_017527	CCT	2	6	524703	524708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001219
14000	NC_017527	GTG	2	6	524783	524788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001219

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