MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_017527	CGA	2	6	2150767	2150772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002673
57003	NC_017527	CCCG	2	8	2150789	2150796	0 %	0 %	25 %	75 %	386002673
57004	NC_017527	CGT	4	12	2150884	2150895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002673
57005	NC_017527	CGC	2	6	2150896	2150901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002673
57006	NC_017527	CAT	2	6	2150917	2150922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002673
57007	NC_017527	CTC	2	6	2150933	2150938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002673
57008	NC_017527	GAT	2	6	2150959	2150964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002673
57009	NC_017527	AGG	2	6	2150985	2150990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002673
57010	NC_017527	GGA	2	6	2151037	2151042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002673
57011	NC_017527	AGG	4	12	2151162	2151173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002673
57012	NC_017527	AG	3	6	2151193	2151198	50 %	0 %	50 %	0 %	386002673
57013	NC_017527	AAG	2	6	2151221	2151226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002673
57014	NC_017527	AAG	2	6	2151239	2151244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002673
57015	NC_017527	GGCG	2	8	2151278	2151285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57016	NC_017527	TATT	2	8	2151358	2151365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57017	NC_017527	AAT	2	6	2151372	2151377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57018	NC_017527	ATC	2	6	2151567	2151572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57019	NC_017527	CGC	2	6	2151603	2151608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57020	NC_017527	TAA	2	6	2151651	2151656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57021	NC_017527	TGATA	2	10	2151657	2151666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57022	NC_017527	A	6	6	2151770	2151775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57023	NC_017527	GAT	2	6	2151778	2151783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57024	NC_017527	GT	3	6	2151823	2151828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57025	NC_017527	GGAC	2	8	2152035	2152042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57026	NC_017527	GAA	2	6	2152113	2152118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57027	NC_017527	CGC	2	6	2152182	2152187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57028	NC_017527	ATCCA	2	10	2152212	2152221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57029	NC_017527	GAAT	2	8	2152271	2152278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57030	NC_017527	CAA	2	6	2152344	2152349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57031	NC_017527	GCC	2	6	2152422	2152427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57032	NC_017527	TGA	2	6	2152429	2152434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57033	NC_017527	GAGG	2	8	2152473	2152480	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57034	NC_017527	CGT	3	9	2152501	2152509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57035	NC_017527	TCG	2	6	2152513	2152518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57036	NC_017527	GCC	3	9	2152528	2152536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57037	NC_017527	TCG	2	6	2152634	2152639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57038	NC_017527	GAA	2	6	2152702	2152707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57039	NC_017527	CGC	2	6	2152803	2152808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57040	NC_017527	TCCTT	2	10	2152838	2152847	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57041	NC_017527	GAG	2	6	2152853	2152858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57042	NC_017527	AGGC	2	8	2152978	2152985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57043	NC_017527	CTT	2	6	2153001	2153006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57044	NC_017527	CGA	2	6	2153007	2153012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57045	NC_017527	CCA	2	6	2153030	2153035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57046	NC_017527	GGC	2	6	2153038	2153043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57047	NC_017527	CGC	2	6	2153136	2153141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002674
57048	NC_017527	CAT	2	6	2153157	2153162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002674
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57052	NC_017527	GGC	2	6	2153355	2153360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002674
57053	NC_017527	AGG	2	6	2153402	2153407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002674
57054	NC_017527	AG	3	6	2153433	2153438	50 %	0 %	50 %	0 %	386002674
57055	NC_017527	GAG	2	6	2153449	2153454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002674
57056	NC_017527	AAG	2	6	2153461	2153466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002674
57057	NC_017527	AAG	2	6	2153479	2153484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002674
57058	NC_017527	CGG	2	6	2153524	2153529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57059	NC_017527	C	6	6	2153559	2153564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57060	NC_017527	CCG	2	6	2153755	2153760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57061	NC_017527	TCT	2	6	2153850	2153855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57062	NC_017527	ATC	2	6	2153896	2153901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57063	NC_017527	ATA	2	6	2153936	2153941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57064	NC_017527	TA	3	6	2153986	2153991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57065	NC_017527	AAG	2	6	2154008	2154013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57066	NC_017527	TA	3	6	2154021	2154026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57067	NC_017527	TCG	2	6	2154178	2154183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57068	NC_017527	TCG	2	6	2154289	2154294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002675
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57081	NC_017527	TA	3	6	2155161	2155166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57082	NC_017527	TAAA	2	8	2155218	2155225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57090	NC_017527	CTG	2	6	2155665	2155670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002676
57091	NC_017527	TCAA	2	8	2155676	2155683	50 %	25 %	0 %	25 %	386002676
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57094	NC_017527	T	6	6	2155713	2155718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57095	NC_017527	A	6	6	2155750	2155755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57096	NC_017527	T	6	6	2155762	2155767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57097	NC_017527	ATG	2	6	2155815	2155820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57098	NC_017527	TCA	2	6	2155839	2155844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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57101	NC_017527	ATT	2	6	2155975	2155980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57102	NC_017527	TAAT	2	8	2156219	2156226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57103	NC_017527	CCAA	2	8	2156304	2156311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57104	NC_017527	ATA	2	6	2156313	2156318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57105	NC_017527	CCCT	2	8	2156341	2156348	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57106	NC_017527	TTC	2	6	2156360	2156365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57107	NC_017527	T	6	6	2156399	2156404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57108	NC_017527	AGT	2	6	2156426	2156431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57109	NC_017527	TCT	3	9	2156436	2156444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57110	NC_017527	ACTA	2	8	2156450	2156457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57111	NC_017527	AATT	2	8	2156470	2156477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57112	NC_017527	GCT	2	6	2156505	2156510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57113	NC_017527	TAGT	2	8	2156524	2156531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57114	NC_017527	TAA	2	6	2156575	2156580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57115	NC_017527	CTA	2	6	2156584	2156589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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57117	NC_017527	TTA	2	6	2156602	2156607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57118	NC_017527	A	7	7	2156645	2156651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57119	NC_017527	ATATA	2	10	2156678	2156687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57120	NC_017527	TA	6	12	2156684	2156695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57121	NC_017527	AT	4	8	2156696	2156703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57122	NC_017527	T	6	6	2156746	2156751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57123	NC_017527	TA	3	6	2156758	2156763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57124	NC_017527	TAA	2	6	2156819	2156824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57125	NC_017527	CTC	2	6	2156828	2156833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57240	NC_017527	TCC	2	6	2160381	2160386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002681
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57347	NC_017527	TCC	2	6	2164448	2164453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002686
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57352	NC_017527	GGAGA	2	10	2164624	2164633	40 %	0 %	60 %	0 %	386002686
57353	NC_017527	CGA	2	6	2164634	2164639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002686
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57355	NC_017527	GAG	2	6	2164657	2164662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002686
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