MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017527	TCC	2	6	411176	411181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001103
11002	NC_017527	CCT	2	6	411226	411231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001103
11003	NC_017527	AGG	2	6	411236	411241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001103
11004	NC_017527	TCG	3	9	411242	411250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001103
11005	NC_017527	TCCTC	2	10	411309	411318	0 %	40 %	0 %	60 %	386001103
11006	NC_017527	C	6	6	411327	411332	0 %	0 %	0 %	100 %	386001103
11007	NC_017527	CT	3	6	411350	411355	0 %	50 %	0 %	50 %	386001103
11008	NC_017527	CTC	3	9	411362	411370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001103
11009	NC_017527	CCT	2	6	411435	411440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001103
11010	NC_017527	GCC	3	9	411449	411457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001103
11011	NC_017527	GAG	2	6	411510	411515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001104
11012	NC_017527	CCT	2	6	411590	411595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001104
11013	NC_017527	AGAGA	2	10	411639	411648	60 %	0 %	40 %	0 %	386001104
11014	NC_017527	GTC	2	6	411753	411758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001104
11015	NC_017527	CGG	2	6	411794	411799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001104
11016	NC_017527	TCG	2	6	412159	412164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001104
11017	NC_017527	CCT	2	6	412240	412245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_017527	GA	3	6	412249	412254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_017527	CT	3	6	412294	412299	0 %	50 %	0 %	50 %	386001105
11020	NC_017527	GAA	2	6	412327	412332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001105
11021	NC_017527	TCG	2	6	412346	412351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001105
11022	NC_017527	CCA	2	6	412372	412377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001105
11023	NC_017527	TGG	3	9	412416	412424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001105
11024	NC_017527	GCCC	2	8	412429	412436	0 %	0 %	25 %	75 %	386001105
11025	NC_017527	CT	3	6	412470	412475	0 %	50 %	0 %	50 %	386001105
11026	NC_017527	CTG	2	6	412484	412489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001105
11027	NC_017527	CTC	2	6	412502	412507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001105
11028	NC_017527	ACTC	2	8	412609	412616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11029	NC_017527	GGA	2	6	412649	412654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001106
11030	NC_017527	GTC	2	6	412761	412766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001106
11031	NC_017527	CGG	2	6	412775	412780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001106
11032	NC_017527	GCTG	2	8	412862	412869	0 %	25 %	50 %	25 %	386001106
11033	NC_017527	TGG	2	6	412876	412881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001106
11034	NC_017527	CCCTC	2	10	412894	412903	0 %	20 %	0 %	80 %	386001106
11035	NC_017527	CGA	2	6	412934	412939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001106
11036	NC_017527	ATC	2	6	412959	412964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001106
11037	NC_017527	GGC	2	6	412991	412996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001106
11038	NC_017527	G	6	6	413035	413040	0 %	0 %	100 %	0 %	386001106
11039	NC_017527	TGG	2	6	413068	413073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001106
11040	NC_017527	GGTCCT	2	12	413129	413140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001106
11041	NC_017527	GGC	2	6	413157	413162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001106
11042	NC_017527	CGA	2	6	413171	413176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001106
11043	NC_017527	AGG	3	9	413191	413199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001106
11044	NC_017527	TGG	2	6	413254	413259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001106
11045	NC_017527	CTC	2	6	413461	413466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001107
11046	NC_017527	CTC	2	6	413479	413484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001107
11047	NC_017527	C	6	6	413583	413588	0 %	0 %	0 %	100 %	386001107
11048	NC_017527	CGG	2	6	413631	413636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001107
11049	NC_017527	ACG	2	6	413645	413650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001107
11050	NC_017527	CCT	2	6	413666	413671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_017527	TCG	2	6	413748	413753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001108
11052	NC_017527	GCA	2	6	413777	413782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001108
11053	NC_017527	AGGT	2	8	413796	413803	25 %	25 %	50 %	0 %	386001108
11054	NC_017527	C	8	8	413806	413813	0 %	0 %	0 %	100 %	386001108
11055	NC_017527	TGT	2	6	413830	413835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386001108
11056	NC_017527	CCT	2	6	413855	413860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001108
11057	NC_017527	CGA	2	6	413896	413901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001108
11058	NC_017527	GAG	2	6	413933	413938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001108
11059	NC_017527	GAC	2	6	414005	414010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001108
11060	NC_017527	AT	3	6	414033	414038	50 %	50 %	0 %	0 %	386001108
11061	NC_017527	ACC	2	6	414056	414061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_017527	CGG	2	6	414103	414108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_017527	G	7	7	414128	414134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_017527	TCGGC	2	10	414148	414157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11065	NC_017527	CGT	2	6	414211	414216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_017527	TA	4	8	414300	414307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_017527	GAA	2	6	414353	414358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017527	GGA	2	6	414402	414407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_017527	CAG	2	6	414445	414450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001109
11070	NC_017527	GAG	2	6	414542	414547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001109
11071	NC_017527	C	7	7	414626	414632	0 %	0 %	0 %	100 %	386001109
11072	NC_017527	TA	3	6	414656	414661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_017527	GTC	2	6	414676	414681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_017527	GTCTG	2	10	414718	414727	0 %	40 %	40 %	20 %	386001110
11075	NC_017527	CCA	2	6	414740	414745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001110
11076	NC_017527	CCA	2	6	414784	414789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001110
11077	NC_017527	GGA	2	6	414803	414808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11078	NC_017527	TTC	2	6	414822	414827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386001110
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11080	NC_017527	GGA	2	6	414881	414886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11081	NC_017527	GAG	2	6	414951	414956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11082	NC_017527	CTC	2	6	415011	415016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001110
11083	NC_017527	TCGA	2	8	415119	415126	25 %	25 %	25 %	25 %	386001110
11084	NC_017527	CCT	2	6	415129	415134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001110
11085	NC_017527	GAG	3	9	415167	415175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11086	NC_017527	TCG	2	6	415186	415191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001110
11087	NC_017527	CGA	2	6	415202	415207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001110
11088	NC_017527	TCG	2	6	415243	415248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001110
11089	NC_017527	GCCG	2	8	415299	415306	0 %	0 %	50 %	50 %	386001110
11090	NC_017527	GAT	2	6	415313	415318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001110
11091	NC_017527	CGGGG	2	10	415386	415395	0 %	0 %	80 %	20 %	386001110
11092	NC_017527	ACCTGA	2	12	415423	415434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386001110
11093	NC_017527	GCA	2	6	415466	415471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001110
11094	NC_017527	CCT	3	9	415472	415480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001110
11095	NC_017527	CTC	2	6	415497	415502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001110
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11098	NC_017527	G	8	8	415595	415602	0 %	0 %	100 %	0 %	386001110
11099	NC_017527	GCTG	2	8	415619	415626	0 %	25 %	50 %	25 %	386001110
11100	NC_017527	GGCTC	2	10	415669	415678	0 %	20 %	40 %	40 %	386001110
11101	NC_017527	CGG	2	6	415712	415717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001110
11102	NC_017527	CAC	2	6	415754	415759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001110
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11104	NC_017527	TGG	2	6	415819	415824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001110
11105	NC_017527	GGC	2	6	415847	415852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001110
11106	NC_017527	GCG	2	6	415875	415880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001110
11107	NC_017527	TGG	2	6	415888	415893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001110
11108	NC_017527	GAG	2	6	415902	415907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11109	NC_017527	CGAG	2	8	415933	415940	25 %	0 %	50 %	25 %	386001110
11110	NC_017527	GACG	2	8	415982	415989	25 %	0 %	50 %	25 %	386001110
11111	NC_017527	C	6	6	415991	415996	0 %	0 %	0 %	100 %	386001110
11112	NC_017527	GGT	3	9	415997	416005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001110
11113	NC_017527	TCC	2	6	416032	416037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001110
11114	NC_017527	CGA	2	6	416048	416053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001110
11115	NC_017527	GCG	2	6	416058	416063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001110
11116	NC_017527	GAG	2	6	416139	416144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
11117	NC_017527	TCCC	2	8	416160	416167	0 %	25 %	0 %	75 %	386001110
11118	NC_017527	C	6	6	416165	416170	0 %	0 %	0 %	100 %	386001110
11119	NC_017527	TGG	2	6	416176	416181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001110
11120	NC_017527	GAT	2	6	416195	416200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001110
11121	NC_017527	GGGGTC	2	12	416217	416228	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386001110
11122	NC_017527	GCCCTC	2	12	416265	416276	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386001110
11123	NC_017527	GAG	2	6	416285	416290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001110
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11244	NC_017527	TAT	2	6	421122	421127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11245	NC_017527	GGAG	2	8	421141	421148	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_017527	C	6	6	421252	421257	0 %	0 %	0 %	100 %	386001115
11247	NC_017527	GTC	2	6	421322	421327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001115
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11485	NC_017527	CGT	2	6	429701	429706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001122
11486	NC_017527	CAA	2	6	429728	429733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386001122
11487	NC_017527	ACC	2	6	429742	429747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001122
11488	NC_017527	GGA	2	6	429785	429790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001122
11489	NC_017527	TCC	2	6	429814	429819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001122
11490	NC_017527	TGG	2	6	429844	429849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001122
11491	NC_017527	AGA	2	6	429877	429882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001122
11492	NC_017527	GTG	2	6	429887	429892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001122
11493	NC_017527	CCCCA	2	10	429896	429905	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11494	NC_017527	TC	3	6	429951	429956	0 %	50 %	0 %	50 %	386001123
11495	NC_017527	CGA	2	6	429958	429963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001123
11496	NC_017527	CTC	2	6	430001	430006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001123
11497	NC_017527	CCTCG	2	10	430039	430048	0 %	20 %	20 %	60 %	386001123
11498	NC_017527	GAG	3	9	430054	430062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001123
11499	NC_017527	AAG	2	6	430073	430078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001123
11500	NC_017527	CGT	2	6	430084	430089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001123

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