MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_017527	CGC	2	6	2414874	2414879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002928
64003	NC_017527	GAC	2	6	2414931	2414936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002928
64004	NC_017527	CTC	2	6	2414956	2414961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002928
64005	NC_017527	CCT	2	6	2414976	2414981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002928
64006	NC_017527	CGT	2	6	2414991	2414996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002928
64007	NC_017527	GAG	2	6	2415031	2415036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002928
64008	NC_017527	CCT	2	6	2415039	2415044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002928
64009	NC_017527	GGC	2	6	2415057	2415062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002928
64010	NC_017527	GGA	2	6	2415065	2415070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002928
64011	NC_017527	GTG	2	6	2415079	2415084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002928
64012	NC_017527	GGGGA	2	10	2415114	2415123	20 %	0 %	80 %	0 %	386002928
64013	NC_017527	CAG	2	6	2415127	2415132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002928
64014	NC_017527	TCC	2	6	2415146	2415151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002928
64015	NC_017527	ATC	2	6	2415175	2415180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002928
64016	NC_017527	C	6	6	2415188	2415193	0 %	0 %	0 %	100 %	386002928
64017	NC_017527	CCT	2	6	2415216	2415221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002928
64018	NC_017527	GGT	2	6	2415252	2415257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002928
64019	NC_017527	AGG	2	6	2415305	2415310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002928
64020	NC_017527	CGCCTC	2	12	2415312	2415323	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386002928
64021	NC_017527	GGGGAA	2	12	2415340	2415351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002928
64022	NC_017527	GCT	2	6	2415363	2415368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64023	NC_017527	A	6	6	2415444	2415449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64024	NC_017527	AGG	2	6	2415460	2415465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64025	NC_017527	CTT	2	6	2415627	2415632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64026	NC_017527	CTT	2	6	2415726	2415731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002929
64027	NC_017527	TCC	2	6	2415931	2415936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002929
64028	NC_017527	TGA	2	6	2415974	2415979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002929
64029	NC_017527	CCA	2	6	2415986	2415991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002929
64030	NC_017527	CAG	2	6	2416007	2416012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002929
64031	NC_017527	TCG	2	6	2416015	2416020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002929
64032	NC_017527	GGC	2	6	2416023	2416028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002929
64033	NC_017527	GAT	2	6	2416038	2416043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002929
64034	NC_017527	ACT	2	6	2416099	2416104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002929
64035	NC_017527	ATG	2	6	2416111	2416116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002929
64036	NC_017527	CTG	2	6	2416215	2416220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002929
64037	NC_017527	ATC	2	6	2416291	2416296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002929
64038	NC_017527	AGA	2	6	2416318	2416323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002929
64039	NC_017527	TCC	2	6	2416349	2416354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002929
64040	NC_017527	TTC	2	6	2416421	2416426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002930
64041	NC_017527	CTT	2	6	2416444	2416449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002930
64042	NC_017527	GGT	2	6	2416455	2416460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002930
64043	NC_017527	CT	3	6	2416610	2416615	0 %	50 %	0 %	50 %	386002930
64044	NC_017527	GA	3	6	2416616	2416621	50 %	0 %	50 %	0 %	386002930
64045	NC_017527	CGA	2	6	2416632	2416637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002930
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64047	NC_017527	TAG	2	6	2416673	2416678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002930
64048	NC_017527	TCA	2	6	2416743	2416748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002930
64049	NC_017527	CTG	2	6	2416751	2416756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002930
64050	NC_017527	GA	3	6	2416809	2416814	50 %	0 %	50 %	0 %	386002930
64051	NC_017527	GTC	2	6	2416870	2416875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002930
64052	NC_017527	CTT	2	6	2416915	2416920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002930
64053	NC_017527	TGA	2	6	2416926	2416931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002930
64054	NC_017527	CCCG	2	8	2416934	2416941	0 %	0 %	25 %	75 %	386002930
64055	NC_017527	GCC	2	6	2417012	2417017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002930
64056	NC_017527	AGT	2	6	2417040	2417045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002930
64057	NC_017527	GTC	2	6	2417108	2417113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002930
64058	NC_017527	GAG	2	6	2417131	2417136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002930
64059	NC_017527	CGG	2	6	2417145	2417150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002930
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64063	NC_017527	CGT	2	6	2417322	2417327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002930
64064	NC_017527	TGG	2	6	2417397	2417402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002930
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64066	NC_017527	GCG	2	6	2417441	2417446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002930
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64069	NC_017527	GAT	2	6	2417542	2417547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002930
64070	NC_017527	GA	3	6	2417553	2417558	50 %	0 %	50 %	0 %	386002930
64071	NC_017527	GCC	2	6	2417611	2417616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002930
64072	NC_017527	GAC	4	12	2417635	2417646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002930
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64077	NC_017527	ACC	2	6	2417802	2417807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64078	NC_017527	GAG	2	6	2417992	2417997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002931
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64085	NC_017527	CCAG	2	8	2418264	2418271	25 %	0 %	25 %	50 %	386002931
64086	NC_017527	TGAG	2	8	2418296	2418303	25 %	25 %	50 %	0 %	386002931
64087	NC_017527	TCGAG	2	10	2418306	2418315	20 %	20 %	40 %	20 %	386002931
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64091	NC_017527	TCCT	2	8	2418493	2418500	0 %	50 %	0 %	50 %	386002931
64092	NC_017527	CT	3	6	2418532	2418537	0 %	50 %	0 %	50 %	386002931
64093	NC_017527	CGG	2	6	2418567	2418572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002931
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64099	NC_017527	CCA	2	6	2418720	2418725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002931
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64106	NC_017527	CCGTC	2	10	2419002	2419011	0 %	20 %	20 %	60 %	386002931
64107	NC_017527	TGA	2	6	2419107	2419112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002931
64108	NC_017527	GCT	2	6	2419116	2419121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002931
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64111	NC_017527	CTT	3	9	2419192	2419200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002931
64112	NC_017527	CTG	2	6	2419229	2419234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002931
64113	NC_017527	CCA	2	6	2419254	2419259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002931
64114	NC_017527	GAT	2	6	2419420	2419425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002931
64115	NC_017527	TCA	2	6	2419431	2419436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002931
64116	NC_017527	GACCAG	2	12	2419450	2419461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002931
64117	NC_017527	CAC	2	6	2419495	2419500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64118	NC_017527	TCT	2	6	2419568	2419573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002932
64119	NC_017527	CT	3	6	2419572	2419577	0 %	50 %	0 %	50 %	386002932
64120	NC_017527	TGCTC	2	10	2419586	2419595	0 %	40 %	20 %	40 %	386002932
64121	NC_017527	TTG	2	6	2419663	2419668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002932
64122	NC_017527	ACG	2	6	2419687	2419692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002932
64123	NC_017527	CTC	2	6	2419740	2419745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002932
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64126	NC_017527	TTC	2	6	2419847	2419852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002933
64127	NC_017527	CCT	2	6	2419876	2419881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002933
64128	NC_017527	GGAT	2	8	2419951	2419958	25 %	25 %	50 %	0 %	386002933
64129	NC_017527	GAT	2	6	2419963	2419968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002933
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64131	NC_017527	CCT	2	6	2420037	2420042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002933
64132	NC_017527	GCT	2	6	2420046	2420051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002933
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64142	NC_017527	CGG	2	6	2420473	2420478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002933
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64144	NC_017527	CCA	2	6	2420659	2420664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002933
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64146	NC_017527	TCC	2	6	2420721	2420726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002933
64147	NC_017527	GTA	2	6	2420863	2420868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64148	NC_017527	TCGC	2	8	2420929	2420936	0 %	25 %	25 %	50 %	386002934
64149	NC_017527	CT	3	6	2420980	2420985	0 %	50 %	0 %	50 %	386002934
64150	NC_017527	ACG	2	6	2420989	2420994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002934
64151	NC_017527	CCG	2	6	2420995	2421000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002934
64152	NC_017527	AAGAG	2	10	2421033	2421042	60 %	0 %	40 %	0 %	386002934
64153	NC_017527	TGA	2	6	2421113	2421118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002934
64154	NC_017527	GTTCTC	2	12	2421120	2421131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386002934
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64158	NC_017527	CTTGCT	2	12	2421378	2421389	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386002934
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64162	NC_017527	CAC	2	6	2421587	2421592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002935
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64164	NC_017527	CCA	2	6	2421687	2421692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64165	NC_017527	TTTTC	2	10	2421715	2421724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64166	NC_017527	TC	3	6	2421753	2421758	0 %	50 %	0 %	50 %	386002936
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64169	NC_017527	TGA	2	6	2421892	2421897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002936
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64201	NC_017527	GCA	2	6	2423719	2423724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64215	NC_017527	ATCC	2	8	2424458	2424465	25 %	25 %	0 %	50 %	386002938
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64220	NC_017527	CCG	2	6	2424755	2424760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002938
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64232	NC_017527	CCT	2	6	2425109	2425114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002938
64233	NC_017527	CGA	2	6	2425145	2425150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002938
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64243	NC_017527	CTC	2	6	2425460	2425465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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64247	NC_017527	CGG	2	6	2425522	2425527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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64250	NC_017527	CAG	2	6	2425619	2425624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64497	NC_017527	CGC	2	6	2433873	2433878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002945
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