MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017527	CGA	4	12	448983	448994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001143
12002	NC_017527	TGG	4	12	449036	449047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001143
12003	NC_017527	TC	3	6	449113	449118	0 %	50 %	0 %	50 %	386001143
12004	NC_017527	CGGCG	2	10	449128	449137	0 %	0 %	60 %	40 %	386001143
12005	NC_017527	CCT	2	6	449175	449180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001143
12006	NC_017527	ACG	2	6	449186	449191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001143
12007	NC_017527	GCG	2	6	449192	449197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001143
12008	NC_017527	AAG	2	6	449198	449203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001143
12009	NC_017527	TCC	2	6	449237	449242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001143
12010	NC_017527	GAT	2	6	449247	449252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001143
12011	NC_017527	CAT	2	6	449365	449370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001144
12012	NC_017527	CAC	2	6	449404	449409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001144
12013	NC_017527	TCG	2	6	449411	449416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12014	NC_017527	CGA	2	6	449475	449480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12015	NC_017527	CGG	2	6	449488	449493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001144
12016	NC_017527	CAC	2	6	449524	449529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001144
12017	NC_017527	CGA	2	6	449544	449549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12018	NC_017527	GAC	2	6	449578	449583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12019	NC_017527	CGA	2	6	449595	449600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12020	NC_017527	GTC	2	6	449725	449730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001144
12021	NC_017527	GAT	3	9	449734	449742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001144
12022	NC_017527	CGGA	2	8	449762	449769	25 %	0 %	50 %	25 %	386001144
12023	NC_017527	GCC	2	6	449825	449830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001144
12024	NC_017527	TGG	2	6	449856	449861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001144
12025	NC_017527	ATC	2	6	449906	449911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001144
12026	NC_017527	ATC	3	9	449955	449963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_017527	TGG	2	6	449966	449971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_017527	CGAC	2	8	449982	449989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12029	NC_017527	GGA	2	6	449997	450002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_017527	ATA	2	6	450017	450022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_017527	GATAC	2	10	450172	450181	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12032	NC_017527	TAA	2	6	450184	450189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_017527	CAA	2	6	450197	450202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12034	NC_017527	GGAG	2	8	450225	450232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_017527	GAGC	2	8	450274	450281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12036	NC_017527	GCC	2	6	450339	450344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001145
12037	NC_017527	GAT	2	6	450357	450362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001145
12038	NC_017527	ATC	2	6	450379	450384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12039	NC_017527	GGCCAT	2	12	450471	450482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001145
12040	NC_017527	CCA	2	6	450563	450568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001145
12041	NC_017527	GCG	2	6	450596	450601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12042	NC_017527	GGCT	2	8	450604	450611	0 %	25 %	50 %	25 %	386001145
12043	NC_017527	GGC	2	6	450612	450617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12044	NC_017527	CCT	2	6	450626	450631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001145
12045	NC_017527	CGA	2	6	450635	450640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001145
12046	NC_017527	GC	3	6	450695	450700	0 %	0 %	50 %	50 %	386001145
12047	NC_017527	TCG	2	6	450778	450783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001145
12048	NC_017527	CAT	2	6	450786	450791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12049	NC_017527	CAG	2	6	450801	450806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001145
12050	NC_017527	CAT	2	6	450840	450845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12051	NC_017527	TCA	3	9	450866	450874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12052	NC_017527	C	7	7	450906	450912	0 %	0 %	0 %	100 %	386001145
12053	NC_017527	ACCGC	2	10	450937	450946	20 %	0 %	20 %	60 %	386001145
12054	NC_017527	CCA	2	6	450950	450955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001145
12055	NC_017527	CGG	2	6	451115	451120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12056	NC_017527	AGG	2	6	451121	451126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001145
12057	NC_017527	TCC	2	6	451142	451147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001145
12058	NC_017527	GCG	2	6	451228	451233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12059	NC_017527	ATCCT	2	10	451234	451243	20 %	40 %	0 %	40 %	386001145
12060	NC_017527	GGC	2	6	451257	451262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12061	NC_017527	ACT	2	6	451283	451288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12062	NC_017527	CGG	2	6	451338	451343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001145
12063	NC_017527	CTT	2	6	451377	451382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001145
12064	NC_017527	CAT	2	6	451443	451448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001145
12065	NC_017527	G	6	6	451450	451455	0 %	0 %	100 %	0 %	386001145
12066	NC_017527	CCT	2	6	451479	451484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001145
12067	NC_017527	CTT	2	6	451500	451505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001145
12068	NC_017527	TCG	3	9	451538	451546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001145
12069	NC_017527	GAG	2	6	451580	451585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001145
12070	NC_017527	GAG	2	6	451615	451620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_017527	CCA	2	6	451671	451676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001146
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12073	NC_017527	TTC	2	6	451715	451720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001146
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12075	NC_017527	CGG	2	6	451747	451752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001146
12076	NC_017527	CT	3	6	451764	451769	0 %	50 %	0 %	50 %	386001146
12077	NC_017527	AT	3	6	451784	451789	50 %	50 %	0 %	0 %	386001146
12078	NC_017527	TCA	2	6	451797	451802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001146
12079	NC_017527	TCTCC	2	10	451807	451816	0 %	40 %	0 %	60 %	386001146
12080	NC_017527	GAG	2	6	451840	451845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001146
12081	NC_017527	GGC	2	6	451851	451856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001146
12082	NC_017527	GGAGG	2	10	451944	451953	20 %	0 %	80 %	0 %	386001146
12083	NC_017527	GAG	2	6	452032	452037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001146
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12085	NC_017527	GAG	2	6	452047	452052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001146
12086	NC_017527	TCG	2	6	452054	452059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001146
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12088	NC_017527	A	6	6	452136	452141	100 %	0 %	0 %	0 %	386001146
12089	NC_017527	TCT	2	6	452196	452201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001146
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12091	NC_017527	AGG	2	6	452274	452279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001146
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12094	NC_017527	CCGT	2	8	452366	452373	0 %	25 %	25 %	50 %	386001146
12095	NC_017527	CGA	2	6	452400	452405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001146
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12101	NC_017527	TCG	2	6	452495	452500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001146
12102	NC_017527	CGC	2	6	452513	452518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001146
12103	NC_017527	CTC	2	6	452560	452565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001146
12104	NC_017527	GACGG	2	10	452605	452614	20 %	0 %	60 %	20 %	386001146
12105	NC_017527	GAG	2	6	452623	452628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001146
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12107	NC_017527	C	7	7	452722	452728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12108	NC_017527	CGG	2	6	452757	452762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001147
12109	NC_017527	AGG	2	6	452795	452800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001147
12110	NC_017527	TGG	2	6	452838	452843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001147
12111	NC_017527	CGC	2	6	452852	452857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001147
12112	NC_017527	GAG	2	6	452870	452875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001147
12113	NC_017527	CGG	2	6	452944	452949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001147
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12116	NC_017527	AGT	2	6	453052	453057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001147
12117	NC_017527	TCT	2	6	453073	453078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001147
12118	NC_017527	CT	3	6	453077	453082	0 %	50 %	0 %	50 %	386001147
12119	NC_017527	CTC	2	6	453104	453109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001147
12120	NC_017527	CGA	2	6	453112	453117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001147
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12141	NC_017527	ATC	3	9	453856	453864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12143	NC_017527	AGCG	2	8	453962	453969	25 %	0 %	50 %	25 %	386001148
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12241	NC_017527	GAG	2	6	457650	457655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001152
12242	NC_017527	TGG	2	6	457658	457663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001152
12243	NC_017527	C	6	6	457703	457708	0 %	0 %	0 %	100 %	386001152
12244	NC_017527	TCG	2	6	457741	457746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001152
12245	NC_017527	AGG	2	6	457777	457782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001152
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12272	NC_017527	CTT	2	6	458769	458774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001152
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12280	NC_017527	GCC	2	6	459300	459305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12281	NC_017527	CGG	2	6	459314	459319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12282	NC_017527	GAG	2	6	459364	459369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001153
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12340	NC_017527	C	8	8	461429	461436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12341	NC_017527	CGG	2	6	461440	461445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12342	NC_017527	GATC	2	8	461471	461478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12343	NC_017527	GCC	2	6	461494	461499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12344	NC_017527	GGC	2	6	461500	461505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12345	NC_017527	GCG	2	6	461513	461518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12346	NC_017527	CTTT	2	8	461538	461545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12347	NC_017527	TCG	2	6	461587	461592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12348	NC_017527	A	6	6	461620	461625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12349	NC_017527	GAG	2	6	461634	461639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12350	NC_017527	GTT	2	6	461693	461698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12351	NC_017527	AGCTGA	2	12	461823	461834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386001154
12352	NC_017527	GA	3	6	461859	461864	50 %	0 %	50 %	0 %	386001154
12353	NC_017527	AGGA	2	8	461896	461903	50 %	0 %	50 %	0 %	386001154
12354	NC_017527	GAT	2	6	462035	462040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001154
12355	NC_017527	CCG	2	6	462121	462126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001154
12356	NC_017527	C	6	6	462156	462161	0 %	0 %	0 %	100 %	386001154
12357	NC_017527	GAA	2	6	462202	462207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001154
12358	NC_017527	TCC	2	6	462219	462224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001154
12359	NC_017527	TGA	2	6	462297	462302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001154
12360	NC_017527	CCT	2	6	462322	462327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001154
12361	NC_017527	CGA	2	6	462328	462333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001154
12362	NC_017527	CTC	2	6	462365	462370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001154
12363	NC_017527	TCAGGC	2	12	462384	462395	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386001154
12364	NC_017527	TCCT	2	8	462437	462444	0 %	50 %	0 %	50 %	386001154
12365	NC_017527	ACG	2	6	462465	462470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001154
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12367	NC_017527	ATCT	2	8	462497	462504	25 %	50 %	0 %	25 %	386001154
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12369	NC_017527	TAC	2	6	462545	462550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001154
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12372	NC_017527	TCG	2	6	462672	462677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001154
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12408	NC_017527	TCC	2	6	463696	463701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001155
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12464	NC_017527	CAT	3	9	465690	465698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001155
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12467	NC_017527	C	6	6	465744	465749	0 %	0 %	0 %	100 %	386001155
12468	NC_017527	TCCA	2	8	465843	465850	25 %	25 %	0 %	50 %	386001156
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12472	NC_017527	TGG	2	6	465963	465968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001156
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12477	NC_017527	C	9	9	466093	466101	0 %	0 %	0 %	100 %	386001156
12478	NC_017527	GGC	2	6	466126	466131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001156
12479	NC_017527	TCC	2	6	466155	466160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001156
12480	NC_017527	GTT	2	6	466210	466215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386001156
12481	NC_017527	ATG	2	6	466232	466237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001156
12482	NC_017527	CCT	2	6	466298	466303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12483	NC_017527	TC	3	6	466318	466323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12484	NC_017527	TGA	2	6	466335	466340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12485	NC_017527	TCCG	2	8	466366	466373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12486	NC_017527	AAT	2	6	466406	466411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12487	NC_017527	GAC	2	6	466437	466442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12488	NC_017527	CCT	2	6	466449	466454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12489	NC_017527	GGAG	2	8	466492	466499	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_017527	GCC	2	6	466599	466604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001157
12491	NC_017527	TCC	2	6	466624	466629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001157
12492	NC_017527	GAT	2	6	466770	466775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001157
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12499	NC_017527	AT	3	6	467198	467203	50 %	50 %	0 %	0 %	386001157
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