MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61002	NC_017527	AAG	2	6	2304347	2304352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002812
61003	NC_017527	GCCG	2	8	2304357	2304364	0 %	0 %	50 %	50 %	386002812
61004	NC_017527	GTC	2	6	2304368	2304373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002812
61005	NC_017527	ACG	2	6	2304480	2304485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002812
61006	NC_017527	ATC	2	6	2304520	2304525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002812
61007	NC_017527	A	6	6	2304548	2304553	100 %	0 %	0 %	0 %	386002812
61008	NC_017527	TCC	2	6	2304594	2304599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002813
61009	NC_017527	CCT	2	6	2304626	2304631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002813
61010	NC_017527	CAC	2	6	2304646	2304651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002813
61011	NC_017527	ATG	2	6	2304665	2304670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002813
61012	NC_017527	C	8	8	2304696	2304703	0 %	0 %	0 %	100 %	386002813
61013	NC_017527	GGC	2	6	2304712	2304717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002813
61014	NC_017527	GCCGG	2	10	2304718	2304727	0 %	0 %	60 %	40 %	386002813
61015	NC_017527	GAG	2	6	2304790	2304795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002813
61016	NC_017527	CCTC	2	8	2304798	2304805	0 %	25 %	0 %	75 %	386002813
61017	NC_017527	AAAGGC	2	12	2304839	2304850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386002813
61018	NC_017527	CGC	2	6	2304852	2304857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002813
61019	NC_017527	AGG	2	6	2304872	2304877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002813
61020	NC_017527	CCA	2	6	2304886	2304891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002813
61021	NC_017527	ATC	2	6	2304904	2304909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002813
61022	NC_017527	GGC	2	6	2304911	2304916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002813
61023	NC_017527	CTC	2	6	2304953	2304958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002813
61024	NC_017527	CCA	2	6	2304960	2304965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002813
61025	NC_017527	TCC	2	6	2305016	2305021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002813
61026	NC_017527	GCC	2	6	2305043	2305048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002814
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61028	NC_017527	TCC	2	6	2305136	2305141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002814
61029	NC_017527	ATC	2	6	2305174	2305179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002814
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61033	NC_017527	GGA	2	6	2305286	2305291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002814
61034	NC_017527	C	7	7	2305343	2305349	0 %	0 %	0 %	100 %	386002814
61035	NC_017527	CGT	2	6	2305388	2305393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002814
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61037	NC_017527	ATC	2	6	2305480	2305485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002814
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61039	NC_017527	TA	3	6	2305717	2305722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61040	NC_017527	GTA	2	6	2305781	2305786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61041	NC_017527	TCCCC	2	10	2305983	2305992	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
61042	NC_017527	TTA	2	6	2306028	2306033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61043	NC_017527	CGT	2	6	2306055	2306060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61044	NC_017527	G	7	7	2306135	2306141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61045	NC_017527	CCGGGG	2	12	2306165	2306176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61046	NC_017527	TCC	2	6	2306239	2306244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002815
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61049	NC_017527	TCT	2	6	2306276	2306281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002815
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61055	NC_017527	CTC	2	6	2306433	2306438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002815
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61058	NC_017527	GTA	2	6	2306502	2306507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002815
61059	NC_017527	GAG	2	6	2306511	2306516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002815
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61065	NC_017527	GAG	2	6	2306744	2306749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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61067	NC_017527	GGA	2	6	2306820	2306825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61068	NC_017527	GGC	2	6	2306840	2306845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61069	NC_017527	C	6	6	2307025	2307030	0 %	0 %	0 %	100 %	386002816
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61118	NC_017527	GCCGAG	2	12	2308864	2308875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386002817
61119	NC_017527	GAG	2	6	2308888	2308893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002817
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61134	NC_017527	ACCG	2	8	2309327	2309334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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61137	NC_017527	CGTCC	2	10	2309409	2309418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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61234	NC_017527	TAA	2	6	2313196	2313201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002820
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61355	NC_017527	TGA	2	6	2319026	2319031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61356	NC_017527	ATC	2	6	2319053	2319058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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61374	NC_017527	GAA	2	6	2319744	2319749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61381	NC_017527	CCCG	2	8	2320009	2320016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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61383	NC_017527	C	6	6	2320037	2320042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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61386	NC_017527	CGG	2	6	2320067	2320072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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61444	NC_017527	ACG	2	6	2323001	2323006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002830
61445	NC_017527	TTCT	2	8	2323106	2323113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61446	NC_017527	GAT	2	6	2323147	2323152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61447	NC_017527	CTGG	2	8	2323199	2323206	0 %	25 %	50 %	25 %	386002831
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61455	NC_017527	CTC	2	6	2323638	2323643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002832
61456	NC_017527	ATC	3	9	2323753	2323761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002832
61457	NC_017527	CAG	2	6	2323782	2323787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002832
61458	NC_017527	CTG	3	9	2323797	2323805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002832
61459	NC_017527	GCT	2	6	2323808	2323813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002832
61460	NC_017527	AGG	2	6	2323953	2323958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002833
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61462	NC_017527	TCC	2	6	2324007	2324012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002833
61463	NC_017527	GCG	3	9	2324028	2324036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002833
61464	NC_017527	CCTCGA	2	12	2324050	2324061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386002833
61465	NC_017527	CGT	2	6	2324112	2324117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002834
61466	NC_017527	CGA	2	6	2324118	2324123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002834
61467	NC_017527	GATC	2	8	2324124	2324131	25 %	25 %	25 %	25 %	386002834
61468	NC_017527	GCC	2	6	2324154	2324159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002834
61469	NC_017527	GAA	2	6	2324191	2324196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002834
61470	NC_017527	CGG	3	9	2324208	2324216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002834
61471	NC_017527	ACC	2	6	2324231	2324236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002834
61472	NC_017527	CGCCC	2	10	2324263	2324272	0 %	0 %	20 %	80 %	386002834
61473	NC_017527	GGA	2	6	2324292	2324297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002834
61474	NC_017527	CTC	2	6	2324302	2324307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002834
61475	NC_017527	CCCG	2	8	2324308	2324315	0 %	0 %	25 %	75 %	386002834
61476	NC_017527	ACC	3	9	2324354	2324362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002834
61477	NC_017527	TCG	2	6	2324372	2324377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002834
61478	NC_017527	CCT	2	6	2324449	2324454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002834
61479	NC_017527	CCT	2	6	2324470	2324475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002834
61480	NC_017527	GGT	2	6	2324479	2324484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002834
61481	NC_017527	TCA	2	6	2324490	2324495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002834
61482	NC_017527	GTC	2	6	2324518	2324523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002835
61483	NC_017527	TCT	2	6	2324600	2324605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002835
61484	NC_017527	CCG	2	6	2324705	2324710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002836
61485	NC_017527	CT	3	6	2324755	2324760	0 %	50 %	0 %	50 %	386002836
61486	NC_017527	GCTCC	2	10	2324806	2324815	0 %	20 %	20 %	60 %	386002836
61487	NC_017527	CTTC	2	8	2324842	2324849	0 %	50 %	0 %	50 %	386002836
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61492	NC_017527	CGG	2	6	2325042	2325047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002837
61493	NC_017527	CTC	2	6	2325082	2325087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002837
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61495	NC_017527	TCC	2	6	2325173	2325178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002837
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61497	NC_017527	GCG	2	6	2325221	2325226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002837
61498	NC_017527	GTC	2	6	2325265	2325270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002837
61499	NC_017527	GGACGT	2	12	2325273	2325284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386002837
61500	NC_017527	AGGG	2	8	2325326	2325333	25 %	0 %	75 %	0 %	386002837

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