MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017527	G	7	7	320455	320461	0 %	0 %	100 %	0 %	386001017
8502	NC_017527	GA	3	6	320517	320522	50 %	0 %	50 %	0 %	386001017
8503	NC_017527	GCC	2	6	320540	320545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001017
8504	NC_017527	CGA	2	6	320553	320558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001017
8505	NC_017527	GAC	2	6	320579	320584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001017
8506	NC_017527	GGC	2	6	320593	320598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001017
8507	NC_017527	GTC	2	6	320620	320625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001017
8508	NC_017527	TCG	2	6	320676	320681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001017
8509	NC_017527	GTG	2	6	320684	320689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001017
8510	NC_017527	GAA	2	6	320692	320697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001017
8511	NC_017527	G	6	6	320773	320778	0 %	0 %	100 %	0 %	386001017
8512	NC_017527	AT	3	6	320896	320901	50 %	50 %	0 %	0 %	386001018
8513	NC_017527	GGC	2	6	320918	320923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001018
8514	NC_017527	GCCG	2	8	320960	320967	0 %	0 %	50 %	50 %	386001018
8515	NC_017527	GCC	3	9	320978	320986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001018
8516	NC_017527	TCCA	2	8	321005	321012	25 %	25 %	0 %	50 %	386001018
8517	NC_017527	CTC	2	6	321038	321043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001018
8518	NC_017527	CAC	2	6	321047	321052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001018
8519	NC_017527	GGTGG	2	10	321192	321201	0 %	20 %	80 %	0 %	386001018
8520	NC_017527	TCC	2	6	321243	321248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001018
8521	NC_017527	G	6	6	321260	321265	0 %	0 %	100 %	0 %	386001018
8522	NC_017527	AGG	2	6	321285	321290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386001018
8523	NC_017527	GATC	2	8	321297	321304	25 %	25 %	25 %	25 %	386001018
8524	NC_017527	TCG	2	6	321324	321329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001018
8525	NC_017527	CCG	2	6	321340	321345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001018
8526	NC_017527	CGATC	2	10	321353	321362	20 %	20 %	20 %	40 %	386001018
8527	NC_017527	C	8	8	321364	321371	0 %	0 %	0 %	100 %	386001018
8528	NC_017527	G	6	6	321373	321378	0 %	0 %	100 %	0 %	386001018
8529	NC_017527	CGG	2	6	321385	321390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001018
8530	NC_017527	CGC	2	6	321406	321411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001018
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8532	NC_017527	CGC	4	12	321497	321508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001018
8533	NC_017527	CCG	2	6	321534	321539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386001018
8534	NC_017527	TTG	2	6	321546	321551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386001018
8535	NC_017527	G	6	6	321554	321559	0 %	0 %	100 %	0 %	386001018
8536	NC_017527	CT	3	6	321591	321596	0 %	50 %	0 %	50 %	386001018
8537	NC_017527	GTCGTT	2	12	321623	321634	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386001018
8538	NC_017527	C	6	6	321636	321641	0 %	0 %	0 %	100 %	386001018
8539	NC_017527	GGT	2	6	321689	321694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001018
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8541	NC_017527	CGT	2	6	321823	321828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001018
8542	NC_017527	ACG	2	6	321868	321873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001018
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8544	NC_017527	GAT	2	6	321959	321964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_017527	GGC	2	6	321993	321998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_017527	CCT	2	6	322014	322019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8547	NC_017527	CGAT	2	8	322064	322071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_017527	AG	3	6	322088	322093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_017527	ACT	2	6	322124	322129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001019
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8551	NC_017527	GA	3	6	322235	322240	50 %	0 %	50 %	0 %	386001019
8552	NC_017527	CAC	2	6	322398	322403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386001019
8553	NC_017527	GTC	2	6	322417	322422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386001019
8554	NC_017527	GAC	2	6	322435	322440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001019
8555	NC_017527	GGC	2	6	322540	322545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001019
8556	NC_017527	CACCGG	2	12	322593	322604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386001019
8557	NC_017527	CCT	2	6	322667	322672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001019
8558	NC_017527	TCC	2	6	322676	322681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001019
8559	NC_017527	GAC	2	6	322723	322728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001019
8560	NC_017527	CGA	2	6	322770	322775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001019
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8564	NC_017527	CCCTGC	2	12	323047	323058	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386001019
8565	NC_017527	ACCC	2	8	323065	323072	25 %	0 %	0 %	75 %	386001019
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8573	NC_017527	TGG	2	6	323351	323356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001019
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8577	NC_017527	TGG	2	6	323478	323483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386001020
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8581	NC_017527	CTACGC	2	12	323773	323784	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386001020
8582	NC_017527	ACG	2	6	323792	323797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001020
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8588	NC_017527	AAG	2	6	323917	323922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_017527	AAT	2	6	324011	324016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001021
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8593	NC_017527	TTA	2	6	324105	324110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386001021
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8595	NC_017527	CCT	2	6	324201	324206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001021
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8597	NC_017527	TA	3	6	324327	324332	50 %	50 %	0 %	0 %	386001021
8598	NC_017527	A	7	7	324406	324412	100 %	0 %	0 %	0 %	386001021
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8601	NC_017527	ATCT	2	8	324586	324593	25 %	50 %	0 %	25 %	386001021
8602	NC_017527	ATA	2	6	324596	324601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001021
8603	NC_017527	GAT	2	6	324652	324657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386001021
8604	NC_017527	TA	3	6	324678	324683	50 %	50 %	0 %	0 %	386001021
8605	NC_017527	ATT	2	6	324703	324708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386001021
8606	NC_017527	ACGA	2	8	324774	324781	50 %	0 %	25 %	25 %	386001021
8607	NC_017527	AAT	2	6	324817	324822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001021
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8609	NC_017527	CAT	2	6	324925	324930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001021
8610	NC_017527	CCATA	2	10	324975	324984	40 %	20 %	0 %	40 %	386001021
8611	NC_017527	AGA	2	6	324992	324997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386001021
8612	NC_017527	TAAT	2	8	325002	325009	50 %	50 %	0 %	0 %	386001021
8613	NC_017527	TCTT	2	8	325011	325018	0 %	75 %	0 %	25 %	386001021
8614	NC_017527	CT	3	6	325055	325060	0 %	50 %	0 %	50 %	386001021
8615	NC_017527	TA	3	6	325078	325083	50 %	50 %	0 %	0 %	386001021
8616	NC_017527	CAG	2	6	325091	325096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001021
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8618	NC_017527	TCC	2	6	325178	325183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386001021
8619	NC_017527	ATA	2	6	325187	325192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386001021
8620	NC_017527	ATC	2	6	325219	325224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_017527	TACCAA	2	12	325280	325291	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386001022
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8623	NC_017527	CGA	2	6	325449	325454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386001022
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8756	NC_017527	GAGGTC	2	12	330088	330099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386001025
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8995	NC_017527	GGGGC	2	10	338509	338518	0 %	0 %	80 %	20 %	386001033
8996	NC_017527	CGGGT	2	10	338573	338582	0 %	20 %	60 %	20 %	386001033
8997	NC_017527	ACA	2	6	338583	338588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386001033
8998	NC_017527	CTA	2	6	338599	338604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386001033
8999	NC_017527	CGG	2	6	338631	338636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386001033
9000	NC_017527	G	8	8	338671	338678	0 %	0 %	100 %	0 %	386001033

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